-
2
-
-
0024354291
-
-
Futai, M.; Noumi, T.; Maeda, M. Annu. Rev. Biochem. 1989, 58, 111-136
-
(1989)
Annu. Rev. Biochem.
, vol.58
, pp. 111-136
-
-
Futai, M.1
Noumi, T.2
Maeda, M.3
-
8
-
-
0032478354
-
-
Kinosita, K., Jr.; Yasuda, R.; Noji, H.; Ishiwata, S.; Yoshida, M. Cell 1998, 93, 21-24
-
(1998)
Cell
, vol.93
, pp. 21-24
-
-
Kinosita Jr., K.1
Yasuda, R.2
Noji, H.3
Ishiwata, S.4
Yoshida, M.5
-
9
-
-
26844546402
-
-
Gao, Y. Q.; Yang, W.; Karplus, M. Cell 2005, 123, 195-205
-
(2005)
Cell
, vol.123
, pp. 195-205
-
-
Gao, Y.Q.1
Yang, W.2
Karplus, M.3
-
16
-
-
0032568695
-
-
Yasuda, R.; Noji, H.; Kinosita, K., Jr.; Yoshida, M. Cell 1998, 93, 1117-1124
-
(1998)
Cell
, vol.93
, pp. 1117-1124
-
-
Yasuda, R.1
Noji, H.2
Kinosita Jr., K.3
Yoshida, M.4
-
17
-
-
0035912221
-
-
Yasuda, R.; Noji, H.; Yoshida, M.; Kinosita, K., Jr.; Itoh, H. Nature 2001, 410, 898-904
-
(2001)
Nature
, vol.410
, pp. 898-904
-
-
Yasuda, R.1
Noji, H.2
Yoshida, M.3
Kinosita Jr., K.4
Itoh, H.5
-
18
-
-
0345166868
-
-
Shimabukuro, K.; Yasuda, R.; Muneyuki, E.; Hara, K. Y.; Kinosita, K., Jr.; Yoshida, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 14731-14736
-
(2003)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.100
, pp. 14731-14736
-
-
Shimabukuro, K.1
Yasuda, R.2
Muneyuki, E.3
Hara, K.Y.4
Kinosita Jr., K.5
Yoshida, M.6
-
19
-
-
0028114231
-
-
Abrahams, J. P.; Leslie, A. G.; Lutter, R.; Walker, J. E. Nature 1994, 370, 621-628
-
(1994)
Nature
, vol.370
, pp. 621-628
-
-
Abrahams, J.P.1
Leslie, A.G.2
Lutter, R.3
Walker, J.E.4
-
20
-
-
0030934380
-
-
Noji, H.; Yasuda, R.; Yoshida, M.; Kinosita, K., Jr. Nature 1997, 386, 299-302
-
(1997)
Nature
, vol.386
, pp. 299-302
-
-
Noji, H.1
Yasuda, R.2
Yoshida, M.3
Kinosita Jr., K.4
-
21
-
-
0742270832
-
-
Itoh, H.; Takahashi, A.; Adachi, K.; Noji, H.; Yasuda, R.; Yoshida, M.; Kinosita, K., Jr. Nature 2004, 427, 465-468
-
(2004)
Nature
, vol.427
, pp. 465-468
-
-
Itoh, H.1
Takahashi, A.2
Adachi, K.3
Noji, H.4
Yasuda, R.5
Yoshida, M.6
Kinosita Jr., K.7
-
23
-
-
34447628890
-
-
Adachi, K.; Oiwa, K.; Nishizaka, T.; Furuike, S.; Noji, H.; Itoh, H.; Yoshida, M.; Kinosita, K., Jr. Cell 2007, 130, 309-321
-
(2007)
Cell
, vol.130
, pp. 309-321
-
-
Adachi, K.1
Oiwa, K.2
Nishizaka, T.3
Furuike, S.4
Noji, H.5
Itoh, H.6
Yoshida, M.7
Kinosita Jr., K.8
-
24
-
-
39349094544
-
-
Furuike, S.; Hossain, M. D.; Maki, Y.; Adachi, K.; Suzuki, T.; Kohori, A.; Itoh, H.; Yoshida, M.; Kinosita, K., Jr. Science 2008, 319, 955-958
-
(2008)
Science
, vol.319
, pp. 955-958
-
-
Furuike, S.1
Hossain, M.D.2
Maki, Y.3
Adachi, K.4
Suzuki, T.5
Kohori, A.6
Itoh, H.7
Yoshida, M.8
Kinosita Jr., K.9
-
25
-
-
58149280492
-
-
Hossain, M. D.; Furuike, S.; Maki, Y.; Adachi, K.; Suzuki, T.; Kohori, A.; Itoh, H.; Yoshida, M.; Kinosita, K., Jr. Biophys. J. 2008, 95, 4837-4844
-
(2008)
Biophys. J.
, vol.95
, pp. 4837-4844
-
-
Hossain, M.D.1
Furuike, S.2
Maki, Y.3
Adachi, K.4
Suzuki, T.5
Kohori, A.6
Itoh, H.7
Yoshida, M.8
Kinosita Jr., K.9
-
26
-
-
11444269939
-
-
Yagi, H.; Tsujimoto, T.; Yamazaki, T.; Yoshida, M.; Akutsu, H. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16632-16638
-
(2004)
J. Am. Chem. Soc.
, vol.126
, pp. 16632-16638
-
-
Yagi, H.1
Tsujimoto, T.2
Yamazaki, T.3
Yoshida, M.4
Akutsu, H.5
-
27
-
-
59049084745
-
-
Yagi, H.; Kajiwara, N.; Iwabuchi, T.; Izumi, K.; Yoshida, M.; Akutsu, H. J. Biol. Chem. 2009, 284, 2374-2382
-
(2009)
J. Biol. Chem.
, vol.284
, pp. 2374-2382
-
-
Yagi, H.1
Kajiwara, N.2
Iwabuchi, T.3
Izumi, K.4
Yoshida, M.5
Akutsu, H.6
-
28
-
-
0033975117
-
-
Masaike, T.; Mitome, N.; Noji, H.; Muneyuki, E.; Yasuda, R.; Kinosita, K., Jr.; Yoshida, M. J. Exp. Biol. 2000, 203, 1-8
-
(2000)
J. Exp. Biol.
, vol.203
, pp. 1-8
-
-
Masaike, T.1
Mitome, N.2
Noji, H.3
Muneyuki, E.4
Yasuda, R.5
Kinosita Jr., K.6
Yoshida, M.7
-
32
-
-
0000220710
-
Nudged Elastic Band Method for Finding Minimum Energy Paths of Transitions
-
Berne B.J. Cicotti G. Coker D.F. Eds.; World Scientific: Rivers Edge, NJ
-
Jonsson, H.; Mills, G.; Jacobsen, K. W. Nudged Elastic Band Method for Finding Minimum Energy Paths of Transitions. In Classical and Quantum Dynamics in Condensed Phase Simulations; Berne, B. J.; Cicotti, G.; Coker, D. F., Eds.; World Scientific: Rivers Edge, NJ, 1998; pp 385 - 404.
-
(1998)
Classical and Quantum Dynamics in Condensed Phase Simulations
, pp. 385-404
-
-
Jonsson, H.1
Mills, G.2
Jacobsen, K.W.3
-
33
-
-
0942268404
-
-
Chu, J. W.; Trout, B. L.; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12708-12717
-
(2003)
J. Chem. Phys.
, vol.119
, pp. 12708-12717
-
-
Chu, J.W.1
Trout, B.L.2
Brooks, B.R.3
-
38
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187-217
-
(1983)
J. Comput. Chem.
, vol.4
, pp. 187-217
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
39
-
-
84986519238
-
-
Kumar, S.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A.; Rosenberg, J. M. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021
-
(1992)
J. Comput. Chem.
, vol.13
, pp. 1011-1021
-
-
Kumar, S.1
Bouzida, D.2
Swendsen, R.H.3
Kollman, P.A.4
Rosenberg, J.M.5
-
40
-
-
34347226731
-
-
Bowler, M. W.; Montgomery, M. G.; Leslie, A. G. W.; Walker, J. E. J. Biol. Chem. 2007, 282, 14238-14242
-
(2007)
J. Biol. Chem.
, vol.282
, pp. 14238-14242
-
-
Bowler, M.W.1
Montgomery, M.G.2
Leslie, A.G.W.3
Walker, J.E.4
-
43
-
-
3142714765
-
-
MacKerell, A. D., Jr.; Feig, M.; Brooks, C. L., III. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1400-1415
-
(2004)
J. Comput. Chem.
, vol.25
, pp. 1400-1415
-
-
Mackerell Jr., A.D.1
Feig, M.2
Brooks III, C.L.3
-
44
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935
-
(1983)
J. Chem. Phys.
, vol.79
, pp. 926-935
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
45
-
-
33645961739
-
-
Essmann, U.; Perera, L.; Berkowitz, M. L.; Darden, T.; Lee, H.; Pedersen, L. G. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8593
-
(1995)
J. Chem. Phys.
, vol.103
, pp. 8577-8593
-
-
Essmann, U.1
Perera, L.2
Berkowitz, M.L.3
Darden, T.4
Lee, H.5
Pedersen, L.G.6
-
46
-
-
0028356171
-
-
Amano, T.; Tozawa, K.; Yoshida, M.; Murakami, H. FEBS Lett. 1994, 348, 93-98
-
(1994)
FEBS Lett.
, vol.348
, pp. 93-98
-
-
Amano, T.1
Tozawa, K.2
Yoshida, M.3
Murakami, H.4
-
47
-
-
0030614445
-
-
Löbau, S.; Weber, J.; Wilke-Mounts, S.; Senior, A. E. J. Biol. Chem. 1997, 272, 3648-3656
-
(1997)
J. Biol. Chem.
, vol.272
, pp. 3648-3656
-
-
Löbau, S.1
Weber, J.2
Wilke-Mounts, S.3
Senior, A.E.4
-
48
-
-
34548503612
-
-
Ariga, T.; Muneyuki, E.; Yoshida, M. Nat. Struct. Mol. Biol. 2007, 14, 841-846
-
(2007)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.14
, pp. 841-846
-
-
Ariga, T.1
Muneyuki, E.2
Yoshida, M.3
-
49
-
-
0033564733
-
-
Nadanaciva, S.; Weber, J.; Senior, A. E. Biochemistry 1999, 38, 7670-7677
-
(1999)
Biochemistry
, vol.38
, pp. 7670-7677
-
-
Nadanaciva, S.1
Weber, J.2
Senior, A.E.3
-
50
-
-
16344395751
-
-
Dittrich, M.; Hayashi, S.; Schulten, K. Biophys. J. 2004, 87, 2954-2967
-
(2004)
Biophys. J.
, vol.87
, pp. 2954-2967
-
-
Dittrich, M.1
Hayashi, S.2
Schulten, K.3
-
52
-
-
77951707330
-
-
Kobayashi, M.; Akutsu, H.; Suzuki, T.; Yoshida, M.; Yagi, H. J. Mol. Biol. 2010, 398, 189-199
-
(2010)
J. Mol. Biol.
, vol.398
, pp. 189-199
-
-
Kobayashi, M.1
Akutsu, H.2
Suzuki, T.3
Yoshida, M.4
Yagi, H.5
-
55
-
-
4143067019
-
-
Armen, R. S.; DeMarco, M. L.; Alonso, D. O.; Daggett, V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 11622-11627
-
(2004)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.101
, pp. 11622-11627
-
-
Armen, R.S.1
Demarco, M.L.2
Alonso, D.O.3
Daggett, V.4
-
56
-
-
33646191816
-
-
Shimabukuro, K.; Muneyuki, E.; Yoshida, M. Biophys. J. 2006, 90, 1028-1032
-
(2006)
Biophys. J.
, vol.90
, pp. 1028-1032
-
-
Shimabukuro, K.1
Muneyuki, E.2
Yoshida, M.3
-
57
-
-
69249141416
-
-
Enoki, S.; Watanabe, R.; Iino, R.; Noji, H. J. Biol. Chem. 2009, 284, 23169-23176
-
(2009)
J. Biol. Chem.
, vol.284
, pp. 23169-23176
-
-
Enoki, S.1
Watanabe, R.2
Iino, R.3
Noji, H.4
-
58
-
-
45149095736
-
-
Yoshidome, T.; Kinoshita, M.; Hirota, S.; Baden, N.; Terazima, M. J. Chem. Phys. 2008, 128, 225104(1-9)
-
(2008)
J. Chem. Phys.
, vol.128
, pp. 2251041-9
-
-
Yoshidome, T.1
Kinoshita, M.2
Hirota, S.3
Baden, N.4
Terazima, M.5
-
61
-
-
33846798356
-
-
Foulkes-Murzycki, J. E.; Scott, W. R.; Schiffer, C. A. Structure 2007, 15, 225-233
-
(2007)
Structure
, vol.15
, pp. 225-233
-
-
Foulkes-Murzycki, J.E.1
Scott, W.R.2
Schiffer, C.A.3
-
62
-
-
0027317040
-
-
Weber, J.; Wilke-Mounts, S.; Lee, R. S.; Grell, E.; Senior, A. E. J. Biol. Chem. 1993, 268, 20126-20133
-
(1993)
J. Biol. Chem.
, vol.268
, pp. 20126-20133
-
-
Weber, J.1
Wilke-Mounts, S.2
Lee, R.S.3
Grell, E.4
Senior, A.E.5
-
63
-
-
37849051356
-
-
Watanabe, R.; Iino, R.; Shimabukuro, K.; Yoshida, M.; Noji, H. EMBO Rep. 2008, 9, 84-90
-
(2008)
EMBO Rep.
, vol.9
, pp. 84-90
-
-
Watanabe, R.1
Iino, R.2
Shimabukuro, K.3
Yoshida, M.4
Noji, H.5
-
64
-
-
57149107555
-
-
Masaike, T.; Koyama-Horibe, F.; Oiwa, K.; Yoshida, M.; Nishizaka, T. Nat. Struct. Mol. Biol. 2008, 15, 1326-1333
-
(2008)
Nat. Struct. Mol. Biol.
, vol.15
, pp. 1326-1333
-
-
Masaike, T.1
Koyama-Horibe, F.2
Oiwa, K.3
Yoshida, M.4
Nishizaka, T.5
-
65
-
-
0035838982
-
-
Menz, R. I.; Walker, J. E.; Leslie, A. G. Cell 2001, 106, 331-341
-
(2001)
Cell
, vol.106
, pp. 331-341
-
-
Menz, R.I.1
Walker, J.E.2
Leslie, A.G.3
-
66
-
-
0035923515
-
-
Hirono-Hara, Y.; Noji, H.; Nishiura, M.; Muneyuki, E.; Hara, K. Y.; Yasuda, R.; Kinosita, K., Jr.; Yoshida, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 13649-13654
-
(2001)
Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.
, vol.98
, pp. 13649-13654
-
-
Hirono-Hara, Y.1
Noji, H.2
Nishiura, M.3
Muneyuki, E.4
Hara, K.Y.5
Yasuda, R.6
Kinosita Jr., K.7
Yoshida, M.8
|