Ca2+ bridging of apposed phospholipid bilayers

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 41, 2010, Pages 13249-13254

  Issa, Zeena K ^a   Manke, Charles W ^a   Jena, Bhanu P ^a,b   Potoff, Jeffrey J ^a  

^a Wayne State University   (United States)

^b WAYNE STATE UNIVERSITY SCHOOL OF MEDICINE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CALCIUM; COMPLEXATION; DEHYDRATION; DEWATERING; MOLECULAR DYNAMICS; PHOSPHOLIPIDS; SODIUM;

ANHYDROUS COMPLEXES; BI-LAYER; CLOSE PROXIMITY; HEAD GROUPS; ISOBARIC-ISOTHERMAL ENSEMBLE; LARGE REGIONS; LIPID VESICLES; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; PHOSPHOLIPID BILAYER;

LIPID BILAYERS;

EID: 77958043609     PISSN: 15206106     EISSN: 15205207     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp105781z     Document Type: Article

References (62)

1. Sollner, T.; Whiteheart, S. W.; Brunner, M.; Erdjument-Bromage, H.; Geromanos, S.; Tempst, P. L.; Rothman, J. Nature 1993, 362, 318-324
2. Fix, M. T.; Melia, J.; Jaiswal, J. K.; Rappoport, J. Z.; You, D.; Sollner, T. H.; Rothman, J. E.; Simon, S. M. Proc. Nat. Acad. Sci. 2004, 101, 7311-7316
3. Bai, J. C. T.; Wange, D. A.; Richards, M. B.; Jackson, E. R. Neuron 2004, 41, 929-942
4. Yoon, T.-Y.; Lu, X.; Diao, J.; Lee, S.-M.; Ha, T.; Shin, Y.-K. Nat. Struct. Mol. Biol. 2008, 15, 707-713
5. Jahn, R.; Sudhof, T. C. Annu. Rev. Biochem. 1999, 68, 864-911
6. Chen, Y. A.; Scheller, R. H. Nat. Rev. Mol. Biol. 2001, 2, 98-106
7. Papahadjopoulos, D.; Poste, G.; Schaeffer, B. E.; Vail, W. J. Biochim. Biophys. Acta 1974, 352, 10
8. Ekerdt, R.; Papahadjopoulos, D. Proc. Natl. Acad. Sci. 1982, 79, 2273-2277
9. Portis, A.; Newton, C.; Pangborn, W.; Papahadjopoulos, D. Biochemistry 1979, 18, 780-790
10. Papahadjopoulos, D.; Watkins, J. C. Biochim. Biophys. Acta 1967, 135, 639-652
11. Papahadjopoulos, D.; Nir, S.; Buzgunes, N. J. Bioenerg. Biomembr. 1990, 22, 157-179
12. Jeremic, A.; Kelly, M.; Cho, J. A.; Choo, S.-J.; Horber, J. K.; Jena, B. P. Cell Biol. Int. 2004, 28, 19-31
13. Böckmann, R. A.; Hac, A.; Heimburg, T.; Grubmüller, H. Biophys. J. 2003, 85, 1647-1655
14. Pandit, S. A.; Bostick, D.; Berkowitz, M. L. Biophys. J. 2003, 85, 3120-3131
15. Böckmann, R. A.; Grubmüller, H. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 1021-1021
16. Potoff, J. J.; Issa, Z. K.; Manke, C. W.; Jena, B. P. Cell Biol. Int. 2008, 32, 361-366
17. Foloppe, N.; MacKerell, A. D., Jr. J. Comput. Chem. 2000, 21, 86-104
18. www.charmm- gui.org accessed September 8, 2010.
19. Lis, L. J.; McAlister, M.; Fuller, N.; Rand, R. P. Biophys. J. 1982, 37, 657-666
20. Rand, R. P.; Parsegian, V. A. Annu. Rev. Physiol. 1986, 48, 201-212
21. De Young, L.; Dill, K. Biochem. J. 1988, 27, 5281-5289
22. Petrache, H.; Tristram-Nagle, S.; Nagle, F. Chem. Phys. Lipids 1988, 95, 83-94
23. Evans, E.; Needham, D. J. Phys. Chem. 1987, 91, 4219-4228
24. Taly, A.; Baciou, L.; Sebban, P. FEBS Lett. 2002, 532, 91-96
25. Pinaki, R.; Blume, A. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 10753-10763
26. Feller, S. E.; Shang, Y. H.; Paster, R. W.; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 1995, 103, 4613-4621
27. Essman, U.; Perera, L.; Berkowitz, M.; Darden, H.; Pedersen, L. J. Chem. Phys. 1995, 103, 8577-8592
28. Phillips, J. C. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1781-1802
29. Hmphrey, W.; Dalke, A.; Schulten, K. J. Mol. Graphics 1996, 14, 33-38
30. Gurtovenko, A. A.; Vattulainen, M. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 4629-4634
31. Sachs, J. N.; Corzier, P. S.; Woolf, T. B. J. Chem. Phys. 2004, 121, 10847-10851
32. Gurtovenko, A. A. J. Chem. Phys. 2005, 122, 244902
33. Katz, A. K.; Glusker, J. P.; Beebs, S. A.; Bock, C. W. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 5752-5763
34. Pavlov, M.; Siegbahn, P. E. M.; Sandstrom, M. J. Phys. Chem. 1998, 102, 219-228
35. Carugo, O.; Djinovic, K.; Rizzi, M. J. Chem. Soc. Dalton Trans. 1993, 2127-2135
36. Lightstone, F. C.; Schwegler, E.; Allesch, M.; Gygi, F.; Galli, G. Chem. Phys. Chem. 2005, 6, 1745-1749
37. Poyry, S.; Rog, T.; Karttunen, M.; Vattulainen, M. J. Phys. Chem. B 2009, 113, 15513-15521
38. Gurtovenko, A.; Vattulainen, M. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 1953-1962
39. Feller, S. E.; Paster, R. W. Biophys. J. 1996, 71, 1350-1355
40. Nagle, J. F.; Nagle-Tristram, S. Biochim. Biophys. Acta Rev. Biomembr. 2000, 1469, 159-195
41. Caffrey, M.; Feigenson, G. Biochem. J. 1981, 20, 1949-1961
42. Lewis, B. A.; Engelman, D. M. J. Mol. Biol. 1983, 166, 211-217
43. Yuan, C.; O'Connell, R. J.; Feinberg-Zadek, P. L.; Jonston, L. J.; Treistman, S. N. Biophys. J. 2004, 86, 3620-3633
44. Tieleman, D. P.; Berendsen, H. J. C. J. Chem. Phys. 1996, 105, 4871-4880
45. Nezil, F. A.; Bloom, M. Biophys. J. 1992, 61, 1176-1183
46. Gullingsrud, J.; Schulten, K. Biophys. J. 2004, 86, 3496-3509
47. Kucerka, N.; Kiselev, M.; Balgavy, P. Eur. Biophys. J. 2004, 33, 328-334
48. Zhao, W.; Rog, T.; Gurtovenko, A. A.; Vattulainen, M.; Karttunen, M. Biophys. J. 2007, 92, 1114-1124
49. Murzyn, K.; Rog, T.; Pasenkiewicz-Gierula, M. Biophys. J. 2005, 88, 1091-1103
50. Patra, M.; Kattunen, M.; Hyvonen, M. T.; Lindqvist, P.; Flack, E.; Vattulainen, I. Biophys. J. 2003, 84, 3636-3645
51. Armen, R. S.; Uitto, O. D.; Feller, S. E. Biophys. J. 1998, 75, 734-744
52. Hogberg, C.; Lyubartsev, A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 14326-14336
53. Berkowitz, M.; Bostick, D.; Pandit, S. Chem. Rev. 2006, 106, 1527-1539
54. Milhaud, J. Biochim. Biophys. Acta 2004, 1663, 19-51
55. Pedersen, U.; Leify, C.; Westh, P.; Peters, G. Biochim. Biophys. Acta 2006, 1758, 573-582
56. Pearson, R.; Pascher, I. Nature 1979, 218, 499-501
57. Heller, H.; Schaefer, M.; Schulten, K. J. Phys. Chem. 1993, 97, 8343-8360
58. Tristram-Nagle, S.; Zhang, R.; Suter, R. M.; Worthington, C. R.; Sun, W. J.; Nagle, J. F. Biophys. J. 1993, 64, 1097-1109
59. Kechuan, T.; Tobias, T.; Blasie, K.; Klein, M. Biophys. J. 1996, 70, 595-608
60. Golovina, E.; Golovin, A.; Hoekstra, F.; Faller, R. Biophys. J. 2009, 97, 490-499
61. Coorssen, J.; Rand, P. Biophys. J. 1995, 68, 1009-1018
62. Esteban-Martin, S.; Risselada, J.; Salgado, J.; Marrink, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2009, 131, 15194-15202