Localization and socialization: Experimental insights into the functional architecture of IP3 receptors

Chaos

Volumn 19, Issue 3, 2009, Pages

  Diambra, Luis ^a   Marchant, Jonathan S ^b  

^a UNIVERSIDAD NACIONAL DE LA PLATA   (Argentina)

^b UNIVERSITY OF MINNESOTA MEDICAL SCHOOL   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

INOSITOL 1,4,5 TRISPHOSPHATE RECEPTOR;

ALGORITHM; ANIMAL; BIOLOGICAL MODEL; BIOLOGICAL RHYTHM; CALCIUM SIGNALING; CELL FRACTIONATION; CHANNEL GATING; COMPUTER SIMULATION; HUMAN; METABOLISM; METHODOLOGY; NONLINEAR SYSTEM; OSCILLOMETRY; PHYSIOLOGY; REVIEW;

ALGORITHMS; ANIMALS; BIOLOGICAL CLOCKS; CALCIUM SIGNALING; COMPUTER SIMULATION; HUMANS; INOSITOL 1,4,5-TRISPHOSPHATE RECEPTORS; ION CHANNEL GATING; MODELS, BIOLOGICAL; NONLINEAR DYNAMICS; OSCILLOMETRY; SUBCELLULAR FRACTIONS;

EID: 70349634912     PISSN: 10541500     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1063/1.3147425     Document Type: Article

References (108)

1. M. J. Boulware and J. S. Marchant, Curr. Biol. 15, 765 (2005). 10.1016/j.cub.2005.02.065 (Pubitemid 40599933)
2. E. Vermassen, J. B. Parys, and J.-P. Mauger, Biol. Cell 96, 3 (2004). 10.1016/j.biolcel.2003.11.004 (Pubitemid 38240394)
3. S. Zhang, A. Mizutani, C. Hisatsune, T. Higo, H. Bannai, T. Nakayama, M. Hattori, and M. Mikoshiba, J. Biol. Chem. 278, 4048 (2003). 10.1074/jbc. M209960200 (Pubitemid 36801139)
4. M. Yamamoto-Hino, A. Miyawaki, A. Segawa, E. Adachi, S. Yamashina, T. Fujimotok, T. Sugiyama, T. Furuichi, M. Hasegawa, and K. Mikoshiba, J. Cell Biol. 141, 135 (1998). 10.1083/jcb.141.1.135 (Pubitemid 28182646)
5. O. H. Petersen and A. V. Tepikin, Annu. Rev. Physiol. 70, 273 (2008). 10.1146/annurev.physiol.70.113006.100618 (Pubitemid 351738181)
6. M. G. Lee, X. Xu, W. Zeng, J. Diaz, R. J. H. Wojcikiewicz, T. H. Kuo, F. Wuytack, L. Racymaekers, and S. Muallem, J. Biol. Chem. 272, 15765 (1997). 10.1074/jbc.272.25.15765 (Pubitemid 27265552)
7. E. Hernandez, M. F. Leite, M. T. Guerra, E. A. Kruglov, O. Bruna-Romero, M. A. Rodrigues, D. A. Gomes, F. J. Giordano, J. A. Dranoff, and M. H. Nathanson, J. Biol. Chem. 282, 10057 (2007). 10.1074/jbc.M700746200
8. K. Kiselyov, X. Wang, D. M. Shin, W. Zang, and S. Muallem, Cell Calcium 40, 451 (2006). 10.1016/j.ceca.2006.08.009 (Pubitemid 44660716)
9. T. Satoh, C. A. Ross, A. Villa, S. Supattapone, T. Pozzan, S. H. Snyder, and J. Meldolesi, J. Cell Biol. 111, 615 (1990). 10.1083/jcb.111.2.615 (Pubitemid 20239873)
10. O. Dellis, S. G. Dedos, S. C. Tovey, T. Ur-Rahman, S. J. Dubel, and C. W. Taylor, Science 313, 229 (2006). 10.1126/science.1125203 (Pubitemid 44066255)
11. P. Pinton, T. Pozzan, and R. Rizzuto, EMBO J. 17, 5298 (1998). 10.1093/emboj/17.18.5298 (Pubitemid 28427045)
12. J. V. Gerasimenko, M. Sherwood, A. V. Tepikin, O. H. Petersen, and O. V. Gerasimenko, J. Cell. Sci. 119, 226 (2006). 10.1242/jcs.02721 (Pubitemid 43210692)
13. W. Echevarría, M. F. Leite, M. T. Guerra, W. R. Zipfel, and M. H. Nathanson, Nat. Cell Biol. 5, 440 (2003). 10.1038/ncb980 (Pubitemid 36592267)
14. E. Vermassen, K. Van Acker, W. G. Annaert, B. Himpens, G. Callewaert, L. Missiaen, H. De Smedt, and J. B. Parys, J. Cell. Sci. 116, 1269 (2003). 10.1242/jcs.00354 (Pubitemid 36410665)
15. R. A. Fissore, F. J. Longo, E. Anderson, J. B. Parys, and T. Ducibella, Biol. Reprod. 60, 49 (1999). 10.1095/biolreprod60.1.49 (Pubitemid 29022349)
16. K. J. Seymour-Laurent and M. E. Barish, J. Neurosci. 15, 2592 (1995).
17. A. H. Sharp, P. S. McPherson, T. M. Dawson, C. Aoki, K. P. Campbell, and S. H. Synder, J. Neurosci. 13, 3051 (1993).
18. N. Callamaras, X.-P. Sun, I. Ivorra, and I. Parker, J. Physiol. (London) 511, 395 (1998). 10.1111/j.1469-7793.1998.395bh.x (Pubitemid 28444610)
19. J. K. Foskett, C. White, K. H. Cheung, and D. O. Mak, Physiol. Rev. 87, 593 (2007). 10.1152/physrev.00035.2006 (Pubitemid 47084681)
20. K. Mikoshiba, J. Neurochem. 102, 1426 (2007). 10.1111/j.1471-4159.2007. 04825.x (Pubitemid 47256212)
21. P. Delmas, N. Wanaverbecq, F. C. Abogadie, M. Mistry, and D. A. Brown, Neuron 34, 209 (2002). 10.1016/S0896-6273(02)00641-4 (Pubitemid 34442564)
22. C. Sala, V. Pich, N. R. Wilson, M. Passafaro, G. Liu, and M. Sheng, Neuron 31, 115 (2001). 10.1016/S0896-6273(01)00339-7 (Pubitemid 32757093)
23. I. Isshiki, J. Ando, K. Yamamoto, T. Fujita, Y. Ying, and R. G. W. Anderson, J. Cell. Sci. 115, 475 (2002).
24. J. Ledoux, M. S. Taylor, A. D. Bonev, R. M. Hannah, V. Solodushko, B. Shui, Y. Tallini, M. I. Kotikoff, and M. T. Nelson, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105, 9627 (2008). 10.1073/pnas.0801963105 (Pubitemid 352031351)
25. A. K. Weaver, M. L. Olsen, M. B. McFerrin, and H. Sontheimer, J. Biol. Chem. 282, 31558 (2007). 10.1074/jbc.M702866200 (Pubitemid 350044881)
26. S. C. Tovey, S. G. Dedos, E. J. Taylor, J. E. Church, and C. W. Taylor, J. Cell Biol. 183, 297 (2008). 10.1083/jcb.200803172
27. A. Miyakawa-Naito, P. Uhĺn, M. Lal, O. Aizman, K. Mikoshiba, H. Brismar, S. Zelenin, and A. Aperia, J. Biol. Chem. 278, 50355 (2003). 10.1074/jbc.M305378200 (Pubitemid 37548878)
28. C. Wei, X. Wang, M. Chen, K. Ouyang, L. S. Song, and H. Cheng, Nature (London) 457, 901 (2009). 10.1038/nature07577
29. P. B. Simpson, S. Mehorta, G. D. Lange, and J. T. Russell, J. Biol. Chem. 272, 22654 (1997). 10.1074/jbc.272.36.22654 (Pubitemid 27386081)
30. N. Callamaras and I. Parker, J. Gen. Physiol. 113, 199 (1999). 10.1085/jgp.113.2.199
31. A. A. Khan, J. P. Steiner, M. G. Klein, M. F. Schneider, and S. H. Snyder, Science 257, 815 (1992). 10.1126/science.1323146
32. B. S. Wilson, J. R. Pfeiffer, A. J. Smith, J. M. Oliver, J. A. Oberdorf, and R. J. H. Wojcikiewicz, Mol. Biol. Cell 9, 1465 (1998).
33. M. Chalmers, M. J. Schell, and P. Thorn, Biochem. J. 394, 57 (2006). 10.1042/BJ20051130 (Pubitemid 43259656)
34. C. Soeller, D. Crossmam, R. Gilbert, and M. B. Cannell, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 104, 14958 (2007). 10.1073/pnas.0703016104 (Pubitemid 47619575)
35. C. Soeller, I. D. Jayasingle, P. Li, A. V. Holden, and M. B. Cannell, Exp. Physiol. 94, 496 (2009).
36. D.-O. D. Mak and J. K. Foskett, J. Gen. Physiol. 109, 571 (1997). 10.1085/jgp.109.5.571
37. L. Ionescu, K. H. Cheung, H. Vais, D. O. Mak, C. White, and J. K. Foskett, J. Physiol. (London) 573, 645 (2006). 10.1113/jphysiol.2006.109504 (Pubitemid 43842508)
38. I. Parker, J. Choi, and Y. Yao, Cell Calcium 20, 105 (1996). 10.1016/S0143-4160(96)90100-1 (Pubitemid 26326563)
39. M. D. Bootman and M. J. Berridge, Cell 83, 675 (1995). 10.1016/0092-8674(95)90179-5
40. I. Parker and Y. Yao, Proc. R. Soc. London, Ser. B 246, 269 (1991). 10.1098/rspb.1991.0154
41. X.-P. Sun, N. Callamaras, J. S. Marchant, and I. Parker, J. Physiol. (London) 509, 67 (1998). 10.1111/j.1469-7793.1998.067bo.x (Pubitemid 28252012)
42. D. Thomas, P. Lipp, M. J. Berridge, M. D. Bootman, J. Biol. Chem. 273, 27130 (1998). 10.1074/jbc.273.42.27130 (Pubitemid 28500420)
43. M. G. Klein and M. F. Schneider, Prog. Biophys. Mol. Biol. 92, 308 (2006). 10.1016/j.pbiomolbio.2005.05.016 (Pubitemid 44302011)
44. S. Guatimosim, K. Dilly, L. F. Santana, M. Saleet Jafri, E. A. Sobie, and W. J. Lederer, J. Mol. Cell. Cardiol. 34, 941 (2002). 10.1006/jmcc.2002.2032 (Pubitemid 35316142)
45. H. J. Rose, S. Dargan, J. Shuai, and I. Parker, Biophys. J. 91, 4024 (2006). 10.1529/biophysj.106.088872 (Pubitemid 44887262)
46. J. Shuai, H. J. Rose, and I. Parker, Biophys. J. 91, 4033 (2006). 10.1529/biophysj.106.088880 (Pubitemid 44887263)
47. N. Callamaras, J. S. Marchant, X.-P. Sun, and I. Parker, J. Physiol. (London) 509, 81 (1998). 10.1111/j.1469-7793.1998.081bo.x (Pubitemid 28252013)
48. J. S. Marchant, N. Callamaras, and I. Parker, EMBO J. 18, 5285 (1999). 10.1093/emboj/18.19.5285 (Pubitemid 29465579)
49. M. D. Bootman, E. Niggli, M. J. Berridge, and P. Lipp, J. Physiol. (London) 499, 307 (1997).
50. S. C. Tovey, P. De Smet, P. Lipp, D. Thomas, K. W. Young, L. Missiaen, H. De Smedt, J. B. Parys, M. J. Berridge, J. Thuring, A. Holmes, and M. D. Bootman, J. Cell Biol. 114, 3979 (2001).
51. M. D. Bootman, M. J. Berridge, and P. Lipp, Cell 91, 367 (1997). 10.1016/S0092-8674(00)80420-1 (Pubitemid 27467967)
52. J. S. Marchant and I. Parker, EMBO J. 20, 65 (2001). 10.1093/emboj/20.1. 65 (Pubitemid 32099103)
53. D. Thomas, P. Lipp, S. C. Tovey, M. J. Berridge, W. Li, R. Y. Tsien, and M. D. Bootman, Curr. Biol. 10, 1 (2000). 10.1016/S0960-9822(99)00257-2 (Pubitemid 30057406)
54. J. S. Marchant, V. Ramos, and I. Parker, Am. J. Physiol. 282, C1374 (2002).
55. M. D. Bootman, P. Lipp, and M. J. Berridge, J. Cell. Sci. 114, 2213 (2001).
56. J. Shuai, J. E. Pearson, J. K. Foskett, D.-O. D. Mak, and I. Parker, Biophys. J. 93, 1151 (2007). 10.1529/biophysj.107.108795 (Pubitemid 47330895)
57. A. Demuro and I. Parker, Cell Calcium 43, 367 (2008). 10.1016/j.ceca.2007.07.002 (Pubitemid 351298571)
58. C. W. Taylor, P. C. A. Da Fonseca, and E. P. Morris, Trends Biochem. Sci. 29, 210 (2004). 10.1016/j.tibs.2004.02.010 (Pubitemid 38472026)
59. M. J. Boulware and J. S. Marchant, J. Physiol. (London) 586, 2873 (2008). 10.1113/jphysiol.2008.153379 (Pubitemid 351837282)
60. E. Katayama, H. Funahashi, T. Michikawa, T. Shiraishi, T. Ikemoto, M. Iino, K. Hirosawa, and K. Mikoshiba, EMBO J. 15, 4844 (1996).
61. C. C. Yin, L. M. Blayney, and F. A. Lai, J. Mol. Biol. 349, 538 (2005). 10.1016/j.jmb.2005.04.002 (Pubitemid 40724564)
62. J. R. Groff and G. D. Smith, Biophys. J. 95, 135 (2008). 10.1529/biophysj.107.119982
63. D. Bray and T. Duke, Annu. Rev. Biophys. Biomol. Struct. 33, 53 (2004). 10.1146/annurev.biophys.33.110502.132703 (Pubitemid 38829951)
64. S. Swillens, G. Dupont, L. Combettes, and P. Champeil, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 96, 13750 (1999). 10.1073/pnas.96.24.13750
65. H. DeRemigio and J. R. Groff, Mathematical Medicine and Biology 25, 65 (2008).
66. T. Ur-Rahman, A. Skupin, M. Falcke, and C. W. Taylor, Nature (London) 458, 655 (2009). 10.1038/nature07763
67. M. Kalamvoki and B. Roizman, J. Virol. 81, 6316 (2007). 10.1128/JVI.00311-07 (Pubitemid 46878038)
68. R. G. Kessel, Int. Rev. Cytol. 133, 43 (1992). 10.1016/S0074-7696(08) 61858-6
69. O. Stendahl, K.-H. Krause, J. Krischer, P. Jerström, J.-M. Theler, R. A. Clark, J.-L. Carpentier, and D. P. Lew, Science 265, 1439 (1994). 10.1126/science.8073285
70. S. A. Stricker, Semin Cell Dev. Biol. 17, 303 (2006). 10.1016/j.semcdb.2006.02.002 (Pubitemid 44051940)
71. F. Mitsuyama and T. Sawai, Int. J. Dev. Biol. 45, 861 (2001).
72. J. G. Goetz, H. Genty, P. St-Pierre, T. Dang, B. Joshi, R. Sauv́, W. Vogl, and I. R. Nabi, J. Cell. Sci. 120, 3553 (2007). 10.1242/jcs.03486 (Pubitemid 350120948)
73. V. C. Cordes, S. Reidenbach, and W. W. Franke, Cell Tissue Res. 284, 177 (1996). 10.1007/s004410050578 (Pubitemid 26140517)
74. K. Subramanian and T. Meyer, Cell 89, 963 (1997). 10.1016/S0092-8674(00) 80281-0
75. J. Andrade, H. Zhao, B. Titus, S. T. Pearce, and M. Barroso, Mol. Biol. Cell 15, 481 (2004). 10.1091/mbc.E03-07-0500 (Pubitemid 38146467)
76. S. A. Stricker and T. L. Smythe, Development 130, 2867 (2003). 10.1242/dev.00508 (Pubitemid 36857236)
77. A. A. Pieper, D. J. Brat, E. O'Hearn, D. K. Krug, A. I. Kaplin, K. Takahashi, J. H. Greenberg, D. Ginty, M. E. Molliver, and S. H. Snyder, Neuroscience 102, 433 (2001). 10.1016/S0306-4522(00)00470-X (Pubitemid 32126497)
78. J. Liou, L. M. Kim, W. D. Heo, J. T. Jones, J. W. Myers, J. E. Ferrell, Jr., and T. Meyer, Curr. Biol. 15, 1235 (2005). 10.1016/j.cub.2005.05.055 (Pubitemid 40950523)
79. J. Roos, P. J. DiGregorio, A. V. Yeromin, K. Ohlsen, M. Lioudyno, S. Zhang, O. Safrina, J. A. Kozak, S. L. Wagner, M. D. Cahalan, G. Velicelebi, and K. A. Stauderman, J. Cell Biol. 169, 435 (2005). 10.1083/jcb.200502019 (Pubitemid 40686694)
80. M. Ferreri-Jacobia, D. O. Mak, and J. K. Foskett, J. Biol. Chem. 280, 3824 (2005). 10.1074/jbc.M409462200 (Pubitemid 40223852)
81. K. Fukatsu, H. Bannai, S. Zhang, H. Nakamura, T. Inoue, and K. Mikoshiba, J. Biol. Chem. 279, 48976 (2004). 10.1074/jbc.M408364200 (Pubitemid 39625779)
82. C. Cruttwell, J. Bernard, M. Hilly, V. Nicolas, R. E. A. Tunwell, and J.-P. Mauger, Biol. Cell 97, 699 (2005). 10.1042/BC20040503 (Pubitemid 41335163)
83. D. Boehning and S. K. Joseph, J. Biol. Chem. 275, 21492 (2000). 10.1074/jbc.M001724200 (Pubitemid 30481853)
84. M. Iwai, Y. Tateishi, M. Hattori, A. Mizutani, T. Nakamura, A. Futatsugi, T. Inoue, T. Furuichi, T. Michikawa, and K. Mikoshiba, J. Biol. Chem. 280, 10305 (2005). 10.1074/jbc.M413824200 (Pubitemid 40395887)
85. Y. Tojyo, T. Morita, A. Nezu, and A. Tanimura, J. Pharmacol. Sci. 107, 138 (2008).
86. Y. Tateishi, M. Hattori, T. Nakayama, M. Iwai, H. Bannai, T. Nakamura, T. Michikawa, T. Inoue, and K. Mikoshiba, J. Biol. Chem. 280, 6816 (2005). 10.1074/jbc.M405469200 (Pubitemid 40341236)
87. K. Machaca, Dev. Biol. 275, 170 (2004). 10.1016/j.ydbio.2004.08.004 (Pubitemid 39298182)
88. M. Hattori, A. Z. Suzuki, T. Higo, H. Miyaucji, T. Michikawa, T. Nakamoura, T. Inoue, and K. Mikoshiba, J. Biol. Chem. 279, 11967 (2004). 10.1074/jbc.M311456200 (Pubitemid 38401702)
89. K. Hamada, T. Miyata, K. Mayanagi, J. Hirota, and K. Mikoshiba, J. Biol. Chem. 277, 21115 (2002). 10.1074/jbc.C200244200 (Pubitemid 34952245)
90. B. Alarcon, M. Swamy, H. M. van Santen, and W. W. A. Schamel, EMBO Rep. 7, 490 (2006). 10.1038/sj.embor.7400682 (Pubitemid 43904864)
91. Y. Zhang, S. E. McKay, B. Bewley, and L. K. Kaczmarek, J. Biol. Chem. 283, 10632 (2008). 10.1074/jbc.M800253200
92. H. Misonou, D. P. Mohapatra, E. W. Park, V. Leung, D. Zhen, K. Misonou, A. E. Anderson, and J. S. Trimmer, Nat. Neurosci. 7, 711 (2004). 10.1038/nn1260 (Pubitemid 38859055)
93. M. L. Molina, F. N. Barrera, A. M. Fernández, J. A. Poveda, M. L. Renart, J. A. Encinar, G. Riquelme, and J. M. González-Ros, J. Biol. Chem. 281, 18837 (2006). 10.1074/jbc.M600342200 (Pubitemid 44035543)
94. A. Penna, A. Demuro, A. V. Yeromin, S. L. Zhang, O. Safrina, I. Parker, and M. D. Cahalan, Nature (London) 456, 116 (2008). 10.1038/nature07338
95. K. D. Mossman, G. Campi, J. T. Groves, and M. L. Dustin, Science 310, 1191 (2005). 10.1126/science.1119238 (Pubitemid 41681746)
96. T. Yokosuka, K. Sakata-Sogawa, W. Kobayashi, M. Hiroshima, A. Hashimoto-Tane, M. Tokunga, M. L. Dustin, and T. Saito, Nature Immunology 6, 1253 (2005).
97. C. Zhang and S.-H. Kim, Pac. Symp. Biocomput., 353 (2000).
98. M. Gopalakrishnan, K. Forsten-Williams, M. A. Nugent, U. C. Täuber, Biophys. J. 89, 3686 (2005). 10.1529/biophysj.105.065300 (Pubitemid 41725594)
99. D. Bray, M. D. Levin, and C. J. Morton-Firth, Nature (London) 393, 85 (1998). 10.1038/30018 (Pubitemid 28240260)
100. S. Valitutti, S. Müller, M. Cella, E. Padovan, and A. Lanzavecchia, Nature (London) 375, 148 (1995). 10.1038/375148a0
101. S. Means, A. J. Smith, J. Shepherd, J. Shadid, J. Fowler, R. J. H. Wojcikiewicz, T. Mazel, G. D. Smith, and B. S. Wilson, Biophys. J. 91, 537 (2006). 10.1529/biophysj.105.075036
102. L. Missiaen, H. De Smedt, G. Droogmans, and R. Casteels, Nature (London) 357, 599 (1992). 10.1038/357599a0
103. T. Higo, M. Hattori, T. Nakamura, T. Natsume, T. Michikawa, and K. Mikosiba, Cell 120, 85 (2005). 10.1016/j.cell.2004.11.048 (Pubitemid 40094605)
104. C. W. Taylor, A. A. Genazzani, and S. A. Morris, Cell Calcium 26, 237 (1999). 10.1054/ceca.1999.0090 (Pubitemid 30037825)
105. K. Takei, G. A. Mignery, E. Mugnaini, T. C. Südhof, and P. De Camilli, Neuron 12, 327 (1994). 10.1016/0896-6273(94)90275-5 (Pubitemid 24071298)
106. J. W. Shuai and P. Jung, Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 100, 506 (2003). 10.1073/pnas.0236032100 (Pubitemid 36126081)
107. J. W. Shuai and P. Jung, Phys. Rev. Lett. 88, 068102 (2002). 10.1103/PhysRevLett.88.068102
108. E. Hong-Geller and R. A. Cerione, J. Cell Biol. 148, 481 (2000). 10.1083/jcb.148.3.481 (Pubitemid 30682561)