Docking study of biflavonoids, allosteric inhibitors of protein tyrosine phosphatase 1B

Bulletin of the Korean Chemical Society

Volumn 29, Issue 8, 2008, Pages 1479-1484

  Lee, Jee Young ^a   Jung, Ki Woong ^a   Woo, Eun Rhan ^b   Kim, Yangmee ^a  

^a Konkuk University   (South Korea)

^b Chosun University   (South Korea)

Author keywords

Allosteric site; Biflavonoid; Docking study; In silico screening; PTP1B

Indexed keywords

HYDROGEN BONDS; PHARMACODYNAMICS; PHOSPHATASES; PROTEINS;

ALLOSTERIC SITE; BIFLAVONOID; DOCKING STUDIES; IN-SILICO SCREENING; PTP1B;

AMINO ACIDS;

EID: 50449086960     PISSN: 02532964     EISSN: 12295949     Source Type: Journal    
DOI: 10.5012/bkcs.2008.29.8.1479     Document Type: Article

References (43)

1. Östman, A.; Böhmer, F. Trends Cell. Biol. 2001, 11, 258.
2. Li, S.; Depetris, R. S.; Barford, D.; Chernoff, J.; Hubbard, S. R. Structure 2005, 13, 1643.
3. Dixit, M.; Tripathi, B. K.; Tamrakar, A. K.; Srivastava, A. K.; Kumar, B.; Goel, A. Bioorg. Med. Chem. 2001, 15, 727.
4. Yi, T.; Lindner, D. Curr. Onco. Report 2008, 10, 114.
5. Dubé, N.; Cheng, A.; Tremblay, M. L. PNAS 2004, 101, 1834.
6. Lyon, M. A.; Ducruet, A. P.; Wipf, P.; Lazo, J. S. Nat. Rev. 2002, 1, 961.
7. Wiesmann, C.; Barr, K. J.; Kung, J.; Zhu, J.; Erlanson, D. A.; Shen, W.; Fahr, B. J.; Zhong, M.; Taylor, L.; Randal, M.; McDowell, R. S.; Hansen, S. K. Nat. Struc. Mol. Biol. 2004, 11, 730.
8. Na, M.; Kim, K. A.; Oh, H.; Kim, O. Y.; Oh, W. K.; Ahn, J. S. Biol. Pharm. Bull. 2007, 30, 379.
9. Chen, J.; Chang, H. W.; Kim, H. P.; Park, H. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2006, 16, 2373.
10. Kim, H. P.; Park, H.; Son, K. H.; Chang, H. W.; Kang, S. S. Arch. Pharm. Res. 2008, 31, 265.
11. Lin, Y.; Flavin, M. T.; Cassidy, C. S.; Mar, A.; Chen, F. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2001, 11, 2101.
12. Blazso, G.; Gabor, M.; Rohdewald, P. Pharmazie. 1997, 52, 380.
13. Ursini, F.; Rapuzzi, I.; Toniolo, R.; Tubaro, F.; Bontempelli, G. Methods Enzymol. 2001, 335, 338.
14. Woo, E. R.; Lee, J. Y.; Chom, I. J.; Kim, S. G.; Kang, K. W. Pharmaco. Res. 2005, 51, 539.
15. Pan, X.; Tan, N.; Zeng, G.; Zhang, Y.; Jia, R. Bioorg. Med. Chem. 2005, 13, 5819.
16. Paul, D. K.; Rob, B.; Scott, K.; Marvin, W.; Venkatachalam, C. M. J. of Comp. Chem. 2001, 22, 993.
17. Hoffrén, A. M.; Murray, C. M.; Hoffmann, R. D. Curr. Pharm. Des. 2001, 7, 547.
18. Luke, S. F.; Osman, F. G. J. Braz. Chem. Soc. 2002, 13, 777.
19. Pickett, S. D.; Mason, J. S.; McLay, I. M. J. Chem. Inf. Comput. Sci. 1996, 36, 1214.
20. Lee, J. Y.; Baek, S.; Kim, Y. Bull. Korean Chem. Soc. 2007, 28, 379.
21. Morris, G. M.; Goodsell, D. S.; Halliday, R. S.; Huey, R.; Hart, W. E.; Belew, R. K.; Olson, A. J. J. Computational Chemistry 1998, 19, 1639.
22. Lee, J. Y.; Lee, S. A.; Kim, Y. Bull. Korean Chem. Soc. 2007, 28, 941.
23. Yang, S. F.; Chu, S. C.; Liu, S. J.; Chen, Y. C.; Chang, Y. Z.; Hsieh, Y. S. J. Ethnopharmaco 2007, 110, 483.
24. Gil, R. R.; Lin, L.; Cordell, G. A.; Kumar, M. R.; Ramesh, M.; Reddy, B. M.; Mohan, G. K.; Rao, A. V. N. A. Phytochem 1995, 39, 405.
25. Selvam, C.; Sanjay, M. J. J. Ethnopharmaco 2004, 95, 209.
26. Li, X.; Hoshi, A. S.; Tan, B.; ElSohly, H. N.; Walker, L. A.; Zjawiony, J. K.; Ferreira, D. Tetrahedron 2002, 58, 8709.
27. Bekker, R.; Ferreira, D.; Swart, K. J.; Brandt, E. V. Tetrahedron 2000, 56, 5297.
28. Hyun, S. K.; Kang, S. S.; Son, K. H.; Chung, H. Y.; Choi, J. S. Chem. Pharm. Bull. 2005, 53, 1200.
29. Yamaguchi, L. F.; Vassao, D. G.; Kato, M. J.; Mascio, P. D. Phytochem. 2005, 66, 2238.
30. Das, B.; Mahender, G.; Rao, Y. K.; Prabhakar, A.; Jagadeesh, B. Chem. Pharm. Bull. 2005, 53, 135.
31. Kumar, N.; Singh, B.; Bhandarim, P.; Gupta, A. P.; Uniyal, S. K.; Kaul, V. K. Phytochem. 2005, 66, 2740.
32. Choi, S. K.; Oh, H. M.; Lee, S. K.; Jeong, D. G.; Ryu, S. E.; Son, K. H.; Han, D. C.; Sung, N. D.; Baek, N. I.; Kown, B. M. Nat. Product. Res. 2006, 20, 341.
33. Lee, C. W.; Choi, H. J.; Kim, H. S.; Kim, D. H.; Chang, I. S.; Moon, H. T.; Lee, S. Y.; Oh, W. K.; Woo, E. R. Bioorg. Med. Chem. 2008, 16, 732.
34. Slade, D.; Ferreira, D.; Marais, J. P. J. Phytochem. 2005, 66, 2177.
35. Weniger, B.; Vonthron-Sénécheau, C.; Kaiser, M.; Brun, R.; Anton, R. Phytomedicine 2006, 13, 176.
36. Ariyasena, J.; Baek, S. H.; Perry, N. B.; Weavers, R. T. J. Nat. Prod. 2004, 67, 693.
37. Mayer, R. Phytochem. 2004, 65, 593.
38. Innocenti, M.; Michelozzi, M.; Giaccherini, C.; Ieri, F.; Vincieri, F. F.; Mulinacci, N. J. Agric. Food Chem. 2007, 55, 6596.
39. Likhitwitayawuid, K.; Kaewamatawong, R.; Ruangrungsi, N. Biochem. Systemat. Ecology 2005, 33, 527.
40. Rampendahl, C.; Seeger, T.; Geiger, H.; Zinsmeister, H. D. Phytochem. 1996, 41, 1621.
41. Howell, H.; Malan, E.; Brand, D. J.; Kamara, B. I.; Bezuidenhoudt, B. C. B.; Marais, C.; Steenkamp, J. A. Chemistry of Natural Compounds 2007, 43, 533.
42. Krammer, A.; Kirchhoff, P. D.; Venkatachalam, X. J. C. M.; Waldman, M. J. Mol. Graph. Model. 2005, 23, 395.
43. Verkhivker, G. M.; Bouzida, D.; Gehlhaar, D. K.; Rejto, P. A.; Arthurs, S.; Colson, A. B.; Freer, S. T.; Larson, V.; Lutyi, B. A.; Marrone, T.; Rose, P. W. Journal of Computer-Aided Molecular Design 2000, 14, 731.