SCOPUS 정보 검색 플랫폼

Journal of Chemical Theory and Computation

Volumn 4, Issue 6, 2008, Pages 898-907

Microscopic picture of the aqueous solvation of glutamic acid

(3) Leenders, Elske J M a Bolhuis, Peter G a Meijer, Evert Jan a

a UNIVERSITY OF AMSTERDAM (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 58149112502 PISSN: 15499618 EISSN: None Source Type: Journal
DOI: 10.1021/ct700344f Document Type: Article

Times cited : (10)

References (46)

1
- 3242888980
- Speranskiy, K.; Kurnikova, M. J. Chem. Phys. 2004, 121, 1516-1524.
- (2004) J. Chem. Phys , vol.121 , pp. 1516-1524
- Speranskiy, K.¹ Kurnikova, M.²

2
- 34248135998
- Leenders, E. J. M.; Guidoni, L.; Röthlisberger, U.; Vreede, J.; Bolhuis, P. G.; Meijer, E. J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 3765-3773.
- (2007) J. Phys. Chem. B , vol.111 , pp. 3765-3773
- Leenders, E.J.M.¹ Guidoni, L.² Röthlisberger, U.³ Vreede, J.⁴ Bolhuis, P.G.⁵ Meijer, E.J.⁶

3
- 0027940414
- Hoff, W. D.; Düx, P.; Hård, K.; Devreese, B.; Nugteren-Roodzant, I. M.; Crielaard, W.; Boelens, R.; Kaptein, R.; Van Beeumen, J.; Hellingwerf, K. J. Biochemistry 1994, 33, 13959-13962.
- (1994) Biochemistry , vol.33 , pp. 13959-13962
- Hoff, W.D.¹ Düx, P.² Hård, K.³ Devreese, B.⁴ Nugteren-Roodzant, I.M.⁵ Crielaard, W.⁶ Boelens, R.⁷ Kaptein, R.⁸ Van Beeumen, J.⁹ Hellingwerf, K.J.¹⁰

4
- 0028577744
- Baca, M.; Borgstahl, G. E. O.; Boissinot, M.; Burke, P. M.; Williams, D. R.; Slater, K. E.; Getzoff, E. D. Biochemistry 1994, 34, 14369-14377.
- (1994) Biochemistry , vol.34 , pp. 14369-14377
- Baca, M.¹ Borgstahl, G.E.O.² Boissinot, M.³ Burke, P.M.⁴ Williams, D.R.⁵ Slater, K.E.⁶ Getzoff, E.D.⁷

5
- 37249020962
- Leenders, E. J. M.; VandeVondele, J.; Bolhuis, P. G.; Meijer, E. J. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 13591-13599.
- (2007) J. Phys. Chem. B , vol.111 , pp. 13591-13599
- Leenders, E.J.M.¹ VandeVondele, J.² Bolhuis, P.G.³ Meijer, E.J.⁴

6
- 34047221884
- Kamiya, M.; Saito, S.; Ohmine, I. J. Phys. Chem. B 2007, 111, 2948-2956.
- (2007) J. Phys. Chem. B , vol.111 , pp. 2948-2956
- Kamiya, M.¹ Saito, S.² Ohmine, I.³

7
- 0001182231
- Sun, W.; Kinsel, G. R.; Marynick, D. S. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 4113-4117.
- (1999) J. Phys. Chem. A , vol.103 , pp. 4113-4117
- Sun, W.¹ Kinsel, G.R.² Marynick, D.S.³

8
- 0034415261
- Prabhakar, R.; Blomberg, M. R. A.; Siegbahn, P. E. M. Theor. Chem. Acc. 2000, 104, 461-470.
- (2000) Theor. Chem. Acc , vol.104 , pp. 461-470
- Prabhakar, R.¹ Blomberg, M.R.A.² Siegbahn, P.E.M.³

9
- 0039592758
- Jayaraman, V.; Keesey, R.; Madden, D. R. Biochemistry 2000, 39, 8693-8697.
- (2000) Biochemistry , vol.39 , pp. 8693-8697
- Jayaraman, V.¹ Keesey, R.² Madden, D.R.³

10
- 4444282928
- Oostenbrink, C.; Villa, A.; Mark, A. E.; Van Gunsteren, W. F. J. Comput. Chem. 2004, 25, 1656-1676.
- (2004) J. Comput. Chem , vol.25 , pp. 1656-1676
- Oostenbrink, C.¹ Villa, A.² Mark, A.E.³ Van Gunsteren, W.F.⁴

11
- 0037089015
- Villa, A.; Mark, A. E. J. Comput. Chem. 2002, 23, 548-553.
- (2002) J. Comput. Chem , vol.23 , pp. 548-553
- Villa, A.¹ Mark, A.E.²

12
- 0035913529
- Kaminski, G. A.; Friesner, R. A.; Tirado-Rives, J.; Jorgensen, W. L. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 6474-6487.
- (2001) J. Phys. Chem. B , vol.105 , pp. 6474-6487
- Kaminski, G.A.¹ Friesner, R.A.² Tirado-Rives, J.³ Jorgensen, W.L.⁴

13
- 0029011701
- Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R.; Merz, K. M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Caldwell, J. W.; Kollman, P. A. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 5179-5197.
- (1995) Am. Chem. Soc , vol.117 , pp. 5179-5197
- Cornell, W.D.¹ Cieplak, P.² Bayly, C.I.³ Gould, I.R.⁴ Merz, K.M.⁵ Ferguson, D.M.⁶ Spellmeyer, D.C.⁷ Fox, T.⁸ Caldwell, J.W.⁹ Kollman, P.A.J.¹⁰

14
- 0002680478
- Smith, B. J. J. Comput. Chem. 1999, 20, 428-442.
- (1999) J. Comput. Chem , vol.20 , pp. 428-442
- Smith, B.J.¹

15
- 0008819754
- Scott, W. R. P.; Hünenberger, P. H.; Tironi, I. G.; Mark, A. E.; Billeter, S. R.; Fennen, J.; Torda, A. E.; Huber, T.; Krüger, P.; Van Gunsteren, W. F. J. Phys. Chem. A 1999, 103, 3596-3607.
- (1999) J. Phys. Chem. A , vol.103 , pp. 3596-3607
- Scott, W.R.P.¹ Hünenberger, P.H.² Tironi, I.G.³ Mark, A.E.⁴ Billeter, S.R.⁵ Fennen, J.⁶ Torda, A.E.⁷ Huber, T.⁸ Krüger, P.⁹ Van Gunsteren, W.F.¹⁰

16
- 58149123429
- Gromacs user manual
- version 3.3;, accessed Dec 7, 2007
- Van der Spoel, D.; Lindahl, E.; Hess, B.; Van Buuren, A. R.; Apol, E.; Meulenhoff, P. J.; Tieleman, D. P.; Sijbers, A. L. T. M.; Feenstra, K. A.; Van Drunen, R.; Berendsen, H. J. C. Gromacs user manual, version 3.3; 2005. Gromacs Web site http://www.gromacs.org (accessed Dec 7, 2007).
- (2005) Gromacs Web site
- Van der Spoel, D.¹ Lindahl, E.² Hess, B.³ Van Buuren, A.R.⁴ Apol, E.⁵ Meulenhoff, P.J.⁶ Tieleman, D.P.⁷ Sijbers, A.L.T.M.⁸ Feenstra, K.A.⁹ Van Drunen, R.¹⁰ Berendsen, H.J.C.¹¹

17
- 0001538909
- Hoover, W. G. Phys. Rev. A 1985, 31, 1695-1697.
- (1985) Phys. Rev. A , vol.31 , pp. 1695-1697
- Hoover, W.G.¹

18
- 0000388705
- Hess, B.; Bekker, H.; Berendsen, H. J. C.; Fraaije, J. G. E. M. J. Comput. Chem. 1997, 18, 1463-1472.
- (1997) J. Comput. Chem , vol.18 , pp. 1463-1472
- Hess, B.¹ Bekker, H.² Berendsen, H.J.C.³ Fraaije, J.G.E.M.⁴

19
- 84986440341
- Miyamoto, S.; Kollman, P. A. J. Comput. Chem. 1992, 13, 952-962.
- (1992) J. Comput. Chem , vol.13 , pp. 952-962
- Miyamoto, S.¹ Kollman, P.A.²

20
- 33750587438
- Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; Van Gunsteren, W. F.; DiNola, A.; Haak, J. R. J. Chem. Phys. 1984, 57, 3684-3690.
- (1984) J. Chem. Phys , vol.57 , pp. 3684-3690
- Berendsen, H.J.C.¹ Postma, J.P.M.² Van Gunsteren, W.F.³ DiNola, A.⁴ Haak, J.R.⁵

21
- 15344345714
- VandeVondele, J.; Krack, M.; Mohamed, F.; Parrinello, M.; Chassaing, T.; Hutter, J. Comput. Phys. Commun. 2005, 167, 103-128.
- (2005) Comput. Phys. Commun , vol.167 , pp. 103-128
- VandeVondele, J.¹ Krack, M.² Mohamed, F.³ Parrinello, M.⁴ Chassaing, T.⁵ Hutter, J.⁶

22
- 58149114643
- CP2K developers home page, accessed Dec 7, 2007
- CP2K developers home page, http://cp2k.berlios.de (accessed Dec 7, 2007).

23
- 58149119426
- Lippert, G.; Hutter, J.; Parrinello, M. Mol. Phys. 1997, 92, 411-487.
- (1997) Mol. Phys , vol.92 , pp. 411-487
- Lippert, G.¹ Hutter, J.² Parrinello, M.³

24
- 0000160164
- Goedecker, S.; Teter, M.; Hutter, J. Phys. Rev. B 1996, 54, 1703-1710.
- (1996) Phys. Rev. B , vol.54 , pp. 1703-1710
- Goedecker, S.¹ Teter, M.² Hutter, J.³

25
- 0000083717
- Hartwigsen, C.; Goedecker, S.; Hutter, J. Phys. Rev. B 1998, 58, 3641-3662.
- (1998) Phys. Rev. B , vol.58 , pp. 3641-3662
- Hartwigsen, C.¹ Goedecker, S.² Hutter, J.³

26
- 0001723472
- Sprik, M.; Hutter, J.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1996, 105, 1142-1152.
- (1996) J. Chem. Phys , vol.105 , pp. 1142-1152
- Sprik, M.¹ Hutter, J.² Parrinello, M.³

27
- 4243553426
- Becke, A. D. Phys. Rev. A 1988, 38, 3098-3100.
- (1988) Phys. Rev. A , vol.38 , pp. 3098-3100
- Becke, A.D.¹

28
- 0345491105
- Lee, C.; Yang, W.; Parr, R. G. Phys. Rev. B 1988, 37, 785-789.
- (1988) Phys. Rev. B , vol.37 , pp. 785-789
- Lee, C.¹ Yang, W.² Parr, R.G.³

29
- 36449000062
- Martyna, G. J.; Klein, M. L.; Tuckerman, M. J. Chem. Phys. 1992, 97, 2635-2643.
- (1992) J. Chem. Phys , vol.97 , pp. 2635-2643
- Martyna, G.J.¹ Klein, M.L.² Tuckerman, M.³

30
- 0037162256
- Izvekov, S.; Voth, G. J. Chem. Phys. 2002, 116, 10372-10376.
- (2002) J. Chem. Phys , vol.116 , pp. 10372-10376
- Izvekov, S.¹ Voth, G.²

31
- 84990424072
- Hermans, J.; Berendsen, H. J. C.; Van Gunsteren, W. F.; Postma, J. P. M. Biopolymers 1984, 23, 1513-1518.
- (1984) Biopolymers , vol.23 , pp. 1513-1518
- Hermans, J.¹ Berendsen, H.J.C.² Van Gunsteren, W.F.³ Postma, J.P.M.⁴

32
- 2442545593
- Soper, A. K.; Bruni, F.; Ricci, M. A. J. Chem. Phys. 1997, 106, 247-254.
- (1997) J. Chem. Phys , vol.106 , pp. 247-254
- Soper, A.K.¹ Bruni, F.² Ricci, M.A.³

33
- 0034316640
- Sorenson, J. M.; Hura, G.; Glaeser, R. M.; Head-Gordon, T. J. Chem. Phys. 2000, 113, 9149-9161.
- (2000) J. Chem. Phys , vol.113 , pp. 9149-9161
- Sorenson, J.M.¹ Hura, G.² Glaeser, R.M.³ Head-Gordon, T.⁴

34
- 4944230287
- Schwegler, E.; Grossman, J. C.; Gygi, F.; Galii, G. J. Chem. Phys. 2004, 121, 5400-5409.
- (2004) J. Chem. Phys , vol.121 , pp. 5400-5409
- Schwegler, E.¹ Grossman, J.C.² Gygi, F.³ Galii, G.⁴

35
- 0942288567
- Grossman, J. C.; Schwegler, E.; Draeger, E. W.; Gygi, F.; Galii, G J. Chem. Phys. 2004, 120, 300-311.
- (2004) J. Chem. Phys , vol.120 , pp. 300-311
- Grossman, J.C.¹ Schwegler, E.² Draeger, E.W.³ Gygi, F.⁴ Galii, G.⁵

36
- 33846320458
- Kuo, I. W.; Mundy, C. J.; McGrath, M. J.; Siepmann, J. I. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 1274-1281.
- (2006) J. Chem. Theory Comput , vol.2 , pp. 1274-1281
- Kuo, I.W.¹ Mundy, C.J.² McGrath, M.J.³ Siepmann, J.I.⁴

37
- 0037042610
- Glattli, A.; Daura, X.; Van Gunsteren, W. F. J. Chem. Phys. 2002, 116, 9811-9828.
- (2002) J. Chem. Phys , vol.116 , pp. 9811-9828
- Glattli, A.¹ Daura, X.² Van Gunsteren, W.F.³

38
- 0038391137
- Alagona, G. J. Am. Chem. Soc. 1986, 108, 185-191.
- (1986) J. Am. Chem. Soc , vol.108 , pp. 185-191
- Alagona, G.¹

39
- 11144289718
- Fernández-Serra, M. V.; Artacho, E. J. Chem. Phys. 2004, 121, 11136-11144.
- (2004) J. Chem. Phys , vol.121 , pp. 11136-11144
- Fernández-Serra, M.V.¹ Artacho, E.²

40
- 4243422452
- Luzar, A.; Chandler, D. Phys. Rev. Lett. 1996, 76, 928-931.
- (1996) Phys. Rev. Lett , vol.76 , pp. 928-931
- Luzar, A.¹ Chandler, D.²

41
- 0042936805
- Mills, R. J. Phys. Chem. 1973, 77, 685-688.
- (1973) J. Phys. Chem , vol.77 , pp. 685-688
- Mills, R.¹

42
- 58149109027
- Watanabe, K.; Klein, M. L. Chem. Phys. 1989, 131, 157167.
- (1989) Chem. Phys , vol.131 , pp. 157167
- Watanabe, K.¹ Klein, M.L.²

43
- 0035155532
- Mahoney, M. W.; Jorgensen, W. L. J. Chem. Phys. 2001, 114, 363-366.
- (2001) J. Chem. Phys , vol.114 , pp. 363-366
- Mahoney, M.W.¹ Jorgensen, W.L.²

44
- 4444372137
- Kuo, I. W.; Mundy, C. J.; McGrath, M. J.; Siepmann, J. I.; VandeVondele, J.; Sprik, M.; Hutter, J.; Chen, B.; Klein, M. L.; Mohamed, F.; Krack, M.; Parrinello, M. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 12990-12998.
- (2004) J. Phys. Chem. B , vol.108 , pp. 12990-12998
- Kuo, I.W.¹ Mundy, C.J.² McGrath, M.J.³ Siepmann, J.I.⁴ VandeVondele, J.⁵ Sprik, M.⁶ Hutter, J.⁷ Chen, B.⁸ Klein, M.L.⁹ Mohamed, F.¹⁰ Krack, M.¹¹ Parrinello, M.¹²

45
- 0346934847
- Asthagiri, D.; Pratt, L. R.; Kress, J. D. Phys. Rev. E 2003, 68, 041505.
- (2003) Phys. Rev. E , vol.68 , pp. 041505
- Asthagiri, D.¹ Pratt, L.R.² Kress, J.D.³

46
- 0142057630
- Silvestrelli, P. L.; Parrinello, M. J. Chem. Phys. 1999, 111, 3572-3580.
- (1999) J. Chem. Phys , vol.111 , pp. 3572-3580
- Silvestrelli, P.L.¹ Parrinello, M.²

* 이 정보는 Elsevier사의 SCOPUS DB에서 KISTI가 분석하여 추출한 것입니다.