How can hydrophobic association be enthalpy driven?

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 6, Issue 9, 2010, Pages 2866-2871

  Setny, Piotr ^a   Baron, Riccardo ^a   McCammon, J Andrew ^a  

^a TECHNICAL UNIVERSITY OF MUNICH   (Germany)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 77956583186     PISSN: 15499618     EISSN: 15499626     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct1003077     Document Type: Article

References (58)

1. Lum, K.; Luzar, A. Phys. Rev. E: Stat. Phys., Plasmas, Fluids, Relat. Interdiscip. Top. 1997, 56, R6283-R6286
2. Rajamani, S.; Truskett, T. M.; Garde, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 9475-9480
3. Ashbaugh, H. S.; Pratt, L. R. Rev. Mod. Phys. 2006, 78, 156-178
4. Meyer, E. E.; Rosenberg, K. J.; Israelachvili, J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2006, 103, 15739-15746
5. Chandler, D. Phys. Rev. E: Stat. Phys., Plasmas, Fluids, Relat. Interdiscip. Top. 1993, 48, 2898-2905
6. Hummer, G.; Garde, S.; Garcia, A. E.; Pohorille, A.; Pratt, L. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 8951-8955
7. Hummer, G.; Garde, S.; Garcia, A.; Paulaitis, M.; Pratt, L. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 10469-10482
8. Chandler, D. Nature 2005, 437, 640-647
9. Smith, D. E.; Zhang, L.; Haymet, A. D. J. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 5875-5876
10. Smith, D. E.; Haymet, A. D. J. J. Chem. Phys. 1993, 98, 6445-6454
11. Ludemann, S.; Abseher, R.; Schreiber, H.; Steinhauser, O. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 4206-4213
12. Shimizu, S.; Chan, H. S. J. Chem. Phys. 2000, 113, 4683-4700
13. Raschke, T. M.; Tsai, J.; Levitt, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2001, 98, 5965-5969
14. Lee, C. Y.; McCammon, J. A.; Rossky, P. J. J. Chem. Phys. 1984, 80, 4448-4455
15. Berne, B. J.; Weeks, J. D.; Zhou, R. Annu. Rev. Phys. Chem. 2009, 60, 85-103
16. Hummer, G.; Rasaiah, J. C.; Noworyta, J. P. Nature 2001, 414, 188-190
17. Choudhury, N.; Pettitt, B. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 4847-4852
18. Stillinger, F. H. J. Solution Chem. 1973, 2, 141-158
19. Wallqvist, A.; Gallicchio, E.; Levy, R. M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6745-6753
20. Jensen, T. R.; Jensen, M. O.; Reitzel, N.; Balashev, K.; Peters, G. H.; Kjaer, K.; Bjornholm, T. Phys. Rev. Lett. 2003, 90 086101-1-086101-4
21. Young, T.; Abel, R.; Kim, B.; Berne, B. J.; Friesner, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 808-813
22. Qvist, J.; Davidovic, M.; Hamelberg, D.; Halle, B. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 6296-6301
23. Wallqvist, A.; Berne, B. J. J. Phys. Chem. 1995, 99, 2893-2899
24. ten Wolde, P. R.; Chandler, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 6539-6543
25. Huang, X.; Margulis, C. J.; Berne, B. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2003, 100, 11953-11958
26. Liu, P.; Huang, X.; Zhou, R.; Berne, B. J. Nature 2005, 437, 159-162
27. Choudhury, N.; Pettitt, B. M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 3556-3567
28. Choudhury, N.; Pettitt, B. M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 8459-8463
29. Athawale, M. V.; Goel, G.; Ghosh, T.; Truskett, T. M.; Garde, S. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2007, 104, 733-738
30. Setny, P. J. Chem. Phys. 2007, 127 054505
31. Hua, L.; Huang, X.; Liu, P.; Zhou, R.; Berne, B. J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 9069-9077
32. Willard, A. P.; Chandler, D. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 6187-6192
33. Zangi, R.; Berne, B. J. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 8634-8644
34. Young, T.; Hua, L.; Huang, X.; Abel, R.; Friesner, R.; Berne, B. J. Proteins: Struct., Funct., Bioinf. 2010, 78, 1856-1869
35. Dunitz, J. D. Science 1994, 264, 670
36. Vaitheeswaran, S.; Yin, H.; Rasaiah, J. C.; Hummer, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 17002-17005
37. Yin, H.; Hummer, G.; Rasaiah, J. C. J. Am. Chem. Soc. 2007, 129, 7369-7377
38. Rasaiah, J. C.; Garde, S.; Hummer, G. Annu. Rev. Phys. Chem. 2008, 59, 713-740
39. Ernst, J. A.; Clubb, R. T.; Zhou, H. X.; Gronenborn, A. M.; Clore, G. M. Science 1995, 267, 1813-1817
40. Denisov, V. P.; Venu, K.; Peters, J.; Horlein, H. D.; Halle, B. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 9380-9389
41. Olano, L. R.; Rick, S. W. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 7991-8000
42. Sharrow, S. D.; Novotny, M. V.; Stone, M. J. Biochemistry (Moscow) 2003, 42, 6302-6309
43. Bingham, R. J.; Findlay, J. B. C.; Hsieh, S.-Y.; Kalverda, A. P.; Kjellberg, A.; Perazzolo, C.; Phillips, S. E. V.; Seshadri, K.; Trinh, C. H.; Turnbull, W. B.; Bodenhausen, G.; Homans, S. W. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 1675-1681
44. Barratt, E.; Bingham, R. J.; Warner, D. J.; Laughton, C. A.; Phillips, S. E. V.; Homans, S. W. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 11827-11834
45. Setny, P.; Wang, Z.; Cheng, L.-T.; Li, B.; McCammon, J. A.; Dzubiella, J. Phys. Rev. Lett. 2009, 103, 187801
46. Jorgensen, W. L.; Madura, J. D.; Swenson, C. J. J. Am. Chem. Soc. 1984, 106, 6638-6646
47. Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J. Chem. Phys. 1983, 79, 926-935
48. Torrie, G.; Valleau, J. J. Comput. Phys. 1977, 23, 187-199
49. Kumar, S.; Rosenberg, J. M.; Bouzida, D.; Swendsen, R. H.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 1011-1021
50. Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J. Comput. Chem. 1983, 4, 187-217
51. Cooper, J. Revised Release on the IAPWS Industrial Formulation 1997 for the Thermodynamic Properties of Water and Steam; University of London: London; 2007.
52. Setny, P.; Geller, M. J. Chem. Phys. 2006, 125, 144717
53. Preusser, A. ACM Trans. Math. Software 1998, 15, 79-89
54. Brovchenko, I.; Paschek, D.; Geiger, A. J. Chem. Phys. 2000, 113, 5026-5036
55. Li, Z.; Lazaridis, T. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 573-81
56. Giovambattista, N.; Lopez, C. F.; Rossky, P. J.; Debenedetti, P. G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2008, 105, 2274-2279
57. Carey, C.; Cheng, Y.-K.; Rossky, P. J. Chem. Phys. 2000, 258, 415-425
58. Baron, R.; Setny, P.; McCammon, J. A. J. Am. Chem. Soc. 2010, 132, 12091-12097.