PCR, sequencing and PCR-RFLP of the 5S-rRNA-NTS region as a tool for the DNA fingerprinting of medicinal and aromatic plants

Flavour and Fragrance Journal

Volumn 25, Issue 3, 2010, Pages 132-137

  Gnavi, Giorgio ^a   Bertea, Cinzia M ^a   Maffei, Massimo E ^a  

^a UNIVERSITY OF TURIN   (Italy)

Author keywords

5S rRNA; DNA fingerprinting; Medicinal and aromatic plants; Non transcribed sequence region; PCR RFLP

Indexed keywords

AROMATIC PLANTS; DNA FINGERPRINTING; GENETIC METHODS; GENOME EVOLUTION; HERBAL MEDICINES; HIGHER PLANTS; INTRASPECIFIC VARIATION; MOLECULAR DISCRIMINATION; MOLECULAR GENETICS; NANOGRAMS; PCR APPROACH; PCR-RFLP; PHYLOGENETIC RECONSTRUCTION; PLANT SPECIES; RAPID IDENTIFICATION; RRNA GENES;

AROMATIC COMPOUNDS; AROMATIZATION; DNA; RNA; SOFTWOODS; TRANSCRIPTION;

GENES;

DNA 5S; ESSENTIAL OIL; HERBACEOUS AGENT; RNA 5S;

DNA DETERMINATION; DNA FINGERPRINTING; GENE SEQUENCE; GENETIC ANALYSIS; GENOME ANALYSIS; GENOTYPE; HIGH PERFORMANCE LIQUID CHROMATOGRAPHY; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS FRAGMENTOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; MEDICINAL PLANT; MOLECULAR GENETICS; MOLECULAR PHYLOGENY; NONHUMAN; PHENOTYPE; POLYMERASE CHAIN REACTION; RESTRICTION FRAGMENT LENGTH POLYMORPHISM; REVIEW;

EMBRYOPHYTA;

EID: 77951564814     PISSN: 08825734     EISSN: 10991026     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/ffj.1970     Document Type: Review

References (66)

1. Z. H. Cai, P. Li, T. T. X. Dong, K. W. K. Tsim. Planta Med. 1999, 65, 360.
2. P. Rubiolo, M. Matteodo, C. Bicchi, G. Appendino, G. Gnavi, C. M. Bertea, M. E. Maffei. J. Agric. Food Chem. 2009, 57, 3436.
3. P. Luciano, C. M. Bertea, G. Temporale, M. E. Maffei. Forens. Sci. Int. Genet. 2007, 1, 262.
4. C. M. Bertea, C. M. M. Azzolin, S. Bossi, G. Doglia, M. E. Maffei. Phytochemistry 2005, 66, 507.
5. G. R. Brown, J. E. Carlson. Theoret. Appl. Genet. 1997, 95, 1.
6. Y. K. Park, K. C. Park, C. H. Park, N. S. Kim. Mol. Cell 2000, 10, 18.
7. G. I. Scoles, B. S. Gill, Z.-Y. Xin, B. C. Clarke, C. L. McIntyre, C. Chapman, R. Appels. Plant Syst. Evol. 1988, 160, 105.
8. S. H. Lee, G. S. Do, B. B. Seo. Chromatogr. Res. 1999, 7, 89.
9. M. S. Negi, J. Rajagopal, N. Chauhan, R. Cronn, M. Lakshmikumaran. Genome 2002, 45, 1181.
10. W. J. Baker, T. A. Hedderson, J. Dransfield. Mol. Phylogen. Evol. 2000, 14, 218.
11. J. F. Trontin, C. Grandemange, J. M. Favre. Genome 1999, 42, 837.
12. N. Sugimoto, F. Kiuchi, M. Mikage, M. Mori, H. Mizukami, Y. Tsuda. Biol. Pharmacol. Bull. 1999, 22, 481.
13. A. V. Cox, M. D. Bennett, T. A. Dyer. Theoret. Appl. Genet. 1992, 83, 684.
14. F. Udovicic, G. I. Mcfadden, P. Y. Ladiges. Mol. Phylogen. Evol. 1995, 4, 247.
15. K. Bachmann. New Phytol. 1994, 126, 403.
16. L. M. Foster, K. R. Kozak, M. G. Loftus, J. J. Stevens, I. K. Ross. Mycol. Res. 1993, 97, 769.
17. T. Stadejek. Med. Weteryn. 2006, 62, 390.
18. S. A. Deepak, K. R. Kottapalli, R. Rakwal, G. Oros, K. S. Rangappa, H. Iwahashi, Y. Masuo, G. K. Agrawal. Curr. Genom. 2007, 8, 234.
19. H. Kotani, S. Tabata. Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1998, 49, 151.
20. S. Gibson, C. Somerville. Trends Biotechnol. 1993, 11, 306.
21. K. Semagn, A. Bjornstad, M. N. Ndjiondjop. Afr. J. Biotechnol. 2006, 5, 2540.
22. T. Harada, K. Matsukawa, T. Sato, R. Ishikawa, M. Niizeki, K. Saito. Euphytica 1993, 65, 87.
23. V. Tesevic, S. Milosavljevic, V. Vajs, I. Dordevic, M. Sokovic, V. Lavadinovic, M. Novakovic. J. Serbian Chem. Soc. 2009, 74, 1035.
24. V. Amarasinghe, J. E. Carlson. J. Hered. 1998, 89, 495.
25. E. Duquesnoy, V. Castola, J. Casanova. Flavour Fragr. J. 2007, 22, 293.
26. V. Besendorfer, I. Krajacic-Sokol, S. Jelenic, J. Puizina, J. Mlinarec, T. Sviben, D. Papes. Theoret. Appl. Genet. 2005, 110, 730.
27. E. Puchalska, B. Czajkowska, M. Kielkiewicz. Acta Physiol. Plant 2008, 30, 225.
28. Z. L. Liu, D. M. Zhang, X. Q. Wang, X. F. Ma, X. R. Wang. Am. J. Bot. 2003, 90, 17.
29. P. V. Petrakis, C. Tsitsimpikou, O. Tzakou, M. Couladis, C. Vagias, V. Roussis. Flavour Fragr. J. 2001, 16, 249.
30. S. W. Gorman, R. D. Teasdale, C. A. Cullis. Plant Syst. Evol. 1992, 183, 223.
31. G. F. Moran, D. Smith, J. C. Bell, R. Appels. Plant Syst. Evol. 1992, 183, 209.
32. A. S. Timeryanov. Khimiya Prirodn. Soed. 1994, 640.
33. D. R. Batish, H. P. Singh, S. K. Kohli, S. Kaur. Forest Ecol. Manag. 2008, 256, 2166.
34. D. J. Boland, J. J. Brophy. ACS Symp. Ser. 1993, 525, 72.
35. M. Meyberg, S. Krohn, B. Brummer, U. Kristen. Flora 1991, 185, 357.
36. R. M. Smith, J. A. Marshall, M. R. Davey, K. C. Lowe, J. B. Power. Phytochemistry 1996, 43, 753.
37. K. Venkateswarlu, S. W. Lee, R. N. Nazar. Gene 1991, 105, 249.
38. E. S. Poyrazoglu, O. Yemis, C. Kadakal, N. Artik. J. Sci. Food Agric. 2005, 85, 1435.
39. S. Krist, G. Stuebiger, S. Bail, H. Unterweger. Eur. J. Lipid Sci. Technol. 2006, 108, 48.
40. R. G. Schneeberger, C. A. Cullis. Plant Syst. Evol. 1992, 183, 265.
41. H. Zhou, Y. X. Huang, T. Hoshi, Y. Kashiwagi, J. Anzai, G. X. Li. Anal. Bioanal. Chem. 2005, 382, 1196.
42. L. F. Liu, T. Liu, G. X. Li, Q. Wang, T. Ng. Anal. Bioanal. Chem. 2003, 376, 854.
43. S. Bhatia, K. Singh, V. Jagannathan, M. Lakshmikumaran. Plant Sci. 1993, 92, 47.
44. I. Capesius. J. Plant Physiol. 1993, 142, 112.
45. M. Miyazawa, T. Maehara, K. Kurose. Flavour Fragr. J. 2002, 17, 187.
46. K. Singh, S. Bhatia, M. Lakshmikumaran. Genome 1994, 37, 121.
47. N. Benkeblia. Food Sci. Technol. 2004, 37, 263.
48. F. Shibata, M. Hizume. Theoret. Appl. Genet. 2002, 105, 167.
49. G. Zhang, L. Qin, Y. Y. Shi. J. Bone Miner. Res. 2007, 22, 1072.
50. R. H. Hui, D. Y. Hou, T. C. Li, C. X. Guan, Y. Q. Zhu, X. Y. Liu. Chin. J. Anal. Chem. 2004, 32, 695.
51. Y. Sun, K. P. Fung, P. C. Leung, D. W. Shi, P. C. Shaw. Planta Med. 2004, 70, 287.
52. H. Akhlaghi, A. Rustaiyan, K. Larijani, A. Shafaghat, N. Masnabadi, S. Masoudi. J. Essent. Oil Res. 2007, 19, 269.
53. S. Sinclair. Altem. Med. Rev. 2009, 3, 338.
54. X. Q. Ma, J. A. Duan, D. Y. Zhu, T. T. X. Dong, K. W. K. Tsim. Phytochemistry 2000, 54, 363.
55. P. Werkhoff, W. Bretschneider, M. Guntert, R. Hopp, H. Surburg. Z. Lebens. Unt. Forsch. 1991, 192, 111.
56. F. Chen, H. Y. E. Chan, K. L. Wong, J. Wang, M. T. Yu, P. P. H. But, P. C. Shaw. Planta Med. 2008, 74, 889.
57. K. Babu, E. W. Boyer, C. Hernon, E. Brush. Clin. Ped. Emerg. Med. 2005, 6, 81.
58. D. J. Siebert. J. Ethnopharmacol. 1994, 43, 53.
59. C. M. Bertea, P. Luciano, S. Bossi, F. Leoni, C. Baiocchi, C. Medana, C. M. Azzolin, G. Temporale, M. A. Lombardozzi, M. E. Maffei. Phytochemistry 2006, 67, 371.
60. R. Bucheler, C. H. Gleiter, R. Schwoerer, I. Gaertner. Pharmacopsychiatry 2005, 38, 1.
61. D. W. Lachenmeier, S. G. Walch, S. A. Padosch, L. U. Kroner. Crit. Rev. Food Sci. Nutr. 2006, 46, 365.
62. D. W. Lachenmeier, J. Emmert, T. Kuballa, G. Sartor. Forens. Sci. Int. 2006, 158, 1.
63. Council Directive (EEC) No 88/388. J. Eur. Commun. 1998, L184, 61.
64. C. Rey, I. Slacanin. Rev. Suisse Viticult. Arboricult. Horticult. 1997, 39, 1.
65. R. Holmes. New Sci. 2004, 2453, 32.
66. W. J. Kress, K. J. Wurdack, E. A. Zimmer, L. A. Weigt, D. H. Janzen. Proc. Natl Acad. Sci. USA 2005, 102, 8369.