-
1
-
-
33645641242
-
-
IM, W.; Chen, J.; Brooks, C. L., III. Adv. Protein Chem. 2006, 72, 173-198.
-
(2006)
Adv. Protein Chem
, vol.72
, pp. 173-198
-
-
Im, W.1
Chen, J.2
Brooks III, C.L.3
-
5
-
-
0037047134
-
-
Shi, Z.; Olson, C. A.; Rose, G. D.; Baldwin, R. L.; Kallenbach, N. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 9190-9195.
-
(2002)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.99
, pp. 9190-9195
-
-
Shi, Z.1
Olson, C.A.2
Rose, G.D.3
Baldwin, R.L.4
Kallenbach, N.R.5
-
6
-
-
0026490069
-
-
Head-Gordon, T.; Stillinger, F. H.; Wright, M. H.; Gay, D. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 11513-11517.
-
(1992)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.89
, pp. 11513-11517
-
-
Head-Gordon, T.1
Stillinger, F.H.2
Wright, M.H.3
Gay, D.M.4
-
8
-
-
11444269715
-
-
Ramakrishnan, V.; Ranbhor, R.; Durani, S. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16332-16333.
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc
, vol.126
, pp. 16332-16333
-
-
Ramakrishnan, V.1
Ranbhor, R.2
Durani, S.3
-
9
-
-
23844465902
-
-
Zagrovic, B.; Lipfert, J.; Sorin, E. J.; Millett, I. S.; van Gunsteren, W. F.; Doniach, S.; Pande, V. S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 11698-11703.
-
(2005)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.102
, pp. 11698-11703
-
-
Zagrovic, B.1
Lipfert, J.2
Sorin, E.J.3
Millett, I.S.4
Van Gunsteren, W.F.5
Doniach, S.6
Pande, V.S.7
-
10
-
-
60849125449
-
-
Makowska, J.;Boginska,K.; Skwierawska,A.;Liwo,A.;Chmurzynski, L.; Scheraga, H. A. Pept. Sci. 2008, 90, 772-782.
-
(2008)
Pept. Sci
, vol.90
, pp. 772-782
-
-
Makowska, J.1
Boginska, K.2
Skwierawska, A.3
Liwo, A.4
Chmurzynski, L.5
Scheraga, H.A.6
-
11
-
-
32444434361
-
-
Makowska, J.; Rodziewicz-Motowidlo, S.; Baginska, K.; Vila, J. A.; Liwo, A.; Chmurzynski, L.; Scheraga, H. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S. A. 2006, 103, 1744-1749.
-
(2006)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S. A
, vol.103
, pp. 1744-1749
-
-
Makowska, J.1
Rodziewicz-Motowidlo, S.2
Baginska, K.3
Vila, J.A.4
Liwo, A.5
Chmurzynski, L.6
Scheraga, H.A.7
-
12
-
-
34147162150
-
-
Makowska, J.; Rodziewicz-Motowidlo, S.; Baginska,K.;Makowski, M.; Vila, J. A.; Liwo, A.; Chmurzynski, L.; Scheraga, H. A. Biophys. J. 2007, 92, 2904-2917.
-
(2007)
Biophys. J
, vol.92
, pp. 2904-2917
-
-
Makowska, J.1
Rodziewicz-Motowidlo, S.2
Baginska, K.3
Makowski, M.4
Vila, J.A.5
Liwo, A.6
Chmurzynski, L.7
Scheraga, H.A.8
-
13
-
-
0036400325
-
-
Shi, Z.; Woody, R. W.; Kallenbach, N. R. Adv. Protein Chem. 2002, 62, 163-240.
-
(2002)
Adv. Protein Chem
, vol.62
, pp. 163-240
-
-
Shi, Z.1
Woody, R.W.2
Kallenbach, N.R.3
-
14
-
-
72949123785
-
-
Kumar, A.; Ramakrishnan, V.; Ranbhor, R.; Patel, K.; Durani, S. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 16435-16442.
-
(2009)
J. Phys. Chem. B
, vol.113
, pp. 16435-16442
-
-
Kumar, A.1
Ramakrishnan, V.2
Ranbhor, R.3
Patel, K.4
Durani, S.5
-
15
-
-
33744822163
-
-
Ramakrishnan, V.; Ranbhor, R.; Kumar, A.; Durani, S. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 9314-9323.
-
(2006)
J. Phys. Chem. B
, vol.110
, pp. 9314-9323
-
-
Ramakrishnan, V.1
Ranbhor, R.2
Kumar, A.3
Durani, S.4
-
16
-
-
33845197716
-
-
Ranbhor, R.; Ramakrishnan, V.; Kumar, A.; Durani, S. Biopolymers 2006, 83, 537-545.
-
(2006)
Biopolymers
, vol.83
, pp. 537-545
-
-
Ranbhor, R.1
Ramakrishnan, V.2
Kumar, A.3
Durani, S.4
-
19
-
-
31944446531
-
-
Mahalakshmi, R.; Raghthama, S.; Balaram, P. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 1125-1138.
-
(2006)
J. Am. Chem. Soc
, vol.128
, pp. 1125-1138
-
-
Mahalakshmi, R.1
Raghthama, S.2
Balaram, P.3
-
20
-
-
49149094036
-
-
Duarte, A. M. S.; van Mierlo, C. P. M.; Hemminga, M. A. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 8664-8671.
-
(2008)
J. Phys. Chem. B
, vol.112
, pp. 8664-8671
-
-
Duarte, A.M.S.1
Van Mierlo, C.P.M.2
Hemminga, M.A.3
-
21
-
-
35748974824
-
-
Anakawa, T.; Kita, Y.; Timasheff, S. N. Biophys. Chem. 2007, 131, 62-70.
-
(2007)
Biophys. Chem
, vol.131
, pp. 62-70
-
-
Anakawa, T.1
Kita, Y.2
Timasheff, S.N.3
-
24
-
-
0027594494
-
-
Karle, I. L.; Flippenánderson, L. J.; Uma, K.; Balaram, P. Biopolymers 1993, 33, 827-837.
-
(1993)
Biopolymers
, vol.33
, pp. 827-837
-
-
Karle, I.L.1
Flippenánderson, L.J.2
Uma, K.3
Balaram, P.4
-
25
-
-
33846389189
-
-
Duarte, A. M. S.; De Jong, E. R.; Wechselberger, R.; Van Mierlo, C. P. M.; Hemminga, M. A. Biochim. Biophys. Acta 2007, 1768, 218-227.
-
(2007)
Biochim. Biophys. Acta
, vol.1768
, pp. 218-227
-
-
Duarte, A.M.S.1
De Jong, E.R.2
Wechselberger, R.3
Van Mierlo, C.P.M.4
Hemminga, M.A.5
-
26
-
-
0035137732
-
-
Bellanda, M.; Peggion, E.; Burgi, R.; van Gunsteren, W.; Mammi, S. J. Pept. Res. 2001, 57, 97-106.
-
(2001)
J. Pept. Res
, vol.57
, pp. 97-106
-
-
Bellanda, M.1
Peggion, E.2
Burgi, R.3
Van Gunsteren, W.4
Mammi, S.5
-
29
-
-
21644476077
-
-
Milner-White, E. J.; Nissink, J. W. M.; Allen, F. H.; Duddy, W. J. Acta Crystallogr. 2004, D60, 1935-1942.
-
(2004)
J. Acta Crystallogr
, vol.D60
, pp. 1935-1942
-
-
Milner-White, E.J.1
Nissink, J.W.M.2
Allen, F.H.3
Duddy, W.4
-
32
-
-
73649194755
-
-
Ramachandran, G. N.; Ramakrishnan, C.; Sasisekharan, V. J. Mol. Biol. 1963, 7, 95-99.
-
(1963)
J. Mol. Biol
, vol.7
, pp. 95-99
-
-
Ramachandran, G.N.1
Ramakrishnan, C.2
Sasisekharan, V.3
-
36
-
-
0002230535
-
-
Brant, D. A.; Miller, W. G.; Flory, P. J. J. Mol. Biol. 1967, 23, 47-65.
-
(1967)
J. Mol. Biol
, vol.23
, pp. 47-65
-
-
Brant, D.A.1
Miller, W.G.2
Flory, P.J.3
-
39
-
-
0002830680
-
-
Miller, W. G.; Brant, D. A.; Flory, P. J J. Mol. Biol. 1967, 23, 67-80.
-
(1967)
J. Mol. Biol
, vol.23
, pp. 67-80
-
-
Miller, W.G.1
Brant, D.A.2
Flory, P.J.3
-
41
-
-
33750945327
-
-
Rose, G. D.; Fleming, P. J.; Banavar, J. R.; Maritan, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 16623-16633.
-
(2006)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.103
, pp. 16623-16633
-
-
Rose, G.D.1
Fleming, P.J.2
Banavar, J.R.3
Maritan, A.4
-
43
-
-
20744442020
-
-
Dill, K. A.; Truskett, T. M.; Vlachy, V.; Hribar-Lee, B. Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 2005, 34, 173-199.
-
(2005)
Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct
, vol.34
, pp. 173-199
-
-
Dill, K.A.1
Truskett, T.M.2
Vlachy, V.3
Hribar-Lee, B.4
-
45
-
-
0026723063
-
-
Leopold, P. E.; Montal, M.; Onuchic, J. N. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1992, 89, 8721-8725.
-
(1992)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.89
, pp. 8721-8725
-
-
Leopold, P.E.1
Montal, M.2
Onuchic, J.N.3
-
46
-
-
0028947257
-
-
Bryngelson, J. D.; Onuchic, J. N.; Socci, N. D.; Wolynes, P. G. Proteins 1995, 21, 167-195.
-
(1995)
Proteins
, vol.21
, pp. 167-195
-
-
Bryngelson, J.D.1
Onuchic, J.N.2
Socci, N.D.3
Wolynes, P.G.4
-
48
-
-
0034725551
-
-
Avbelj, F. J. Mol. Biol. 2000, 300, 1335-1359.
-
(2000)
J. Mol. Biol
, vol.300
, pp. 1335-1359
-
-
Avbelj, F.1
-
50
-
-
0034718590
-
-
Avbelj, F.; Luo, P.; Baldwin, R. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 10786-10791.
-
(2000)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.97
, pp. 10786-10791
-
-
Avbelj, F.1
Luo, P.2
Baldwin, R.L.3
-
52
-
-
10644250720
-
-
Avbelj, F.; Kocjan, D.; Baldwin, R. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 2004, 101, 17394-17397.
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A
, vol.101
, pp. 17394-17397
-
-
Avbelj, F.1
Kocjan, D.2
Baldwin, R.L.3
-
54
-
-
0035789518
-
-
Lindahl, E.; Hess, B.; van der Spoel, D. J. Mol. Model. 2001, 7, 306.
-
(2001)
J. Mol. Model
, vol.7
, pp. 306
-
-
Lindahl, E.1
Hess, B.2
Van Der Spoel, D.3
-
55
-
-
0003544049
-
-
Hochschulverlag AG an der ETH Zürich: Zürich
-
van Gunsteren, W. F.; Billeter, S. R.; Eising, A. A.;Hünenberger, P. H.; Krüger, P.; Mark, A. E.; Scott, W. R. P.; Tironi, I. G. Biomolecular simulation: The GROMOS96 Manual and User Guide; Hochschulverlag AG an der ETH Zürich: Zürich, 1996.
-
(1996)
Biomolecular Simulation: The GROMOS96 Manual and User Guide
-
-
Van Gunsteren, W.F.1
Billeter, S.R.2
Eising, A.A.3
Hünenberger, P.H.4
Krüger, P.5
Mark, A.E.6
Scott, W.R.P.7
Tironi, I.G.8
-
56
-
-
0442326613
-
-
Geerke, D. P.; Oostenbrink, C.; van Vegt, N. F. A.; van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 1436-1445.
-
(2004)
J. Phys. Chem. B
, vol.108
, pp. 1436-1445
-
-
Geerke, D.P.1
Oostenbrink, C.2
Van Vegt, N.F.A.3
Van Gunsteren, W.F.4
-
57
-
-
33646940952
-
-
Ryckaert, J. P.; Ciccotti, G.; Berendsen, H. J. C. J. Comput. Phys. 1977, 23, 327-341.
-
(1977)
J. Comput. Phys
, vol.23
, pp. 327-341
-
-
Ryckaert, J.P.1
Ciccotti, G.2
Berendsen, H.J.C.3
-
58
-
-
33846823909
-
-
Darden, T.; York, D.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1993, 98, 10089-10092.
-
(1993)
J. Chem. Phys
, vol.98
, pp. 10089-10092
-
-
Darden, T.1
York, D.2
Pedersen, L.3
-
59
-
-
33645961739
-
-
Essmann, U.; Perera, M. L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593.
-
(1995)
J. Chem. Phys
, vol.103
, pp. 8577-8593
-
-
Essmann, U.1
Perera, M.L.2
Berkowitz, M.L.3
Darden, T.4
Lee, H.5
Pedersen, L.G.6
-
60
-
-
0033954256
-
-
Berman, H. M.; Westbrook, J.; Feng, Z.; Gilliland, G.; Bhat, T. N.; Weissig, H.; Shindyalov, I. N.; Bourne, P. E. Nucleic Acids Res. 2000, 28, 235-242.
-
(2000)
Nucleic Acids Res
, vol.28
, pp. 235-242
-
-
Berman, H.M.1
Westbrook, J.2
Feng, Z.3
Gilliland, G.4
Bhat, T.N.5
Weissig, H.6
Shindyalov, I.N.7
Bourne, P.E.8
-
61
-
-
0033557181
-
-
Daura, X.; van Gunsteren, W. F.; Mark, A. E. Proteins: Struct., Funct., Genet. 1999, 34, 269-280.
-
(1999)
Proteins: Struct., Funct., Genet
, vol.34
, pp. 269-280
-
-
Daura, X.1
Van Gunsteren, W.F.2
Mark, A.E.3
-
62
-
-
70349559399
-
-
Wang, D.; Jaun, B.; van Gunsteren, W. F. ChemBioChem 2009, 10, 2032-2042.
-
(2009)
ChemBioChem
, vol.10
, pp. 2032-2042
-
-
Wang, D.1
Jaun, B.2
Van Gunsteren, W.F.3
|