Dependence of amide vibrations on hydrogen bonding

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 38, 2008, Pages 11873-11877

  Myshakina, Nataliya S ^a   Ahmed, Zeeshan ^a   Asher, Sanford A ^a  

^a UNIVERSITY OF PITTSBURGH   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

AMIDES; FUNCTIONAL GROUPS; HYDROGEN; MOLECULAR SPECTROSCOPY; REACTION KINETICS;

AMIDE FUNCTIONAL GROUP; AMIDE GROUPS; EFFECT OF HYDROGEN; HYDROGEN BONDINGS; RESONANCE MODEL;

HYDROGEN BONDS;

EID: 53849137681     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp8057355     Document Type: Article

References (29)

1. Garrett, R. H. G.; Charles, M. Biochemistry; 2nd ed.; Saunders College Publishing: Philadelphia, PA, 1999.
2. Tiffany, M. L.; Krimm, S. Biopolymers 1969, 8, 347-359.
3. Shi, Z.; Olson, C. A.; Rose, G. D.; Baldwin, R. L.; Kallenbach, N. R. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2002, 99, 9190-4195.
4. Bochicchio, B.; Tamburro, A. M. Chirality 2002, 14, 782-792.
5. Mikhonin, A. V.; Bykov, S. V.; Myshakina, N. S.; Asher, S. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 1928-1943.
6. Manas, E. S.; Getahun, Z.; Wright, W. W.; DeGrado, W. F.; Vanderkooi, J. M. J. Am. Chem. Soc. 2080, 122, 9883-9890.
7. Walsh, S. T. R.; Cheng, R. P.; Wright, W. W.; Alonso, D. O. V.; Daggett, V.; Vanderkooi, J. M.; DeGrado, W. F. Protein Sci. 2003, 12, 520-531.
8. Qian, W.; Mirkin, N. G.; Krimm, S. Chem. Phys. Lett. 1999, 315, 125-129.
9. Mirkin, N. G.; Krimm, S. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 5438-5448.
10. Mikhonin, A. V.; Ahmed, Z.; Ianoul, A.; Asber, S. A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 19020-19028.
11. Wang, Y.; Purrello, R.; Georgiou, S.; Spiro, T. G. J. Am Chem Soc. 1991, 113, 6368-6377.
12. Dixon, D. A.; Dobbs, K. D.; Valentini, J. J. J. Phys. Chem 1994, 98, 13435-13439.
13. Torii, H.; Tatsumi, T.; Tasumi, M. J. Raman Spectrosc. 1998, 29, 537-546.
14. Schmidt, P.; Dybal, J.; Rodriguez-Cabello, J. C.; Reboto, V. Biomacromolecules 2005, 6, 697-706.
15. Besley, N. A. J. Phys. Chem. A 2004, 108, 10794-10800.
16. Chen, X. G.; Schweitzer-Stenoer, R.; Asher, S. A.; Mirkin, N. G.; Krimm, S. J. Phys. Chem 1995, 99, 3074-3083.
17. Mikhonin, A. V.; Bykov, S. V.; Myshakina, N. S.; Asher, S. A. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 5509-5518.
18. Milner-White, E. J. Protein Sci. 1997, 6, 2477-2482.
19. Mikhonin, A. V.; Ahmed, Z.; Ianoul, A.; Asher, S. A. J. Phys. Chem. B 2004, 108, 19020-19028.
20. Triggs, N. E.; Valentini, J. J. J. Phys. Chem. 1992, 96, 6922-6931.
21. Kota, W.; Sham, L. J. Phys. Rev. 1965, 137, 1697-705.
22. Becke, A. D. J. Chem Phys. 1993, 98, 5648-5652.
23. Frisch, M. J. Trucks, G. W.; Schlegel, H. B.; Scuseria, G. E; Robb, M. A.; Cheeseman, J. R.; Montgomery, J. A., Jr.; Vreven, T.; Kudin, K. N.; Burant, J. C.; Millam, J. M.; Iyengar, S. S.; Tomasi, J.; Barone, V.; Mennucci, B.; Cossi, M.; Scalmani, G.; Rega, N.; Petersson, G. A.; Nakatsuji, H.; Hada, M.; Ehara, M.; Toyota, K.; Fuknda, R.; Hasegawa, J.; Ishida, M.; Nakajima, T.; Honda, Y.; Kitao, O.; Nakai, H.; Klene, M.; Li, X.; Knox, J. E.; Hratchian, H. P.; Cross, J. B.; Bakken, V.; Adamo, C.; Jaramillo, J.; Gomperts, R.; Stratmann, R. E.; Yazyev, O.; Austin, A. J.; Cammi, R.; Pomelli, C.; Ochterski, J. W.; Ayala, P. Y.; Morokuma, K.; Voth, G. A.; Salvador, P.; Dannenberg, J. J.; Zakrzewski, V. G.; Dapprich, S.; Daniels, A. D.; Strain, M. C.; Farkas, O.; Malick, D. K.; Rabuck, A. D.; Raghavachari, K.; Foresman, J. B.; Ortiz, J. V.; Cui, Q.; Baboul, A. G.; Clifford, S.; Cioslowski, J.; Stefanov, B. B.; Liu, G.; Liashenko, A.; Piskorz, P.; Komaromi, I.; Martin, R. L.; Fox, D. J.; Keith, T.; Al-Laham, M. A.; Peng, C. Y.; Nanayakkara, A.; Challacombe, M.; Gill, P. M. W.; Johnson, B.; Chen, W.; Wong, M. W.; Gonzalez, C.; Pople, J. A. Gaussian 03, revision C.01; Gaussian, Inc.: Wallingford, CT, 2004.
24. Chen, X. G.; Schweitzer-Stenner, R.; Krimm, S.; Mirkin, N. G.; Asher, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1994, 116, 11141-11142.
25. Gresh, N.; Guo, H.; Salahub, D. R.; Roques, B. P.; Kafafi, S. A. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 7885-7894.
26. Jacob, R.; Fischer, G. J. Mol. Struct. 2002, 613, 175-188.
27. Jishi, R. A.; Flores, R. M.; Valderrama, M.; Lou, L.; Bragin, J. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 9858-9862.
28. Kubelka, J.; Huang, R.; Keiderling, T. A. J. Phys. Chem. B 2005, 109, 8231-8243.
29. Sundararajan, K.; Sankaran, K.; Kavitha, V. J. Mol. Struct. 2008, 876, 240249.