-
1
-
-
33748272936
-
-
Muthusamy, M.; Burrell, M. R.; Thorneley, R. N. F.; Bornemann. S. Biochemistry 2006, 45, 10667-10673.
-
(2006)
Biochemistry
, vol.45
, pp. 10667-10673
-
-
Muthusamy, M.1
Burrell, M.R.2
Thorneley, R.N.F.3
Bornemann, S.4
-
2
-
-
33750289491
-
-
Bandaranayake, K. M. P.; Wang, R.; Johnson, T. W.; Hastings, G. Biochemistry 2006, 45, 12733-12740.
-
(2006)
Biochemistry
, vol.45
, pp. 12733-12740
-
-
Bandaranayake, K.M.P.1
Wang, R.2
Johnson, T.W.3
Hastings, G.4
-
3
-
-
44849130393
-
-
Hastings, G.; Bandaranayake, K. M. P.; Carrion, E. Biophys. J. 2008, 94, 4383-4392.
-
(2008)
Biophys. J
, vol.94
, pp. 4383-4392
-
-
Hastings, G.1
Bandaranayake, K.M.P.2
Carrion, E.3
-
6
-
-
0000928098
-
-
Eichinger, M.; Tavan, P.; Hutter, J.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1999, 110, 10452-10467.
-
(1999)
J. Chem. Phys
, vol.110
, pp. 10452-10467
-
-
Eichinger, M.1
Tavan, P.2
Hutter, J.3
Parrinello, M.4
-
8
-
-
0037426786
-
-
Nonella, M.; Mathias, G.; Eichinger, M.; Tavan, P. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 316-322.
-
(2003)
J. Phys. Chem. B
, vol.107
, pp. 316-322
-
-
Nonella, M.1
Mathias, G.2
Eichinger, M.3
Tavan, P.4
-
9
-
-
0242365465
-
-
Nonella, M.; Mathias, G.; Tavan, P. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 8638-8647.
-
(2003)
J. Phys. Chem. A
, vol.107
, pp. 8638-8647
-
-
Nonella, M.1
Mathias, G.2
Tavan, P.3
-
10
-
-
3342946959
-
-
Klähn, M.; Mathias, G.; Kotting, C.; Nonella, M.; Schlitter, J.; Gerwert, K.; Tavan, P. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6186-6194.
-
(2004)
J. Phys. Chem. A
, vol.108
, pp. 6186-6194
-
-
Klähn, M.1
Mathias, G.2
Kotting, C.3
Nonella, M.4
Schlitter, J.5
Gerwert, K.6
Tavan, P.7
-
12
-
-
22244451654
-
-
Klahn, M.; Schlitter, J.; Gerwert, K. Biophys. J. 2005, 88, 3829-3844.
-
(2005)
Biophys. J
, vol.88
, pp. 3829-3844
-
-
Klahn, M.1
Schlitter, J.2
Gerwert, K.3
-
13
-
-
32344438115
-
-
Freindorf, M.; Shao, Y.; Brown, S. T.; Kong, J.; Furlani, T. R. Chem. Phys. Lett. 2006, 419, 563-566.
-
(2006)
Chem. Phys. Lett
, vol.419
, pp. 563-566
-
-
Freindorf, M.1
Shao, Y.2
Brown, S.T.3
Kong, J.4
Furlani, T.R.5
-
14
-
-
34548730298
-
-
Mroginski, M. A.; Mark, F.; Thiel, W.; Hildebrandt, P. Biophys. J. 2007, 93, 1885-1894.
-
(2007)
Biophys. J
, vol.93
, pp. 1885-1894
-
-
Mroginski, M.A.1
Mark, F.2
Thiel, W.3
Hildebrandt, P.4
-
15
-
-
52649107474
-
-
Herrmann, C.; Neugebauer, J.; Reiher, M. J. Comput. Chem. 2008, 29, 2460-2470.
-
(2008)
J. Comput. Chem
, vol.29
, pp. 2460-2470
-
-
Herrmann, C.1
Neugebauer, J.2
Reiher, M.3
-
17
-
-
0033515394
-
-
Dapprich, S.; Komaromi, I.; Byun, K. S.; Morokuma, K.; Frisch, M. J. J. Mol. Struct. (Theochem) 1999, 461-462, 1-21.
-
(1999)
J. Mol. Struct. (Theochem)
, vol.461-462
, pp. 1-21
-
-
Dapprich, S.1
Komaromi, I.2
Byun, K.S.3
Morokuma, K.4
Frisch, M.J.5
-
19
-
-
0028232615
-
-
Govindaraj, S.; Eisenstein, E.; Jones, L. H.; Sanders-Loehr, J.; Chistoserdov, A. Y.; Davidson, V. L.; Edwards, S. L. J. Bacteriol. 1994, 176, 2922-2929.
-
(1994)
J. Bacteriol
, vol.176
, pp. 2922-2929
-
-
Govindaraj, S.1
Eisenstein, E.2
Jones, L.H.3
Sanders-Loehr, J.4
Chistoserdov, A.Y.5
Davidson, V.L.6
Edwards, S.L.7
-
20
-
-
33645801770
-
-
Masgrau, L.; Roujeinikova, A.; Johannissen, L. O.; Hothi, P.; Basran, J.; Ranaghan, K. E.; Mulholland, A. J.; Sutcliffe, M. J.; Scrutton, N. S.; Leys, D. Science 2006, 312, 237-241.
-
(2006)
Science
, vol.312
, pp. 237-241
-
-
Masgrau, L.1
Roujeinikova, A.2
Johannissen, L.O.3
Hothi, P.4
Basran, J.5
Ranaghan, K.E.6
Mulholland, A.J.7
Sutcliffe, M.J.8
Scrutton, N.S.9
Leys, D.10
-
21
-
-
34547897921
-
-
Roujeinikova, A.; Hothi, P.; Masgrau, L.; Sutcliffe, M. J.; Scrutton, N. S.; Leys, D. J. Biol. Chem. 2007, 282, 23766-23777.
-
(2007)
J. Biol. Chem
, vol.282
, pp. 23766-23777
-
-
Roujeinikova, A.1
Hothi, P.2
Masgrau, L.3
Sutcliffe, M.J.4
Scrutton, N.S.5
Leys, D.6
-
22
-
-
0029867254
-
-
Moenne-Loccoz, P.; Nakamura, N.; Itoh, S.; Fukuzumi, S.; Gorren, A. C. F.; Duine, J. A.; Sanders-Loehr, J. Biochemistry 1996, 35, 4713-4720.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 4713-4720
-
-
Moenne-Loccoz, P.1
Nakamura, N.2
Itoh, S.3
Fukuzumi, S.4
Gorren, A.C.F.5
Duine, J.A.6
Sanders-Loehr, J.7
-
23
-
-
0025936407
-
-
Backes, G.; Davidson, V. L.; Huitema, F.; Duine, J. A.; Sanders- Loehr, J. Biochemistry 1991, 30, 9201-9210.
-
(1991)
Biochemistry
, vol.30
, pp. 9201-9210
-
-
Backes, G.1
Davidson, V.L.2
Huitema, F.3
Duine, J.A.4
Sanders- Loehr, J.5
-
24
-
-
84962349001
-
-
Cossi, M.; Rega, N.; Scalmani, G.; Barone, V. J. Comput. Chem. 2003, 24, 669-681.
-
(2003)
J. Comput. Chem
, vol.24
, pp. 669-681
-
-
Cossi, M.1
Rega, N.2
Scalmani, G.3
Barone, V.4
-
25
-
-
0033722017
-
-
Cammi, R.; Mennucci, B.; Tomasi, J. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 5631-5637.
-
(2000)
J. Phys. Chem. A
, vol.104
, pp. 5631-5637
-
-
Cammi, R.1
Mennucci, B.2
Tomasi, J.3
-
27
-
-
75249090940
-
-
Frisch, M. J, Trucks, G. W, Schlegel, H. B, Scuseria, G. E, Robb, M. A, Cheeseman, J. R, Montgomery, J, J. A, Vreven, T, Kudin, K. N, Burant, J. C, Millam, J. M, Iyengar, S. S, Tomasi, J, Barone, V, Mennucci, B, Cossi, M, Scalmani, G, Rega, N, Petersson, G. A, Nakatsuji, H, Hada, M, Ehara, M, Toyota, K, Fukuda, R, Hasegawa, J, Ishida, M, Nakajima, T, Honda, Y, Kitao, O, Nakai, H, Klene, M, Li, X, Knox, J. E, Hratchian, H. P, Cross, J. B, Bakken, V, Adamo, C, Jaramillo, J, Gomperts, R, Stratmann, R. E, Yazyev, O, Austin, A. J, Cammi, R, Pomelli, C, Ochterski, J. W, Ayala, P. Y, Morokuma, K, Voth, G. A, Salvador, P, Dannenberg, J. J, Zakrzewski, V. G, Dapprich, S, Daniels, A. D, Strain, M. C, Farkas, O, Malick, D. K, Rabuck, A. D, Raghavachari, K, Foresman, J. B, Ortiz, J. V, Cui, Q, Baboul, A. G, Clifford, S, Cioslowski, J, Stefanov, B. B, Liu, G, Liashenko, A, Piskorz, P, Komaromi, I, Martin, R. L, Fox, D. J, Keith
-
Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J., J. A.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03; Gaussian, Inc.: Wallingford CT, 2004.
-
-
-
-
29
-
-
33745713377
-
-
Pierdominici-Sottile, G.; Echave, J.; Palma, J. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 11592-11599.
-
(2006)
J. Phys. Chem. B
, vol.110
, pp. 11592-11599
-
-
Pierdominici-Sottile, G.1
Echave, J.2
Palma, J.3
-
30
-
-
23144457576
-
-
Gordon, J. C.; Myers, J. B.; Folta, T.; Shoja, V.; Heath, L. S.; Onufriev, A. Nucleic Acids Res. 2005, 33, W368-371.
-
(2005)
Nucleic Acids Res
, vol.33
-
-
Gordon, J.C.1
Myers, J.B.2
Folta, T.3
Shoja, V.4
Heath, L.S.5
Onufriev, A.6
-
32
-
-
0029011701
-
-
Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, J., K. M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179-5197.
-
(1995)
J. Am. Chem. Soc
, vol.117
, pp. 5179-5197
-
-
Cornell, W.D.1
Cieplak, P.2
Bayly, C.I.3
Gould, I.R.4
Merz, J.K.M.5
Ferguson, D.M.6
Spellmeyer, D.C.7
Fox, T.8
Caldwell, J.W.9
Kollman, P.A.10
-
33
-
-
23444454552
-
-
Case, D. A.; Cheatham, T. E., 3rd; Darden, T.; Gohlke, H.; Luo, R.; Merz, J., K. M.; Onufriev, A.; Simmerling, C.; Wang, B.; Woods, R. J. J. Comput. Chem. 2005, 26, 1668-1688.
-
(2005)
J. Comput. Chem
, vol.26
, pp. 1668-1688
-
-
Case, D.A.1
Cheatham 3rd, T.E.2
Darden, T.3
Gohlke, H.4
Luo, R.5
Merz, J.K.M.6
Onufriev, A.7
Simmerling, C.8
Wang, B.9
Woods, R.J.10
-
34
-
-
58149290224
-
Hybrid Methods: ONIOM(QM:MM) and QM/MM
-
Elsevier
-
Vreven, T.; Morokuma, K.; David, C. S., Chapter 3 Hybrid Methods: ONIOM(QM:MM) and QM/MM. In Annual Reports in Computational Chemistry, Elsevier: 2006; Vol 2, pp 35-51.
-
(2006)
Annual Reports in Computational Chemistry
, vol.2
, pp. 35-51
-
-
Vreven, T.1
Morokuma, K.2
David, C.S.3
-
36
-
-
84988148225
-
-
Nonaka, Y.; Tsuboi, M.; Nakamoto, K. J. Raman Spectrosc. 1990, 21, 133-141.
-
(1990)
J. Raman Spectrosc
, vol.21
, pp. 133-141
-
-
Nonaka, Y.1
Tsuboi, M.2
Nakamoto, K.3
-
37
-
-
33751010484
-
-
Sukumar, N.; Chen, Z.; Ferrari, D.; Merli, A.; Rossi, G. L.; Bellamy, H. D.; Chistoserdov, A.; Davidson, V. L.; Mathews, F. S. Biochemistry 2006, 45, 13500-13510.
-
(2006)
Biochemistry
, vol.45
, pp. 13500-13510
-
-
Sukumar, N.1
Chen, Z.2
Ferrari, D.3
Merli, A.4
Rossi, G.L.5
Bellamy, H.D.6
Chistoserdov, A.7
Davidson, V.L.8
Mathews, F.S.9
|