UV resonance raman investigation of electronic transitions in α-helical and polyproline II-like conformations

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 37, 2008, Pages 11762-11769

  Sharma, Bhavya ^a   Bykov, Sergei V ^a   Asher, Sanford A ^a  

^a UNIVERSITY OF PITTSBURGH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMINES; POLARIZATION;

ALANINE PEPTIDE; ELECTRONIC TRANSITIONS; EXCITATION PROFILES; POLYPROLINE II; RAMAN DEPOLARIZATION; UV RESONANCE RAMAN;

RESONANCE;

EID: 53049088731     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp801110q     Document Type: Article

References (65)

1. Mix, G.; Schweitzer-Stenner, R.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9028.
2. Ianoul, A.; Boyden, M. N.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 7433.
3. Asher, S. A.; Ianoul, A.; Mix, G.; Boyden, M. N.; Karnoup, A.; Diem, M.; Schweitzer-Stenner, R. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 11775.
4. Chi, Z.; Chen, X. G.; Holtz, J. S. W.; Asher, S. A. Biochemistry 1998, 37, 2854.
5. Sieler, G.; Schweitzer-Stenner, R.; Holu, J. S. W.; Pajcini, V.; Asher, S. A. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 372.
6. Holtz, J. S. W.; Holtz, J, H.; Chi, Z.; Asher, S. A. Biophys, J. 1999, 76, 3227.
7. Ozdemir, A.; Lednev, I. K.; Asher, S. A. Biochemistry 2002, 41, 1893.
8. Holtz, J. S. W.; Lednev, I. K.; Asher, S. A. Biopolymers 2000, 57, 55.
9. Boyden, M. N.; Asher, S. A. Biochemistry 2001, 40, 13723-13727.
10. Chi, Z.; Asher, S. A. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9595.
11. Ianoul, A.; Mikhonin, A.; Lednev, I. K.; Asher, S. A. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 3621.
12. Asher, S. A.; Mikhonin, A. V.; Bykov, S. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 8433.
13. Mikhonin, A. V.; Ahmed, Z.; Ianoul, A.; Asher, S. A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 19020.
14. Mikhonin, A. V.; Bykov, S. V.; Myshakina, N. S.; Asher, S. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 1928.
15. Mikhonin, A. V.; Myshakina, N. S.; Bykov, S. V.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 7712.
16. Cho, N.; Asher, S. A. Biospectroscopy 1996, 2, 71.
17. Asher, S. A. Anal. Chem. 1993, 65, 59A.
18. Chen, X. G.; Asher, S. A.; Schweitzer-Stenner, R.; Mirkin, N. G.; Krimm, S. J. Am. Chem. Soc. 1995, 117, 2884.
19. Beeler, J. A.; Yan, S.-Z.; Bykov, S.; Murza, A.; Asher, S.; Tang, W.-J. Biochemistry 2004, 43, 15463.
20. Mikhonin, A. V.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2006, 128, 13789.
21. Pimenov, K. V.; Bykov, S. V.; Mikhonin, A. V.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 2840.
22. Dudik, J. M.; Johnson, C. R.; Asher, S. A. J. Chem. Phys. 1985, 82, 1732.
23. Asher, S. A.; Chi, Z.; Li, P. J. Raman Spectrosc. 1998, 29, 927.
24. Chen, X. G.; Schweitzer-Stenner, R.; Asher, S. A.; Mirkin, N. G.; Krimm, S. J. Phys. Chem. 1995, 99, 3074.
25. Chen, X. G.; Schweitzer-Stenner, R.; Krimm, S.; Mirkin, N. G.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11141.
26. Lednev, I. K.; Karnoup, A. S.; Sparrow, M. C.; Asher, S. A. J. Am. Chem Soc 1999, 121, 8074.
27. Chen, X. G.; Li, P.; Holtz, J. S. W.; Chi, Z.; Pajcini, V.; Asher, S. A.; Kelly, L. A. J. Am. Chem Soc 1996, 118, 9716.
28. Huang, C.-Y.; Balakrishnan, G.; Spiro, T. G. J. Raman Spectrosc. 2006, 37, 277.
29. JiJi, R. D.; Balakrishnan, G.; Hu, Y.; Spiro, T. G. Biochemistry 2006, 45, 34.
30. Peterson, D. L.; Simpson, W. T. J. Am. Chem. Soc. 1957, 79, 2375.
31. Basch, H.; Robin, M. B.; Kuebler, N. A. J. Chem. Phys. 1967, 47, 1201.
32. Basch, H.; Robin, M. B.; Kuebler, N. A. J. Chem. Phys. 1968, 49, 5007.
33. Schellman, J. A.; Nielsen, E. B. J. Phys. Chem. 1967, 71, 3914.
34. Barnes, D. G.; Rhodes, W. J. Chem. Phys. 1968, 48, 817.
35. Serrano-Andres, L.; Fuelscher, M. P. J. Am. Chem. Soc. 1998, 120, 10912.
36. Serrano-Andres, L.; Fuelscher, M. P. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 9323.
37. Clark, L. B. J. Am. Chem. Soc. 1995, 177, 7974.
38. Pajcini, V.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 10942.
39. Hunt, H. D.; Simpson, W. T. J. Am. Chem. Soc. 1953, 75, 4540.
40. Robin, M. B. Higher Excited States of Polyatomic Molecules; Academic Press, Inc.: New York, 1985; Vol. III.
41. Moffitt, W. J. Chem. Phys. 1956, 25, 467.
42. Rosenheck, K.; Doty, P. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1961, 47, 1775.
43. Brahms, J.; Pilet, J.; Damany, H.; Chandrasekharan, V. Proc. Natl. Acad. Sci. USA. 1968, 60, 1130.
44. Brahms, S.; Brahms, J. J. Mol. Biol. 1980, 138, 149.
45. Mandel, R.; Holzwarth, G. J. Chem. Phys. 1972, 57, 3469.
46. Woody, R. W. Monatsh. Chem. 2005, 136, 347.
47. Blanch, E. W.; Morozova-Roche, L. A.; Cochran, D. A. E.; Doig, A. J.; Hecht, L.; Barron, L. D. J. Mol. Biol. 2000, 301, 553.
48. Shi, Z.; Woody, R. W.; Kallenbach, N. R. Adv. Protein Chem 2002, 62, 163.
49. Ramakrishnan, V.; Ranbhor, R.; Durani, S. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 16332.
50. Asciutto, E. K.; Mikhonin, A. V.; Asher, S. A.; Madura, J. D. Biochemistry 2008, 47, 2046.
51. Vila, J. A.; Baldoni, H. A.; Ripoll, D. R.; Ghosh, A.; Scheraga, H. A. Biophys. J. 2004, 86, 731.
52. Makowska, J.; Rodziewicz-Motowidlo, S.; Baginska, K.; Makowski, M.; Vila, J. A.; Liwo, A.; Chmurzynski, L.; Scheraga, H. A. Biophys. J. 2007, 92, 2904.
53. Lednev, I. K.; Karnoup, A. S.; Sparrow, M. C.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 2001, 123, 2388.
54. Bykov, S.; Lednev, I.; Ianoul, A.; Mikhonin, A.; Munro, C.; Asher, S. A. Appl. Spectrosc. 2005, 59, 1541.
55. DeVito, V. L.; Cai, M. Z.; Asher, S. A.; Kehres, L. A.; Smith, K. M. J. Phys. Chem. 1992, 96, 6917.
56. Shriver, D. F.; Dunn, J. B. R. Appl. Spectrosc. 1974, 28, 319.
57. Ludwig, M.; Asher, S. A. Appl. Spectrosc. 1988, 42, 1458.
58. Lee, S.-H.; Krimm, S. Biopolymers 1998, 46, 283.
59. Imahori, K.; Tanaka, J. J. Mol. Biol. 1959, 1, 359.
60. Tinoco, I., Jr.; Halpern, A.; Simpson, W. T. In Polyamino Acids, Polypeptides, and Proteins; Stahmann, M. A., Ed.; University of Wisconsin Press: Madison, WI, 1962; Chapter 13.
61. Long, D. A. The Raman Effect: A Unified Treatment of the Theory of Raman Scattering by Molecules; John Wiley & Sons: New York, 2002.
62. Sorin, E. J.; Rhee, Y. M.; Shirts, M. R.; Pande, V. S. J. Mol. Biol. 2006, 356, 248.
63. Cartailler, J.-P.; Luecke, H. Structure 2004, 12, 133.
64. Ismer, L.; Ireta, J.; Neugebauer, J. J. Phys. Chem. B 2008, 112, 4109.
65. Goetz, M.; Carlotti, C.; Bontems, F.; Dufourc, E. J. Biochemistry 2001, 40, 6534.