Platform technology to identify potential disease markers and establish heritability and environmental determinants of the human serum N-glycome

Carbohydrate Research

Volumn 345, Issue 10, 2010, Pages 1280-1282

  Tharmalingam, Tharmala ^a   Mariño, Karina ^a   Rudd, Pauline M ^a  

^a UNIVERSITY COLLEGE DUBLIN   (Ireland)

Author keywords

Biomarker; Glycomics; High throughput; Serum N glycans

Indexed keywords

BIOMARKERS; BODY FLUIDS; MOLECULAR BIOLOGY; POLYSACCHARIDES; THROUGHPUT;

ENVIRONMENTAL DETERMINANTS; GENOME-WIDE ASSOCIATION STUDIES; GLYCOMICS; HIGH THROUGHPUT; HIGH-THROUGHPUT ANALYSIS; N-GLYCANS; PLATFORM TECHNOLOGY; STRUCTURAL CHARACTERIZATION;

ENVIRONMENTAL TECHNOLOGY;

GLYCAN DERIVATIVE; IMMUNOGLOBULIN G; SIALYL LEWIS X ANTIGEN; BIOLOGICAL MARKER; POLYSACCHARIDE;

CANCER GROWTH; CARBOHYDRATE ANALYSIS; CARBOHYDRATE SYNTHESIS; DISEASE MARKER; DNA POLYMORPHISM; ENVIRONMENTAL FACTOR; GLYCOBIOLOGY; GLYCOSYLATION; HERITABILITY; HIGH THROUGHPUT SCREENING; HUMAN; OVARY CANCER; PRIORITY JOURNAL; RHEUMATOID ARTHRITIS; ROBOTICS; SHORT SURVEY; BLOOD; DISEASES; ENVIRONMENT; GENETICS; PROCEDURES;

BIOLOGICAL MARKERS; DISEASE; ENVIRONMENT; GLYCOMICS; HUMANS; POLYSACCHARIDES; ROBOTICS;

EID: 77955796448     PISSN: 00086215     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1016/j.carres.2010.04.012     Document Type: Review

References (29)

1. Opdenakker, G.; Rudd, P. M.; Ponting, C. P.; Dwek, R. A. FASEB J. 1993, 7, 1330-1337.
2. Apweiler, R.; Hermjakob, H.; Sharon, N. Biochim. Biophys. Acta 1999, 1473, 4-8.
3. Freeze, H. H. Nat. Rev. Genet. 2006, 7, 537-551.
4. Zaia, J. Chem. Biol. 2008, 15, 881-892.
5. Domann, P. J.; Pardos-Pardos, A. C.; Fernandes, D. L.; Spencer, D. I.; Radcliffe, C. M.; Royle, L.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Proteomics 2007, 1, 70-76.
6. Royle, L.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Curr. Prot. Protein Sci. 2006, 12.6.1-12.6.45.
7. Royle, L.; Radcliffe, C. M.; White, D. M.; Harvey, D. J.; Abrahams, J. L.; Kim, Y. G.; Henry, G. W.; Shadick, N. A.; Weinblatt, M. E.; Lee, D. M.; Rudd, P. M.; Dwek, R.A. Anal. Biochem. 2008, 376, 1-12.
8. Campbell, M. P.; Royle, L.; Radcliffe, C. M.; Dwek, R. A.; Rudd, P. M. Bioinformatics 2008, 24, 1214-1216.
9. Parekh, R. B.; Sutton, B. J.; Fernandes, D. L.; Leung, A.; Stanworth, D.; Rademacher, T. W.; Mizuochi, T.; Taniguchi, T.; Matsuta, K.; Takeuchi, F.; Nagano, Y.; Miyamoto, T.; Kobata, A. Nature 1985, 316, 452-457.
10. Butler, M.; Quelhas, D.; Critchley, A. J.; Carchon, H.; Hebestreit, H. F.; Hibbert, R. G.; Vilarinho, L.; Teles, E.; Matthijs, G.; Schollen, E.; Argibay, P.; Harvey, D. J.; Dwek, R. A.; Jaeken, J.; Rudd, P. M. Glycobiology 2003, 13, 601-622.
11. Gindzienska-Sieskiewicz, E.; Klimiuk, P. A.; Kisiel, D. G.; Gindzienski, A.; Sierakowski, S. Clin. Rheumatol. 2007, 26, 685-690.
12. Singh, A. P.; Senapati, S.; Ponnusamy, M. P.; Jain, M.; Lele, S. M.; Davis, J. S.; Remmenga, S.; Batra, S. K. Lancet Oncol. 2008, 9, 1076-1085.
13. Nossov, V.; Amneus, M.; Su, F.; Lang, J.; Janco, J. M.; Reddy, S. T.; Farias-Eisner, R. Am. J. Obstet. Gynecol. 2008, 199, 215-223.
14. Leiserowitz, G. S.; Lebrilla, C.; Miyamoto, S.; An, H. J.; Duong, H.; Kirmiz, C.; Li, B.; Liu, H.; Lam, K. S. Int. J. Gynecol. Cancer 2008, 18, 470.
15. Saldova, R.; Royle, L.; Radcliffe, C. M.; Abd Hamid, U. M.; Evans, R.; Arnold, J. N.; Banks, R. E.; Hutson, R.; Harvey, D. J.; Antrobus, R.; Petrescu, S. M.; Dwek, R. A.;Rudd, P. M. Glycobiology 2007, 17, 1344.
16. Kannagi, R.; Izawa, M.; Koike, T.; Miyazaki, K.; Kimura, N. Cancer Sci. 2004, 95, 377-384.
17. Knezevic, A.; Polaek, O.; Gornik, O.; Rudan, I.; Campbell, H.; Hayward, C.; Wright, A.; Koli, I.; O'Donoghue, N.; Bones, J.; Rudd, P. M.; Lauc, G. J. Proteome Res. 2008, 8, 694-701.
18. Kwok, P.; Chen, X. Curr. Issues Mol. Biol. 2002, 5, 43-60.
19. Hardy, J.; Singleton, A. N. Eng. J. Med. 2009, 360, 1759-1768.
20. Merx, S.; Neumaier, M.; Wagner, H.; Kirschning, C. J.; Ahmad-Nejad, P. Hum. Mol. Genet. 2007, 16, 1225-1232.
21. Wray, N.; Goddard, M.; Visscher, P. Genome Res. 2007, 17, 1520.
22. Polašek, O.; Marušić , A.; Rotim, K.; Hayward, C.; Vitart, V.; Huffman, J.; Campbell, S.; Janković , S.; Boban, M.; Biloglav, Z.; Kolčić , I.; Krželj, V.; Terzić , J.; Matec, L.; Tometić , G.; Nonković , D.; Ninčević , J.; Pehlić , M.; Žedelj, J.; Velagić , V.; Juričić , D.; Kirac, I.; Kovačević , S. B.; Wright, A. F.; Campbell, H.; Rudan, I. Genomics 2009, 50, 7-16.
23. Lauc, G.; Huffman, J.; Hayward, C.; Knezevic, A.; Polasek, O.; Gornik, O.; Vitart, V.; Kolcic, I.; Biloglav, Z.; Zgaga, L.; Hastie, N.D.; Wright, A.F.; Campbell, H.; Rudd, P.M.; Rudan, I. Nat. Proceed., 2009, http://hdl.handle.net/ 10101/npre.2009.2864.1.
24. Osumi, D.; Takahashi, M.; Miyoshi, E.; Yokoe, S.; Lee, S. H.; Noda, K.; Nakamori, S.; Gu, J.; Ikeda, Y.; Kuroki, Y.; Sengoku, K.; Ishikawa, M.; Taniguchi, N. Cancer Sci. 2009, 100, 888-895.
25. Wang, X.; Inoue, S.; Gu, J.; Miyoshi, E.; Noda, K.; Li, W.; Mizuno-Horikawa, Y.; Nakano, M.; Asahi, M.; Takahashi, M.; Uozumi, N.; Ihara, S.; Lee, S. H.; Ikeda, Y.; Yamaguchi, Y.; Aze, Y.; Tomiyama, Y.; Fujii, J.; Suzuki, K.; Kondo, A.; Shapiro, S. D.; Lopez-Otin, C.; Kuwaki, T.; Okabe, M.; Honke, K.; Taniguchi, N. P. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 15791-15796.
26. Geng, F.; Shi, B. Z.; Yuan, Y. F.; Wu, X. Z. Cell Res. 2004, 14, 423-433.
27. Ogawa, S.; Emi, M.; Shiraki, M.; Hosoi, T.; Ouchi, Y.; Inoue, S. J. Hum. Genet. 2000, 45, 327-330.
28. Setiawan, V. W.; Hankinson, S. E.; Colditz, G. A.; Hunter, D. J.; De Vivo, I. Cancer Causes Control 2004, 15, 627-633.
29. Goulart, A. C.; Zee, R. Y. L.; Rexrode, K. M. Maturitas 2009, 62, 179-183.