Targeting intermediates of [FeFe]-hydrogenase by CO and CN vibrational signatures

Inorganic Chemistry

Volumn 50, Issue 9, 2011, Pages 3888-3900

  Yu, Lian ^a   Greco, Claudio ^b   Bruschi, Maurizio ^b   Ryde, Ulf ^c   De Gioia, Luca ^b   Reiher, Markus ^a  

^a ETH ZURICH   (Switzerland)

^b UNIVERSITY OF MILANO BICOCCA   (Italy)

^c LUND UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CARBON MONOXIDE; CYANIDE; HYDROGENASE; IRON HYDROGENASE; IRON SULFUR PROTEIN;

ARTICLE; CALIBRATION; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ENZYME ACTIVE SITE; INFRARED SPECTROPHOTOMETRY; METABOLISM; OXIDATION REDUCTION REACTION; VIBRATION;

CALIBRATION; CARBON MONOXIDE; CATALYTIC DOMAIN; CYANIDES; HYDROGENASE; IRON-SULFUR PROTEINS; MODELS, MOLECULAR; OXIDATION-REDUCTION; SPECTROPHOTOMETRY, INFRARED; VIBRATION;

EID: 79955372778     PISSN: 00201669     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ic102039z     Document Type: Article

References (86)

1. Tye, J. W.; Darensbourg, M. Y.; Hall, M. B. J. Comput. Chem. 2006, 27, 1454
2. Tye, J. W.; Darensbourg, M. Y.; Hall, M. B. Inorg. Chem. 2008, 47, 2380
3. Zilberman, S.; Stiefel, E. I.; Cohen, M. H.; Car, R. Inorg. Chem. 2006, 5715
4. Zilberman, S.; Stiefel, E. I.; Cohen, M. H.; Car, R. Inorg. Chem. 2007, 1153
5. Zilberman, S.; Stiefel, E. I.; Cohen, M. H.; Car, R. J. Phys. Chem. B 2006, 7049
6. Cammack, R. Nature 1999, 397, 214
7. Holm, R. H.; Kennepohl, P.; Solomon, E. I. Chem. Rev. 1996, 96, 2239
8. Frey, M. ChemBioChem 2002, 3, 153
9. Thauer, R. K.; Klein, A. R.; Hartmann, G. C. Chem. Rev. 1996, 96, 3031
10. Volbeda, A.; Charon, M. H.; Piras, C.; Hatchikian, E. C.; Frey, M.; Fontecilla-Camps, J. C. Nature 1995, 373, 580
11. Canaguier, S.; Artero, V.; Fontecave, M. Dalton Trans. 2008, 315
12. Albracht, S. P. J. Biochim. Biophys. Acta 1994, 1178, 167
13. Korbas, M.; Vogt, S.; Meyer-Klaucke, W.; Bill, E.; Lyon, E. J.; Thauer, R. K.; Shima, S. J. Biol. Chem. 2006, 30804
14. Nicolet, Y.; Cavazza, C.; Fontecilla-Camps, J. C. J. Inorg. Biochem. 2002, 91, 1
15. Peters, J. W. Curr. Opin. Struct. Biol 1999, 6, 670
16. Cao, Z.; Hall, M. B. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 3734
17. Peters, J. W.; Lanzilotta, W. N.; Lemon, B. J.; Seefeldt, L. C. Science 1998, 282, 1853
18. Nicolet, Y.; Piras, C.; Legrand, P.; Hatchikian, E. C.; Fontecilla-Camps, J. C. Structure 1999, 7, 13
19. Pierik, A. J.; Hagen, W. R.; Redeker, J. S.; Wolbert, R. B. G.; Boersma, M.; Verhagen, M. F. J. M.; Grandee, H. J.; Veeger, C.; Mutsaers, P. H. A.; Sands, R. H.; Dunham, W. R. Eur. J. Biochem. 1992, 209, 63
20. Liu, Z.-P.; Hu, P. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 5175
21. Le Cloirec, A.; Davies, S. C.; Evans, D. J.; Hughes, D. L.; Pickett, C. J.; Best, S. P.; Borg, S. Chem. Commum. 1999, 22, 2285
22. Razavet, M.; Davies, S. C.; Hughes, D. L.; Barclay, J. E.; Evans, D. J.; Fairhurst, S. A.; Liu, X.; Pickett, C. J. Dalton Trans. 2003, 586
23. Gloaguen, F.; Lawrence, J. D.; Schmidt, M.; Wilson, S. R.; Rauchfuss, T. B. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 12518
24. Zhao, X.; Georgakaki, I. P.; Miller, M. L.; Mejia-Rodriguez, R.; Chiang, C. Y.; Darensbourg, M. Y. Inorg. Chem. 2002, 41, 3917
25. Hasan, M. M.; Hursthouse, M. B.; Kabir, S. E.; Malik, K. A. Polyhedron 2001, 20, 97
26. Mejia-Rodriguez, R.; Chong, D.; Reibenspies, J. H.; Soriaga, M. P.; Darensbourg, M. Y. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 12004
27. Gloaguen, F.; Lawrence, J. D.; Rauchfuss, T. B.; Bénard, M.; Rohmer, M.-M. Inorg. Chem. 2002, 41, 6573
28. Fan, H. J.; Hall, M. B. J. Am. Chem. Soc. 2001, 3828
29. Bruschi, M.; Fantucci, P.; De Gioia, L. Inorg. Chem. 2002, 41, 1421
30. Bruschi, M.; Fantucci, P.; De Gioia, L. Inorg. Chem. 2003, 42, 4773
31. Zhou, T.; Mo, Y.; Liu, A.; Zhou, Z.; Tsai, K. R. Inorg. Chem. 2004, 43, 923
32. Zhou, T.; Mo, Y.; Zhou, Z.; Tsai, K. R. Inorg. Chem. 2005, 44, 4941
33. Zampella, G.; Greco, C.; Fantucci, P.; De Gioia, L. Inorg. Chem. 2006, 45, 4109
34. Lukin, J. A.; Ho, C. Chem. Rev. 2004, 104, 1219
35. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098
36. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822
37. Brehm, G.; Reiher, M.; Schneider, S. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 12024
38. Neugebauer, J.; Hess, B. A. J. Chem. Phys. 2003, 118, 7215
39. Reiher, M.; Brehm, G.; Schneider, S. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 734
40. Galinato, M. G. I.; Whaley, C. M.; Lehnert, N. Inorg. Chem. 2010, 49, 3201
41. Ahlrichs, R.;.; TURBOMOLE, http://www.cosmologic.de/turbomole.html.
42. Ahlrichs, R.; Bär, M.; Häser, M.; Horn, H.; Kölmel, C. Chem. Phys. Lett. 1989, 162, 165
43. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648
44. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785
45. Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1994, 11623
46. Schäfer, A.; Huber, C.; Ahlrichs, R. J. Chem. Phys. 1994, 100, 5829
47. Reiher, M.; Salomon, O.; Sellmann, D.; Hess, B. A. Chem.-Eur. J. 2001, 7, 5195
48. Reiher, M.; Neugebauer, J.; Hess, B. A. Z. Phys. Chem. 2003, 217, 91
49. Koch, W.; Holthausen, M. C. A Chemist's Guide to Density Functional Theory; Wiley-VCH: Weinheim, 2001.
50. Neugebauer, J.; Reiher, M.; Kind, C.; Hess, B. A. J. Comput. Chem. 2002, 23, 895
51. Klamt, A.; Eckert, F. Fluid Phase Equilib. 2000, 172, 43
52. Schäfer, A.; Klamt, A.; Sattel, D.; Lohrenz, J. C.; Eckert, F. Phys. Chem. Chem. Phys. 2000, 2, 2187
53. Sillanpää, A. J.; Aksela, R.; Laasonen, K. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 3382
54. Schaftenaar, G.; Noordik, J. H. J. Comput.-Aided Mol. Design 2000, 14, 123
55. Noodleman, L.; J. G. Norman, J. J. Chem. Phys. 1979, 70, 4903
56. Noodleman, L. J. Chem. Phys. 1981, 74, 5737
57. Noodleman, L.; Davidson, E. R. Chem. Phys. 1986, 109, 131
58. Herrmann, C.; Yu, L.; Reiher, M. J. Comput. Chem. 2006, 27, 1223
59. Windhager, J.; Görls, H.; Petzold, H.; Mloston, G.; Linti, G.; Weigand, W. Eur. J. Inorg. Chem. 2007, 4462
60. Silakov, A.; Wenk, B.; Reijerse, E.; Lubitz, W. Phys. Chem. Chem. Phys. 2009, 11, 6592
61. Ryde, U.; Greco, C.; De Gioia, L. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 4512
62. Nicolet, Y.; de Lacey, A. L.; Vernede, X.; Fernandez, V. M.; Hatchikian, E. C.; Fontecilla-Camps, J. C. J. Am. Chem. Soc. 2001, 1596
63. Pandey, A. S.; Harris, T. V.; Giles, L. J.; Peters, J. W.; Szilagyi, R. K. J. Am. Chem. Soc. 2008, 4533
64. Bruschi, M.; Greco, C.; Fantucci, P.; De Gioia, L. Inorg. Chem. 2008, 47, 6056
65. Fiedler, A. T.; Brunold, T. C. Inorg. Chem. 2005, 44, 9322-9334
66. Bruschi, M.; Fantucci, P.; De Gioia, L. Inorg. Chem. 2004, 43, 3733
67. Rusnak, F. M.; Adams, M. W. W.; Mortenson, L. E.; Munck, E. J. Biol. Chem. 1987, 38
68. Popescu, C. V.; Munck, E. J. Am. Chem. Soc. 1999, 7877
69. Pereira, A. S.; Tavares, P.; Moura, I.; Moura, J. J. G.; Huynh, B. H. J. Am. Chem. Soc. 2001, 2771
70. Bennet, B.; Lemon, B. J.; Peters, J. W. Biochemistry 2000, 7455-7460
71. Albracht, S. P. J.; Roseboom, W.; Hatchikian, E. C. J. Biol. Inorg. Chem. 2006, 88
72. Lacey, A. L. D.; Stadler, C.; Cavazza, C.; Hatchikian, E. C.; Fernandez, V. M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 11232
73. Roseboom, W.; Lacey, A. L. D.; Fernandez, V. M.; Hatchikian, E. C.; Albracht, S. P. J. J. Biol. Inorg. Chem. 2006, 102
74. Greco, C.; Bruschi, M.; Heimdal, J.; Fantucci, P.; De Gioia, L.; Ryde, U. Inorg. Chem. 2007, 7256
75. Silakov, A.; Kamp, C.; Reijerse, E.; Happe, T.; Lubitz, W. Biochemistry 2009, 48, 7780
76. Greco, C.; Bruschi, M.; De Gioia, L.; Ryde, U. Inorg. Chem. 2007, 46, 5911
77. Reiher, M.; Neugebauer, J. J. Chem. Phys. 2003, 118, 1634
78. Herrmann, C.; Neugebauer, J.; Reiher, M. J. Comput. Chem. 2008, 29, 2460
79. Justice, A. K.; Rauchfuss, T. B.; Wilson, S. R. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 6152
80. Boyke, C. A.; van der Vlugt, J. I.; Rauchfuss, T. B.; Wilson, S. R.; Zampella, G.; De Gioia, L. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 11010
81. Schmidt, M.; Contakes, S.; Rauchfuss, T. B. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9736
82. Georgakaki, I. P.; Miller, M. L.; Darensbourg, M. Y. Inorg. Chem. 2003, 42, 2489
83. Singleton, M. L.; Bhuvanesh, N.; Reibenspies, J. H.; Darensbourg, M. Y. Angew. Chem., Int. Ed. 2008, 47, 9492
84. Lyon, E. J.; Georgakaki, I. P.; Reibenspies, J. H.; Darensbourg, M. Y. Angew. Chem., Int. Ed. 1999, 38, 3178
85. Li, H.; Rauchfuss, T. B. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 726
86. Lawrence, J. D.; Li, H.; Rauchfuss, T. B.; Bénard, M.; Rohmer, M.-M. Angew. Chem., Int. Ed. 2001, 40, 1768