-
1
-
-
34249930405
-
-
Scheraga, H. A.; Khalili, M.; Liwo, A. Annu. Rev. Phys. Chem. 2007, 58, 57-83
-
(2007)
Annu. Rev. Phys. Chem.
, vol.58
, pp. 57-83
-
-
Scheraga, H.A.1
Khalili, M.2
Liwo, A.3
-
2
-
-
0037397987
-
-
Gnanakaran, S.; Nymeyer, H.; Portman, J.; Sanbonmatsu, K. Y.; Garcia, A. E. Curr. Opin. Struct. Biol. 2003, 13, 168-174
-
(2003)
Curr. Opin. Struct. Biol.
, vol.13
, pp. 168-174
-
-
Gnanakaran, S.1
Nymeyer, H.2
Portman, J.3
Sanbonmatsu, K.Y.4
Garcia, A.E.5
-
3
-
-
0037038372
-
-
Snow, C. D.; Nguyen, H.; Pande, V. S.; Gruebele, M. Nature 2002, 420, 102-106
-
(2002)
Nature
, vol.420
, pp. 102-106
-
-
Snow, C.D.1
Nguyen, H.2
Pande, V.S.3
Gruebele, M.4
-
4
-
-
0037174385
-
-
Simmerling, C.; Strockbine, B.; Roitberg, A. E. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 11258-11259
-
(2002)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.124
, pp. 11258-11259
-
-
Simmerling, C.1
Strockbine, B.2
Roitberg, A.E.3
-
5
-
-
33646415982
-
-
Fujitani, H.; Tanida, Y.; Ito, M.; Jayachandran, G.; Snow, C. D.; Shirts, M. R.; Sorin, E. J.; Pande, V. S. J. Chem. Phys. 2005, 123, 084108
-
(2005)
J. Chem. Phys.
, vol.123
, pp. 084108
-
-
Fujitani, H.1
Tanida, Y.2
Ito, M.3
Jayachandran, G.4
Snow, C.D.5
Shirts, M.R.6
Sorin, E.J.7
Pande, V.S.8
-
6
-
-
0000862725
-
-
Smit, B.; Hilbers, P. A. J.; Esselink, K.; Rupert, L. A. M.; van Os, N. M.; Schlijper, A. G. Nature 1990, 348, 624-625
-
(1990)
Nature
, vol.348
, pp. 624-625
-
-
Smit, B.1
Hilbers, P.A.J.2
Esselink, K.3
Rupert, L.A.M.4
Van Os, N.M.5
Schlijper, A.G.6
-
7
-
-
2342473866
-
-
Nielsen, S.; Lopez, C.; Srinivas, G.; Klein, M. J. Phys.: Condens. Matter 2004, 6, R481-R512
-
(2004)
J. Phys.: Condens. Matter
, vol.6
-
-
Nielsen, S.1
Lopez, C.2
Srinivas, G.3
Klein, M.4
-
9
-
-
1642485164
-
-
Marrink, S. J.; de Vries, A. H.; Mark, A. E. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 750-760
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 750-760
-
-
Marrink, S.J.1
De Vries, A.H.2
Mark, A.E.3
-
10
-
-
34547474332
-
-
Marrink, S. J.; Risselada, H. J.; Yefimov, S.; Tieleman, D. P.; de Vries, A. H. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 7812-7824
-
(2007)
J. Phys. Chem. B
, vol.111
, pp. 7812-7824
-
-
Marrink, S.J.1
Risselada, H.J.2
Yefimov, S.3
Tieleman, D.P.4
De Vries, A.H.5
-
11
-
-
49449107938
-
-
Baoukina, S.; Monticelli, L.; Risselada, H. J.; Marrink, S. J.; Tieleman, D. P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 10803-10808
-
(2008)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.105
, pp. 10803-10808
-
-
Baoukina, S.1
Monticelli, L.2
Risselada, H.J.3
Marrink, S.J.4
Tieleman, D.P.5
-
14
-
-
49449113010
-
-
Monticelli, L.; Kandasamy, S. K.; Periole, X.; Larson, R. G.; Tieleman, D. P.; Marrink, S.-J. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 819-834
-
(2008)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.4
, pp. 819-834
-
-
Monticelli, L.1
Kandasamy, S.K.2
Periole, X.3
Larson, R.G.4
Tieleman, D.P.5
Marrink, S.-J.6
-
15
-
-
4444282928
-
-
Oostenbrink, C.; Villa, A.; Mark, A. E.; van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1656-1676
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1656-1676
-
-
Oostenbrink, C.1
Villa, A.2
Mark, A.E.3
Van Gunsteren, W.F.4
-
16
-
-
0141990949
-
-
Shirts, M. R.; Pitera, J. W.; Swope, W. C.; Pande, V. S. J. Chem. Phys. 2003, 119, 5740-5761
-
(2003)
J. Chem. Phys.
, vol.119
, pp. 5740-5761
-
-
Shirts, M.R.1
Pitera, J.W.2
Swope, W.C.3
Pande, V.S.4
-
20
-
-
33745630723
-
-
Tieleman, D. P.; MacCallum, J. L.; Ash, W. L.; Kandt, C.; Xu, Z.; Monticelli, L. J. Phys.: Condens. Matter 2006, 18, S1221
-
(2006)
J. Phys.: Condens. Matter
, vol.18
, pp. 1221
-
-
Tieleman, D.P.1
MacCallum, J.L.2
Ash, W.L.3
Kandt, C.4
Xu, Z.5
Monticelli, L.6
-
21
-
-
37049023237
-
-
Ozdirekcan, S.; Etchebest, C.; Killian, J. A.; Fuchs, P. F. J. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 15174-15181
-
(2007)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.129
, pp. 15174-15181
-
-
Ozdirekcan, S.1
Etchebest, C.2
Killian, J.A.3
Fuchs, P.F.J.4
-
22
-
-
77956586675
-
-
Monticelli, L.; Tieleman, D. P.; Fuchs, P. F. J. Biophys. J. 2010, 99, 1455-1464
-
(2010)
Biophys. J.
, vol.99
, pp. 1455-1464
-
-
Monticelli, L.1
Tieleman, D.P.2
Fuchs, P.F.J.3
-
23
-
-
0030005250
-
-
Wimley, W. C.; Creamer, T. P.; White, S. H. Biochemistry 1996, 35, 5109-5124
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 5109-5124
-
-
Wimley, W.C.1
Creamer, T.P.2
White, S.H.3
-
26
-
-
73149101885
-
-
Snider, C.; Jayasinghe, S.; Hristova, K.; White, S. H. Protein Sci. 2009, 18, 2624-2628
-
(2009)
Protein Sci.
, vol.18
, pp. 2624-2628
-
-
Snider, C.1
Jayasinghe, S.2
Hristova, K.3
White, S.H.4
-
27
-
-
0043167827
-
-
Aliste, M. P.; MacCallum, J. L.; Tieleman, D. P. Biochemistry 2003, 42, 8976-8987
-
(2003)
Biochemistry
, vol.42
, pp. 8976-8987
-
-
Aliste, M.P.1
MacCallum, J.L.2
Tieleman, D.P.3
-
29
-
-
34247626293
-
-
MacCallum, J. L.; Bennett, W. F. D.; Tieleman, D. P. J. Gen. Physiol. 2007, 129, 371-377
-
(2007)
J. Gen. Physiol.
, vol.129
, pp. 371-377
-
-
MacCallum, J.L.1
Bennett, W.F.D.2
Tieleman, D.P.3
-
30
-
-
43649094583
-
-
MacCallum, J. L.; Bennett, W. F. D.; Tieleman, D. P. Biophys. J. 2008, 94, 3393-3404
-
(2008)
Biophys. J.
, vol.94
, pp. 3393-3404
-
-
MacCallum, J.L.1
Bennett, W.F.D.2
Tieleman, D.P.3
-
31
-
-
46249092554
-
-
Hess, B.; Kutzner, C.; van der Spoel, D.; Lindahl, E. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 435-447
-
(2008)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.4
, pp. 435-447
-
-
Hess, B.1
Kutzner, C.2
Van Der Spoel, D.3
Lindahl, E.4
-
32
-
-
84943502952
-
-
Nose, S. Mol. Phys. 1984, 52, 255-268
-
(1984)
Mol. Phys.
, vol.52
, pp. 255-268
-
-
Nose, S.1
-
35
-
-
33750587438
-
-
Berendsen, H. J. C.; Postma, J.; DiNola, A.; Haak, J. J. Chem. Phys. 1984, 81, 3684-3690
-
(1984)
J. Chem. Phys.
, vol.81
, pp. 3684-3690
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Postma, J.2
Dinola, A.3
Haak, J.4
-
36
-
-
0002316936
-
-
Humphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graph. 1996, 14 (33-8) 27-8
-
(1996)
J. Mol. Graph.
, vol.14
, Issue.33-38
, pp. 27-28
-
-
Humphrey, W.1
Dalke, A.2
Schulten, K.3
-
37
-
-
34548703110
-
-
Shirts, M. R.; Mobley, D. L.; Chodera, J. D. Annu. Rep. Comput. Chem. 2007, 3, 41-59
-
(2007)
Annu. Rep. Comput. Chem.
, vol.3
, pp. 41-59
-
-
Shirts, M.R.1
Mobley, D.L.2
Chodera, J.D.3
-
42
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. M. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021
-
(1992)
J. Comput. Chem.
, vol.13
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Bouzida, D.2
Swendsen, R.H.3
Kollman, P.A.4
Rosenberg, J.M.5
-
44
-
-
0035789518
-
-
Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306-317
-
(2001)
J. Mol. Model.
, vol.7
, pp. 306-317
-
-
Lindahl, E.1
Hess, B.2
Van Der Spoel, D.3
-
45
-
-
77955503561
-
-
Yesylevskyy, S. O.; Schafer, L. V.; Sengupta, D.; Marrink, S. J. PLoS Comput. Biol. 2010, 6, e1000810
-
(2010)
PLoS Comput. Biol.
, vol.6
, pp. 1000810
-
-
Yesylevskyy, S.O.1
Schafer, L.V.2
Sengupta, D.3
Marrink, S.J.4
-
46
-
-
78651282170
-
-
Hub, J. S.; de Groot, B. L.; van der Spoel, D. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 3713-3720
-
(2010)
J. Chem. Theory Comput.
, vol.6
, pp. 3713-3720
-
-
Hub, J.S.1
De Groot, B.L.2
Van Der Spoel, D.3
-
48
-
-
1242346370
-
-
Berendsen, H. J. C.; Grigera, J. R.; Straatsma, T. P. J. Phys. Chem. 1987, 91, 6269-6271
-
(1987)
J. Phys. Chem.
, vol.91
, pp. 6269-6271
-
-
Berendsen, H.J.C.1
Grigera, J.R.2
Straatsma, T.P.3
-
49
-
-
0032552880
-
-
Yau, W. M.; Wimley, W. C.; Gawrisch, K.; White, S. H. Biochemistry 1998, 37, 14713-14718
-
(1998)
Biochemistry
, vol.37
, pp. 14713-14718
-
-
Yau, W.M.1
Wimley, W.C.2
Gawrisch, K.3
White, S.H.4
-
51
-
-
52049097563
-
-
Sun, H.; Greathouse, D. V.; Andersen, O. S.; Koeppe, R. E. J. Biol. Chem. 2008, 283, 22233-22243
-
(2008)
J. Biol. Chem.
, vol.283
, pp. 22233-22243
-
-
Sun, H.1
Greathouse, D.V.2
Andersen, O.S.3
Koeppe, R.E.4
|