Computational studies on response and binding selectivity of fluorescence sensors

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 114, Issue 2, 2010, Pages 870-876

  Hudson, George A ^a   Cheng, Lei ^a   Yu, Jiamei ^a   Yan, Yong ^a   Dyer, Daniel J ^a   McCarroll, Matthew E ^a   Wang, Lichang ^a  

^a SOUTHERN ILLINOIS UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BINDING ENERGY; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; ELECTRON TRANSITIONS; FLUOROPHORES; MOLECULAR ORBITALS;

B3LYP CALCULATIONS; BASIS SETS; BINDING SELECTIVITY; COMPUTATIONAL DESIGN; COMPUTATIONAL STRATEGY; COMPUTATIONAL STUDIES; DENSITY FUNCTIONAL THEORY CALCULATIONS; DIVALENT CATION; FLUORESCENCE SENSORS; FLUORESCENT SENSORS; LUMO ENERGY; MOLECULAR ORBITAL ENERGY; PHOTO-INDUCED ELECTRON TRANSFER; RELATIVE ENERGIES; TIME-DEPENDENT;

SENSORS;

EID: 75649094168     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp908368k     Document Type: Article

References (29)

1. McCarroll, M. E.; Shi, Y.; Harris, S.; Puli, S.; Kimaru, I.; Xu, R.; Wang, L.; Dyer, D. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 22991.
2. Wu, X.; Kim, J.; Dordick, J. S. Biotechnol. Pros. 2000, 16, 513.
3. Shiraishi, Y.; Ichimuraa, C.; Hiraia, T. Tetrahedron Lett. 2007, 48, 7769.
4. Burdette, S. C.; Frederickson, C. J.; Bu, W.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 1778.
5. Burdette, S. C.; Walkup, G. K.; Spingler, B.; Tsien, R. Y.; Lippard, S. J. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 7831.
6. Komatsu, K.; Kikuchi, K.; Kojima, H.; Urano, Y.; Nagano, T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 10197.
7. Kawabata, E.; Kikuchi, K.; Urano, Y.; Kojima, H.; Odani, A.; Nagano, T. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 818.
8. Taki, M.; Wolford, J. L.; O'Halloran, T. V. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 712.
9. Maske, H. Naturwissenschaften 1955, 42, 424.
10. Eom, S.-J.; Kim, E. Y.; Lee, J. E.; Kang, H. J.; Shim, J.; Kim, S. U.; Gwag, B. J.; Choi, E.-J. Mol. Pharm. 2001, 59, 981.
11. Bozym, R. A.; Thompson, R. B.; Stoddard, A. K.; Fierke, C. A. ACS Chem. Biol. 2006, 1.
12. Maruyama, S.; Kikuchi, K.; Hirano, T.; Urano, Y.; Nagano, T. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 10650.
13. Wu, Z.; Ma, Y. Z. J. S.; Yang, G. Inors. Chem. 2006, 45, 3140.
14. Koike, T.; Watanabe, T.; Aoki, S.; Kimura, E.; Shiro, M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 12696.
15. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
16. Becke, A. D. Phys. Rev.A 1998, 38, 3098.
17. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev.B 1998, 37, 785.
18. Miehlich, B.; Savin, A.; Stoll, H.; Preuss, H. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 200.
19. Tirado-Rivers, J.; Jorgensen, W. L. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 297.
20. Tada, M. K. T.; Yoshizawa, K. Chem. Phys. Lett. 2005, 412, 55.
21. Cramariuc, O.; Hukka, T. I.; Rantala, T. T.; Lemmetyinen, H. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 12470.
22. Braden, D. A.; Tyler, D. R. Orsanometallics 2000, 19, 3762.
23. Badaeva, E. A.; Timofeeva, T. V.; Masunov, A.; Tretiak, S. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 7276.
24. Danielsson, J.; Ulicny, J.; Laaksonen, A. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 9817.
25. Turki, M.; Daniel, C.; Zalis, S.; Vlcek Jr, A.; van Slageren, J.; Stufkens, D. J. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11431.
26. Jaworska, M.; Andruniow, P. L. T.; Kozlowski, P. M. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 2419.
27. Kurashige, Y.; Nakajima, T.; Kurashige, S.; Hirao, K.; Nishikitani, Y. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 5544.
28. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. N.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A. J.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalamni, G.; Rega, N. Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stramann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; PiskorZ, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. j.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Grill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision B.05; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
29. CRC Handbook of Chemistry and Physics, 85th ed.; CRC Press: New York, 2004.