Thermodynamic stability of Hoogsteen and Watson-Crick base pairs in the presence of histone H3-mimicking peptide

Chemical Communications

Volumn 47, Issue 10, 2011, Pages 2790-2792

  Pramanik, Smritimoy ^a   Nakamura, Kaori ^a   Usui, Kenji ^a   Nakano, Shu Ichi ^a   Saxena, Sarika ^a   Matsui, Jun ^a   Miyoshi, Daisuke ^a   Sugimoto, Naoki ^a  

^a KONAN UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

HISTONE H3; PEPTIDE;

ARTICLE; BASE PAIRING; HOOGSTEEN BASE PAIR; MOLECULAR INTERACTION; PROTEIN DNA INTERACTION; THERMODYNAMICS; THERMOSTABILITY; WATSON CRICK BASE PAIR;

EID: 79951889910     PISSN: 13597345     EISSN: 1364548X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0cc05776b     Document Type: Article

References (24)

1. K. Luger, A. W. Mader, R. K. Richmond, D. F. Sargent, T. J. Richmond, Nature 1997, 389, 251-260
2. G. Arents, R. W. Burlingame, B. C. Wang, W. E. Love, E. N. Moudrianakis, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1991, 88, 10148-10152
3. T. J. Richmond, J. T. Finch, B. Rushton, D. Rhodes, A. Klug, Nature 1984, 311, 532-537
4. G. Felsenfeld, M. Groudine, Nature 2003, 421, 448-453
5. J. S. Choy, S. Wei, J. Y. Lee, S. Tan, S. Chu, T.-H. Lee, J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 1782-1783
6. X. Cheng, R. M. Blumenthal, Biochemistry 2010, 49, 2999-3008
7. T. Jenuwein, C. D. Allis, Science 2001, 293, 1074-1080
8. A. T. Phan, V. Kuryavyi, D. J. Patel, Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 288-298
9. Y. H. Wang, S. Amirhaeri, S. Kang, R. D. Wells, J. D. Griffith, Science 1994, 265, 669-671
10. J. S. Godde, A. P. Wolffe, J. Biol. Chem. 1996, 271, 15222-15229
11. D. Miyoshi, K. Nakamura, H. T. Karimata, T. Ohmichi, N. Sugimoto, J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 3522-3531
12. A. P. Wolffe, Chromatin: Structure and Function, 3rd edn, Academic Press, New York
13. L. A. Ingerman, M. E. Cuellar, M. L. Waters, Chem. Commun. 2010, 46, 1839-1841
14. G. Arya, T. Schlick, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2006, 103, 16236-16241
15. G. Arya, T. Schlick, J. Phys. Chem. A 2009, 113, 4045-4059
16. C. Tse, J. C. Hansen, Biochemistry 1997, 36, 11381-11388
17. J. C. Hansen, C. Tse, A. P. Wolffe, Biochemistry 1998, 37, 17637-17641
18. D. Angelov, J. M. Vitolo, V. Mutskov, S. Dimitrov, J. J. Hayes, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2001, 98, 6599-6604
19. A. Arora, C. Balasubramanian, N. Kumar, S. Agrawal, R. P. Ojha, S. Maiti, FEBS J. 2008, 275, 3971-3983
20. J. L. Mergny, J. Li, L. Lacroix, S. Amrane, J. B. Chaires, Nucleic Acids Res. 2005, 33, e138
21. L. Arcesi, G. L. Penna, A. Perico, Biopolymers 2007, 86, 127-135
22. N. Korolev, A. P. Lyubartsev, L. Nordenskiöld, Biophys. J. 2006, 90, 4305-4316
23. J. Sun, Q. Zhang, T. Schlick, Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005, 102, 8180-818
24. L. Hong, G. P. Schroth, H. R. Matthews, P. Yau, E. M. Bradbury, J. Biol. Chem. 1993, 268, 305-314