Energy-transfer dynamics in the LHCII complex of higher plants: Modified redfield approach

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 108, Issue 29, 2004, Pages 10363-10375

  Novoderezhkin, Vladimir I ^a   Palacios, Miguel A ^b   Van Amerongen, Herbert ^c   Van Grondelle, Rienk ^b  

^a MOSCOW STATE UNIVERSITY   (Russian Federation)

^b VU UNIVERSITY AMSTERDAM   (Netherlands)

^c WAGENINGEN UNIVERSITY   (Netherlands)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

CHLOROPHYLL; EIGENVALUES AND EIGENFUNCTIONS; ENERGY TRANSFER; LIGHT ABSORPTION; LOW TEMPERATURE EFFECTS; MONOMERS; PERTURBATION TECHNIQUES; PHONONS; PIGMENTS; TEMPERATURE SCALES;

CIRCULAR DICHROISM (CD); PHONON COUPLING; TEMPERATURE DEPENDENT; TRANSIENT ABSORPTION (TA);

PLANTS (BOTANY);

EID: 3442880427     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0496001     Document Type: Article

References (46)

1. van Amerongen, H.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 604.
2. Kühlbrandt, W.; Wang, D. N.; Fujiyoshi, Y. Nature 1994, 367, 614.
3. Remelli, R.; Varotto, C.; Sandona, D.; Croce, R.; Bassi, R. J. Biol. Chem. 1999, 274, 33510.
4. Rogl, H.; Kühlbrandt, W. Biochemistry 1999, 38, 16214.
5. Yang, C.; Kosemund, K.; Cornet, C.; Paulsen, H. Biochemistry 1999, 38, 16205.
6. Rogl, H.; Schödel, R.; Lokstein, H.; Kühlbrandt, W.; Schubert, A. Biochemistry 2002, 41, 2281.
7. Bassi, R.; Croce, R.; Cugini, D.; Sandonà, D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 10056.
8. Simonetto, R.; Crimi, M.; Sandonà, D.; Croce, R.; Cinque, G.; Breton, J.; Bassi, R. Biochemistry 1999, 38, 12974.
9. Işeri, E. I.; Gülen, D. Eur. Biophys. J. 2001, 30, 344.
10. Gülen, D.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7256.
11. Novoderezhkin, V.; Salverda, J. M.; van Amerongen, H.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 1893.
12. Renger, Th.; May, V. Phys. Rev. Lett. 2000, 84, 5228.
13. Bittner, T.; Wiederrecht, G. P.; Irrgang, K.-D.; Renger, G.; Wasielewski, M. R. Chem. Phys. 1995, 194, 311.
14. Visser, H. M.; Kleima, F. J.; van Stokkum, I. H. M.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. J. Chem. Phys. 1996, 210, 297.
15. Kleima, F. J.; Gradinaru, C. C.; Calkoen, F.; van Stokkum, I. H. M.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. Biochemistry 1997, 36, 15262.
16. Gradinaru, C. C.; Özdemir, S.; Gülen, D.; van Stokkum, I. H. M.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. Biophys. J. 1998, 75, 3064.
17. Gradinaru, C. C.; van Stokkum, I. H. M.; Pascal. A. A.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 9330.
18. Du, M.; Xie, X.; Mets, L.; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. 1994, 98, 4736.
19. Bittner, T.; Irrgang, K.-D.; Renger, G.; Wasielewski, M. R. J. Phys. Chem. 1994, 98, 11821.
20. Connelly, J. P.; Müller, M. G.; Hucke, M.; Gatzen, G.; Mullineaux, C. W.; Ruban, A. V.; Horton, P.; Holzwarth, A. R. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 1902.
21. Agarwal, R.; Krueger, B. P.; Scholes, G. D.; Yang, M.; Yom, J.; Mets, L. ; Fleming, G. R. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 2908.
22. Salverda, J. M.; Vengris, M.; Krueger, B. P.; Scholes, G. D.; Czarnoleski, A. R.; Novoderezhkin, V.; van Amerongen, H.; van Grondelle, R. Biophys. J. 2003, 84, 450.
23. Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 1999, 111, 27.
24. Schubert, A.; Beenken, W. J. D.; Stiel, H.; Voigt, B.; Leupold, D.; Lokstein, H. Biophys. J. 2002, 82, 1030.
25. Palacios, M. A.; de Weerd, F. L.; Ihalainen, J. A.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 5782.
26. Redfield, A. G. Adv. Magn. Reson. 1965, 1, 1.
27. Pollard, W. T.; Felts, A. K.; Friesner, R. A. Adv. Chem. Phys. 1996, 93, 77.
28. Zhang, W. M.; Meier, T.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 1998, 108, 7763.
29. Peterman, E. J. G.; Pullerits, T.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 4448.
30. Peterman, E. J. G.; Dukker, F. M.; van Grondelle, R.; van Amerongen, H. Biophys. J. 1995, 69, 2670.
31. van Amerongen, H.; Kwa, S. L. S.; van Bolhuis, B. M.; van Grondelle, R. Biophys. J. 1994, 67, 837.
32. Kühn, O.; Sundström, V. J. Chem. Phys. 1997, 107, 4154.
33. Novoderezhkin, V.; van Grondelle, R. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 6025.
34. Pieper, J.; Voigt, J.; Small, G. J. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 2319.
35. Knox, R. S.; Spring, B. Q. Photochem. Photobiol. 2003, 77 (5), 497.
36. Yang, M.; Fleming, G. R. Chem. Phys. 2002, 275, 355.
37. Schütze, J.; Brüggemann, B.; Renger, Th.; May, V. Chem. Phys. 2002, 275, 333.
38. Renger. Th.; Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 2002, 116, 9997.
39. Mukamel, S. Principles of Nonlinear Optical Spectroscopy; Oxford University Press: New York, 1995.
40. Meier, T.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 1997, 107, 8759.
41. Chernyak, V.; Minami, T.; Mukamel, S. J. Chem. Phys. 2000, 112, 7953.
42. Dahlbom, M.; Minami, T.; Chernyak, V.; Pullerits, T.; Sundström, V. ; Mukamel, S. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 3976.
43. Fidder, H.; Knoester, J.; Wiersma, D. A. J. Chem. Phys. 1991, 95, 7880.
44. Meier, T.; Chernyak, V.; Mukamel, S. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 7332.
45. Novoderezhkin, V.; Monshouwer, R.; van Grondelle, R. Biophys. J. 1999, 77, 666.
46. Ohta, K.; Yang, M.; Fleming, G. R. J. Chem. Phys. 2001, 115, 7609.