Benign decay vs. photolysis in the photophysics and photochemistry of 5-bromouracil. A computational study

Journal of Physical Chemistry A

Volumn 113, Issue 19, 2009, Pages 5489-5495

  Kobyłecka, Monika ^a   Migani, Annapaola ^b   Asturiol, David ^b   Rak, Janusz ^a   Blancafort, Lluís ^b  

^a UNIVERSITY OF GDA SK   (Poland)

^b UNIVERSITY OF GIRONA   (Spain)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AB INITIO; COMPUTATIONAL STUDIES; CONICAL INTERSECTION; DECAY DYNAMICS; EXCITED STATE LIFETIMES; LIMITING CASE; MINIMUM ENERGY PATHS; PHOTOPHYSICS; PICOSECOND; TWO-STATE;

BROMINE; DECAY (ORGANIC); EXCITED STATES; INTERSECTIONS; POTENTIAL ENERGY; POTENTIAL ENERGY SURFACES; QUANTUM CHEMISTRY;

PHOTOLYSIS;

5 BROMOURACIL;

ARTICLE; CHEMICAL STRUCTURE; CHEMISTRY; CONFORMATION; PHOTOLYSIS; QUANTUM THEORY;

BROMOURACIL; MODELS, MOLECULAR; MOLECULAR CONFORMATION; PHOTOLYSIS; QUANTUM THEORY;

EID: 66149148646     PISSN: 10895639     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp811330v     Document Type: Article

References (51)

1. Friedberg, E. C.; Walker, G. C.; Sided, W.; Wood, R. D.; Schultz, R. A.; Ellenberger, T. DNA repair mutagenesis; ASM Press: Herndon, VA, 2006.
2. Chen, T. Q.; Cook, G. P.; Koppisch, A. T.; Greenberg, M. M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 3861-3866.
3. Cook, G. P.; Chen, T. Q.; Koppisch, A. T.; Greenberg, M. M. Chem. Biol. 1999, 6, 451-459.
4. Cook, G. P.; Greenberg, M. M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 10025-10030.
5. Zeng, Y.; Wang, Y. S. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 6552-6553.
6. Zeng, Y.; Wang, Y. S. Biochemistry 2007, 46, 8189-8195.
7. Cecchini, S.; Masson, C.; La Madeleine, C.; Huels, M. A.; Sanche, L.; Wagner, J. R.; Hunting, D. J. Biochemistry 2005, 44, 16957-16966.
8. Szybalsky, W. Cancer Chemother. Rep., Part 1 1974, 58, 539-557.
9. Blatter, E. E.; Ebright, Y. W.; Ebright, R. H. Nature (London) 1992, 359, 650-652.
10. Dietz, T. M.; Koch, T. H. Photochem. Photobiol. 1989, 49, 121-129.
11. Jensen, K. B.; Atkinson, B. L.; Willis, M. C.; Koch, T. H.; Gold, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 12220-12224.
12. Willis, M. C.; Hicke, B. J.; Uhlenbeck, O. C.; Cech, T. R.; Koch, T. H. Science 1993, 262, 1255-1257.
13. Lu, Q. B.; Baskin, J. S.; Zewail, A. H. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10509-10514.
14. Wang, C. R.; Hu, A.; Lu, Q. B. J. Chem. Phys. 2006, 124, 241102.
15. Campbell, J. M.; Schulte-Frohlinde, D.; von Sonntag, C. Photochem. Photobiol. 1974, 20, 465-467.
16. Dietz, T. M.; von Trebra, R. J.; Swanson, B. J.; Koch, T. H. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 1793-1797.
17. Swanson, B. J.; Kutzer, J. C.; Koch, T. H. J. Am. Chem. Soc. 1981, 103, 1274-1276.
18. Frisch, M. J. et al. Gaussian03, Revision B.02 ed.; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
19. Karlström, G.; Lindh, R.; Malmqvist, P.-Å.; Roos, B. O.; Ryde, U.; Veryazov, V.; Widmark, P.-O.; Cossi, M.; Schimmelpfennig, B.; Neogrady, P.; Seijo, L. Comput. Mater. Sci. 2003, 28, 222-239.
20. González, C.; Schlegel, H. B. J. Phys. Chem. 1990, 94, 5523-5527.
21. Celani, P.; Robb, M. A.; Garavelli, M.; Bernardi, F.; Olivucci, M. Chem. Phys. Lett. 1995, 243, 1-8.
22. Bearpark, M. J.; Blancafort, L.; Paterson, M. J. Mol. Phys. 2006, 104, 1033-1038.
23. Bearpark, M. J.; Robb, M. A.; Schlegel, H. B. Chem. Phys. Lett. 1994, 223, 269-274.
24. Yamamoto, N.; Vreven, T.; Robb, M. A.; Frisch, M. J.; Schlegel, H. B. Chem. Phys. Lett. 1996, 250, 373-378.
25. Ghigo, G.; Roos, B. O.; Malmqvist, P. A. Chem. Phys. Lett. 2004, 396, 142-149.
26. Fleig, T.; Knecht, S.; Hättig, C. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 5482-5491.
27. Gustavsson, T.; Banyasz, A.; Lazzarotto, E.; Markovitsi, D.; Scalmani, G.; Frisch, M. J.; Barone, V.; Improta, R. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 607-619.
28. Schreiber, M.; Silva, M. R.; Sauer, S. P. A.; Thiel, W. J. Chem. Phys. 2008, 128.
29. Shukla, M. K.; Leszczynski, J. J. Comput. Chem. 2004, 25, 768-778.
30. Silva, M. R.; Schreiber, M.; Sauer, S. P. A.; Thiel, W. J. Chem. Phys. 2008, 129, 104013.
31. Abouaf, R.; Pommier, J.; Dunet, H. Chem. Phys. Lett. 2003, 381, 486-494.
32. Campbell, J. M.; von Sonntag, C.; Schulte-Frohlinde, D. Z. Naturforsch. 1974, 29, 750-757.
33. Hudock, H. R.; Levine, B. G.; Thompson, A. L.; Satzger, H.; Townsend, D.; Gador, N.; Ullrich, S.; Stolow, A.; Martinez, T. J. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 8500-8508.
34. Matsika, S. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 7584-7590.
35. Merchán, M.; González-Luque, R.; Climent, T.; Serrano-Andrés, L.; Rodríguez, E.; Reguero, M.; Peláez, D. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 26471-26476.
36. Perun, S.; Sobolewski, A. L.; Domcke, W. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 13238-13244.
37. Zechmann, G.; Barbatti, M. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 8273-8279.
38. Zgierski, M. Z.; Patchkovskii, S.; Fujiwara, T.; Lim, E. C. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 9384-9387.
39. Mercier, Y.; Santoro, F.; Reguero, M.; Improta, R. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 10769-10772.
40. Serrano-Pérez, J. J.; González-Luque, R.; Merchán, M.; Serrano-Andrés, L. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 11880-11883.
41. Chang, A. H. H.; Mebel, A. M.; Yang, X. M.; Lin, S. H.; Lee, Y. T. Chem. Phys. Lett. 1998, 287, 301-306.
42. Barbatti, M.; Paier, J.; Lischka, H. J. Chem. Phys. 2004, 121, 11614-11624.
43. Migani, A.; Blancafort, L.; Robb, M. A.; Debellis, A. D. J. Am. Chem. Soc. 2008, 130, 6932-6933.
44. Buenker, R. J.; Bonačíć-Koutecký, V.; Pogliani, L. J. Chem. Phys. 1980, 73, 1836-1849.
45. Ohmine, I. J. Chem. Phys. 1985, 83, 2348-2362.
46. Bonačíć-Koutecký, V.; Koutecký, J.; Michl, J. Angew. Chem. Int. Ed. Engl. 1987, 26, 170-189.
47. Freund, L.; Klessinger, M. Int. J. Quantum Chem. 1998, 70, 1023-1028.
48. Ben-Nun, M.; Martinez, T. J. Chem. Phys. 2000, 259, 237-248.
49. Kosma, K.; Trushin, S. A.; Fuss, W.; Schmid, W. E. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 7514-7529.
50. Chang, A. H. H.; Hwang, D. W.; Yang, X. M.; Mebel, A. M.; Lin, S. H.; Lee, Y. T. J. Chem. Phys. 1999, 110, 10810-10820.
51. Crespo-Hernández, C. E.; Cohen, B.; Kohler, B. Nature (London) 2005, 436, 1141-1144.