Identification of a haloalkaliphilic and thermostable cellulase with improved ionic liquid tolerance

Green Chemistry

Volumn 13, Issue 8, 2011, Pages 2083-2090

  Zhang, Tao ^a   Datta, Supratim ^b   Eichler, Jerry ^c   Ivanova, Natalia ^a   Axen, Seth D ^a   Kerfeld, Cheryl A ^a,d   Chen, Feng ^a   Kyrpides, Nikos ^a   Hugenholtz, Philip ^a,b,e   Cheng, Jan Fang ^a   Sale, Kenneth L ^b   Simmons, Blake ^b   Rubin, Eddy ^a  

^a DOE JOINT GENOME INSTITUTE   (United States)

^b JOINT BIOENERGY INSTITUTE   (United States)

^c BEN GURION UNIVERSITY OF THE NEGEV   (Israel)

^d UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^e UNIVERSITY OF QUEENSLAND   (Australia)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ARCHAEA; HALORHABDUS UTAHENSIS;

EID: 80051596661     PISSN: 14639262     EISSN: 14639270     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1gc15193b     Document Type: Article

References (68)

1. P. Wasserscheid W. Keim Angew. Chem., Int. Ed. 2000 39 3772.
2. R. P. Swatloski S. K. Spear J. D. Holbrey R. D. Rogers J. Am. Chem. Soc. 2002 124 4974.
3. I. Kilpelainen H. Xie A. King M. Granstrom S. Heikkinen D. S. Argyropoulos J. Agric. Food Chem. 2007 55 9142.
4. M. Zavrel D. Bross M. Funke J. Buchs A. C. Spiess Bioresour. Technol. 2009 100 2580.
5. S. Singh B. A. Simmons K. P. Vogel Biotechnol. Bioeng. 2009 104 68.
6. D. A. Fort R. C. Remsing R. P. Swatloski P. Moyna G. Moyna R. D. Rogers Green Chem. 2007 9 63.
7. D. A. Fort R. P. Swatloski P. Moyna R. D. Rogers G. Moyna Chem. Commun. 2006 714.
8. H. Zhao C. L. Jones G. A. Baker S. Xia O. Olubajo V. N. Person J. Biotechnol. 2009 139 47.
9. S. H. Lee T. V. Doherty R. J. Linhardt J. S. Dordick Biotechnol. Bioeng. 2009 102 1368.
10. A. P. Dadi S. Varanasi C. A. Schall Biotechnol. Bioeng. 2006 95 904.
11. A. P. Dadi C. A. Schall S. Varanasi Appl. Biochem. Biotechnol. 2007 137–140 407.
12. N. Kamiya Y. Matsushita M. Hanaki K. Nakashima M. Narita M. Goto H. Takahashi Biotechnol. Lett. 2008 30 1037.
13. M. B. Turner S. K. Spear J. G. Huddleston J. D. Holbrey R. D. Rogers Green Chem. 2003 5 443.
14. S. Park R. J. Kazlauskas Curr. Opin. Biotechnol. 2003 14 432.
15. S. Bose D. W. Armstrong J. W. Petrich J. Phys. Chem. B 2010 114 8221.
16. M. Moniruzzaman N. Kamiya M. Goto Org. Biomol. Chem. 2010 8 2887.
17. H. Zhao O. Olubajo Z. Song A. L. Sims T. E. Person R. A. Lawal L. A. Holley Bioorg. Chem. 2006 34 15.
18. D. Constatinescu C. Herrmann H. Weingartner Phys. Chem. Chem. Phys. 2010 12 1756.
19. F. van Rantwijk R. A. Sheldon Chem. Rev. 2007 107 2757.
20. S. Paul S. K. Bag S. Das E. T. Harvill C. Dutta GenomeBiology 2008 9 R70.
21. J. K. Lanyi Bacteriol Rev 1974 38 272.
22. G. W. Hutcheon N. Vasisht A. Bolhuis Extremophiles 2005 9 487.
23. S. Fukuchi K. Yoshimune M. Wakayama M. Moriguchi K. Nishikawa J. Mol. Biol. 2003 327 347.
24. F. Frolow M. Harel J. L. Sussman M. Mevarech M. Shoham Nat. Struct. Biol. 1996 3 452.
25. X. Tadeo B. Lopez-Mendez T. Trigueros A. Lain D. Castano O. Millet PLoS Biol. 2009 7 e1000257.
26. N. Coquelle R. Talon D. H. Juers E. Girard R. Kahn D. Madern J. Mol. Biol. 2010 404 493.
27. G. Zaccai Philos. Trans. R. Soc. London, Ser. B 2004 359 1269.
28. G. Zaccai F. Cendrin Y. Haik N. Borochov H. Eisenberg J. Mol. Biol. 1989 208 491.
29. C. Ebel L. Costenaro M. Pascu P. Faou B. Kernel F. Proust-De Martin G. Zaccai Biochemistry 2002 41 13234.
30. M. Mevarech F. Frolow L. M. Gloss Biophys. Chem. 2000 86 155.
31. C. Ebel P. Faou B. Kernel G. Zaccai Biochemistry 1999 38 9039.
32. M. Waino B. J. Tindall K. Ingvorsen Int J Syst Evol Microbiol 2000 50 Pt 1 183.
33. D. Wu P. Hugenholtz K. Mavromatis R. Pukall E. Dalin N. N. Ivanova V. Kunin L. Goodwin M. Wu B. J. Tindall S. D. Hooper A. Pati A. Lykidis S. Spring I. J. Anderson P. D'Haeseleer A. Zemla M. Singer A. Lapidus M. Nolan A. Copeland C. Han F. Chen J. F. Cheng S. Lucas C. Kerfeld E. Lang S. Gronow P. Chain D. Bruce E. M. Rubin N. C. Kyrpides H. P. Klenk J. A. Eisen Nature 2009 462 1056.
34. M. Waino K. Ingvorsen Extremophiles 2003 7 87.
35. P. Bakke N. Carney W. Deloache M. Gearing K. Ingvorsen M. Lotz J. McNair P. Penumetcha S. Simpson L. Voss M. Win L. J. Heyer A. M. Campbell PLoS One 2009 4 e6291.
36. E. Little P. Bork R. F. Doolittle J. Mol. Evol. 1994 39 631.
37. I. A. Kataeva R. D. Seidel 3rd A. Shah L. T. West X. L. Li L. G. Ljungdahl Appl. Environ. Microbiol. 2002 68 4292.
38. H. Liu J. H. Pereira P. D. Adams R. Sapra B. A. Simmons K. L. Sale FEBS Lett. 2010 584 3431.
39. J. H. Pereira R. Sapra J. V. Volponi C. L. Kozina B. Simmons P. D. Adams Acta Crystallogr., Sect. D: Biol. Crystallogr. 2009 65 744.
40. P. Natale T. Bruser A. J. M. Driessen Biochim. Biophys. Acta, Biomembr. 2008 1778 1735.
41. M. Vyazmensky Z. Barak D. M. Chipman J. Eichler Comp. Biochem. Physiol., Part B: Biochem. Mol. Biol. 2000 125 205.
42. S. Datta B. Holmes J. I. Park Z. W. Chen D. C. Dibble M. Hadi H. W. Blanch B. A. Simmons R. Sapra Green Chem. 2010 12 338.
43. K. Shill S. Padmanabhan Q. Xin J. Prausnitz D. S. Clark H. W. Blanch Biotechnol Bioeng 2011 108 511-520.
44. J. Wu J. Zhang H. Zhang J. He Q. Ren M. Guo Biomacromolecules 2004 5 266.
45. S. D. Zhu Y. X. Wu Q. M. Chen Z. N. Yu C. W. Wang S. W. Jin Y. G. Ding G. Wu Green Chem. 2006 8 325.
46. R. H. Vreeland A. F. Piselli Jr. S. McDonnough S. S. Meyers Extremophiles 1998 2 321.
47. R. Rohban M. A. Amoozegar A. Ventosa J. Ind. Microbiol. Biotechnol. 2009 36 333.
48. H. C. Rees S. Grant B. Jones W. D. Grant S. Heaphy Extremophiles 2003 7 415.
49. S. Voget H. L. Steele W. R. Streit J. Biotechnol. 2006 126 26.
50. Z. Gao L. Ruan X. Chen Y. Zhang X. Xu Appl. Microbiol. Biotechnol. 2010 87 1373.
51. C. M. Taupin M. Hartlein R. Leberman Eur. J. Biochem. 1997 243 141.
52. F. Cendrin J. Chroboczek G. Zaccai H. Eisenberg M. Mevarech Biochemistry 1993 32 4308.
53. W. Zhou D. C. Irwin J. Escovar-Kousen D. B. Wilson Biochemistry 2004 43 9655.
54. E. A. Bayer R. Lamed B. A. White H. J. Flint Chem. Rec. 2008 8 364.
55. Y. Hakamada Y. Hatada K. Koike T. Yoshimatsu S. Kawai T. Kobayashi S. Ito Biosci., Biotechnol., Biochem. 2000 64 2281.
56. K. Endo Y. Hakamada S. Takizawa H. Kubota N. Sumitomo T. Kobayashi S. Ito Appl. Microbiol. Biotechnol. 2001 57 109.
57. K. Hirasawa K. Uchimura M. Kashiwa W. D. Grant S. Ito T. Kobayashi K. Horikoshi Antonie van Leeuwenhoek 2006 89 211.
58. O. Blecher S. Goldman M. Mevarech Eur. J. Biochem. 1993 216 199.
59. S. J. Kaczowka J. A. Maupin-Furlow J. Bacteriol. 2003 185 165.
60. S. W. Cline W. L. Lam R. L. Charlebois L. C. Schalkwyk W. F. Doolittle Can. J. Microbiol. 1989 35 148.
61. T. K. Ghose Pure Appl. Chem. 1987 59 257.
62. K. Arnold L. Bordoli J. Kopp T. Schwede Bioinformatics 2006 22 195.
63. F. Kiefer K. Arnold M. Kunzli L. Bordoli T. Schwede Nucleic Acids Res. 2009 37 D387.
64. M. C. Peitsch Bio-Technol 1995 13 723.
65. T. J. Dolinsky J. E. Nielsen J. A. McCammon N. A. Baker Nucleic Acids Res. 2004 32 W665.
66. The PyMOL Molecular Graphics System, Version 1.2r2., Schrödinger, LLC.
67. N. A. Baker D. Sept S. Joseph M. J. Holst J. A. McCammon Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001 98 10037.
68. K. E. Gutowski G. A. Broker H. D. Willauer J. G. Huddleston R. P. Swatloski J. D. Holbrey R. D. Rogers J. Am. Chem. Soc. 2003 125 6632.