Extraction of lifetime distributions from fluorescence decays with application to DNA-base analogues

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 13, Issue 9, 2011, Pages 3819-3830

  Fogarty, Aoife C ^a   Jones, Anita C ^a   Camp, Philip J ^a  

^a UNIVERSITY OF EDINBURGH   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

2 AMINOPURINE; DNA; FLUORESCENT DYE; RHODAMINE; RHODAMINE 6G;

ARTICLE; CHEMISTRY; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; TIME;

2-AMINOPURINE; DNA; FLUORESCENCE RESONANCE ENERGY TRANSFER; FLUORESCENT DYES; NUCLEIC ACID HYBRIDIZATION; RHODAMINES; TIME FACTORS;

EID: 79952437107     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0cp01779e     Document Type: Article

References (42)

1. D. R. James W. R. Ware Chem. Phys. Lett. 1985 120 455 459
2. J. R. Alcala E. Gratton F. G. Prendergast Biophys. J. 1987 51 587 596
3. A. Siemiarczuk W. R. Ware J. Phys. Chem. 1987 91 3677 3682
4. A. Siemiarczuk W. R. Ware J. Phys. Chem. 1989 93 7609 7618
5. Y. S. Liu W. R. Ware J. Phys. Chem. 1993 97 5980 5986
6. J. R. Lakowicz H. Cherek I. Gryczynski N. Joshi M. L. Johnson Biophys. Chem. 1987 28 35 50
7. J. R. Alcala E. Gratton F. G. Prendergast Biophys. J. 1987 51 597 604
8. W. J. Albery P. N. Bartlett C. P. Wilde J. R. Darwent J. Am. Chem. Soc. 1985 107 1854 1858
9. G. Verbeek A. Vaes M. Van der Auweraer F. C. De Schryver C. Geelen D. Terrell S. De Meutter Macromolecules 1993 26 472 478
10. G. Verbeek A. Vaes M. Van der Auweraer F. C. De Schryver C. Geelen D. Terrell S. De Meutter Macromolecules 1993 26 4074
11. S. Bharill P. Sarkar J. D. Ballin I. Gryczynski G. M. Wilson Anal. Biochem. 2008 377 141 149
12. D. R. James W. R. Ware Chem. Phys. Lett. 1986 126 7 11
13. A. K. Livesey J. C. Brochon Biophys. J. 1987 52 693 706
14. A. Siemiarczuk B. D. Wagner W. R. Ware J. Phys. Chem. 1990 94 1661 1666
15. M. Abramowitz and I. A. Stegun, Handbook of Mathematical Functions, Dover Publications, Inc., New York, 1965
16. R. K. Neely D. Daujotyte S. Grazulis S. W. Magennis D. T. F. Dryden S. Klimaauskas A. C. Jones Nucleic Acids Res. 2005 33 6953 6960
17. T. M. Nordlund S. Andersson L. Nilsson R. Rigler A. Gräslund L. W. McLaughlin Biochemistry 1989 28 9095 9103
18. R. A. Hochstrasser T. E. Carver L. C. Sowers D. P. Millar Biochemistry 1994 33 11971 11979
19. T. Lenz E. Y. M. Bonnist G. Pljevaljić R. K. Neely D. T. F. Dryden A. J. Scheidig A. C. Jones E. Weinhold J. Am. Chem. Soc. 2007 129 6240 6248
20. K. D. Raney L. C. Sowers D. P. Millar S. J. Benkovic Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1994 91 6644 6648
21. M. Menger T. Tuschl F. Eckstein D. Porschke Biochemistry 1996 35 14710 14716
22. J. M. Beechem M. R. Otto L. B. Bloom R. Eritja L. J. Reha-Krantz M. F. Goodman Biochemistry 1998 37 10144 10155
23. W. R. Ware L. J. Doemeny T. L. Nemzek J. Phys. Chem. 1973 77 2038 2048
24. A. E. McKinnon A. G. Szabo D. R. Miller J. Phys. Chem. 1977 81 1564 1570
25. W. H. Press, B. P. Flannery, S. A. Teukolsky and W. T. Vetterling, Numerical Recipes in FORTRAN 77: The Art of Scientific Computing, Cambridge University Press, Cambridge, 2nd edn, 1993
26. R. Luchowski Z. Gryczynski P. Sarkar J. Borejdo M. Szabelski P. Kapusta I. Gryczynski Rev. Sci. Instrum. 2009 80 033109
27. J. Vee A. A. Kowalczyk R. E. Dale Rev. Sci. Instrum. 1993 64 3403 3412
28. J. Vee A. A. Kowalczyk L. Davenport R. E. Dale Rev. Sci. Instrum. 1993 64 3413 3424
29. K. Binder and D. P. Landau, A Guide to Monte Carlo Simulations in Statistical Physics, Cambridge University Press, Cambridge, 2nd edn, 2005
30. M. Lee J. Tang R. Hochstrasser Chem. Phys. Lett. 2001 344 501 508
31. V. Z. Marmarelis Ann. Biomed. Eng. 1993 21 573 589
32. J.-M. I. Maarek L. Marcu W. J. Snyder W. S. Grundfest Photochem. Photobiol. 2000 71 178 187
33. D. Magde G. E. Rojas P. G. Seybold Photochem. Photobiol. 1999 70 737 744
34. D. Magde R. Wong P. G. Seybold Photochem. Photobiol. 2002 75 327 334
35. R. K. Neely A. C. Jones J. Am. Chem. Soc. 2006 128 15952 15953
36. M. A. O'Neill J. K. Barton J. Am. Chem. Soc. 2004 126 11471 11483
37. M. A. O'Neill J. K. Barton J. Am. Chem. Soc. 2004 126 13234 13235
38. C. R. Guest R. A. Hochstrasser L. C. Sowers D. P. Millar Biochemistry 1991 30 3271 3279
39. E. L. Rachofsky R. Osman J. B. A. Ross Biochemistry 2001 40 946 956
40. J. R. Lakowicz, Principles of Fluorescence Spectroscopy, Springer, New York, 3rd edn, 2006
41. O. J. Rolinski D. J. S. Birch J. Chem. Phys. 2000 112 8923 8933
42. O. J. Rolinski D. J. S. Birch L. J. McCartney J. C. Pickup Chem. Phys. Lett. 2000 324 95 100