Estimation of partial charges in small zeolite imidazolate frameworks from density functional theory calculations

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 7, Issue 6, 2011, Pages 1575-1582

  Rana, Malay Kumar ^a   Pazzona, Federico Giovanni ^a   Suffritti, Giuseppe Baldovino ^a   Demontis, Pierfranco ^a   Masia, Marco ^a  

^a UNIVERSITY OF SASSARI   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 79959231217     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct100685p     Document Type: Article

References (69)

1. James, S. L. Chem. Soc. Rev. 2003, 32, 276
2. Caté, A. P.; Benin, A. I.; Ockwig, N. W.; OKeeffe, M.; Matzger, A. J.; Yaghi, O. M. Science 2005, 310, 1166
3. Park, K. S.; Ni, Z.; Caté, A. P.; Choi, J. Y.; Huang, R.; Uribe-Romo, F. J.; Chae, H. K.; OKeeffe, M.; Yaghi, O. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 10186
4. Tian, Y. Q.; Zhao, Y. M.; Chen, Z. X.; Zhang, G. N.; Weng, L. H.; Zhao, D. Y. Chem.-Eur. J. 2007, 13, 4146
5. Banerjee, R.; Phan, A.; Wang, B.; Knobler, C.; Furukawa, H.; OKeeffe, M.; Yaghi, O. M. Science 2008, 319, 939
6. Banerjee, R.; Furukawa, H.; Britt, D.; Knobler, C.; OKeeffe, M.; Yaghi, O. M. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 3875
7. Tafipolsky, M.; Amirjalayer, S.; Schmid, R. Microporous Mesoporous Mater. 2010, 129, 304
8. Rankin, R. B.; Liu, J.; Kulkarni, A. D.; Johnson, J. K. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 16906
9. Liu, D.; Zheng, C.; Yang, Q.; Zhong, C. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 5004
10. Liu, B.; Smit, B. J. Phys. Chem. C 2010, 114, 8515
11. Henkelman, G.; Arnaldsson, A.; Jonsson, H. Comput. Mater. Sci. 2006, 36, 354
12. Mulliken, R. S. J. Chem. Phys. 1955, 23, 1833
13. Bader, R. F. W. In Atoms in Molecules; Clarendon: Oxford, U. K., 1990.
14. Liu, J.; Rankin, R. B.; Johnson, J. K. Mol. Simul. 2009, 35, 60
15. Astrand, P. O.; Ruud, K.; Mikkelsen, K. V.; Helgaker, T. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 7686
16. Salles, F.; Ghoufi, A.; Maurin, G.; Bell, R. G.; Mellot-Draznieks, C.; Ferey, G. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 8487
17. Momany, F. A. J. Phys. Chem. 1978, 82, 592
18. Cox, S. R.; Williams, D. E. J. Comput. Chem. 1981, 2, 304
19. Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell, W. D.; Kollman, P. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 10269
20. Laio, A.; VandeVondele, J.; Rothlisberger, U. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 7300
21. Singh, U. C.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1984, 5, 129
22. Besler, B. H.; Merz, K. M.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1990, 11, 431
23. Chirlian, L. E.; Francl, M. M. J. Comput. Chem. 1987, 8, 894
24. Breneman, C. M.; Wiberg, K. B. J. Comput. Chem. 1990, 11, 361
25. Dubbeldam, D.; Walton, K. S.; Ellis, D. E.; Snurr, R. Q. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 4496
26. Greathouse, J. A.; Allendorf, M. D. J. Phys. Chem. C 2008, 112, 5795
27. Maciel, G. S.; Garcia, E. Chem. Phys. Lett. 2005, 409, 29
28. Heinz, H.; Suter, U. W. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 18341
29. Martin, F.; Zipse, H. J. Comput. Chem. 2005, 26, 97
30. Yang, Q.; Zhong, C. ChemPhysChem 2006, 7, 1417
31. Campañá, C.; Mussard, B.; Woo, T. K. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 2866
32. Moggach, S. A.; Bennett, T. D.; Cheetham, A. K. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 7087
33. Wu, H.; Zhou, W.; Yildirim, T. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 5314
34. Venna, S. R.; Carreon, M. A. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 76
35. Liu, Y.; Liu, H.; Hu, Y.; Jiang, J. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 12326
36. Zhou, M.; Wang, Q.; Zhang, L.; Liu, Y.; Kang, Y. J. Phys. Chem B 2009, 113, 11049
37. Pantatosaki, E.; Pazzona, F. G.; Megariotis, G.; Papadopoulos, G. K. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 2493
38. Liu, Y.; Liu, H; Hu, Y.; Jiang, J. J. Phys. Chem. B 2010, 114, 2820
39. Pérez-Pellitero, J.; Amrouche, H.; Siperstein, F. R.; Pirngruber, G.; Nieto-Draghi, C.; Chaplais, G.; Simon-Masseron, A.; Bazer-Bachi, D.; Peralta, D.; Bats, N. Chem.-Eur. J. 2010, 16, 1560
40. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision B.03; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
41. Ahlrichs, R.; Bär, M.; Häser, M.; Horn, H.; Kölmel, C. Chem. Phys. Lett. 1989, 162, 165
42. TURBOMOLE V6.0 2007, a development of University of Karlsruhe and Forschungszentrum Karlsruhe GmbH, 1989-2007, TURBOMOLE GmbH, since 2007; available from http://www.turbomole.com.
43. Tao, J.; Perdew, J. P.; Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 146041
44. Vahtras, O.; Almlöf, J.; Feyereisen, M. Chem. Phys. Lett. 1993, 213, 514
45. Sierka, M.; Hogekamp, A.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 2003, 118, 9136
46. CPMD, version 3.13; Copyright IBM Corp. 1990-2008 (MPI für Festköorperforschung Stuttgart 1997-2001).
47. Lippert, G.; Hutter, J.; Parrinello, M. Mol. Phys. 1997, 92, 477
48. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098
49. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785
50. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865
51. Troullier, N.; Martins, J. L. Phys. Rev. B 1991, 43, 1993
52. Goedecker, S.; Teter, M.; Hutter, J. Phys. Rev. B 1996, 54, 1703
53. Hartwigsen, C.; Goedecker, S.; Hutter, J. Phys. Rev. B 1998, 58, 3641
54. Krack, M. Theor. Chem. Acc. 2005, 114, 145
55. Vanderbilt, D. Phys. Rev. B 1990, 41, 7892
56. Kosa, M.; Tan, J.; Merrill, C. A.; Krack, M.; Cheetham, A. K.; Parrinello, M. ChemPhysChem 2010, 11, 2332
57. Martyna, G.; Klein, M.; Tuckerman, M. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2635
58. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471
59. VandeVondele, J.; Krack, M.; Mohamed, F.; Parrinello, M.; Chassaing, T.; Hutter, J. Comput. Phys. Commun. 2005, 167, 103
60. VandeVondele, J.; Hutter, J. J. Chem. Phys. 2003, 118, 4365
61. Rappe, A. K.; Casewit, C. J.; Colwell, K. S.; Goddard, W. A., III; Skiff, W. M. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 10024
62. Ewald, P. P. Ann. Phys. 1921, 64, 253
63. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. In Computer Simulations of Liquids; Oxford University Press: Oxford, U. K., 1987.
64. Sola, J; Guàrdia, E.; Masia, M. J. Chem. Phys. 2010, 133, 234101
65. Sagara, T.; Klassen, J.; Ganz, E. J. Chem. Phys. 2004, 121, 12543
66. Guàrdia, E.; Skarmoutsos, I.; Masia, M. J. Chem. Theory Comput. 2009, 5, 1449
67. Watanabe, T.; Manz, T. A.; Sholl, D. S. J. Phys. Chem. C 2011, 115, 4824
68. Lin, F.; Wang, R. J. Chem. Theory Comput. 2010, 6, 1852
69. Xu, Q.; Zhong, C. J. Phys. Chem. C 2010, 114, 5035