Kinetic modeling of charge-transfer quenching in the CP29 minor complex

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 42, 2008, Pages 13418-13423

  Cheng, Yuan Chung ^a,b   Ahn, Tae Kyu ^a,b   Avenson, Thomas J ^b   Zigmantas, Donatas ^a,b   Niyogi, Krishna K ^a,b   Ballottari, Matteo ^c   Bassi, Roberto ^c   Fleming, Graham R ^a,b  

^a LAWRENCE BERKELEY NATIONAL LABORATORY   (United States)

^b UNIVERSITY OF CALIFORNIA   (United States)

^c UNIVERSITY OF VERONA   (Italy)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHLOROPHYLL; ELECTRIC INSTRUMENT TRANSFORMERS; ENERGY TRANSFER; PORPHYRINS;

HARVESTING COMPLEXES; HIGHER PLANTS; IN VITRO; IN VIVO MEASUREMENTS; KINETIC MODELING; KINETIC MODELS; PHASE KINETICS; THYLAKOID MEMBRANES; THYLAKOIDS; TRANSIENT ABSORPTIONS; ZEAXANTHIN;

QUENCHING;

EID: 55649100322     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp802730c     Document Type: Article

References (44)

1. Dekker, J. P.; Boekema, E. J. Binchim. Biophys. Acta 2005, 1706, 12-39.
2. Green, B.; Durnford, D. Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1996, 47, 685-714.
3. Formaggio, E.; Cinque, G.; Bassi, R. J. Mol. Biol. 2001, 314, 1157-66.
4. Dainese, P.; Bassi, R. J. Biol. Chem. 1991, 266, 8136-42.
5. Harrer, R.; Bassi, R.; Testi, M. G.; Schäfer, C. Ear. J. Biochem. 1998, 255, 196-205.
6. Boekema, E. J.; Hankamer, B.; Bald, D.; Kruip, J.; Nield, J.; Boonstra, A. F.; Barber, J.; Rogner, M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 175-9.
7. Boekema, E. J.; van Roon, H.; Calkoen, F.; Bassi, R.; Dekker, J. P. Biochemistry 1999, 38, 2233-9.
8. Horton, P.; Ruban, A. V.; Walters, R. Annu. Rev. Plant Physiol. Plant Mol. Biol. 1996, 47, 655-684.
9. Müller, P.; Li, X.-P.; Niyogi, K. K. Plant Physiol. 2001, 125, 1558-66.
10. Kramer, D. M.; Avenson, T. J.; Edwards, G. E. Trends Plant Sci. 2004, 9, 349-57.
11. Briantais, J. M.; Vernotte, C.; Picaud, M.; Krause, G. H. Biochim. Biophys. Acta 1979, 548, 128-38.
12. Niyogi, K. K.; Grossman, A. R.; Björkman, O. Plant Cell 1998, 10, 1121-34.
13. Demmig-Adams, B. Biochim. Biophys. Acta 1990, 1020, 1-24.
14. Li, X.-P.; Björkman, O.; Shih, C.; Grossman, A. R.; Rosenquist, M.; Jansson, S.; Niyogi, K. K. Nature (London) 2000, 403, 391-5.
15. Li, X.-P.; Gilmore, A. M.; Caffarri, S.; Bassi, R.; Golan, T.; Kramer, D. M.; Niyogi, K. K. J. Biol. Chem. 2004, 279, 22866-74.
16. Niyogi, K. K.; Li, X.-P.; Rosenberg, V.; Jung, H.-S. J. Exp. Bot. 2005, 56, 375-82.
17. Horton, P.; Wentworth, M.; Ruban, A. FEBS Lett. 2005, 579, 4201-6.
18. Dreuw, A.; Fleming, G. R.; Head-Gordon, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 2003, 5, 3247-3256.
19. Dreuw, A.; Fleming, G. R.; Head-Gordon, M. Biochem. Soc. Trans. 2005, 33, 858-62.
20. Holt, N. E.; Zigmantas, D.; Valkunas, L.; Li, X.-P.; Niyogi, K. K.; Fleming, G. R. Science 2005, 307, 433-6.
21. Avenson, T. J.; Ahn, T. K.; Zigmantas, D.; Niyogi, K. K.; Li, Z.; Ballottari, M.; Bassi, R.; Fleming, G. R. J. Biol. Chem. 2007, 283, 3550.
22. Ahn, T. K.; Avenson, T. J.; Ballottari, M.; Cheng, Y.-C.; Niyogi, K. K.; Bassi, R.; Fleming, G. R. Science 2008, 320, 794.
23. Giuffra, E.; Cugini, D.; Croce, R.; Bassi, R. Eur. J. Biochem. 1996, 238, 112-20.
24. Valkunas, L.; Trinkunas, G.; Liuolia, V.; van Grondelle, R. Biophys. J. 1995, 69, 1117-29.
25. Barzda, V.; Gulbinas, V.; Kananavicius, R.; Cervinskas, V.; van Amerongen, H.; van Grondelle, R.; Valkunas, L. Biophys. J. 2001, 80, 2409-21.
26. Press, W. H.; Flannery, B. P.; Teukolsky, S. A.; Vetterling, W. T. Numerical Recipes in C: The Art of Scientific Computing; Cambridge University Press: New York, 1992.
27. Tracewell, C. A.; Brudvig, G. W. Biochemistry 2003, 42, 9127-36.
28. Han, R.-M.; Tian, Y.-X.; Wu, Y.-S.; Wang, P.; Ai, X.-C.; Zhang, J.-P.; Skibsted, L. H. Photochem. Photobiol. 2006, 82, 538.
29. Cinque, G.; Croce, R.; Holzwarth, A. R.; Bassi, R. Biophys. J. 2000, 79, 1706.
30. Croce, R.; Müller, M. G.; Bassi, R.; Holzwarth, A. R. Biophys. J. 2003, 84, 2508-16.
31. Croce, R.; Müller, M. G.; Caffarri, S.; Bassi, R.; Holzwarth, A. R. Biophys. J. 2003, 84, 2517-32.
32. Gradinaru, C. C.; Pascal, A. A.; van Mourik, F. P.; Robert, B.; Horton, P.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. Biochemistry. 1998, 37, 1143-9.
33. Salverda, J. M.; Vengris, M.; Krueger, B. P.; Scholes, G. D.; Czarnoleski, A. R.; Novoderezhkin, V. I.; van Amerongen, H.; van Grondelle, R. Biophys. J. 2003, 84, 450-65.
34. Agarwal, R.; Krueger, B. P.; Scholes, G. D.; Yang, M.; Yom, J.; Mets, L.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 2908-2918.
35. Novoderezhkin, V. I.; Palacios, M. A.; van Amerongen, H.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 10363-10375.
36. Novoderezhkin, V. I.; Palacios, M. A.; van Amerongen, H.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 10493-504.
37. Linnanto, J.; Martiskainen, J.; Lehtovuori, V.; Ihalainen, J. A.; Kananavicius, R.; Barbato, R.; Korppi-Tommola, J. Photosynth. Res. 2006, 87, 267-79.
38. Kühlbrandt, W.; Wang, D. N.; Fujiyoshi, Y. Nature (London) 1994, 367, 614-21.
39. Bassi, R.; Croce, R.; Cugini, D.; Sandonà, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 10056-61.
40. We note that the B5 site in CP29 is considered to be a mixed site that binds both Chls a and b (see ref 39). Therefore, when a Chl a is bound to the B5 site, it is capable of being the CT quenching site.
41. Morosinotto, T.; Castelletti, S.; Breton, J.; Bassi, R.; Croce, R. J. Biol. Chem. 2002, 277, 36253.
42. Morosinotto, T.; Breton, J.; Bassi, R.; Croce, R. J. Biol. Chem. 2003, 278, 49223.
43. Croce, R.; Mozzo, M.; Morosinotto, T.; Romeo, A.; Hienerwadel, R.; Bassi, R. Biochemistry 2007, 46, 3846-61.
44. Liu, Z.; Yan, H.; Wang, K.; Kuang, T.; Zhang, J.; Gui, L.; An, X.; Chang, W. Nature (London) 2004, 428, 287-92.