An effective hamiltonian molecular orbital-valence bond (MOVB) approach for chemical reactions as applied to the nucleophilic substitution reaction of hydrosulfide ion and chloromethane

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 5, Issue 1, 2009, Pages 174-185

  Song, Lingchun ^a   Mo, Yirong ^b   Gao, Jiali ^a  

^a UNIVERSITY OF MINNESOTA   (United States)

^b WESTERN MICHIGAN UNIVERSITY   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 61449147172     PISSN: 15499618     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ct800421y     Document Type: Article

References (67)

1. Mo, Y.; Gao, J. J. Comput. Chem. 2000, 21, 1458.
2. Mo, Y.; Gao, J. J. Phys, Chem. A 2000, 104, 3012.
3. Song, L.; Gao, J. J. Phys. Chem. A 2008, ASAP.
4. Mo, Y.; Peyerimhoff, S. D. J. Chem. Phys. 1998, 109, 1687.
5. Mo, Y.; Zhang, Y.; Gao, J. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 5737.
6. Mo, Y.; Gao, J.; Peyerimhoff, S. D. J. Chem. Phys. 2000, 112, 5530.
7. (a) Gianinetti, E.; Raimondi, M.; Tornaghi, E. Int. J. Quantum Chem. 1996, 60, 157.
8. (b) Gianinetti, E.; Vandoni, I.; Famulari, A.; Raimondi, M. Adv. Quantum Chem. 1998, 31, 251.
9. Raimondi, M.; Famulari, A.; Specchio, R.; Sironi, M.; Moroni, F.; Gianinetti, E. THEOCHEM 2001, 573, 25.
10. Khaliullin, R. Z.; Head-Gordon, M.; Bell, A. T. J. Chem. Phys. 2006, 124, 204105/1.
11. Khaliullin, R. Z.; Cobar, E. A.; Lochan, R. C.; Bell, A. T.; Head-Gordon, M. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 8753.
12. Mo, Y.; Song, L.; Lin, Y. J. Phys. Chem. A 2007, 111, 8291.
13. Valence Bond Theory; Cooper, D. L., Ed.; Eisevier: Amsterdam, 2002.
14. Cooper, D. L.; Gerratt, J,; Raimondi, M. Adv. Chem. Phys. 1987, 69, 319.
15. Hiberty, P. C.; Flament, J. P.; Noizet, E. Chem. Phys. Lett. 1992, 189, 259.
16. Wu, W.; Song, L.; Cao, Z.; Zhang, Q.; Shaik, S. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 2721.
17. Song, L.; Mo, Y.; Zhang, Q.; Wu, W. J. Comput. Chem. 2005, 26, 514.
18. Shaik, S.; Shurki, A. Angew. Chem., Int. Ed. 1999, 38, 587.
19. Warshel, A.; Weiss, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1980, 102, 6218.
20. (a) Warshel, A. Computer Modeling of Chemical Reactions in Enzymes and Solutions; Wiley: New York, 1991.
21. (b) Aqvist, J.; Warshel, A. Chem. Rev. 1993, 93, 2523.
22. (c) Villa, J.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 7887.
23. (a) Hong, G.; Rosta, E.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 19570-19574.
24. (b) Xiang, Y.; Warshel, A. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 1007-1015.
25. (a) Wu, Q.; Cheng, C.-L.; Van Voorhis, T. J. Chem. Phys. 2007, 127, 16419.
26. (b) Sharir-Ivry, A.; Shurki, A. J. Phys. Chem. A 2008, ASAP.
27. Schlegel, H. B.; Sonnenberg, J. L. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 905.
28. Chang, Y. T.; Miller, W. H. J. Phys. Chem. 1990, 94, 5884.
29. Schmitt, U. W.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 5547.
30. (a) Day, T. J. F.; Soudackov, A. V.; Cuma, M.; Schmitt, U. W.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 2002, 117, 5839.
31. (b) Maupin, C. M.; Wong, K. F.; Soudackov, A. V.; Kim, S.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 631.
32. Vuilleumier, R.; Borgis, D. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 4261.
33. Sonnenberg, J. L.; Schlegel, H. B. Mol. Phys. 2007, 105, 2719.
34. Kim, Y.; Corchado, J. C.; Villa, J.; Xing, J.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 2000, 112, 2718.
35. Tishchenko, O.; Truhlar, D. G. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 13530.
36. Lin, H.; Zhao, Y.; Tishchenko, O.; Truhlar, D. G. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 1237.
37. Goddard, W. A., III.; Dunning, T. H., Jr.; Hunt, W. J.; Hay, P. J. Acc. Chem. Res. 1973, 6, 368.
38. Mead, C. A.; Truhlar, D. G. J. Chem. Phys. 1982, 77, 6090.
39. Pacher, T.; Cederbaum, L. S.; Koppel, H. J. Chem. Phys. 1988, 89, 7367.
40. Mo, Y.; Wu, W.; Zhang, Q. J. Chem. Phys. 2003, 119, 6448.
41. Mo, Y. J. Chem. Phys. 2007, 126, 224104.
42. Sidis, V. Adv. Chem. Phys. 1992, 82, 73.
43. Van Lenthe, J. H.; Verbeek, J.; Pulay, P. Mol. Phys. 1991, 73, 1159.
44. Van Lenthe, J. H.; Dijkstra, R; Havenith, R. W. A. Theor. Comput. Chem. 2002, 10, 79.
45. Sheppard, M. G.; Freed, K. F. J. Chem. Phys. 1981, 75, 4507.
46. Hurtubise, V.; Freed, K. F. Adv. Chem. Phys. 1993, 83, 465.
47. Martin, C. H.; Graham, R. L.; Freed, K. F. J. Phys. Chem. 1994, 98, 3467.
48. Bernardi, F.; Olivucci, M.; Robb, M. A. J. Am. Chem. Soc. 1992, 114, 1606.
49. Bearpark, M. J.; Robb, M. A.; Bernardi, F.; Olivucci, M. Chem. Phys. Lett. 1994, 217, 513.
50. Bearpark, M. J.; Bernardi, F.; Olivucci, M.; Robb, M. A. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 8395.
51. Bearpark, M. J.; Smith, B. R.; Bernardi, F.; Olivucci, M.; Robb, M. A. ACS Symp. Ser. 1998, 712, 148.
52. Heitler, W.; London, F. Z. Phys. 1927, 44, 455.
53. Mo, Y.; Lin, Z.; Wu, W.; Zhang, Q. J. Phys. Chem. 1996, 100, 11569.
54. Thorsteinsson, T.; Cooper, D. L.; Gerratt, J.; Karadakov, P. B.; Raimondi, M. Theor. Chim. Acta 1996, 93, 343.
55. Hiberty, P. C.; Humbel, S.; Archirel, P. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11697.
56. Song, L.; Wu, W.; Hiberty, P. C.; Shaik, S. Chem.- Eur. J. 2006, 12, 7458.
57. Su, P.; Ying, F.; Wu, W.; Hiberty, P. C.; Shaik, S. ChemP-hysChem 2007, 8, 2603.
58. Gao, J.; Garcia-Viloca, M.; Poulsen, T. D.; Mo, Y. Adv. Phys. Org. Chem. 2003, 38, 161.
59. Gao, J.; Mo, Y. Prog. Theor. Chem. Phys. 2000, 5, 247.
60. Mo, Y.; Gao, J. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 6530.
61. Mo, Y.; Subramanian, G.; Gao, J.; Ferguson, D. M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 4832.
62. Mo, Y.; Wu, W.; Song, L.; Lin, M.; Zhang, Q.; Gao, J. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 1986.
63. Mo, Y.; Gao, J. Acc. Chem. Res. 2007, 40, 113.
64. Brauer, C. S.; Craddock, M. B.; Kilian, J.; Grumstrup, E. M.; Orilall, M. C.; Mo, Y.; Gao, J.; Leopold, K. R. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 10025.
65. Mo, Y.; Gao, J. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 2976.
66. Frisch, M. J. G. W. T.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E.; Robb, M. A.; Montgomery, J. R. C. J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Millam, J. C. B. J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Cossi, B. M. M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Hada, H. N. M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fukuda, R.; Ishida, J. H. M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Knox, M. K. X.; Li, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Jaramillo, C. A. J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Cammi, A. J. A0 R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Voth, K. M. G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Daniels, S. D. A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Rabuck, D. K. M. A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Cui, J. V. O. Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Liu, B. B. S. G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Fox, R. L. M. D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Challacombe, A. N. M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B. W. C.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian03, Revision D.01; Gaussian, Inc.: 2004.
67. Chirgwin, H. B.; Coulson, C. A. Proc. R. Soc. London Ser. A 1950, 2, 196.