-
4
-
-
0025667349
-
-
O'Connell, A. M.; Koeppe, R. E., II; Andersen, O. S. Science 1990, 250, 1256-1259
-
(1990)
Science
, vol.250
, pp. 1256-1259
-
-
O'Connell, A.M.1
Koeppe, R.E.I.I.2
Andersen, O.S.3
-
5
-
-
0006757698
-
-
Arseniev, A. S.; Barsukov, I. L.; Bystrov, V. F.; Ovchinnikov, Yu. A. Biol. Membr. 1986, 3, 437-462
-
(1986)
Biol. Membr.
, vol.3
, pp. 437-462
-
-
Arseniev, A.S.1
Barsukov, I.L.2
Bystrov, V.F.3
Ovchinnikov, Yu.A.4
-
6
-
-
0035797933
-
-
Townsley, L. E.; Tucker, W. A.; Sham, S.; Hinton, J. F. Biochemistry 2001, 40, 11676-11686
-
(2001)
Biochemistry
, vol.40
, pp. 11676-11686
-
-
Townsley, L.E.1
Tucker, W.A.2
Sham, S.3
Hinton, J.F.4
-
7
-
-
0027360175
-
-
Ketchem, R. R.; Hu, W.; Cross, T. A. Science 1993, 261, 1457-1460
-
(1993)
Science
, vol.261
, pp. 1457-1460
-
-
Ketchem, R.R.1
Hu, W.2
Cross, T.A.3
-
8
-
-
0031574382
-
-
Ketchem, R. R.; Roux, B.; Cross, T. A. Structure 1997, 5, 1655-1669
-
(1997)
Structure
, vol.5
, pp. 1655-1669
-
-
Ketchem, R.R.1
Roux, B.2
Cross, T.A.3
-
9
-
-
0042626159
-
-
Allen, T. W.; Andersen, O. S.; Roux, B. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9868-9878
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.125
, pp. 9868-9878
-
-
Allen, T.W.1
Andersen, O.S.2
Roux, B.3
-
12
-
-
0020465420
-
-
Urry, D. W.; Walker, J. T.; Trapane, T. L. J. Membr. Biol. 1982, 69, 225-231
-
(1982)
J. Membr. Biol.
, vol.69
, pp. 225-231
-
-
Urry, D.W.1
Walker, J.T.2
Trapane, T.L.3
-
13
-
-
0029096188
-
-
Jing, N.; Prasad, K. U.; Urry, D. W. Biochim. Biophys. Acta 1995, 1238, 1-11
-
(1995)
Biochim. Biophys. Acta
, vol.1238
, pp. 1-11
-
-
Jing, N.1
Prasad, K.U.2
Urry, D.W.3
-
14
-
-
0025713684
-
-
Smith, R.; Thomas, D. E.; Atkins, A. R.; Separovic, F.; Cornell, B. A. Biochim. Biophys. Acta 1990, 1026, 161-166
-
(1990)
Biochim. Biophys. Acta
, vol.1026
, pp. 161-166
-
-
Smith, R.1
Thomas, D.E.2
Atkins, A.R.3
Separovic, F.4
Cornell, B.A.5
-
15
-
-
0029787815
-
-
Tian, F.; Lee, K. C.; Hu, W.; Cross, T. A. Biochemistry 1996, 35, 11959-11966
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 11959-11966
-
-
Tian, F.1
Lee, K.C.2
Hu, W.3
Cross, T.A.4
-
16
-
-
0025878348
-
-
Olah, G. A.; Huang, H. W.; Liu, W. H.; Wu, Y. L. J. Mol. Biol. 1991, 218, 847-858
-
(1991)
J. Mol. Biol.
, vol.218
, pp. 847-858
-
-
Olah, G.A.1
Huang, H.W.2
Liu, W.H.3
Wu, Y.L.4
-
20
-
-
79958181400
-
-
DOI 10.1021/jp200906y, accompanying manuscript.
-
Vostrikov, V. V.; Gu, H.; Ingólfsson, H. I.; Roux, B.; Andersen, O. S.; Hinton, J. F.; Koeppe, R. E., II. J. Phys. Chem. 2011, DOI 10.1021/jp200906y, accompanying manuscript.
-
(2011)
J. Phys. Chem.
-
-
Vostrikov, V.V.1
Gu, H.2
Ingólfsson, H.I.3
Roux, B.4
Andersen, O.S.5
Hinton, J.F.6
Koeppe, R.E.I.I.7
-
21
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187-217
-
(1983)
J. Comput. Chem.
, vol.4
, pp. 187-217
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
22
-
-
67650500988
-
-
Brooks, B. R.; Brooks, C. L., 3rd; Mackerell, A. D., Jr.; Nilsson, L.; Petrella, R. J.; Roux, B.; Won, Y.; Archontis, G.; Bartels, C.; Boresch, S.; Caflisch, A.; Caves, L.; Cui, Q.; Dinner, A. R.; Feig, M.; Fischer, S.; Gao, J.; Hodoscek, M.; Im, W.; Kuczera, K.; Lazaridis, T.; Ma, J.; Ovchinnikov, V.; Paci, E.; Pastor, R. W.; Post, C. B.; Pu, J. Z.; Schaefer, M.; Tidor, B.; Venable, R. M.; Woodcock, H. L.; Wu, X.; Yang, W.; York, D. M.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 2009, 30, 1545-1614
-
(2009)
J. Comput. Chem.
, vol.30
, pp. 1545-1614
-
-
Brooks, B.R.1
Brooks III, C.L.2
Mackerell Jr., A.D.3
Nilsson, L.4
Petrella, R.J.5
Roux, B.6
Won, Y.7
Archontis, G.8
Bartels, C.9
Boresch, S.10
Caflisch, A.11
Caves, L.12
Cui, Q.13
Dinner, A.R.14
Feig, M.15
Fischer, S.16
Gao, J.17
Hodoscek, M.18
Im, W.19
Kuczera, K.20
Lazaridis, T.21
Ma, J.22
Ovchinnikov, V.23
Paci, E.24
Pastor, R.W.25
Post, C.B.26
Pu, J.Z.27
Schaefer, M.28
Tidor, B.29
Venable, R.M.30
Woodcock, H.L.31
Wu, X.32
Yang, W.33
York, D.M.34
Karplus, M.35
more..
-
23
-
-
0041784950
-
-
MacKerell, A. D., Jr.; Bashford, D.; Bellott, M.; Dunbrack, R. L., Jr; Evanseck, J. D.; Field, M. J.; Fischer, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph-McCarthy, D.; Kuchnir, L.; Kuckzera, K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, W. E. I.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J. C.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Workiewicz-Kuczera, J.; Yinb, D.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3586-3616
-
(1998)
J. Phys. Chem. B
, vol.102
, pp. 3586-3616
-
-
Mackerell Jr., A.D.1
Bashford, D.2
Bellott, M.3
Dunbrack Jr., R.L.4
Evanseck, J.D.5
Field, M.J.6
Fischer, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph-Mccarthy, D.11
Kuchnir, L.12
Kuckzera, K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher, W.E.I.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.C.23
Stote, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Workiewicz-Kuczera, J.27
Yinb, D.28
Karplus, M.29
more..
-
24
-
-
1642576012
-
-
MacKerell, A. D., Jr; Feig, M.; Brooks, C. L., III. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 698-699
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.126
, pp. 698-699
-
-
MacKerell Jr., A.D.1
Feig, M.2
Brooks III, C.L.3
-
26
-
-
0042642646
-
-
Koeppe, R. E., II; Sun, H.; van der Wel, P. C.; Scherer, E. M.; Pulay, P.; Greathouse, D. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 12268-12276
-
(2003)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.125
, pp. 12268-12276
-
-
Koeppe, R.E.I.I.1
Sun, H.2
Van Der Wel, P.C.3
Scherer, E.M.4
Pulay, P.5
Greathouse, D.6
-
27
-
-
0017760120
-
-
Tredgold, R. H.; Hole, P. N.; Sproule, R. C.; Elgamal, M. Biochim. Biophys. Acta 1977, 471, 189-194
-
(1977)
Biochim. Biophys. Acta
, vol.471
, pp. 189-194
-
-
Tredgold, R.H.1
Hole, P.N.2
Sproule, R.C.3
Elgamal, M.4
-
28
-
-
0020200286
-
-
Heitz, F.; Spach, G.; Trudelle, Y. Biophys. J. 1982, 40, 87-89
-
(1982)
Biophys. J.
, vol.40
, pp. 87-89
-
-
Heitz, F.1
Spach, G.2
Trudelle, Y.3
-
29
-
-
0025721931
-
-
Becker, M. D.; Greathouse, D. V.; Koeppe, R. E., II; Andersen, O. S. Biochemistry 1991, 30, 8830-8839
-
(1991)
Biochemistry
, vol.30
, pp. 8830-8839
-
-
Becker, M.D.1
Greathouse, D.V.2
Koeppe, R.E.I.I.3
Andersen, O.S.4
-
30
-
-
0032478974
-
-
Andersen, O. S.; Greathouse, D. V.; Providence, L. L.; Becker, M. D.; Koeppe, R. E., II. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5142-5146
-
(1998)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.120
, pp. 5142-5146
-
-
Andersen, O.S.1
Greathouse, D.V.2
Providence, L.L.3
Becker, M.D.4
Koeppe, R.E.I.I.5
-
31
-
-
0031769568
-
-
Busath, D. D.; Thulin, C. D.; Hendershot, R. W.; Phillips, L. R.; Maughan, P.; Cole, C. D.; Bingham, N. C.; Morrison, S.; Baird, L. C.; Hendershot, R. J.; Cotten, M.; Cross, T. A. Biophys. J. 1998, 75, 2830-2844
-
(1998)
Biophys. J.
, vol.75
, pp. 2830-2844
-
-
Busath, D.D.1
Thulin, C.D.2
Hendershot, R.W.3
Phillips, L.R.4
Maughan, P.5
Cole, C.D.6
Bingham, N.C.7
Morrison, S.8
Baird, L.C.9
Hendershot, R.J.10
Cotten, M.11
Cross, T.A.12
-
36
-
-
36449007836
-
-
Feller, S. E.; Zhang, Y. H.; Pastor, R. W.; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 1995, 103, 4613-4621
-
(1995)
J. Chem. Phys.
, vol.103
, pp. 4613-4621
-
-
Feller, S.E.1
Zhang, Y.H.2
Pastor, R.W.3
Brooks, B.R.4
-
37
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092
-
(1993)
J. Chem. Phys.
, vol.98
, pp. 10089-10092
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
38
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Chem. 1977, 23, 327-341
-
(1977)
J. Comput. Chem.
, vol.23
, pp. 327-341
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
41
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
42
-
-
0000459946
-
-
Levy, R. M.; Karplus, M.; Wolynes, P. G. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 5998-6011
-
(1981)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.103
, pp. 5998-6011
-
-
Levy, R.M.1
Karplus, M.2
Wolynes, P.G.3
-
43
-
-
0021754836
-
-
Olejniczak, E. T.; Dobson, C. M.; Karplus, M.; Levy, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 1923-1930
-
(1984)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.106
, pp. 1923-1930
-
-
Olejniczak, E.T.1
Dobson, C.M.2
Karplus, M.3
Levy, R.M.4
-
46
-
-
0347089020
-
-
Allen, T. W.; Andersen, O. S.; Roux, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 117-122
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.101
, pp. 117-122
-
-
Allen, T.W.1
Andersen, O.S.2
Roux, B.3
-
47
-
-
33646192258
-
-
Allen, T. W.; Andersen, O. S.; Roux, B. Biophys. J. 2006, 90, 3447-3468
-
(2006)
Biophys. J.
, vol.90
, pp. 3447-3468
-
-
Allen, T.W.1
Andersen, O.S.2
Roux, B.3
-
48
-
-
33750606030
-
-
Allen, T. W.; Andersen, O. S.; Roux, B. Biophys. Chem. 2006, 124, 251-267
-
(2006)
Biophys. Chem.
, vol.124
, pp. 251-267
-
-
Allen, T.W.1
Andersen, O.S.2
Roux, B.3
-
49
-
-
45149123917
-
-
Roux, B.; Andersen, O. S.; Allen, T. W. J. Chem. Phys. 2008, 128, 227101
-
(2008)
J. Chem. Phys.
, vol.128
, pp. 227101
-
-
Roux, B.1
Andersen, O.S.2
Allen, T.W.3
-
50
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. M. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021
-
(1992)
J. Comput. Chem.
, vol.13
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Bouzida, D.2
Swendsen, R.H.3
Kollman, P.A.4
Rosenberg, J.M.5
-
52
-
-
0033613906
-
-
Zhou, Y.; Vitkup, D.; Karplus, M. J. Mol. Biol. 1999, 285, 1371-1375
-
(1999)
J. Mol. Biol.
, vol.285
, pp. 1371-1375
-
-
Zhou, Y.1
Vitkup, D.2
Karplus, M.3
-
53
-
-
0026594687
-
-
Katsaras, J.; Prosser, R. S.; Stinson, R. H.; Davis, J. H. Biophys. J. 1992, 61, 827-830
-
(1992)
Biophys. J.
, vol.61
, pp. 827-830
-
-
Katsaras, J.1
Prosser, R.S.2
Stinson, R.H.3
Davis, J.H.4
-
55
-
-
33847361456
-
-
Grossfield, A.; Feller, S. E.; Pitman, M. C. Proteins 2007, 67, 31-40
-
(2007)
Proteins
, vol.67
, pp. 31-40
-
-
Grossfield, A.1
Feller, S.E.2
Pitman, M.C.3
-
57
-
-
0034877101
-
-
Thompson, N.; Thompson, G.; Cole, C. D.; Cotten, M.; Cross, T. A.; Busath, D. D. Biophys. J. 2001, 81, 1245-1254
-
(2001)
Biophys. J.
, vol.81
, pp. 1245-1254
-
-
Thompson, N.1
Thompson, G.2
Cole, C.D.3
Cotten, M.4
Cross, T.A.5
Busath, D.D.6
|