Practical Aspects of Copper Ion-Based Double Electron Electron Resonance Distance Measurements

Applied Magnetic Resonance

Volumn 39, Issue 4, 2010, Pages 487-500

  Yang, Zhongyu ^a   Ji, Ming ^a   Saxena, Sunil ^a  

^a UNIVERSITY OF PITTSBURGH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COPPER IONS; DOUBLE ELECTRON-ELECTRON RESONANCE; EXPERIMENTAL CONDITIONS; FREQUENCY OFFSETS; HIGH QUALITY; MODULATION DEPTH; NITROXIDES; OPTIMAL FREQUENCY; ORIENTATIONAL SELECTIVITY; PULSE LENGTH; PUMP PULSE; SAMPLE CONCENTRATION;

ELECTRON RESONANCE; FREQUENCY ALLOCATION; METAL IONS; PUMPS; SIGNAL ENCODING;

ELECTRONS;

EID: 78449304508     PISSN: 09379347     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1007/s00723-010-0181-5     Document Type: Article

References (60)

1. A. D. Milov, K. M. Salikhov, M. D. Shchirov, Fiz. Tverd. Tela (Leningrad) 23, 975-982 (1981).
2. R. G. Larson, D. J. Singel, J. Chem. Phys. 98, 5134-5146 (1993).
3. C. Altenbach, S. L. Flitsch, H. G. Khorana, W. L. Hubbell, Biochemistry 28, 7806-7812 (1989).
4. W. L. Hubbell, D. S. Cafiso, C. Altenbach, Nat. Struct. Biol. 7, 735-739 (2000).
5. W. L. Hubbell, A. Gross, R. Langen, M. Lietzow, Curr. Opin. Struct. Biol. 8, 649-656 (1998).
6. V. W. Cornish, D. R. Benson, C. A. Altenbach, K. Hideg, W. Hubbell, P. Schultz, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 91, 2910-2914 (1994).
7. Y.-W. Chiang, P. P. Borbat, J. H. Freed, J. Magn. Reson. 172, 279-295 (2005).
8. G. Jeschke, V. Chechik, P. Ionita, A. Godt, H. Zimmermann, J. Banham, C. R. Timmel, D. Hilger, H. Jung, Appl. Magn. Reson. 30, 473-498 (2006).
9. C. Elsässer, M. Brecht, R. Bittl, J. Am. Chem. Soc. 124, 12606-12611 (2002).
10. M. Bennati, J. H. Robblee, V. Mugnaini, J. Stubbe, J. Freed, P. Borbat, J. Am. Chem. Soc. 127, 15014-15015 (2005).
11. A. Kawamori, T.-A. Ono, A. Ishii, S. Nakazawa, H. Hara, T. Tomo, J. Minagawa, R. Bittl, S. A. Dzuba, Photosynth. Res. 84, 187-192 (2005).
12. A. V. Astashkin, J. Seravalli, S. O. Mansoorabadi, G. H. Reed, S. W. Ragsdale, J. Am. Chem. Soc. 128, 3888-3889 (2006).
13. J. E. Banham, C. R. Timmel, R. J. M. Abbott, S. M. Lea, G. Jeschke, Angew. Chem. Int. Ed. 45, 1058-1061 (2006).
14. P. G. Fajer, M. Gyimesi, A. Málnási-Csizmadia, C. R. Bagshaw, K. I. Sen, L. Song, J. Phys: Condens. Matter 19(285208), 1-10 (2007).
15. V. P. Denysenkov, D. Biglino, W. Lubitz, T. F. Prisner, M. Bennati, Angew. Chem. Int. Ed. 47, 1224-1227 (2008).
16. J. C. Klein, A. R. Burr, B. Svensson, D. J. Kennedy, J. Allingham, M. A. Titus, I. Rayment, D. D. Thomas, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105, 12867-12872 (2008).
17. M. A. Swanson, V. Kathirvelu, T. Majtan, F. E. Frerman, G. R. Eaton, S. S. Eaton, J. Am. Chem. Soc. 131, 15978-15979 (2009).
18. J. L. Kear, M. E. Blackburn, A. M. Veloro, B. M. Dunn, G. E. Fanucci, J. Am. Chem. Soc. 131, 14650-14651 (2009).
19. H. Ghimire, R. M. McCarrick, D. E. Budil, G. A. Lorigan, Biochemistry 48, 5782-5784 (2009).
20. O. Schiemann, N. Piton, J. Plackmeyer, B. E. Bode, T. F. Prisner, J. W. Engels, Nat. Protoc. 2, 904-923 (2007).
21. P. Z. Qin, I. S. Haworth, Q. Cai, A. K. Kusnetzow, G. P. G. Grant, E. A. Price, G. Z. Sowa, A. Popova, B. Herreros, H. He, Nat. Protoc. 2, 2354-2365 (2007).
22. G. Sicoli, G. Mathis, O. Delalande, Y. Boulard, D. Gasparutto, S. Gambarelli, Angew. Chem. Int. Ed. 47, 735-737 (2008).
23. N. A. Kuznetsov, A. D. Milov, V. V. Koval, R. I. Samoilova, Y. A. Grishin, D. G. Knorre, Y. D. Tsvetkov, O. S. Fedorova, S. A. Dzuba, Phys. Chem. Chem. Phys. 11, 6826-6832 (2009).
24. A. D. Milov, A. G. Maryasov, Y. D. Tsvetkov, J. Raap, Chem. Phys. Lett. 303, 135-143 (1999).
25. M. Pannier, M. Schöps, V. Schädler, U. Wiesner, G. Jeschke, H. W. Spiess, Macromolecules 34, 5555-5560 (2001).
26. S. Pornsuwan, G. Bird, C. E. Schafmeister, S. Saxena, J. Am. Chem. Soc. 128, 3876-3877 (2006).
27. B. E. Bode, D. Margraf, J. Plackmeyer, G. Dürner, T. F. Prisner, O. Schiemann, J. Am. Chem. Soc. 129, 6736-6745 (2007).
28. J. E. Lovett, M. Hoffmann, A. Cnossen, A. T. J. Shutter, H. J. Hogben, J. E. Warren, S. I. Pascu, C. W. M. Kay, C. R. Timmel, H. L. Anderson, J. Am. Chem. Soc. 131, 13852-13859 (2009).
29. M. Gordon-Grossman, Y. Gofman, H. Zimmermann, V. Frydman, Y. Shai, N. Ben-Tal, D. Goldfarb, J. Phys. Chem. B 113, 12687-12695 (2009).
30. S. V. Gulla, G. Sharma, P. Borbat, J. H. Freed, H. Ghimire, M. R. Benedikt, N. L. Holt, G. A. Lorigan, K. Rege, C. Mavroidis, D. E. Budil, J. Am. Chem. Soc. 131, 5374-5375 (2009).
31. S.-Y. Park, P. P. Borbat, G. Gonzalez-Bonet, J. Bhatnagar, A. M. Pollard, J. H. Freed, A. M. Bilwes, B. R. Crane, Nat. Struct. Biol. 13, 400-407 (2006).
32. I. V. Borovykh, S. Ceola, P. Gajula, P. Gast, H.-J. r. Steinhoff, M. Huber, J. Magn. Reson. 180, 178-185 (2006).
33. A. D. Milov, Y. D. Tsvetkov, E. Y. Gorbunova, L. G. Mustaeva, T. V. Ovchinnikova, J.-W. Handgraaf, J. Raap, Chem. Biodivers. 4, 1243-1255 (2007).
34. M. Kim, Q. Xu, D. Murray, D. S. Cafiso, Biochemistry 47, 670-679 (2008).
35. C. Altenbach, A. K. Kusnetzow, O. P. Ernst, K. P. Hofmann, W. L. Hubbell, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 105, 7439-7444 (2008).
36. P. Zou, M. Bortolus, H. S. Mchaourab, J. Mol. Biol. 393, 586-597 (2009).
37. S. Meyer, S. Böhme, A. Krüger, H.-J. Steinhoff, J. P. Klare, A. Wittinghofer, PLoS Biol 7, 1-15 (2009).
38. D. Z. Herrick, W. Kuo, H. Huang, C. D. Schwieters, J. F. Ellena, D. S. Cafiso, J. Mol. Biol. 390, 913-923 (2009).
39. G. Hagelueken, W. J. Ingledew, H. Huang, B. Petrovic-Stojanovska, C. Whitfield, H. ElMkami, O. Schiemann, J. H. Naismith, Angew. Chem. Int. Ed. 48, 2904-2906 (2009).
40. C. Dockter, A. Volkov, C. Bauer, Y. Polyhach, Z. Joly-Lopez, G. Jeschke, H. Paulsen, Proc. Natl. Acad. Sci. USA 106, 18485-18490 (2009).
41. K. I. Sen, T. M. Logan, P. G. Fajer, Biochemistry 46, 11639-11649 (2007).
42. K. M. Stone, J. E. Townsend, J. Sarver, P. J. Sapienza, S. Saxena, L. Jen-Jacobson, Angew. Chem. Int. Ed. 47, 10192-10194 (2008).
43. I. M. C. vanAmsterdam, M. Ubbink, G. W. Canters, M. Huber, Angew. Chem. Intl. Ed. 42, 62-64 (2003).
44. E. Narr, A. Godt, G. Jeschke, Angew. Chem. Intl. Ed. 41, 3907-3910 (2002).
45. Z. Yang, J. Becker, S. Saxena, J. Magn. Reson. 188, 337-343 (2007).
46. B. E. Bode, J. Plackmeyer, T. F. Prisner, O. Schiemann, J. Phys. Chem. A 112, 5064-5073 (2008).
47. J. E. Lovett, A. M. Bowen, C. R. Timmel, M. W. Jones, J. R. Dilworth, D. Caprotti, S. G. Bell, L. L. Wong, J. Harmer, Phys. Chem. Chem. Phys. 11, 6840-6848 (2009).
48. Z. Yang, D. Kise, S. Saxena, J. Phys. Chem. B 114, 6165-6174 (2010).
49. S. Jun, J. Becker, M. Yonkunas, R. Coalson, S. Saxena, Biochemistry 45, 11666-11673 (2006).
50. G. Jeschke, A. Bender, H. Paulsen, H. Zimmermann, A. Godt, J. Magn. Reson. 169, 1-12 (2004).
51. G. Jeschke, Biological Magnetic Resonance, ed. by M. A. Hemminga, L. J. Berlier. ESR Spectroscopy in Membrane Biophysics, vol 27, (Springer, Berlin, 2007), pp. 18-47.
52. E. Aronoff-Spencer, C. S. Burns, N. I. Avdievich, G. J. Gerfen, J. Peisach, W. E. Antholine, H. L. Ball, F. E. Cohen, S. B. Prusiner, G. L. Millhauser, Biochemistry 39, 13760-13771 (2000).
53. C. S. Burns, E. Aronoff-Spencer, C. M. Dunham, P. Lario, N. I. Avdievich, W. E. Antholine, M. Olmstead, A. Vrielink, G. J. Gerfen, J. Peisach, W. G. Scott, G. L. Millhauser, Biochemistry 41, 3991-4001 (2002).
54. G. L. Millhauser, Acc. Chem. Res. 37, 79-85 (2004).
55. G. Jeschke, Y. Polyhach, Phys. Chem. Chem. Phys. 9, 1895-1910 (2007).
56. A. D. Milov, A. G. Maryasov, Y. D. Tsvetkov, Appl. Magn. Reson. 15, 107-143 (1998).
57. K. M. Salikhov, S. A. Dzuba, A. M. Raitsimring, J. Magn. Reson. 42, 255-276 (1981).
58. A. D. Milov, A. B. Ponomarev, Y. D. Tsvetkov, Chem. Phys. Lett. 110, 67-72 (1984).
59. D. Margraf, B. E. Bode, A. Marko, O. Schiemann, T. F. Prisner, Mol. Phys. 105, 2153-2160 (2008).
60. C. W. M. Kay, H. E. Mkami, R. Cammack, R. W. Evans, J. Am. Chem. Soc. 129(16), 4868-4869 (2007).