Biological identification of peptides that specifically bind to poly(phenylene vinylene) surfaces: Recognition of the branched or linear structure of the conjugated polymer

Langmuir

Volumn 26, Issue 22, 2010, Pages 17278-17285

  Ejima, Hirotaka ^a   Matsuno, Hisao ^a,c   Serizawa, Takeshi ^b  

^a UNIVERSITY OF TOKYO   (Japan)

^b UNIVERSITY OF TOKYO   (Japan)

^c KYUSHU UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AFFINITY CONSTANTS; AROMATIC AMINO ACID; BIOLOGICAL IDENTIFICATION; BRANCHED STRUCTURES; CIRCULAR DICHROISM SPECTROMETRIES; HELICAL CONFORMATION; HYPERBRANCHED; LINEAR STRUCTURES; PEPTIDE SEQUENCES; PHAGE DISPLAY; POLYPROLINE; TYPE II;

AMINO ACIDS; AROMATIC COMPOUNDS; DICHROISM; POLYMER BLENDS; SURFACE PLASMON RESONANCE;

PEPTIDES;

OLIGOPEPTIDE; PEPTIDE LIBRARY; POLY(4 PHENYLENEVINYLENE); POLY(4-PHENYLENEVINYLENE); POLYVINYL DERIVATIVE;

AMINO ACID SEQUENCE; ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; ENZYME SPECIFICITY; ISOMERISM; METABOLISM; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; SURFACE PLASMON RESONANCE; SURFACE PROPERTY; SYNTHESIS;

AMINO ACID SEQUENCE; ISOMERISM; MODELS, MOLECULAR; OLIGOPEPTIDES; PEPTIDE LIBRARY; POLYVINYLS; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; SUBSTRATE SPECIFICITY; SURFACE PLASMON RESONANCE; SURFACE PROPERTIES;

EID: 78650404445     PISSN: 07437463     EISSN: 15205827     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/la102018f     Document Type: Article

References (64)

1. Zheng, M.; Jagota, A.; Strano, M. S.; Santos, A. P.; Barone, P.; Chou, S. G.; Diner, B. A.; Dresselhaus, M. S.; McLean, R. S.; Onoa, G. B.; Samsonidze, G. G.; Semke, E. D.; Usrey, M.; Walls, D. J. Science 2003, 302, 1545-1548.
2. Tu, X. M.; Manohar, S.; Jagota, A.; Zheng, M. Nature 2009, 460, 250-253.
3. Simeonov, A.; Matsushita, M.; Juban, E. A.; Thompson, E. H. Z.; Hoffman, T. Z.; Beuscher, A. E.; Taylor, M. J.; Wirsching, P.; Rettig, W.; McCusker, J. K.; Stevens, R. C.; Millar, D. P.; Schultz, P. G.; Lerner, R. A.; Janda, K. D. Science 2000, 290, 307-313.
4. Debler, E. W.; Kaufmann, G. F.; Meijler, M. M.; Heine, A.; Mee, J. M.; Pljevaljcic, G.; Di Bilio, A. J.; Schultz, P. G.; Millar, D. P.; Janda, K. D.; Wilson, I. A.; Gray, H. B.; Lerner, R. A. Science 2008, 319, 1232-1235.
5. Matsushita, M.; Meijler, M. M.; Wirsching, P.; Lerner, R. A.; Janda, K. D. Org. Lett. 2005, 7, 4943-4946.
6. Nam, K. T.; Kim, D. W.; Yoo, P. J.; Chiang, C. Y.; Meethong, N.; Hammond, P. T.; Chiang, Y. M.; Belcher, A. M. Science 2006, 312, 885-888.
7. Lee, Y. J.; Yi, H.; Kim, W. J.; Kang, K.; Yun, D. S.; Strano, M. S.; Ceder, G.; Belcher, A. M. Science 2009, 324, 1051-1055.
8. Hoogenboom, H. R.; de Bruine, A. P.; Hufton, S. E.; Hoet, R. M.; Arends, J. W.; Roovers, R. C. Immunotechnology 1998, 4, 1-20.
9. Wilson, D. S.; Szostak, J. W. Annu. Rev. Biochem. 1999, 68, 611-647.
10. Smith, G. P. Science 1985, 228, 1315-1317.
11. Wittrup, K. D. Curr. Opin. Biotechnol. 2001, 12, 395-399.
12. Sarikaya, M.; Tamerler, C.; Jen, A. K. Y.; Schulten, K.; Baneyx, F. Nat. Mater. 2003, 2, 577-585.
13. Sarikaya, M.; Tamerler, C.; Schwartz, D. T.; Baneyx, F. O. Annu. Rev. Mater. Res. 2004, 34, 373-408.
14. Baneyx, F.; Schwartz, D. T. Curr. Opin. Biotechnol. 2007, 18, 312-317.
15. Brown, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1992, 89, 8651-8655.
16. Sano, K. I.; Shiba, K. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 14234-14235.
17. Brown, S. Nat. Biotechnol. 1997, 15, 269-272.
18. Naik, R. R.; Stringer, S. J.; Agarwal, G.; Jones, S. E.; Stone, M. O. Nat. Mater. 2002, 1, 169-172.
19. Brown, S.; Sarikaya, M.; Johnson, E. J. Mol. Biol. 2000, 299, 725-735.
20. Tamerler, C.; Oren, E. E.; Duman, M.; Venkatasubramanian, E.; Sarikaya, M. Langmuir 2006, 22, 7712-7718.
21. Tamerler, C.; Duman, M.; Oren, E. E.; Gungormus, M.; Xiong, X. R.; Kacar, T.; Parviz, B. A.; Sarikaya, M. Small 2006, 2, 1372-1378.
22. Hnilova, M.; Oren, E. E.; Seker, U. O. S.; Wilson, B. R.; Collino, S.; Evans, J. S.; Tamerler, C.; Sarikaya, M. Langmuir 2008, 24, 12440-12445.
23. So, C. R.; Tamerler, C.; Sarikaya, M. Angew. Chem., Int. Ed. 2009, 48, 5174-5177.
24. Seker, U. O. S.; Wilson, B.; Sahin, D.; Tamerler, C.; Sarikaya, M. Biomacromolecules 2009, 10, 250-257.
25. Kacar, T.; Zin, M. T.; So, C.; Wilson, B.; Ma, H.; Gul-Karaguler, N.; Jen, A. K. Y.; Sarikaya, M.; Tamerler, C. Biotechnol. Bioeng. 2009, 103, 696-705.
26. Whaley, S. R.; English, D. S.; Hu, E. L.; Barbara, P. F.; Belcher, A. M. Nature 2000, 405, 665-668.
27. Lee, S. W.; Mao, C. B.; Flynn, C. E.; Belcher, A. M. Science 2002, 296, 892-895.
28. Reiss, B. D.; Mao, C. B.; Solis, D. J.; Ryan, K. S.; Thomson, T.; Belcher, A. M. Nano Lett. 2004, 4, 1127-1132.
29. Wang, S. Q.; Humphreys, E. S.; Chung, S. Y.; Delduco, D. F.; Lustig, S. R.; Wang, H.; Parker, K. N.; Rizzo, N. W.; Subramoney, S.; Chiang, Y. M.; Jagota, A. Nat. Mater. 2003, 2, 196-200.
30. Kase, D.; Kulp, J. L.; Yudasaka, M.; Evans, J. S.; Iijima, S.; Shiba, K. Langmuir 2004, 20, 8939-8941.
31. Su, Z. D.; Leung, T.; Honek, J. F. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 23623-23627.
32. Su, Z.; Mui, K.; Daub, E.; Leung, T.; Honek, J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 14411-14417.
33. Zheng, L. F.; Jain, D.; Burke, P. J. Phys. Chem. C 2009, 113, 3978-3985.
34. Adey, N. B.; Mataragnon, A. H.; Rider, J. E.; Carter, J. M.; Kay, B. K. Gene 1995, 156, 27-31.
35. Berglund, J.; Lindbladh, C.; Nicholls, I. A.; Mosbach, K. Anal. Commun. 1998, 35, 3-7.
36. Sanghvi, A. B.; Miller, K. P. H.; Belcher, A. M.; Schmidt, C. E. Nat. Mater. 2005, 4, 496-502.
37. Watanabe, H.; Tsumoto, K.; Taguchi, S.; Yamashita, K.; Doi, Y.; Nishimiya, Y.; Kondo, H.; Umetsu, M.; Kumagai, I. Bioconjugate Chem. 2007, 18, 645-651.
38. Serizawa, T.; Sawada, T.; Matsuno, H.; Matsubara, T.; Sato, T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 13780-13781.
39. Serizawa, T.; Sawada, T.; Kitayama, T. Angew. Chem., Int. Ed. 2007, 46, 723-726.
40. Serizawa, T.; Sawada, T.; Matsuno, H. Langmuir 2007, 23, 11127-11133.
41. Serizawa, T.; Techawanitchai, P.; Matsuno, H. ChemBioChem 2007, 8, 989-993.
42. Matsuno, H.; Sekine, J.; Yajima, H.; Serizawa, T. Langmuir 2008, 24, 6399-6403.
43. Matsuno, H.; Date, T.; Kubo, Y.; Yoshino, Y.; Tanaka, N.; Sogabe, A.; Kuroita, T.; Serizawa, T. Chem. Lett. 2009, 38, 834-835.
44. Burroughes, J. H.; Bradley, D. D. C.; Brown, A. R.; Marks, R. N.; Mackay, K.; Friend, R. H.; Burns, P. L.; Holmes, A. B. Nature 1990, 347, 539-541.
45. Yu, G.; Gao, J.; Hummelen, J. C.; Wudl, F.; Heeger, A. J. Science 1995, 270, 1789-1791.
46. Feng, F. D.; He, F.; An, L. L.; Wang, S.; Li, Y. H.; Zhu, D. B. Adv. Mater. 2008, 20, 2959-2964.
47. Katayama, H.; Nagao, M.; Moriguchi, R.; Ozawa, F. J. Organomet. Chem. 2003, 676, 49-54.
48. Katayama, H.; Nagao, M.; Nishimura, T.; Matsui, Y.; Umeda, K.; Akamatsu, K.; Tsuruoka, T.; Nawafune, H.; Ozawa, F. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 4350-4353.
49. Pan, M.; Bao, Z. N.; Yu, L. P. Macromolecules 1995, 28, 5151-5153.
50. Suzuki, Y.; Hashimoto, K.; Tajima, K. Macromolecules 2007, 40, 6521-6528.
51. Deb, S. K.; Maddux, T. M.; Yu, L. P. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 9079-9080.
52. Meier, H.; Lehmann, M. Angew. Chem., Int. Ed. 1998, 37, 643-645.
53. Ejima, H.; Iwata, T.; Yoshie, N. Macromolecules 2008, 41, 9846-9848.
54. Lim, S. J.; Seok, D. Y.; An, B. K.; Jung, S. D.; Park, S. Y. Macromolecules 2006, 39, 9-11.
55. Kwon, T. W.; Alam, M. M.; Jenekhe, S. A. Chem. Mater. 2004, 16, 4657-4666.
56. Stiriba, S. E.; Frey, H.; Haag, R. Angew. Chem., Int. Ed. 2002, 41, 1329-1334.
57. Schlenoff, J. B.; Wang, L. J. Macromolecules 1991, 24, 6653-6659.
58. Pace, C. N.; Vajdos, F.; Fee, L.; Grimsley, G.; Gray, T. Protein Sci. 1995, 4, 2411-2423.
59. Gallivan, J. P.; Dougherty, D. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1999, 96, 9459-9464.
60. Smith, G. P.; Petrenko, V. A. Chem. Rev. 1997, 97, 391-410.
61. Seker, U. O. S.; Wilson, B.; Dincer, S.; Kim, I. W.; Oren, E. E.; Evans, J. S.; Tamerler, C.; Sarikaya, M. Langmuir 2007, 23, 7895-7900.
62. Helms, B. A.; Reulen, S. W. A.; Nijhuis, S.; de Graaf-Heuvelmans, P.; Merkx, M.; Meijer, E. W. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 11683-11685.
63. Morrison, K. L.; Weiss, G. A. Curr. Opin. Chem. Biol. 2001, 5, 302-307.
64. Chellgren, B. W.; Creamer, T. P. Biochemistry 2004, 43, 5864-5869.