The DBH24/08 database and its use to assess electronic structure model chemistries for chemical reaction barrier heights

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 5, Issue 4, 2009, Pages 808-821

  Zheng, Jingjing ^a   Zhao, Yan ^a   Truhlar, Donald G ^a  

^a NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 65249096094     PISSN: 15499618     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct800568m     Document Type: Article

References (115)

1. Zheng, J.; Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2007, 3, 569.
2. Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 8996.
3. Zhao, Y.; Gonzalez-Garcia, N.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 2012.
4. Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 3898.
5. Martin, J. M. L.; de Oliveira, G. J. Chem. Phys. 1999, 111, 1843.
6. (a) Brown, F. B.; Shavitt, I.; Shepard, R. Chem. Phys. Lett. 1984, 105, 363.
7. (b) Werner, H.-J. Adv. Chem. Phys. 1987, 69, 1.
8. Karton, A.; Tarnopolsky, A.; Jean-François, L.; Schatz, G. C.; Martin, J. M. L. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 12868.
9. Karton, A.; Rabinovich, E.; Martin, J. M. L.; Ruscic, B. J. Chem. Phys. 2006, 125, 144108.
10. Zheng, J.; Gour, J. R.; Lutz, J. J.; Wloch, M.; Piecuch, P.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 2008, 128, 044108.
11. Peterson, K. A.; Dunning, T. H. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 6280.
12. Villa, J.; Corchado, J. C.; Gonzalez-Lafont, A.; Lluch, J. M.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 5061.
13. Villa, J.; Gonzalez-Lafont, A.; Lluch, J. M.; Truhlar, D. G. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 5559. Brown, F. B.; Truhlar, D. G. Chem. Phys. Lett. 1985, 117, 307.
14. Fernandez-Ramos, A.; Ellingson, B. A.; Garrett, B. C.; Truhlar, D. G. Variational Transition State Theory with Multidimensional Tunneling. In Reviews in Computational Chemistry; Cundari, T. R., Lipkowitz, K. B., Eds.; Wiley-VCH: Hoboken, NJ, 2007; Vol. 23, pp 125.
15. Lynch, B. J.; Fast, P. L.; Harris, M.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2000, 104, 4811.
16. Melissas, V. S.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 1993, 99, 3542.
17. Atkins, R. J. Phys. Chem. Ref. Data Monograph 1989, 1, 18.
18. Peng, J.; Hu, X.; Marshall, P. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 5307.
19. Tratz, C. M.; Fast, P. L.; Truhlar, D. G. PhysChemComm 1999, 2, 70.
20. Tishchenko, O.; Zheng, J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1208.
21. Lynch, B. J.; Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 1643.
22. Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Trucks, G. W.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1991, 94, 7221.
23. Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Redfern, P. C.; Rassolov, V.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1998, 109, 7764.
24. Curtiss, L. A.; Raghavachari, K.; Redfern, P. C.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 2000, 112, 1125.
25. Curtiss, L. A.; Redfern, P. C.; Raghavachari, K.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 2001, 114, 108.
26. Curtiss, L. A.; Redfern, P. C.; Raghavachari, K. J. Chem. Phys. 2007, 126, 084108.
27. Curtiss, L. A.; Redfern, P. C.; Raghavachari, K. J. Chem. Phys. 2007, 127, 124105.
28. Grimme, S. J. Chem. Phys. 2003, 118, 9095. Grimme, S. J. Comput. Chem. 2003, 24, 1529.
29. Jung, Y.; Lochan, R. C.; Dutoi, A. D.; Head-Gordon, M. J. Chem. Phys. 2004, 121, 9793.
30. Jung, Y.; Head-Gordon, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 2831.
31. Meyer, W. J. Chem. Phys. 1973, 58, 1017.
32. Grimme, S. J. Chem. Phys. 2006, 124, 034108.
33. Tarnopolsky, A.; Karton, A.; Sertchook, R.; Vuzman, D.; Martin, J. M. L. J. Phys. Chem. A 2008, 112, 3.
34. Schwabe, T.; Grimme, S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2006, 8, 4398.
35. Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098.
36. Stephens, P. J.; Devlin, F. J.; Chabalowski, C. F.; Frisch, M. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11623.
37. Perdew, J. P. In Electronic Structure of Solids'91; Ziesche, P., Eschrig, H., Eds.; Akademie Verlag: Berlin, 1991.
38. Perdew, J. P. Phys. Rev. B 1986, 33, 8822.
39. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 2008, 120, 215.
40. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2008, 4, 1849.
41. Schultz, N. E.; Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 11127.
42. Thompson, J. D.; Cramer, C. J.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 2005, 113, 107.
43. Quintal, M. M.; Karton, A.; Iron, M. A.; Boese, A. D.; Martin, J. M. L. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 709.
44. Perdew, J. P.; Ruzsinszky, A.; Csonka, G. I.; Vydrov, O. A.; Scuseria, G. E.; Constantin, L. A.; Zhou, X.; Burke, K. Phys. ReV. Lett. 2008, 100, 136406.
45. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 2008, 128, 184109.
46. Binkley, J. S.; Pople, J. A.; Hehre, W. J. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 939. Gordon, M. S.; Binkley, J. S.; Pople, J. A.; Pietro, W. J.; Hehre, W. J. J. Am. Chem. Soc. 1982, 104, 2797.
47. Papajak, E.; Leverentz, H.; Zheng, J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput., in press.
48. Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. Theor. Chem. Acc. 2004, 111, 335.
49. Hehre, W. J.; Ditchfield, R.; Stewart, R. F.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1970, 52, 2769. Hehre, W. J.; Stewart, R. F.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1969, 51, 2657.
50. Clark, T.; Chandrasekhar, J.; Spitznagel, G. W.; Schleyer, P. V. J. Comput. Chem. 1983, 4, 294.
51. Dunning, T. H. J. Chem. Phys. 1989, 90, 1007. Woon, D. E.; Dunning, T. H. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1358.
52. Dunning, T. H.; Peterson, K. A.; Wilson, A. K. J. Chem. Phys. 2001, 114, 9244.
53. Thompson, J. D.; Winget, P.; Truhlar, D. G. PhysChem-Comm 2001, 6.
54. Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Zakrzewski, V. G.; Montgomery, J. A., Jr.; Stratmann, R. E.; Burant, J. C.; Dapprich, S.; Millam, J. M.; Daniels, A. D.; Kudin, K. N.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, M.; Cammi, R.; Mennucci, B.; Pomelli, C.; Adamo, C.; Clifford, S.; Ochterski, J.; Petersson, G. A.; Ayala, P. Y.; Cui, Q.; Morokuma, K.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cioslowski, J.; Ortiz, J. V.; Baboul, A. G.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Gomperts, R.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. G.; Chen, W.; Wong, M. W.; Andres, J. L.; Gonzalez, C.; Head-Gordon, M.; Replogle, E. S.; Pople, J. A. Gaussian03; ReVision E.01 ed.; Gaussian, Inc.: Pittsburgh, PA, 2003.
55. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. MN-GFM: Minnesota Gaussian Functional Module; Version 4.1 ed.; University of Minnesota: Minneapolis, 2009.
56. Raghavachari, K.; Trucks, G. W.; Pople, J. A.; Head-Gordon, M. Chem. Phys. Lett. 1989, 157, 479.
57. Werner, H.-J.; Knowles, P. J.; Amos, R. D.; Bernhardsson, A.; Berning, A.; Celani, P.; Cooper, D. L.; Deegan, M. J. O.; Dobbyn, A. J.; Eckert, F.; Hampel, C.; Hetzer, G.; Korona, T.; Lindh, R.; Lloyd, A. W.; McNicholas, S. J.; Manby, F. R.; Meyer, W.; Mura, M. E.; Nicklass, A.; Palmieri, P.; Pitzer, R.; Rauhut, G.; Schtuz, M.; Schumann, U.; Stoll, H.; Stone, A. J.; Tarroni, R.; Thorsteinsson, T. MOLPRO; 2006.1 ed.; University of Birmingham: Birmingham, 2006.
58. Moore, C. E. Atomic Energy Levels;Natl. Bur. Stand. (US) Circ. , 1949.
59. Martin, J. M. L.; Sundermann, A.; Fast, P. L.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 2000, 113, 1348.
60. Eichkorn, K.; Treutler, O.; Öhm, H.; Häser, M.; Ahlrichs, R. Chem. Phys. Lett. 1995, 240, 283. Dunlap, B. I. J. Mol. Struct. (Theochem) 2000, 37.
61. Raghavachari, K.; Anderson, J. B. J. Phys. Chem. 1996, 100, 12960.
62. Curtiss, L. A.; Redfern, P. C.; Raghavachari, K.; Rassolov, V.; Pople, J. A. J. Chem. Phys. 1999, 110, 4703.
63. Hehre, W. J.; Radom, L.; Schleyer, P. v. R.; Pople, J. A. Ab Initio Molecular Orbital Theory; Wiley: New York, 1986.
64. Zhao, Y.; Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 4786.
65. Zhao, Y.; Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. Phys. Chem. Chem. Phys. 2005, 7, 43.
66. Piecuch, P.; Wloch, M. J. Chem. Phys. 2005, 123, 224105. Piecuch, P.; Wloch, M.; Gour, J. R.; Kinal, A. Chem. Phys. Lett. 2006, 418, 467. Wloch, M.; Lodriguito, M. D.; Piecuch, P.; Gour, J. R. Mol. Phys. 2006, 104, 2149.
67. Pople, J. A.; Head-Gordon, M.; Raghavachari, K. J. Chem. Phys. 1987, 87, 5968.
68. Montgomery, J. J. A.; Frisch, M. J.; Ochterski, J. W.; Petersson, G. A. J. Chem. Phys. 1999, 110, 2822.
69. Montgomery, J. J. A.; Frisch, M. J.; Ochterski, J. W.; Petersson, G. A. J. Chem. Phys. 2000, 112, 6532.
70. Ochterski, J. W.; Petersson, G. A.; Montgomery, J. J. A. J. Chem. Phys. 1996, 104, 2598.
71. Petersson, G. A.; Tensfeldt, T. G.; Montgomery, J. J. A. J. Chem. Phys. 1991, 94, 6091.
72. Purvis III, G. D.; Bartlett, R. J. J. Chem. Phys. 1982, 76, 1910.
73. Hirao, K. Quantum Chem. Int. J. 1992, 517. Hirao, K Chem. Phys. Lett. 1992, 196, 397.
74. Møller, C.; Plesset, M. S. Phys. ReV. 1934, 46, 618.
75. Zhao, Y.; Lynch, B. J.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 2715.
76. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1996, 104, 1040.
77. Boese, A. D.; Martin, J. M. L. J. Chem. Phys. 2004, 121, 3405.
78. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 6908.
79. Adamo, C.; Barone, V. J. Chem. Phys. 1998, 108, 664.
80. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2005, 109, 5656.
81. Zhao, Y.; Schultz, N. E.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 364.
82. Keal, T. W.; Tozer, D. J. J. Chem. Phys. 2005, 123, 121103.
83. Krieger, J. B.; Chen, J.; Iafrate, G. J.; Savin, A. Electron Correlations and Materials Properties; Gonis, A.; , Kioussis, N., Eds.; Plenum: New York, 1999; p 463. Rey, J.; Savin, A. Int. J. Quantum Chem. 1998, 69, 581. Toulouse, J.; Savin, A.; Adamo, C. J. Chem. Phys. 2002, 117, 10465.
84. Lee, C. T.; Yang, W. T.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785.
85. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 1372.
86. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 13126.
87. Hamprecht, F. A.; Cohen, A. J.; Tozer, D. J.; Handy, N. C. J. Chem. Phys. 1998, 109, 6264.
88. Schmider, H. L.; Becke, A. D. J. Chem. Phys. 1998, 108, 9624.
89. Perdew, J. P.; Burke, K.; Ernzerhof, M. Phys. Rev. Lett. 1996, 77, 3865.
90. Xu, X.; Goddard, W. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2004, 101, 2673.
91. Boese, A. D.; Handy, N. C. J. Chem. Phys. 2002, 116, 9559.
92. Reiher, M.; Salomon, O.; Hess, B. A. Theor. Chem. Acc. 2001, 107, 48.
93. Adamo, C.; Barone, V. J. Chem. Phys. 1999, 110, 6158.
94. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 415.
95. Handy, N. C.; Cohen, A. J. Mol. Phys. 2001, 99, 403.
96. Hoe, W. M.; Cohen, A. J.; Handy, N. C. Chem. Phys. Lett. 2001, 341, 319.
97. Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E.; Tao, J. M.; Perdew, J. P. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12129. Tao, J. M.; Perdew, J. P.; Staroverov, V. N.; Scuseria, G. E. Phys. Rev. Lett. 2003, 91, 146401.
98. Di Valentin, C.; Pacchioni, G.; Bredow, T.; Dominguez-Ariza, D.; Illas, F. J. Chem. Phys. 2002, 117, 2299.
99. Roothaan, C. C. J. Rev. Mod. Phys. 1951, 23, 69.
100. Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 2006, 125, 194101.
101. Van Voorhis, T.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 1998, 109, 400.
102. Gill, P. M. W. Mol. Phys. 1996, 89, 433.
103. Stewart, J. J. P. J. Comput. Chem. 1989, 10, 209.
104. Dewar, M. J. S.; Zoebisch, E. G.; Healy, E. F.; Stewart, J. J. P. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 3902.
105. Seidl, M.; Perdew, J. P.; Levy, M. Phsy. Rev. A 1999, 59, 51.
106. Perdew, J. P.; Wang, Y. Phys. Rev. B 1992, 45, 13244.
107. Stewart, J. J. P. J. Mol. Model. 2007, 13, 1173.
108. Rocha, G. B.; Freire, R. O.; Simas, A. M.; Stewart, J. J. P. J. Comput. Chem. 2006, 27, 1101.
109. Jorgensen, W. L.; Tubert-Brohman, I.; Guimaraes, C. R. W. Improved semiempirical MO methods: PDDG/PM3; Abstracts of Papers of the American Chemical Society, 2004. Repasky, M. P.; Chandrasekhar, J.; Jorgensen, W. L. J. Comput. Chem. 2002, 23, 1601.
110. Tubert-Brohman, I.; Guimaraes, C. R. W.; Jorgensen, W. L. J. Chem. Theory Comput. 2005, 1, 817.
111. Tubert-Brohman, I.; Guimaraes, C. R. W.; Repasky, M. P.; Jorgensen, W. L. J. Comput. Chem. 2004, 25, 138.
112. Elstner, M.; Porezag, D.; Jungnickel, G.; Elsner, J.; Haugk, M.; Frauenheim, T.; Suhai, S.; Seifert, G. Phys. Rev. B 1998, 58, 7260.
113. Adamo, C.; Barone, V. Chem. Phys. Lett. 1997, 274, 242.
114. Ernzerhof, M.; Scuseria, G. E. J. Chem. Phys. 1999, 110, 5029.
115. Lynch, B. J.; Zhao, Y.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 1384.