MCR-ALS analysis of two-way UV resonance Raman spectra to resolve discrete protein secondary structural motifs

Analyst

Volumn 134, Issue 1, 2009, Pages 138-147

  Simpson, John V ^a   Balakrishnan, Gurusamy ^b,c   Jiji, Renee D ^a  

^a UNIVERSITY OF MISSOURI   (United States)

^b PRINCETON UNIVERSITY   (United States)

^c UNIVERSITY OF WASHINGTON   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

MYOGLOBIN;

ALPHA HELIX; ARTICLE; CHEMICAL ANALYSIS; MULTIVARIATE CURVE RESOLUTION ALTERNATING LEAST SQUARE ANALYSIS; PROTEIN ANALYSIS; PROTEIN MOTIF; PROTEIN STRUCTURE; RAMAN SPECTROMETRY; ULTRAVIOLET RADIATION;

AMINO ACID MOTIFS; HUMANS; LEAST-SQUARES ANALYSIS; MYOGLOBIN; PROTEIN STRUCTURE, SECONDARY; SPECTROPHOTOMETRY, ULTRAVIOLET; SPECTRUM ANALYSIS, RAMAN;

EID: 57649227441     PISSN: 00032654     EISSN: 13645528     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b814392g     Document Type: Article

References (46)

1. R. A. Copeland T. G. Spiro J. Am. Chem. Soc. 1986 108 1281 1285
2. Z. Chi X. G. Chen J. S. W. Holtz S. A. Asher Biochemistry 1998 37 2854 2864
3. C. Y. Huang G. Balakrishnan T. G. Spiro J. Raman Spectrosc. 2006 37 277 282
4. A. V. Mikhonin S. V. Bykov N. S. Myshakina S. A. Asher J. Phys. Chem. B 2006 110 1928 1943
5. J. C. Austin, T. Jordan and T. G. Spiro, in Biomolecular Spectroscopy, ed., R. J. H. Clark, and, R. E. Hester,, Wiley & Sons Ltd., New York, 1993, vol. 20, pp. 55-127
6. A. Barth C. Zscherp Q. Rev. Biophys. 2002 35 369 430
7. S. Krimm and J. Bandekar, in Advances in Protein Chemistry, ed., C. B. Anfinson,,, J. T. Edsall, and, F. M. Richards,, Academic Press, New York, 1986, vol. 38, pp. 181-365
8. A. T. Tu, in Spectroscopy of Biological Systems, ed. R. J. H. Clark and R. E. Hester, Wiley & Sons Ltd., New York, 1986, vol. 13, pp. 47-111
9. G. Balakrishnan C. L. Weeks M. Ibrahim A. V. Soldatova T. G. Spiro Curr. Opin. Struct. Biol. 2008 18 623 629
10. R. A. Copeland T. G. Spiro Biochemistry 1985 24 4960 4968
11. J. S. W. Holtz J. H. Holtz Z. H. Chi S. A. Asher Biophys. J. 1999 76 3227 3234
12. T. Miura A. Hori-i H. Mototani H. Takeuchi Biochemistry 1999 38 11560 11569
13. A. Ozdemir I. K. Lednev S. A. Asher Biochemistry 2002 41 1893 1896
14. Y. Wang R. Purrello T. Jordan T. G. Spiro J. Am. Chem. Soc. 1991 113 6359 6368
15. G. Balakrishnan Y. Hu G. M. Bender Z. Getahun W. F. DeGrado T. G. Spiro J. Am. Chem. Soc. 2007 129 12801 12808
16. I. K. Lednev A. S. Karnoup M. C. Sparrow S. A. Asher J. Am. Chem. Soc. 1999 121 8074 8086
17. I. K. Lednev A. S. Karnoup M. C. Sparrow S. A. Asher J. Am. Chem. Soc. 2001 123 2388 2392
18. R. D. JiJi G. Balakrishnan Y. Hu T. G. Spiro Biochemistry 2006 45 34 41
19. C. Y. Huang G. Balakrishnan T. G. Spiro Biochemistry 2005 44 15734 15742
20. N. Haruta T. Kitagawa Biochemistry 2002 41 6595 6604
21. M. Xu V. A. Shashilov V. V. Ermolenkov L. Fredriksen D. Zagorevski I. K. Lednev Protein Sci. 2007 16 815 832
22. V. A. Shashilov V. V. Ermolenkov I. K. Lednev Inorg. Chem. 2006 45 3606 3612
23. V. A. Shashilov M. Xu V. V. Ermolenkov I. K. Lednev J. Quant. Spectrosc. Radiat. Transfer 2006 102 46 61
24. K. Rosenheck P. Doty Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 1961 47 1775 1785
25. R. A. Copeland T. G. Spiro Biochemistry 1987 26 2134 2139
26. B. Sharma S. V. Bykov S. A. Asher J. Phys. Chem. B 2008 112 11762 11769
27. R. Tauler Anal. Chim. Acta 2007 595 289 298
28. R. Gargallo R. Tauler A. Izquierdo-Ridorsa Anal. Chem. 1997 69 1785 1792
29. R. Gargallo M. Vives R. Tauler R. Eritja Biophys. J. 2001 81 2886 2896
30. M. Vives R. Gargallo R. Tauler Anal. Biochem. 2001 291 1 10
31. J.-H. Wang P. K. Hopke T. M. Hancewicz S. L. Zhang Anal. Chim. Acta 2003 476 93 109
32. C. A. Holden S. S. Hunnicutt R. Sánchez-Ponce J. M. Craig S. C. Rutan Appl. Spectrosc. 2003 57 483 490
33. R. Tauler A. K. Smilde J. M. Henshaw L. W. Burgess B. R. Kowalski Anal. Chem. 1994 66 3337 3344
34. S. Navea A. de Juan R. Tauler Anal. Chem. 2002 74 6031 6039
35. S. Nigam A. de Juan R. J. Stubbs S. C. Rutan Anal. Chem. 2000 72 1956 1963
36. G. Balakrishnan Y. Hu S. B. Nielsen T. G. Spiro Appl. Spectrosc. 2005 59 776 781
37. R. Bro N. D. Sidiropoulos J. Chemom. 1998 12 223 247
38. H. A. L. Kiers J. Chemom. 2000 14 105 122
39. R. Tauler B. Kowalski S. Fleming Anal. Chem. 1993 65 2040 2047
40. E. Bezemer S. C. Rutan Chemom. Intell. Lab. Syst. 2006 81 82 93
41. S. P. A. Fodor R. A. Copeland C. A. Grygon T. G. Spiro J. Am. Chem. Soc. 1989 111 5509 5518
42. X. Zhao R. Chen C. Tengroth T. G. Spiro Appl. Spectrosc. 1999 53 1200 1205
43. Z. H. Chi S. A. Asher Biochemistry 1998 37 2865 2872
44. S. H. Song S. A. Asher J. Am. Chem. Soc. 1989 111 4295 4305
45. S. A. Asher A. Ianoul G. Mix M. N. Boyden A. Karnoup M. Diem R. Schweitzer-Stenner J. Am. Chem. Soc. 2001 123 11775 11781
46. T. Jordan T. G. Spiro J. Raman Spectrosc. 1994 25 537 543