Packaging HIV virion components through dynamic equilibria of a human tRNA synthetase

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 49, 2010, Pages 16273-16279

  Guo, Min ^a   Shapiro, Ryan ^a   Morris, Garrett M ^a   Yang, Xiang Lei ^a   Schimmel, Paul ^a  

^a SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINO ACIDS; MONOMERS; THREE DIMENSIONAL;

3D STRUCTURES; AB INITIO; AMINOACYL; DYNAMIC EQUILIBRIA; HIGH RESOLUTION; PROTEIN SURFACE; REVERSE TRANSCRIPTION; STRUCTURAL BASIS; SYNTHETASES; TERNARY COMPLEX;

DISEASES;

EID: 78650153770     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp1082517     Document Type: Article

References (32)

1. Ibba, M.; Soll, D. Annu. Rev. Biochem. 2000, 69, 617
2. Nechushtan, H.; Kim, S.; Kay, G.; Razin, E. Adv. Immunol. 2009, 103, 1
3. Lee, Y. N.; Nechushtan, H.; Figov, N.; Razin, E. Immunity 2004, 20, 145
4. Lee, Y. N.; Razin, E. Mol. Cell. Biol. 2005, 25, 8904
5. Yannay-Cohen, N.; Carmi-Levy, I.; Kay, G.; Yang, C. M.; Han, J. M.; Kemeny, D. M.; Kim, S.; Nechushtan, H.; Razin, E. Mol. Cell 2009, 34, 603
6. Kleiman, L.; Cen, S. Int. J. Biochem. Cell Biol. 2004, 36, 1776
7. Cen, S.; Javanbakht, H.; Niu, M.; Kleiman, L. J. Virol. 2004, 78, 1595
8. Alberty, R. A. Thermodynamics of biochemical reactions; Wiley: Hoboken, NJ, 2003.
9. Silbey, R. J.; Alberty, R. A.; Bawendi, M. G. Physical chemistry, 4th ed.; Wiley: Hoboken, NJ, 2005.
10. Kovaleski, B. J.; Kennedy, R.; Hong, M. K.; Datta, S. A.; Kleiman, L.; Rein, A.; Musier-Forsyth, K. J. Biol. Chem. 2006, 281, 19449
11. Guo, M.; Chong, Y. E.; Beebe, K.; Shapiro, R.; Yang, X. L.; Schimmel, P. Science 2009, 325, 744
12. Ritchie, D. W.; Kozakov, D.; Vajda, S. Bioinformatics 2008, 24, 1865
13. Mintseris, J.; Pierce, B.; Wiehe, K.; Anderson, R.; Chen, R.; Weng, Z. Proteins 2007, 69, 511
14. Mandell, J. G.; Roberts, V. A.; Pique, M. E.; Kotlovyi, V.; Mitchell, J. C.; Nelson, E.; Tsigelny, I.; Ten Eyck, L. F. Protein Eng. 2001, 14, 105
15. Huey, R.; Morris, G. M.; Olson, A. J.; Goodsell, D. S. J. Comput. Chem. 2007, 28, 1145
16. Brunger, A. T.; Adams, P. D.; Clore, G. M.; DeLano, W. L.; Gros, P.; Grosse-Kunstleve, R. W.; Jiang, J. S.; Kuszewski, J.; Nilges, M.; Pannu, N. S.; Read, R. J.; Rice, L. M.; Simonson, T.; Warren, G. L. Acta. Crystallogr., Sect. D 1998, 54, 905
17. Javanbakht, H.; Halwani, R.; Cen, S.; Saadatmand, J.; Musier-Forsyth, K.; Gottlinger, H.; Kleiman, L. J. Biol. Chem. 2003, 278, 27644
18. Kovaleski, B. J.; Kennedy, R.; Khorchid, A.; Kleiman, L.; Matsuo, H.; Musier-Forsyth, K. J. Biol. Chem. 2007, 282, 32274
19. Guo, M.; Ignatov, M.; Musier-Forsyth, K.; Schimmel, P.; Yang, X. L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 2331
20. Francin, M.; Kaminska, M.; Kerjan, P.; Mirande, M. J. Biol. Chem. 2002, 277, 1762
21. Francin, M.; Mirande, M. Biochemistry 2006, 45, 10153
22. Monaco-Malbet, S.; Berthet-Colominas, C.; Novelli, A.; Battai, N.; Piga, N.; Cheynet, V.; Mallet, F.; Cusack, S. Structure 2000, 8, 1069
23. Kingston, R. L.; Vogt, V. M. Mol. Cell 2005, 17, 166
24. Munro, A. W.; Noble, M. A. Flavoprotein Protocols; Humana Press: Edinburgh, U.K., 1999; Vol. 131.
25. Gray, J. J. Curr. Opin. Struct. Biol. 2006, 16, 183
26. Hargittai, M. R.; Mangla, A. T.; Gorelick, R. J.; Musier-Forsyth, K. J. Mol. Biol. 2001, 312, 985
27. Gabor, J.; Cen, S.; Javanbakht, H.; Niu, M.; Kleiman, L. J. Virol. 2002, 76, 9096
28. Sticht, J.; Humbert, M.; Findlow, S.; Bodem, J.; Muller, B.; Dietrich, U.; Werner, J.; Krausslich, H. G. Nat. Struct. Mol. Biol. 2005, 12, 671
29. Melamed, D.; Mark-Danieli, M.; Kenan-Eichler, M.; Kraus, O.; Castiel, A.; Laham, N.; Pupko, T.; Glaser, F.; Ben-Tal, N.; Bacharach, E. J. Virol. 2004, 78, 9675
30. Francin, M.; Mirande, M. J. Biol. Chem. 2003, 278, 1472
31. Cusack, S.; Yaremchuk, A.; Tukalo, M. EMBO J. 1996, 15, 6321
32. Arnez, J. G.; Moras, D. Trends Biochem. Sci. 1997, 22, 211