메뉴 건너뛰기




Volumn 30, Issue 5, 2009, Pages 750-760

Conformational dependence of charges in protein simulations

Author keywords

Conformation dependence; Electrostatic potential charges; Generalized born; MM PBSA; Molecular dynamics simulations

Indexed keywords

ATOMIC CHARGES; CONFORMATIONAL ENERGIES; ELECTROSTATIC POTENTIAL CHARGES; ELECTROSTATIC POTENTIALS; ENERGY DIFFERENCES; GENERALIZED BORN; INTERACTION ENERGIES; LIGAND BINDINGS; MM/PBSA; MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS; POISSON-BOLTZMANN; PROTEIN SIMULATIONS; QUANTUM MECHANICALS; SOLVATION ENERGIES;

EID: 64549135080     PISSN: 01928651     EISSN: 1096987X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/jcc.21097     Document Type: Article
Times cited : (21)

References (38)
  • 4
    • 84986492477 scopus 로고    scopus 로고
    • Besler, B. H.: Merz, K. M.; Kollman, P. A. J Comput Chem 1990, 11, 431.
    • Besler, B. H.: Merz, K. M.; Kollman, P. A. J Comput Chem 1990, 11, 431.
  • 13
    • 3042524904 scopus 로고    scopus 로고
    • Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell, W. D.: Kollman, P. A. J Phys Chem 1993, 97, 10269.
    • Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell, W. D.: Kollman, P. A. J Phys Chem 1993, 97, 10269.
  • 24
    • 0027214259 scopus 로고    scopus 로고
    • Pugliese, L.; Coda, A.; Malcovati, M.; Bolognesi, M. J Mol Biol 1993. 231, 698.
    • Pugliese, L.; Coda, A.; Malcovati, M.; Bolognesi, M. J Mol Biol 1993. 231, 698.
  • 26
    • 0016415230 scopus 로고    scopus 로고
    • Green, N. M. Aclv Protein Chem 1975, 29, 85.
    • Green, N. M. Aclv Protein Chem 1975, 29, 85.
  • 28
    • 64549107156 scopus 로고    scopus 로고
    • Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, T. E.; Siramerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Merz, K. M.; Wang, B.; Pearlman, D. A.; Crowley, M.; Brozell, S.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Beroza, P.; Schafmeister, C.; Caldwell, J. W.; Ross, W. S.; Kollman, P. A. AMBER 8; University of California: San Francisco, 2004.
    • Case, D. A.; Darden, T. A.; Cheatham, T. E.; Siramerling, C. L.; Wang, J.; Duke, R. E.; Luo, R.; Merz, K. M.; Wang, B.; Pearlman, D. A.; Crowley, M.; Brozell, S.; Tsui, V.; Gohlke, H.; Mongan, J.; Hornak, V.; Cui, G.; Beroza, P.; Schafmeister, C.; Caldwell, J. W.; Ross, W. S.; Kollman, P. A. AMBER 8; University of California: San Francisco, 2004.
  • 35
    • 64549111140 scopus 로고    scopus 로고
    • Frisch, M. J, Trucks, G. W, Schlegel, H. B, Scuseria, G. E, Robb, M. A, Cheeseman, J. R, Montgomery, J. A, Jr, Vreven, T, Kudin, K. N, Burant, J. C, Millam, J. M, Iyengar, S. S, Tomasi, J, Barone, V, Mennucci, B, Cossi, M, Scalmani, G, Rega, N, Petersson, G. A, Nakatsuji, R; Hada, M, Ehara, M, Toyota, K, Fukuda, R, Hasegawa, J, Ishida, M, Nakajima, T, Honda, Y, Kitao, O, Nakai, H, Klene, M, Li, X, Knox, J. E, Hratchian, H. P, Cross, J. B, Bakken, V, Adamo, C: Jaramiilo, J, Gomperts, R, Stratmann, R. E, Yazyev, O, Austin, A. J, Cammi, R, Pomelli, C, Ochterski, J. W, Ayala, P. Y, Morokuma, K, Voth, G. A, Salvador, P, Dannenberg, J. J, Zakrzewski, V. G, Dapprich, S, Daniels, A. D, Strain, M. C, Farkas, O, Malick, D. K, Rabuck, A. D, Raghavachari, K, Foresman, J. B, Ortiz, J. V, Cui, Q, Baboul, A. G, Clifford, S, Cioslowski, J, Stefanov, B. B, Liu, G, Liashenko, A, Piskorz, P, Komaromi, I, Martin, R. L, Fox, D. J, Keith
    • Frisch, M. J.; Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.: Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, R; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C: Jaramiilo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, Revision; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
  • 37
    • 0029016182 scopus 로고
    • Honig, B. Science 1995, 268, 1144.
    • (1995) Science , vol.268 , pp. 1144
    • Honig, B.1


* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.