Protein S-S bridge reduction: A Raman and computational study of lysozyme interaction with TCEP

Physical Chemistry Chemical Physics

Volumn 11, Issue 14, 2009, Pages 2532-2542

  David, Catalina ^a   Foley, Sarah ^a   Enescu, Mironel ^a  

^a UNIVERSITÉ DE FRANCHE COMTÉ   (France)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

DISULFIDE; HEN EGG LYSOZYME; LYSOZYME; PHOSPHINE DERIVATIVE; REDUCING AGENT; TRIS(2 CARBOXYETHYL)PHOSPHINE; TRIS(2-CARBOXYETHYL)PHOSPHINE;

ANIMAL; ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; DRUG EFFECT; KINETICS; METABOLISM; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; QUANTUM THEORY; RAMAN SPECTROMETRY; THERMODYNAMICS;

ANIMALS; COMPUTER SIMULATION; DISULFIDES; KINETICS; MODELS, MOLECULAR; MURAMIDASE; PHOSPHINES; PROTEIN BINDING; PROTEIN CONFORMATION; QUANTUM THEORY; REDUCING AGENTS; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN; THERMODYNAMICS;

EID: 66649085901     PISSN: 14639076     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b815492a     Document Type: Article

References (37)

1. W. J. Wedemeyer E. Welker M. Narayan H. A. Scheraga Biochemistry 2000 39 4207 4216
2. T. E. Creighton Biol. Chem. 1997 378 731 744
3. K. Ravi Charan Reddy H. Lilie R. Rudolph C. Lange Protein Sci. 2005 14 929 935
4. A. P. Hinck D. M. Truckses J. L. Markley Biochemistry 1996 35 10328 10338
5. G. Xu M. Narayan I. Kurinov D. R. Ripoll E. Welker M. Khalili S. E. Ealick H. A. Scheraga J. Am. Chem. Soc. 2006 128 1204 1213
6. M. Karlsson L.-G. Martensson C. Karlsson U. Carlsson Biochemistry 2005 44 3487 3493
7. M. Narayan G. Xu D. R. Ripoll H. Zhai K. Breuker C. Wanjalla H. J. Leung A. Navon E. Welker F. W. McLafferty H. A. Scheraga J. Mol. Biol. 2004 338 795 809
8. D. J. Cline S. E. Redding S. G. Brohawn J. N. Psathas J. P. Schneider C. Thorpe Biochemistry 2004 43 15195 15203
9. D. C. Vaz J. Rodrigues W. Sebald C. M. Dobson R. M. M. Brito Protein Sci. 2006 15 33 44
10. Y.-J. Li D. M. Rothwarf H. A. Scheraga Nat. Struct. Biol. 1995 2 489 494
11. J. Jakoncic M. Aslantas V. Honkimaki M. Dimichel V. Stojanoff J. Appl. Crystallogr. 2006 39 831 841
12. C. T. Reimann I. Velazquez O. Tapia J. Phys. Chem. B 1998 102 2277 2283
13. G. Moraitakis J. M. Goodfellow Biophys. J. 2003 84 2149 2158
14. S. Foley M. Enescu Vib. Spectrosc. 2007 44 256 265
15. M. J. Frisch, G. W. Trucks, H. B. Schlegel, G. E. Scuseria, M. A. Robb, J. R. Cheeseman, J. A. Montgomery, Jr., T. Vreven, K. N. Kudin, J. C. Burant, J. M. Millam, S. S. Iyengar, J. Tomasi, V. Barone, B. Mennucci, M. Cossi, G. Scalmani, N. Rega, G. A. Petersson, H. Nakatsuji, M. Hada, M. Ehara, K. Toyota, R. Fukuda, J. Hasegawa, M. Ishida, T. Nakajima, Y. Honda, O. Kitao, H. Nakai, M. Klene, X. Li, J. E. Knox, H. P. Hratchian, J. B. Cross, V. Bakken, C. Adamo, J. Jaramillo, R. Gomperts, R. E. Stratmann, O. Yazyev, A. J. Austin, R. Cammi, C. Pomelli, J. Ochterski, P. Y. Ayala, K. Morokuma, G. A. Voth, P. Salvador, J. J. Dannenberg, V. G. Zakrzewski, S. Dapprich, A. D. Daniels, M. C. Strain, O. Farkas, D. K. Malick, A. D. Rabuck, K. Raghavachari, J. B. Foresman, J. V. Ortiz, Q. Cui, A. G. Baboul, S. Clifford, J. Cioslowski, B. B. Stefanov, G. Liu, A. Liashenko, P. Piskorz, I. Komaromi, R. L. Martin, D. J. Fox, T. Keith, M. A. Al-Laham, C. Y. Peng, A. Nanayakkara, M. Challacombe, P. M. W. Gill, B. G. Johnson, W. Chen, M. W. Wong, C. Gonzalez and J. A. Pople, GAUSSIAN 03 (Revision B.04), Gaussian, Inc., Wallingford, CT, 2003
16. M. Cossi G. Scalmani N. Rega V. Barone J. Chem. Phys. 2002 117 43 54
17. M. Svensson S. Humbel K. Morokuma J. Chem. Phys. 1996 105 3654 3661
18. D. A. Case, T. A. Darden, T. E. Cheatham III, C. L. Simmerling, J. Wang, R. E. Duke, R. Luo, K. M. Merz, D. A. Pearlman, M. Crowley, R. C. Walker, W. Zhang, B. Wang, S. Hayik, A. Roitberg, G. Seabra, K. F. Wong, F. Paesani, X. Wu, S. Brozell, V. Tsui, H. Gohlke, L. Yang, C. Tan, J. Mongan, V. Hornak, G. Cui, P. Beroza, D. H. Mathews, C. Schafmeister, W. S. Ross and P. A. Kollman, AMBER 9, University of California, San Francisco, 2006
19. U. C. Singh P. A. Kollman J. Comput. Chem. 1984 5 129 145
20. Y. Duan C. Wu S. Chowdhury M. C. Lee G. Xiong W. Zhang R. Yang P. Cieplak R. Luo T. Lee J. Cadwell J. Wang P. Kollman J. Comput. Chem. 2003 24 1999 2012
21. W. L. Jorgensen J. Chandrasekhar J. P. Madura J. Chem. Phys. 1983 79 926 935
22. B. Roux Comput. Phys. Commun. 1995 91 275 282
23. H. Sugeta A. Go T. Miyazawa Bull. Chem. Soc. Jpn. 1973 46 3407 3411
24. W. Qian S. Krimm Biopolymers 1992 32 321 326
25. Z. Deng P. L. Polavarapu S. J. Ford L. Hecht L. D. Barron C. S. Ewig K. Jalkanen J. Phys. Chem. 1996 100 2025 2034
26. W.-G. Han K. J. Jalkanen M. Elstner S. Suhai J. Phys. Chem. B 1998 102 2587 2602
27. C. F. Weise J. C. Weisshaar J. Phys. Chem. B 2003 107 3265 3227
28. M. A. Mroginski F. Mark W. Thiel P. Hildebrant Biophys. J. 2007 93 1885 1894
29. G. Rauhut P. Pulay J. Phys. Chem. 1995 99 3093 3100
30. A. B. Kudryavtsev S. B. Mirov L. J. DeLucas C. Nicolete M. van der Woerd T. L. Bray T. T. Basiev Acta Crystallogr., Sect. D 1998 54 1216 1229
31. H. Schwalbe S. B. Grimshaw A. Spencer M. Buck J. Boyd C. M. Dobson C. Redfield L. J. Smith Protein Sci. 2001 60 677 688
32. C. David S. Foley C. Mavon M. Enescu Biopolymers 2008 89 623 634
33. R. E. Hansen H. Østergaard J. R. Winther Biochemistry 2005 44 5899 5906
34. A. Holmgren Annu. Rev. Biochem. 1985 54 237
35. J. Zheng H. F. Gilbert J. Biol. Chem. 2001 276 15747 15552
36. J. Bergès E. Kassab D. Conte E. Adjadj C. Houée-Levin J. Phys. Chem. A 1997 101 7809 7817
37. S. U. Sane S. M. Cramer T. M. Przybycien Anal. Biochem. 1999 269 255 272