Hydrogen abstraction from deoxyribose by a neighboring 3′-uracil peroxyl radical

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 113, Issue 18, 2009, Pages 6574-6578

  Schyman, Patric ^a   Eriksson, Leif A ^b   Laaksonen, Aatto ^a  

^a STOCKHOLM UNIVERSITY   (Sweden)

^b ÖREBRO UNIVERSITY   (Sweden)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ABSTRACTING; ACTIVATION ENERGY; HYDROGEN; NUCLEIC ACIDS;

AEROBIC CONDITION; DAMAGING AGENTS; HYDROGEN ABSTRACTION; HYDROGEN ATOMS; PEROXYL RADICAL; RADIOSENSITIZERS; REACTION ENERGY; STRAND BREAKS;

DENSITY FUNCTIONAL THEORY;

EID: 66349109967     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp9007569     Document Type: Article

References (26)

1. Rutman, R. J.; Cantarow, A.; Pashkis, K. E. Cancer Res. 1954, 14, 119.
2. Longley, D. B.; Harkin, D. P.; Johnston, G. P. Nature (London) 2003, 3, 330.
3. von Sonntag, C. Free-Radical-Induced DNA Damage and Its Repair; Schreck, S., Ed.; Springer-Verlag: Berlin, 2006.
4. Li, X.; Sanche, L.; Sevilla, M. D. J. Phys. Chem. A 2002, 706, 11248.
5. Wetmore, S. D.; Boyd, R. D.; Eriksson, L. A. Chem. Phys. Lett. 2001, 343, 151.
6. Chen, T.; Cook, G. P.; Koppisch, A. T.; Greenberg, M. M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3861.
7. Sugiyama, H.; Tsutsumi, Y.; Saito, I. J. Am. Chem. Soc. 1990,112, 6720.
8. Saito, I. Pure Appl. Chem. 1992, 64, 1305.
9. Watanabe, T.; Bando, T.; Xu, Y.; Tashiro, R.; Sugiyama, H. J. Am. Chem. Soc. 2004, 127, 44.
10. Cook, G. P.; Greenberg, M. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 778, 10025.
11. Sugiyama, H.; Fujimoto, K.; Sito, I. Tetrahedron Lett. 1996, 37, 1805.
12. Fujimoto, K.; Ikeda, Y.; Ishihara, S.; Saito, I. Terahedron Lett. 2003, 43, 2243.
13. Schyman, P.; Zhang, R. B.; Eriksson, L. A.; Laaksonen, A. Phys. Chem. Chem. Phys. 2007, 9, 5975.
14. Doddridge, Z.; Warner, J. L.; Cullis, P. M.; Jones, G. D. D. Chem. Commun. 1998, 1997.
15. von Sonntag C. The Chemical Basis of Radiation Biology; Taylor & Francis: London, 1987.
16. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 708, 6908.
17. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1996, 98, 1040.
18. Adamo, C.; Barone, V. J. Phys. Chem. 1998, 708, 664.
19. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision B.04; Gaussian Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
20. Ayala, P. Y.; Schlegel, H. B. J. Chem. Phys. 1997, 707, 375.
21. Tomasi, J.; Mennucci, B.; Cammi, R. Chem. Rev. 2005, 705, 2999.
22. Schyman, P.; Eriksson, L. A.; Zhang, R. B.; Laakonen, A. Chem. Phys. Lett. 2008, 458, 186.
23. Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
24. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 5648.
25. Hobza, P.; Sponer, J. Chem. Rev. 1999, 99, 3247.
26. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Ace. Chem. Res. 2008, 41, 157.