Modulation of intramolecular heterodimer-induced fluorescence quenching of tricarbocyanine dye for the development of fluorescent sensor

Organic and Biomolecular Chemistry

Volumn 8, Issue 24, 2010, Pages 5568-5575

  Hirano, Tomoya ^a   Akiyama, Jun ^a   Mori, Shuichi ^a   Kagechika, Hiroyuki ^a  

^a TOKYO MEDICAL AND DENTAL UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AQUEOUS MEDIA; DESIGN APPROACHES; FLUORESCENCE ENHANCEMENT; FLUORESCENCE PROPERTIES; FLUORESCENCE QUENCHING; FLUORESCENCE SENSORS; FLUORESCENT SENSORS; HETERODIMER COMPLEXES; HETERODIMER FORMATION; HETERODIMERS; INTRAMOLECULAR INTERACTIONS; LINKER STRUCTURES; MOLECULAR SPECIES; NEAR INFRARED; RESONANCE ENERGY TRANSFER; STRUCTURAL TRANSITIONS; TARGET ANALYTES;

ENERGY TRANSFER; QUENCHING; SENSORS;

FLUOROPHORES;

CARBOCYANINE; FLUORESCENT DYE;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; DIMERIZATION;

CARBOCYANINES; DIMERIZATION; FLUORESCENT DYES; MOLECULAR STRUCTURE;

EID: 78649493825     PISSN: 14770520     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0ob00207k     Document Type: Article

References (41)

1. J. R. Lackowitz, Principles of Fluorescence Spectroscopy, Third Edition, Springer Science, New York, 2006
2. A. P. de Silva H. Q. Gunaratne T. Gunnlaugsson A. J. M. Huxley C. P. McCoy J. T. Rademacher T. E. Rice Chem. Rev. 1997 97 1515 1566 and references therein
3. A. Hillisch M. Lorenz S. Diekmann Curr. Opin. Struct. Biol. 2001 11 201 207
4. E. A. Jares-Erijman T. M. Jovin Nat. Biotechnol. 2003 21 1387 1395 and references therein
5. T. Miura Y. Urano K. Tanaka T. Nagano K. Ohkubo S. Fukuzumi J. Am. Chem. Soc. 2003 125 8666 8671
6. S. Doose H. Neuweiler M. Sauer ChemPhysChem 2009 10 1389 1398 and references therein
7. A. P. de Silva R. A. D. Rupasinghe J. Chem. Soc., Chem. Commun. 1985 1669 1670
8. Y. Urano D. Asanuma Y. Hama Y. Koyama T. Barrett M. Kamiya T. Nagano T. Watanabe A. Hasegawa P. L. Choyke H. Kobayashi Nat. Med. 2009 15 104 109
9. T. Hirano K. Kikuchi Y. Urano T. Higuchi T. Nagano J. Am. Chem. Soc. 2000 122 12399 12400
10. T. Hirano K. Kikuchi Y. Urano T. Higuchi T. Nagano Angew. Chem., Int. Ed. 2000 39 1052 1054
11. T. Hirano K. Kikuchi Y. Urano T. Higuchi T. Nagano J. Am. Chem. Soc. 2002 124 6555 6562
12. H. Kojima N. Nakatsubo K. Kikuchi S. Kawahara Y. Kirino H. Nagoshi Y. Hirata T. Nagano Anal. Chem. 1998 70 2446 2453
13. A.-P. Wei D. K. Blumenthai J. N. Herron Anal. Chem. 1994 66 1500 1506
14. Y. Hama Y. Urano Y. Koyama M. Kamiya M. Bernardo R. S. Paik I. S. Shin C. H. Paik P. L. Choyke H. Kobayashi Cancer Res. 2007 67 2791 2799
15. R. Weissleder C.-H. Tung U. Mahmood A. Bogdanov Jr Nat. Biotechnol. 1999 17 375 378
16. S. Tyagi F. R. Kramer Nat. Biotechnol. 1996 14 303 308
17. S. Tyagi D. P. Bratu F. R. Kramer Nat. Biotechnol. 1998 16 49 53
18. S. Bernacchi Y. Mely Nucleic Acids Res. 2001 29 e62
19. S. A. E. Marras F. R. Kramer S. Tyagi Nucleic Acids Res. 2002 30 e122
20. M. K. Johansson H. Fidder D. Dick R. M. Cook J. Am. Chem. Soc. 2002 124 6950 6956
21. Q. Wang S. M. Cahill M. Blumenstein D. S. Lawrence J. Am. Chem. Soc. 2006 128 1808 1809
22. M. K. Johansson R. M. Cook Chem.-Eur. J. 2003 9 3466 3471 and references therein
23. H. Yang G. Luo P. Karnchanaphanurach T.-M. Louie I. Rech S. Cova L. Xun X. S. Xie Science 2003 302 262 266
24. G. A. Frank Y. Kipnis E. Smolensky S. S. Daube A. Horovitz G. Haran Bioconjugate Chem. 2008 19 1339 1341
25. S. Doose H. Neuweiler M. Sauer ChemPhysChem 2005 6 2277 2285
26. H. Neuweiler M. Lollmann S. Doose M. Sauer J. Mol. Biol. 2007 365 856 869
27. S. Doose H. Neuweiler H. Barsch M. Sauer Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2007 104 17400 17405
28. S. Doose H. Neuweiler M. Sauer ChemPhysChem 2009 10 1389 1398
29. J. V. Frangioni Curr. Opin. Chem. Biol. 2003 7 626 634
30. W. Pham R. Weissleder C.-H. Tung Angew. Chem., Int. Ed. 2002 41 3659 3662
31. W. Pham R. Weissleder C.-H. Tung Tetrahedron Lett. 2003 44 3975 3978
32. C.-H. Tung Biopolymers 2004 76 391 404
33. J. H. Flanagan Jr. S. H. Khan S. Menchen S. A. Soper R. P. Hammer Bioconjugate Chem. 1997 8 751 756
34. R. C. Benson H. A. Kue J. Chem. Eng. Data 1977 22 379 383
35. W. Saenger Angew. Chem., Int. Ed. Engl. 1980 19 344 362
36. H. Takakusa K. Kikuchi Y. Urano T. Higuchi T. Nagano Anal. Chem. 2001 73 939 942
37. M. Cardamone N. K. Puri Biochem. J. 1992 282 589 593
38. C. A. Haskard E. C. Y. Li-Chan J. Agric. Food Chem. 1998 46 2671 2677
39. C. C. Bigelow, M. Channon in Handbook of Biochemistry and Molecular Biology, ed., G. D. Fasman, CRC Press, Cleveland, OH, 1975, pp. 209-243
40. J. Broos H. H. Pas G. T. Robillard J. Am. Chem. Soc. 2002 124 6812 6813
41. H. Sahoo D. Roccatano M. Zacharias W. M. Nau J. Am. Chem. Soc. 2006 128 8118 8119