Trends in molluscan gene sequence similarity: An observation from genes expressed within the hypobranchial gland of Dicathais orbita (Gmelin, 1791) (Neogastropoda: Muricidae)

Nautilus

Volumn 123, Issue 3, 2009, Pages 154-158

  Laffy, Patrick W ^a   Benkendorff, Kirsten ^a   Abbott, Catherine A ^a  

^a FLINDERS UNIVERSITY   (Australia)

Author keywords

DNA; Gastropoda

Indexed keywords

ANIMALIA; ASCOMYCOTA; BACTERIA (MICROORGANISMS); CILIOPHORA; DICATHAIS ORBITA; FUNGI; GASTROPODA; INVERTEBRATA; MOLLUSCA; MURICIDAE; NEOGASTROPODA; PROTOZOA; STREPTOPHYTA; VERTEBRATA;

EID: 72149097627     PISSN: 00281344     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Conference Paper

References (20)

1. Abernathy, J. W., P. Xu, P. Li, D. H. Xu, H. Kucuktas, P. Klesius, C. Arias, and Z. J. Liu. 2007. Generation and analysis of expressed sequence tags from the ciliate protozoan parasite Ichthyophthirius multifiliis. BMC Genomics 8: 1-10.
2. Aguinaldo, A. M. A., J. M. Turbeville, L. S. Linford, M. C. Rivera, J. R. Garey, R. A. Raff, and J. A. Lake. 1997. Evidence for a clade of nematodes, arthropods and other moulting animals. Nature 387: 489-493.
3. Baker, J. T. 1974. Tyrian purple: an ancient dye, a modern problem. Endeavour (Oxford). 33: 11-17.
4. Barnes, D. W., C. J. Mattingly, A. Parton, L. M. Dowell, C. J. Bayne, and J. N. Forrest. 2004. Marine organism cell biology and regulatory sequence discovery in comparative functional genomics 46: 123-137.
5. Beesley, P. L., G. J. B. Ross, and A. Wells. 1998. Mollusca: The Southern Synthesis. Fauna of Australia, CSIRO Publishing, Melbourne, Part A, xvi + 563 pp., Part B, viii + pp. 565-1234.
6. Colgan, D. J., W. F. Ponder, E. Beacham, and J. Macaranas. 2007. Molecular phylogenetics of Caenogastropoda (Gastropoda: Mollusca). Molecular Phylogenetics and Evolution 42: 717-737.
7. Collins, F. S., M. Morgan, and A. Patrinos. 2003. The Human Genome Project: lessons from large scale biology. Science 300: 286-290.
8. Cooksey, C. J. 2001. Tyrian purple: 6, 6'-dibromoindigo and related compounds. Molecules 6: 736-769.
9. Diatchenko, L., S. Lukyanov, Y. F. C. Lau, and P. D. Siebert. 1999. Suppression subtractive hybridization: a versatile method for identifying differentially expressed genes, cDNA preparation and characterization. Methods In Enzymology 303: 349-380.
10. Epstein, E., M. W. Nabors, and B. B. Stowe. 1967. Origin of Indigo of Woad. Nature. 216: 547-549.
11. Galagan, J. E., S. E. Calvo, K. A. Borkovich, E. U. Selker, N. D. Read, D. Jaffe, W. FitzHugh, L.-J. Ma, S. Smirnov, S. Purcell, B. Rehman, T. Elkins, R. Engels, S. Wang, C. B. Nielsen, J. Butler, M. Endrizzi, D. Qui, P. Ianakiev, D. Bell-Pedersen, M. A. Nelson, M. Werner-Washburne, C. P. Selitrennikoff, J. A. Kinsey, E. L. Braun, A. Zelter, U. Schulte, CO. Kothe, G. Jedd, W. Mewes, C. Staben, E. Marcotte, D. Greenberg, A. Roy, K. Foley, J. Naylor, N. Stange-Thomann, R. Barrett, S. Gnerre, M. Kamal, M. Kamvysselis, E. Mauceli, C. Bielke, S. Rudd, D. Frishman, S. Krystofova, C. Rasmussen, R. L. Metzenberg, D. D. Perkins, S. Kroken, C. Cogoni, G. Macino, D. Catcheside, W. Li, R. J. Pratt, S. A. Osmani, C. P. C. DeSouza, L. Glass, M. J. Orbach, J. A. Berglund, R. Voelker, O. Yarden, M. Plamann, S. Seiler, J. Dunlap, A. Radford, R. Aramayo, D. O. Natvig, L. A. Alex, G. Mannhaupt, D. J. Ebbole, M. Freitag, I. Paulsen, M. S. Sachs, E. S. Lander, C. Nusbaum, and B. Birren. 2003. The genome sequence of the filamentous fungus Neurospora crassa. Nature 422: 859-868. (Pubitemid 36520034)
12. Harasewych, M. G., S. L. Adamkewicz, J. A. Blake, D. Saudek, T. Spriggs, and C. J. Bult. 1997. Neogastropod phylogeny: A molecular perspective. Journal of Molluscan Studies 63: 327-351.
13. Heckman, D. S., D. M. Geiser, B. R. Eidell, R. L. Stauffer, N. L. Kardos, and S. B. Hedges. 2001. Molecular evidence for the early colonization of land by fungi and plants. Science 293: 1129-1133.
14. Lobban, C. S., L. Modeo, F. Verni, and G. Rosati. 2005. Euplotes uncinatus (Ciliophora, Hypotrichia), a new species with zooxanthellae. Marine Biology 147: 1055-1061.
15. Mayser, P., M. Wenzel, H. J. Kramer, B. L. J. Kindler, P. Spiteller, and G. Haase. 2007. Production of indole pigments by Candida glahrata. Medical Mycology 45: 519-524.
16. NCBI [National Center for Biotechnology Information]. 2007. ENTREZ Genome Project Home Website, http://www.ncbi.nlm.nih.gov/sites/entrez?db=genomeprj, accessed 17 December 2007.
17. Oliverio, M. and P. Mariottini. 2001. A molecular framework for the phylogeny of Coralliophila and related muricoids. Journal of Molluscan Studies 67: 215-224.
18. Pechenik, J. A. 2000. Biology of the Invertebrates. Fourth Edition. McGraw-Hill Higher Education, Boston, 578 pp.
19. Venter, J. C., M. D. Adams, E. W Myers, P. W. Li, R. J. Mural, G. G. Sutton, H. O. Smith, M. Yandell, C. A. Evans, R. A. Holt, J. D. Gocayne, P. Amanatides, R. M. Ballew, D. H. Huson, J. R. Wortman, Q. Zhang, C. D. Kodira, X. H. Zheng, L. Chen, M. Skupski, G. Subramanian, P. D. Thomas, J. Zhang, G. L. Gabor Miklos, C. Nelson, S. Broder, A. G. Clark, J. Nadeau, V. A. McKusick, N. Zinder, A. J. Levine, R. J. Roberts, M. Simon, C. Slayman, M. Hunkapiller, R. Bolanos, A. Delcher, I. Dew, D. Fasulo, M. Flanigan, L. Florea, A. Halpern, S. Hannenhalli, S. Kravitz, S. Levy, C. Mobarry, K. Reinert, K. Remington, J. Abu-Threideh, E. Beasley, K. Biddick, V. Bonazzi, R. Brandon, M. Cargill, I. Chandramouliswaran, R. Charlab, K. Chaturvedi, Z. Deng, V. D. Francesco, P. Dunn, K. Eilbeck, C. Evangelista, A. E. Gabrielian, W. Gan, W. Ge, F. Gong, Z. Gu, P. Guan, T. J. Heiman, M. E. Higgins, R.-R. Ji, Z. Ke, K. A. Ketchum, Z. Lai, Y. Lei, Z. Li, J. Li, Y. Liang, X. Lin, F. Lu, G. V. Merkulov, N. Milshina, H. M. Moore, A. K. Naik, V. A. Narayan, B. Neelam, D. Nusskern, D. B. Rusch, S. Salzberg, W. Shao, B. Shue, J. Sun, Z. Y. Wang, A. Wang, X. Wang, J. Wang, M.-H. Wei, R. Wides, C. Xiao, C., Yan, A. Yao, J. Ye, M. Zhan, W. Zhang, H. Zhang, Q. Zhao, L. Zheng, F. Zhong, W. Zhong, S. C. Zhu, S. Zhao, D. Gilbert, S. Baumhueter, G. Spier, C. Carter, A. Cravchik, T. Woodage, F. Ali, H. An, A. Awe, D. Baldwin, H. Baden, M. Barnstead, I. Barrow, K. Beeson, D. Busam, A. Carver, A. Center, M. L. Cheng, L. Curry, S. Danaher, L. Davenport, R. Desilets, S. Dietz, K. Dodson, L. Doup, S. Ferriera, N. Garg, A. Gluecksmann, B. Hart, J. Haynes, C. Haynes, C., Heiner, S. Hladun, D. Hostin, J. Houck, T. Howland, C. Ibegwam, J. Johnson, F. Kalush, L. Kline, S. Koduru, A. Love, F. Mann, D. May, S. McCawley, T. McIntosh, I. McMullen, M. Moy, L. Moy, B. Murphy, K. Nelson, C. Pfannkoch, E. Pratts, V. Puri, H. Qureshi, M. Reardon, R. Rodriguez, Y.-H. Rogers, D. Romblad, B. Ruhfel, R. Scott, C. Sitter, M. Smallwood, E. Stewart, R. Strong, E. Suh, R. Thomas, N. N. Tint, S. Tse, C. Vech, G. Wang, J. Wetter, S. Williams, M. Williams, S. Windsor, E. Winn-Deen, K. Wolfe, J. Zaveri, K. Zaveri, J. F. Abril, R. Guigo, M. J. Campbell, K. V Sjolander, B. Karlak, A. Kejariwal, H. Mi, B. Lazareva, T. Hatton, A. Narechania, K. Diemer, A. Muruganujan, N. Guo, S. Sato, V. Bafna, S. Istrail, R. Lippert, R. Schwartz, B. Walenz, S. Yooseph, D. Allen, A. Basu, J. Baxendale, L. Blick, M. Caminha, J. Carnes-Stine, P. Caulk, Y.-H. Chiang, M. Coyne, C. Dahlke, A. D. Mays, M. Dombroski, M. Donnelly, D. Ely, S. Esparham, C. Foster, H. Gire, S. Glanowski, K. Glasser, A. Glodek, M. Gorokhov, K. Graham, B. Gropman, M. Harris, J. Heil, S. Henderson, J. Hoover, D. Jennings, C. Jordan, J. Jordan, J. Kasha, L. Kagan, C. Kraft, A. Levitsky, M. Lewis, X. Liu, J. Lopez, D. Ma, W. Majoros, J. McDaniel, S. Murphy, M. Newman, T. Nguyen, N. Nguyen, M. Nodell, S. Pan, J. Peck, M. Peterson, W. Rowe, R. Sanders, J. Scott, M. Simpson, T. Smith, A. Sprague, T. Stockwell, R. Turner, E. Venter, M. Wang, M. Wen, D. Wu, M. Wu, A. Xia, A. Zandieh, and X. Zhu. 2001. The Sequence of the Human Genome. Science 291 (5507) : 1304-1351.
20. Westley, C., K. Benkendorff, and K. L. Vine. 2006. A proposed functional role for indole derivatives in reproduction and the defense system of Muricidae (Neogastropoda: Mollusca), Life in Progress editions, Roscoff, France, pp. 31-44.