DNA binding geometries of ruthenium(II) complexes with 1,10-phenanthroline and 2,2′-bipyridine ligands studied with linear dichroism spectroscopy. Borderline cases of intercalation

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 102, Issue 47, 1998, Pages 9583-9594

  Lincoln, Per ^a   Nordén, Bengt ^a  

^a CHALMERS UNIVERSITY OF TECHNOLOGY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 0001670577     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9824914     Document Type: Article

References (64)

1. (a) Nordén, B.; Lincoln, P.; Åkerman, B.; Tuite, E. DNA Interactions with Substitution-Inert Transition Metal Ion Complexes. Met. Ions Biol. Sys. 33; Marcel Dekker: New York, 1996; pp 177-252.
2. (b) Stemp, E. D. A.; Barton, J. K. Electron-Transfer Between Metal-Complexes Bound to DNA-Is DNA a Wire? Ibid., pp 325-365.
3. (c) Johann, T. W.; Barton, J. K. Philos. Trans. R. Soc. London A 1996, 354, 299-324.
4. (d) Sigman, D. S.; Mazumder, A.; Perrin, D. M. Chem. Rev. 1993, 93, 2295.
5. Dwyer, F. P.; Gyarfas, E. C. J. Proc. R. Soc. N.S.W. 1949, 170-173.
6. Nordén, B.; Tjerneld, F. FEBS Lett. 1976, 67, 368-370.
7. Härd, T.; Nordén, B. Biopolymers 1986, 81, 1961-1965.
8. Härd, T.; Hiort, C.; Nordén, B. J. Biomol. Struct. Dyn. 1987, 5, 89.
9. Hiort, C.; Nordén, B.; Rodger, A. J. Am. Chem. Soc. 1990, 112, 1971-1982.
10. Satyanarayana, S.; Dabrowiak, J. C.; Chaires, J. B. Biochemistry 1992, 31, 9319-9324.
11. Satyanarayana, S.; Dabrowiak, J. C.; Chaires, J. B. Biochemistry 1993, 32, 2573-2584.
12. Gisselfält, K. Lic. Thesis, Chalmers University of Technology, Gothenburg, 1997.
13. Coury, J. E.; Anderson, J. R.; McFail-Isom, L.; Williams, L. D.; Bottomley, L. A. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3792-3796.
14. Barton, J. K.; Dannenberg, J. J.; Raphael, A. L. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 4967-4969.
15. (a) Barton, J. K.; Danishefsky, A. T.; Goldberg, J. M. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 2172-2176.
16. (b) Kelly, J. M.; Tossi, A. B.; McConnell, D. J.; OhUigín, C. Nucl. Acids Res. 1985, 13, 6017.
17. (c) Pyle, A. M.; Rehmann, J. P.; Meshoyrer, R.; Kumar, C. V.; Turro, N. J.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1989, 111, 3051-3058.
18. (a) Rehmann, J. P.; Barton, J. K. Biochemistry 1990, 29, 1701-1709.
19. (b) Rehmann, J. P.; Barton, J. K. Biochemistry 1990, 29, 1710-1717.
20. Eriksson, M.; Leijon, M.; Hiort, C.; Nordén, B.; Gräslund, A. Biochemistry 1994, 33, 5031-5040.
21. Brodkorb, A. Dipl. Thesis, Trinity College, Dublin, 1995.
22. (a) Barton, J. K.; Goldberg, J. M.; Kumar, C. V.; Turro, N. J. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 2081-2088.
23. (b) Kumar, C. V.; Barton, J. K.; Turro, N. J. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 5518-5523.
24. Haworth, I. S.; Elcock, A. H.; Freeman, J.; Rodger, A.; Richards, W. G. J. Biomol. Struct. Dyn. 1991, 9, 23-44.
25. Yamagishi, A. J. Phys. Chem. 1984, 88, 5709-5713.
26. Lincoln, P.; Broo, A.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 2644-2653.
27. Giordano, P. J.; Bock, C. R.; Wrighton, M. S. J. Am. Chem. Soc. 1978, 100, 6960.
28. Krause, R. A. Inorg. Chim. Acta 1977, 22, 209.
29. Trifonov, A.; Elenkowa, N. Z. Phys. Chem. (Leipzig) 1955, 205, 124.
30. Hiort, C.; Lincoln, P.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 3488-3454.
31. (a) Gillard, R. D.; Hill, R. E. E.; Maskill, R. J. Chem. Soc. A 1970, 1447.
32. (b) Fees, J.; Kaim, W.; Moscherosch, M.; Matheis, W.; Klíma, J.; Krejcik, M.; Zá.liš, S. Inorg. Chem. 1993, 32, 166-174.
33. Bonneson, P.; Walsh, J. L.; Pennington, W. T.; Cordes, A. W.; Durham, B. Inorg. Chem. 1983, 22, 1761-1765.
34. Felsenfeld, G.; Hirschman, S. Z. J. Mol. Biol. 1965, 13, 409-419.
35. Lin, C-T.; Böttcher, W.; Chou, M.; Creutz, C.; Sutin, N. J. Am. Chem. Soc. 1976, 98, 6536-6544.
36. Chambron, J.-C.; Sauvage, J.-P. Chem. Phys. Lett. 1991, 182, 603-607.
37. Cantor, C. R.; Schimmel, P. R. Biophysical Chemistry. Part II; W. H. Freeman and Co.: San Fransisco, 1980.
38. (a) Nordén, B.; Davidsson, Å. Tetrahedron Lett. 1972, 30, 3093.
39. (b) Nordén, B.; Tjerneld, F. Chem. Phys. Lett. 1977, 50, 508.
40. (c) Nordén, B.; Seth, S. Appl. Spectrosc. 1985, 39, 647.
41. (a) Nordén, B.; Kubista, M.; Kurucsev, T. Q. Rev. Biophys. 1992, 25, 51.
42. (b) Nordén, B.; Kurucsev, T. J. Mol. Recognit. 1994, 7, 141.
43. Tuite, E.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 7548.
44. Kalsbeck, W. A.; Thorp, H. H. J. Am. Chem. Soc. 1993, 115, 7146-7151.
45. (a) Record, M. T.; Anderson, C. F.; Lohman, T. M. Q. Rev. Biophys. 1978, 11, 103.
46. (b) Manning, G. S. Q. Rev. Biophys. 1978, 11, 179.
47. Broo, A.; Lincoln, P. Inorg. Chem. 1997, 36, 2544-2553.
48. Kim, H.-K.; Lincoln, P.; Nordén, B.; Tuite, E. Chem. Commun. 1997, 2375-2376.
49. Krausz, E.; Ferguson, J. Prog. Inorg. Chem. 1989, 37, 293-390.
50. (a) Felix, F.; Ferguson, J.; Güdel, H. U.; Ludi, A. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 4096-4102.
51. (b) Krausz, E. Inorg. Chem. 1988, 27, 2392-2393.
52. Crosby, G. A.; Elfring, Jr., W. H. J. Phys. Chem. 1976, 80, 2206-2211.
53. Haq, I.; Lincoln, P.; Suh, D.; Nordén, B.; Chowhry, B. Z.; Chaires, J. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 4788-4796.
54. Michl, J.; Thulstrup, E. Spectroscopy with Polarized Light; VCH Publishers: New York, 1986; p 120.
55. Choi, S.-D.; Kim, M.-S.; Kim, S. K.; Lincoln, P.; Tuite, E.; Nordén, B. Biochemistry 1997, 36, 214-223.
56. (a) Görner, H.; Tossi, A. B.; Stradowski, C.; Schulte-Frohlinde, D. J. Photochem. Photobiol. B. 1988, 2, 67-89.
57. (b) Tossi, A. B.; Kelly, J. M. Photochem. Photobiol. 1989, 49, 545.
58. Kamitori, S.; Takusagawa, F. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 4154-4165.
59. Greguric, I.; Aldrich-Wright, J. R.; Collins, J. G. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3621-3622.
60. Tuite, E.; Lincoln, P.; Nordén, B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 239-240.
61. (a) Dupureur, C. M.; Barton, J. K. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 10286.
62. (b) Dupureur, C. M.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 1997, 36, 33.
63. (c) Holmlin, R. E.; Stemp, E. D. A.; Barton, J. K. Inorg. Chem. 1998, 37, 29.
64. Kapicak, L.; Gabbay, E. J. J. Am. Chem. Soc. 1975, 97, 403-408.