Docking of selected natural polyphenols to ARF activated A1 subunit of cholera toxin

Acta Chimica Slovenica

Volumn 56, Issue 1, 2009, Pages 156-165

  Podlipnik, Črtomir ^a  

^a UNIVERSITY OF LJUBLJANA   (Slovenia)

Author keywords

ADP ribosylation; Cholera Toxin; Molecular docking; Natural polyphenols

Indexed keywords

EID: 65349166632     PISSN: 13180207     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: None     Document Type: Article

References (31)

1. D. C. Griffith, L. A. Kelly-Hope, M. A. Miller, Am. J. Trop. Med. Hyg. 2006, 75, 973-977.
2. T. K. Sixma, S. E. Pronk, H. K. Kalk, E. S. Wartna, B. A. M. van Zanten, B. Witholt, W. G. Hol, W. G. Nature 1991, 351, 371-377.
3. A. Bernardi, C. Podlipnik, J. Jimenez-Barbero, Protein-Carbohydrate Interactions in Infectious Diseases, Bewley, C. A. Ed.; RCS Publishing: Cambridge 2006, Chapter 5.
4. D. Arosio, S. Baretti, S. Cattaldo, D. Potenza, A. Bernardi, Bioorg. Med. Chem. Lett. 2003, 13, 3831-2834.
5. A. Bernardi, D. Arosio, S. Sonnino, Neurochemicals research 2002, 27, 539-545.
6. A. Bernardi, M. Galgano, L. Belvisi, G. Colombo, Journal of Computed-Aided Molecular Design 2001, 15, 117-128.
7. A. Bernardi, D. Potenza, A. M. Capelli, A. García-Herrero, F.J. Cañada, J. Jiménez-Berbero, Chem. Eur. J. 2002, 8, 4597-4612.
8. P. Brocca, A. Bernardi, L. Raimondi, S. Sonnino, Glycoconjugate Journal, 2000, 17, 283-299.
9. C. Podlipnik, I. Velter, I., B. La Ferla, G. Marcou, L. Belvisi, F. Nicotra, A. Bernardi, Carbohydr Res. 2007, 342, 1651-1660.
10. Podlipnik, A. Bernardi, A. Acta Chim. Slov. 2007, 54, 425-436
11. E. Fan, C. J. O'Neil, D. D. Mithchell, M. A. Robien, Z. Zhang, J. C. Pickens, X.-J. Tan, K. Korotkov, C. Roach, B. Krumm, C. L. M. J. Verlinde, E. A. Merritt, Int. J. Med. Micr. 2004, 294, 217-223
12. J. J. Mekalanos, R. J. Collier, W. R. Romig, J. Biol. Chem. 1979, 254, 5855-5861.
13. R. A. Khan, A. G. Gilman, J. Biol. Chem. 1986, 261, 7906-7911.
14. M. Noda, M., S. C. Tsai, R. Adamik, J. Moss, M. Vaughan, Biochim. Biophys. Acta 1990, 1034, 195-199.
15. X. Zhu, X., R. A. Kahn, J. Biol. Chem. 2001, 276, 25014-25021.
16. C. L. O'Neal, M. G. Jobling, R. K. Holmes, W. G. Hol, Science 2005, 309, 1093-1096.
17. T. Saito, M. Miyake, M. Toba, H. Okamatsu, S. Simizu, M. Noda, Microbiol. Immunol. 2002, 46, 249-255.
18. M. Toda, S. Okubo, H. Ikigai, T. Suzuki, Y. Suzuki, T. Shimamura, Microbiol. Immunol. 1992, 36, 999-1001.
19. M. Toda, S. Okubo, H. Ikigai, T. Suzuki, Y. Suzuki, T. Shimamura, J. Appl. Bacteriol. 1991 70, 109-112.
20. H. Oi, D. Matsuura, M. Miyake, M. Ueno, I. Takai, T. Yamamoto, M. Kubo, J. Moss, M. Noda, PNAS 2002, 99, 3042- 3046.
21. I. A. Velter, M. Politi, C. Podlipnik, F. Nicotra, F. Mini Rev. Med. Chem. 2007, 7, 159-170.
22. S. Liu, H. Lu, Q. Zhao, Y. He, J. Niu, K. D. Debnath, S. Wu, S. Jiang, Biochim. Biophis. Acta 2005, 1723, 270-281.
23. E. Haslam, Phytochemistry 2003, 64, 61-73.
24. J. M. T. Hamilton-Miller, Antimicrob. Agents and Chemother. 1995, 39, 2375-2377.
25. T. Tauguri, T. Tanaka, I. Kouno, Biol. Pharm. Bull. 2004, 27, 1965-1969.
26. Ligprep, Pprep, Glide ver. 5.0 and Maestro, ver. 8.5: Schrodinger, Inc.
27. R. A. Friesner, J. L. Banks, R. B. Murphy, T. A. Halgren, J. J. Klicic, D. T. Mainz, J. Med. Chem. 2004, 47, 1739-1749.
28. T. A. Halgren, R. B. Murphy, R. A. Friesner, H. S. Beard, L. L. Frye, W. T. Pollard, J. Med. Chem. 2004, 47, 1750-1759.
29. R. A. Friesner, R. B. Murphy, M. P. Repasky, L. L. Frye, J. R. Greenwood, T. A. Halgren, P. C. Sanschagrin, D. T. Mainz, J. Med. Chem. 2006, 49, 6177-6196.
30. MARVIN was used for drawing, displaying, and characterizing structures, substructures and reactions, MarvinBeans 4.1.2, 2006 ChemAxon (http://www.chemaxon.com)
31. G. M. Morris, D. S. Goodsell, R. S. Halliday, W. E. Hart, R. K. Belew, A. J. Olson, J. Comput. Chem. 1998, 19, 1639-1662.