Theoretical studies on the inactivation mechanism of γ-aminobutyric acid aminotransferase

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 9, Issue 14, 2011, Pages 5162-5171

  Durak, A T ^a   Gokcan H ^a   Konuklar, F A S ^a  

^a ISTANBUL TECHNICAL UNIVERSITY   (Turkey)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINOBUTYRIC ACIDS; AMINOTRANSFERASE; CONTINUUM MODEL; DENSITY FUNCTIONAL THEORY METHODS; EXPLICIT WATER; INACTIVATION MECHANISMS; KEY FACTORS; SINGLE POINT; THEORETICAL CALCULATIONS; THEORETICAL STUDY;

AMINO ACIDS; CONTINUUM MECHANICS; INTEGRAL EQUATIONS;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

4 AMINOBUTYRATE AMINOTRANSFERASE; 4 AMINOBUTYRIC ACID;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; METABOLISM; QUANTUM THEORY; STEREOISOMERISM;

4-AMINOBUTYRATE TRANSAMINASE; GAMMA-AMINOBUTYRIC ACID; MOLECULAR STRUCTURE; QUANTUM THEORY; STEREOISOMERISM;

EID: 79959785984     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c1ob05146f     Document Type: Article

References (49)

1. J. F. Baxter E. Roberts J. Biol. Chem. 1961 236 3287 3294
2. A. Karlsson F. Fonnum D. Malthe-Sorenssen J. Storm-Mathisen Biochem. Pharmacol. 1974 23 3053 3061
3. R. A. E. Bakay A. B. Harris Brain Res. 1981 206 387 404
4. K. G. Loyd, C. Munati, L. Bossi, C. Stoeffels, J. Talairach and P. L. Morselli, in Neurotransmission, Seizures, Epilepsy,, P. L. Morselli,,, W. Loescher, and, K. G. Loyd,, ed., Raven Press: New York, 1981; pp. 325-338
5. J. Butterworth C. M. Yates J. J. Simpson J. Neurochem. 1983 41 440 447
6. N. Nishino H. Fujiwara S.-A. Noguchi-Kuno C. Tanaka Jpn. J. Pharmacol. 1988 48 331 339
7. T. Aoyagi T. Wada M. Nagai F. Kojima S. Harada T. Takeuchi H. Takahashi K. Hirokawa T. Tsumita Chem. Pharm. Bull. 1990 38 1748 1749
8. B. S. Meldrum, R. W. Horton, in Epilepsy,, P. Harris, and, C. Mawdsley,, ed., Churchill Livingston: Edinburgh, 1974; pp 55-64
9. S. M. Nanavati R. B. Silverman J. Med. Chem. 1989 32 2413 2421
10. K. Gale Epilepsia 1989 30 S1 S11
11. W. Loscher Neuropharmacology 1982 21 803 810
12. G. A. R. Johnston D. R. Curtis P. M. Beart C. J. A. Game R. M. McColloch B. J. Twichin J. Neurochem. 1975 24 157 160
13. G. A. R. Johnston A. L. Stephanson B. J. Twichin Pharm. Pharmacol. 1977 29 240 241
14. L. Brehm H. Hjeds P. Krogsgarrd-Larsen Acta Chem. Scand. 1972 26 1298 1299
15. J. O. McNamara, in The Pharmacological Basis of Therapeutics,, J. G. Hardman,,, L. E. Limbird,,, P. B. Molinoff,,, R. W. Ruddon, and, A. G. Gilman,, ed., McGraw-Hill: New York, 1996 461-486
16. B. Lippert B. W. Metcalf M. J. Jung P. Casara Eur. J. Biochem. 1977 74 441 445
17. B. E. Gidal M. D. Privitera R. D. Sheth J. T. Gilman Ann. Pharmacother. 1999 33 1277 1286
18. S. L. Dewey A. E. Morgan C. R. Jr. Ashby B. Horan S. A. Kushner J. Logan N. D. Volkow J. S. Fowler E. L. Gardner J. D. Brodie Synapse 1998 30 119 129
19. R. Kalviainen I. Nousiainen CNS Drugs 2001 15 217 230
20. N. Sadlej-Sosnowska J. Cz. Dobrowolski W. P. Oziminski A. P. Mazurek J. Phys. Chem. A 2002 106 10554 10562
21. D. De Biase D. Barra F. Bossa P. Pucci R. A. John J. Biol. Chem. 1991 266 20056 20061
22. S. M. Nanavati R. B. Silverman J. Am. Chem. Soc. 1991 113 9341 9349
23. B. W. Metcalf Biochem. Pharmacol. 1979 28 1705 1712
24. P. Storici D. De Biase F. Bossa S. Bruno A. Mozzarelli C. Peneff R. B. Silverman T. Schirmer J. Biol. Chem. 2004 279 363 373
25. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 1372 1377
26. J. J. P. Stewart J. Comput. Chem. 1989 10 209 220
27. J. J. P. Stewart J. Comput. Chem. 1989 10 221
28. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. W. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, Gaussian 03, (Revision D.01), Gaussian Inc, Wallingford CT, 2004
29. A. E. Reed L. A. Curtiss F. Weinhold Chem. Rev. 1988 88 899 926
30. M. Cossi V. Barone R. Cammi J. Tomasi Chem. Phys. Lett. 1996 255 327 335
31. V. Barone M. Cossi J. Tomasi J. Comput. Chem. 1998 19 404 417
32. M. Caricato F. Ingrosso B. Mennucci J. Tomasi J. Chem. Phys. 1999 122 154501 154510
33. R.-Z. Liao W.-J. Ding J.-G Yu W.-H Fang R.-Z Liu J. Comput. Chem. 2008 29 1919 1929
34. R. Casasnovas A. Salva J. Frau J. Donoso F. Munoz Chem. Phys. 2009 355 149 156
35. R. D. Bach C. Canepa M. N. Glukhovtsev J. Am. Chem. Soc. 1999 121 6542 6555
36. M. D. Toney Arch. Biochem. Biophys. 2005 433 279 287
37. M. D. Toney Biochemistry 2001 40 1378 1384
38. S. Sharif G. S. Denisov M. D. Toney H. H. Limbach J. Am. Chem. Soc. 2007 129 6313 6327
39. A. Salvà J. Donoso J. Frau F. Muñoz J. Phys. Chem. A 2003 107 9409 9414
40. A. Salvà J. Donoso J. Frau F. Muñoz J. of Mol. Struct. (THEOCHEM) 2002 577 229 238
41. A. Salvà J. Donoso J. Frau F. Muñoz J. Phys. Chem. A 2004 108 11709 11714
42. A. Salvà J. Donoso J. Frau F. Muñoz Int. J. Quantum Chem. 2002 89 48 56
43. C. Y. Legault, CYLview, 1.0b, Université de Sherbrooke, 2009 (http://www.cylview.org)
44. R.-Z. Liao W.-J. Ding J.-G. Yu W.-H. Fang R.-Z. Liu J. Phys. Chem. A 2007 111 3184 3190
45. L. Pardo R. Osman H. Weinstein J. R. Rabinowitz J. Am. Chem. Soc. 1993 115 8263 8269
46. M. P. Patil R. B. Sunoj J. Org. Chem. 2007 72 8202 8215
47. J. Ortega-Castro M. Adrover J. Frau A. Salva J. Donoso F. Munoz J. Phys. Chem. A 2010 114 4634 4640
48. J. J. Likos H. Ueno R. W. Feidhaus D. E. Metzler Biochemistry 1982 21 4377 4386
49. H. Ueno J. J. Likos D. E. Metzler Biochemistry 1982 21 4387 4393