DNA interaction with Ru(ii) and Ru(ii)/Cu(ii) complexes containing azamacrocycle and dppz residues. A thermodynamic, kinetic and theoretical study.

Dalton Transactions

Volumn 39, Issue 41, 2010, Pages 9838-9850

  Bazzicalupi, Carla ^a   Biagini, Silvia ^a   Bianchi, Antonio ^a   Biver, Tarita ^b   Boggioni, Alessia ^b   Giorgi, Claudia ^a   Gratteri, Paola ^a   Malavolti, Marino ^a   Secco, Fernando ^b   Valtancoli, Barbara ^a   Venturini, Marcella ^b  

^a UNIVERSITY OF FLORENCE   (Italy)

^b UNIVERSITY OF PISA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING AFFINITIES; BINDING MODES; BINDING PROCESS; COMPLEX RATIO; COOPERATIVITY; COPPER (II); COPPER COMPLEXES; COPPER COORDINATION; CU COMPLEXES; DNA INTERACTION; DYE INTERACTIONS; EQUILIBRIUM MEASUREMENTS; INTERCALATION PROCESS; LIGAND STRUCTURE; MACROCYCLES; RU COMPLEXES; RU(BPY); STOPPED-FLOW TECHNIQUES; THEORETICAL CALCULATIONS; THEORETICAL STUDY;

BINDING ENERGY; COMPLEXATION; COPPER; DNA; INTERCALATION; RUTHENIUM ALLOYS;

COPPER COMPOUNDS;

COPPER; DIPYRIDO(3,2 A 2',3' C)PHENAZINE; DIPYRIDO(3,2-A-2',3'-C)PHENAZINE; DNA; HETEROCYCLIC COMPOUND; ORGANOMETALLIC COMPOUND; PHENAZINE DERIVATIVE; PROTON; RUTHENIUM;

ABSORPTION; ANIMAL; ARTICLE; CATTLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CONFORMATION; GENETICS; KINETICS; METABOLISM; NUCLEOTIDE SEQUENCE; SPECTROSCOPY; THERMODYNAMICS;

ABSORPTION; ANIMALS; AZA COMPOUNDS; BASE SEQUENCE; CATTLE; COPPER; DNA; KINETICS; MODELS, MOLECULAR; NUCLEIC ACID CONFORMATION; ORGANOMETALLIC COMPOUNDS; PHENAZINES; PROTONS; RUTHENIUM; SPECTRUM ANALYSIS; THERMODYNAMICS;

EID: 77957914079     PISSN: 14779226     EISSN: 14779234     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/c0dt00552e     Document Type: Article

References (73)

1. K. E. Augustyn, V. C. Pierre and J. K. Barton, in Wiley Encyclopedia of Chemical Biology, ed., T. P. Begley, J. Wiley and Sons Inc., 2009, vol. 3, pp. 34-45
2. A. M. Pyle and J. K. Barton, in Progress in Inorganic Chemistry: Bioinorganic Chemistry, ed., J. Stephen Lippard, J. Wiley and Sons Inc., 1990, vol. 38, pp. 413-475
3. C. Moucheron New J. Chem. 2009 33 235 245
4. I. Kostova Curr. Med. Chem. 2006 13 1085 1107
5. F. Gonzalez-Vilchez, R. Vilaplana, in Metal Compounds in cancer chemotherapy, ed., J. M. Perez, M. A. Fuertes, and, C. Alonso, 2005, pp. 321-354
6. F. Gao H. Chao L.-N. Ji Chem. Biodiversity 2008 5 1962 1979
7. A. E. Friedman J.-C. Chambron J.-P. Sauvage N. J. Turro J. K. Burton J. Am. Chem. Soc. 1990 112 4960 4962
8. K. E. Erkkila D. T. Odom J. K. Barton Chem. Rev. 1999 99 2777 2795
9. M. Navarro E. J. Cisneros-Fajardo A. Sierralta M. Fernandez-Mestre P. Silva D. Arrieche E. Marchan J. Biol. Inorg. Chem. 2003 8 401 408
10. F. Westlund F. Pierard M. P. Eng B. Nordén P. Lincoln J. Phys. Chem. B 2005 109 17327 17332
11. W. R. Browne J. J. McGarvey Coord. Chem. Rev. 2006 250 1696 1709
12. Q. G. Mulazzani M. D'Angelantonio M. Venturi M. L. Boillot J. C. Chambron E. Amouyal New J. Chem. 1989 13 441 447
13. J.-C. Chambron J.-P. Sauvage Chem. Phys. Lett. 1991 182 603 607
14. E. Amouyal A. Homsi J.-C. Chambron J.-P. Sauvage J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1990 1841 1845
15. B. Gholamkhass K. Koike N. Negishi H. Hori K. Takeuchi Inorg. Chem. 2001 40 756 765
16. R. B. Nair B. M. Cullum C. J. Murphy Inorg. Chem. 1997 36 962 965
17. C. Turro S. H. Bossmann Y. Jenkins J. K. Barton N. J. Turro J. Am. Chem. Soc. 1995 117 9026 9032
18. R. E. Holmlin J. A. Yao J. K. Barton Inorg. Chem. 1999 38 174 189
19. I. Haq P. Lincoln D. Suh B. Nordén B. Z. Chowdhry J. B. Chaires J. Am. Chem. Soc. 1995 117 4788 4796
20. T. Biver C. Cavazza F. Secco M. Venturini J. Inorg. Biochem. 2007 101 461 469
21. T. Biver F. Secco M. R. Tinè M. Venturini A. Bencini A. Bianchi C. Giorgi J. Inorg. Biochem. 2004 98 1531 1538
22. T. Biver D. Lombardi F. Secco M. R. Tinè M. Venturini A. Bencini A. Bianchi B. Valtancoli Dalton Trans. 2006 1524 1533
23. C. Lodeiro A. J. Parola F. Pina C. Bazzicalupi A. Bencini A. Bianchi C. Giorgi A. Masotti B. Valtancoli Inorg. Chem. 2001 40 2968 2975
24. C. Anda C. Bazzicalupi A. Bencini A. Bianchi P. Fornasari C. Giorgi B. Valtancoli C. Lodeiro A. J. Parola F. Pina Dalton Trans. 2003 1299 1307
25. P. Arranz C. Bazzicalupi A. Bencini A. Bianchi S. Ciattini P. Fornasari C. Giorni B. Valtancoli Inorg. Chem. 2001 40 6383 6389
26. A. Bencini A. Bianchi S. Del Piero C. Giorgi A. Melchior R. Portauova M. Tolazzi B. Valtancoli J. Solution Chem. 2008 37 503 517
27. C. Bazzicalupi A. Bencini A. Bianchi A. Danesi E. Faggi C. Giorgi C. Lodeiro E. Oliveira F. Pina B. Valtancoli Inorg. Chim. Acta 2008 361 3410 3419
28. C. Lodeiro F. Pina A. J. Parola A. Bencini A. Bianchi C. Bazzicalupi S. Ciattini C. Giorgi A. Masotti B. Valtancoli J. Seixas de Melo Inorg. Chem. 2001 40 6813 6819
29. J. E. Dickeson L. A. Summers Aust. J. Chem. 1970 23 1023 1027
30. P. A. Anderson G. B. Deacon K. H. Haarmann F. R. Keene T. J. Meyer D. A. Reitsma B. W. Skelton G. F. Strouse N. C. Thomas J. A. Treadway A. H. White Inorg. Chem. 1995 34 6145 6157
31. A. Bianchi L. Bologni P. Dapporto M. Micheloni P. Paoletti Inorg. Chem. 1984 23 1201 1205
32. G. Gran Analyst 1952 77 661 671
33. P. Gans A. Sabatini A. Vacca Talanta 1996 43 1739 1753
34. A. K. Covington M. Paabo R. A. Robinson R. G. Bates Anal. Chem. 1968 40 700 706
35. Maestro v7.5, Schrödinger L. L. C. New York (http://www.schrodinger. com)
36. R. Andres M. Gruselle B. Malezieux M. Verdaguer J. Vaissermann Inorg. Chem. 1999 38 4637 4646
37. Jaguar, v 6.5; Schrödinger L. L. C. New York (http://www. schrodinger.com)
38. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 1372 1380
39. A. D. Becke J. Chem. Phys. 1993 98 5648 5657
40. B. Miehlich A. Savin H. Stoll H. Preuss Chem. Phys. Lett. 1989 157 200 208
41. P. J. Hay W. R. Wadt J. Chem. Phys. 1985 82 299 308
42. R. A. Friesner J. L. Banks R. B. Murphy T. A. Halgren J. Klicic D. T. Mainz M. P. Repasky E. H. Knoll M. Shelley J. K. Perry D. E. Shaw P. Francis P. S. Shenkin J. Med. Chem. 2004 47 1739 1749
43. J. L. Banks H. S. Beard Y. X. Cao A. E. Cho W. Damm R. Farid A. K. Felts T. A. Halgren D. T. Mainz J. R. Maple R. Murphy D. M. Philipp M. P. Repasky L. Y. Zhang B. J. Berne R. A. Friesner E. Gallicchio R. M. Levy J. Comput. Chem. 2005 26 1752 1780
44. Qsite, Schrödinger L. L. C., New York (http://www.schrodinger.com)
45. M. C. Cortis R. A. Friesner J. Comput. Chem. 1997 18 1591 1608
46. P. A. Lay A. M. Sargeson H. Taube Inorg. Synth. 1986 24 291 299
47. B. P. Sullivan D. J. Salmon T. J. Meyer Inorg. Chem. 1978 17 3334 3341
48. P. A. Anderson G. B. Deacon K. H. Haarmann F. R. Keene T. J. Meyer D. A. Reitsma B. W. Skelton G. F. Strouse N. C. Thomas J. A. Treadway A. H. White Inorg. Chem. 1995 34 6145 6157
49. N. Nickita M. J. Belousoff A. I. Bhatt A. M. Bond G. B. Deacon G. Gasser L. Spiccia Inorg. Chem. 2007 46 8638 8651
50. G. B. Deacon C. M. Kepter N. Sahely B. W. Skelton L. Spiccia N. C. Thomas A. H. White J. Chem. Soc., Dalton Trans. 1999 275 277
51. A. Bencini A. Bianchi E. Garcia-España M. Micheloni J. A. Ramirez Coord. Chem. Rev. 1999 188 97 156
52. M. Yamada Y. Tanaka Y. Yoshimoto Bull. Chem. Soc. Jpn. 1992 65 1006 1011
53. C.-S. Choi L. Mishra T. Mutai K. Araki Bull. Chem. Soc. Jpn. 2000 73 2051 2058
54. G. Scatchard Ann. N. Y. Acad. Sci. 1949 51 660 672
55. J. D. McGhee P. H. von Hippel J. Mol. Biol. 1974 86 469 489
56. G. L. Eichorn P. Clark Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1965 53 586 593
57. G. L. Eichorn P. Clark E. D. Becker Biochemistry 1966 5 245 253
58. A. M. Fiskin M. Beer Biochemistry 1965 4 1289 1294
59. J. Eisinger R. G. Shulman B. M. Szymanski J. Chem. Phys. 1962 36 1721 1729
60. G. Schwarz Eur. J. Biochem. 1970 12 442 453
61. R. E. Holmlin J. K. Barton Inorg. Chem. 1995 34 7 8
62. D. Z. M. Coggan I. S. Haworth P. J. Bates A. Robinson A. Rodger Inorg. Chem. 1999 38 4486 4497
63. R. E. Holmlin E. D. A. Stemp J. K. Barton J. Am. Chem. Soc. 1996 118 5236 5244
64. C. Hiort P. Lincoln B. Nordén J. Am. Chem. Soc. 1993 115 3448 3454
65. C. M. Dupureur J. K. Barton J. Am. Chem. Soc. 1994 116 10286 10287
66. T. Biver C. Ciatto F. Secco M. Venturini Arch. Biochem. Biophys. 2006 452 93 101
67. A. M. Pyle J. P. Rehmann R. Meshoyrer C. V. Kumar N. J. Turro J. K. Barton J. Am. Chem. Soc. 1989 111 3051 3058
68. P. Lincoln B. Nordén J. Phys. Chem. B 1998 102 9583 9594
69. R. M. Fuoss J. Am. Chem. Soc. 1958 80 5059 5061
70. P. P. Pellegrini J. R. Aldrich-Wright Dalton Trans. 2003 176 183
71. U. Heinemann C. Alings M. Bansal EMBO J. 1992 11 1931 1939
72. F. Westerlund L. M. Wilhelmsson B. Nordén P. Lincoln J. Phys. Chem. B 2005 109 21140 21144
73. F. J. Meyer-Almes D. Pörschke Biochemistry 1993 32 4246 4253