Recent advances and future prospects in peptaibiotics, hydrophobin, and mycotoxin research, and their importance for chemotaxonomy of Trichoderma and Hypocrea

Chemistry and Biodiversity

Volumn 5, Issue 5, 2008, Pages 671-680

  Degenkolb, Thomas ^a   von Döhren, Hans ^b   Nielsen, Kristian Fog ^c   Samuels, Gary J ^d   Brückner, Hans ^a  

^a JUSTUS LIEBIG UNIVERSITY   (Germany)

^b TECHNISCHE UNIVERSITÄT BERLIN   (Germany)

^c TECHNICAL UNIVERSITY OF DENMARK   (Denmark)

^d AGRICULTURAL RESEARCH SERVICE   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

2 AMINO 2 METHYLPROPIONIC ACID; ALAMETHICIN; HYDROPHOBIN; MYCOTOXIN; PEPTAIBOL; TRICHOTHECENE; FUNGAL PROTEIN; HYDROPHOBIN PROTEIN, FUNGAL;

AMINO ACID SEQUENCE; ASCOMYCETES; BIOLOGICAL PEST CONTROL; CARBOXY TERMINAL SEQUENCE; CHEMOTAXONOMY; CLADISTICS; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; FUNGAL MORPHOLOGY; GENUS; HIGH THROUGHPUT SCREENING; HYPOCREA; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; MOLECULAR WEIGHT; NONHUMAN; PHYLOGENY; PLANT DISEASE; PROTEIN SYNTHESIS; REVIEW; TELEOMORPH; TRICHODERMA; TRICHODERMA HARZIANUM; ANIMAL; BIOSYNTHESIS; CHEMISTRY; CLASSIFICATION; HUMAN; METABOLISM;

FUNGI; HYPOCREA; TRICHODERMA; TRICHODERMA BREVICOMPACTUM;

ANIMALS; FUNGAL PROTEINS; HUMANS; HYPOCREA; MYCOTOXINS; TRICHODERMA;

EID: 48349102913     PISSN: 16121872     EISSN: 16121880     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/cbdv.200890064     Document Type: Review

References (76)

1. N. Hosotani, K. Kumagai, S. Honda, A. Ito, T. Shimatani, I. Saji, J. Antibiot. 2007, 60, 184.
2. N. Ruiz, G. Wielgosz-Collin, L. Poirier, O. Grovel, K. E. Petit, M. Mohamed-Benkada, T. Robiou du Pont, J. Bissett, P. Vérité, G. Barnathan, Y. F. Pouchus, Peptides 2007, 28, 1351.
3. T. Neuhof, A. Berg, H. Besl, T. Schwecke, R. Dieckmann, H. von Döhren, Chem. Biodivers. 2007, 4, 1103.
4. T. Degenkolb, J. Kirschbaum, H. Brückner, Chem. Biodivers. 2007, 4, 1052.
5. K. H. Domsch, W. Gams, T.-H. Anderson, 'Compendium of soil fungi', 2nd taxonomically revised edn., Ed. W. Gams, IHW-Verlag, Eching, 2007.
6. C. M. Kullnig, T. Krupica, S. L. Woo, R. L. Mach, M. Rey, M. Lorito, C. P. Kubicek, Mycol. Res. 2001, 105, 770.
7. C. Krause, J. Kirschbaum, H. Brückner, Amino Acids 2006, 30, 435.
8. T. Degenkolb, T. Gräfenhan, H. I. Nirenberg, W. Gams, H. Brückner, J. Agric. Food Chem. 2006, 54, 7047.
9. T. Degenkolb, T. Gräfenhan, A. Berg, H. I. Nirenberg, W. Gams, H. Brückner, Chem. Biodivers. 2006, 3, 593.
10. T. Neuhof, R. Dieckmann, I. S. Druzhinina, C. P. Kubicek, H. von Döhren Microbiology 2007, 153, 3417.
11. T. Neuhof, R. Dieckmann, I. S. Druzhinina, C. P. Kubicek, T. Nakari-Set⊣lä, M. Penttilä, H. von Döhren, FEBS J. 2007, 274, 841.
12. J. Bissett, G. Szakacs, C. A.Nolan, I. Druzhinina, C. Gradinger, C. P. Kubicek, Can. J. Bot. 2003, 81, 570.
13. G. J. Samuels, S. Dodd, B. Lu, O. Petrini, H.-J. Schroers, I. S. Druzhinina, Stud. Mycol. 2006, 56, 67.
14. G. J. Samuels, C. Suarez, K. Solis, K. A. Holmes, S. E. Thomas, A. A. Ismaiel, H. C. Evans, Mycol. Res. 2006, 110, 381.
15. W. M. Jaklitsch, G. J. Samuels, S. L. Dodd, B.-S. Lu, I. Druzhinina, Stud. Mycol. 2006, 56, 137.
16. C. P. Kubicek, J. Bissett, I. Druzhinina, C. M. Kullnig-Gradinger, G. Szakacs, Fungal Genet. Biol. 2003, 38, 310.
17. G. J. Samuels, Phytopathology 2006, 96, 195.
18. M. Schirmböck, M. Lorito, Y. L. Wang, C. K. Hayes, C. Arisan-Atac, F. Scala, G. E. Harman, C. P. Kubicek, Appl. Environ. Microbiol. 1994, 60, 4364.
19. M. Lorito, V. Varkas, S. Rebuffat, B. Bodo, C. P. Kubicek, J. Bacteriol. 1996, 178, 6382.
20. N.-A. Lehr, A. Meffert, L. Antelo, O. Sterner, H. Anke, R.W. S. Weber, FEMS Microbiol. Ecol. 2006, 55, 106.
21. L. Poirier, M. Montagu, A. Landreau, M. Mohamed-Benkada, O. Grovel, C. Sallenave-Namont, J.- F. Biard, C. Amiard-Triquet, J.-C. Amiard, Y. F. Pouchus, Chem. Biodivers. 2007, 4, 1116.
22. C. Krause, J. Kirschbaum, H. Brückner, Chem. Biodivers. 2007, 4, 1083
23. J. Fastner,M. Erhard, H. von Döhren, Appl. Environ. Microbiol. 2001, 67, 5069.
24. M. Welker, M. Bruhnke,K. Preussel, I. Lippert, H. von Döhren, Microbiology 2004, 150, 1785.
25. M. Welker, M. Erhard, J. Mass Spectrom. 2007, 42, 1062.
26. Z. Du, R. Yang, Z. Guo, Y. Song, J. Wang, Anal. Chem. 2002, 74, 5487.
27. M. P. Kumar, M. Vairamani, R. P. Raju, C. Lobo, N. Anbumani, C. P. Kumar, T. Menon, S. Shanmugasundaram, Indian J. Med. Res. 2004, 119, 283.
28. 'Identification of Microorganisms by Mass Spectrometry', Eds. C. L. Wilkins, J. O. Lay Jr., John Wiley & Sons, 2006.
29. R. Dieckmann, I. Kaesler, I. Graeber, U. Szewzyk, H. von Döhren, Appl. Microbiol. Biotechnol. 2005, 67, 539.
30. K. Bernardo, N. Pakulat, M. Macht, O. Krut, H. Seifert, S. Fleer, F. Hönger, M. Krönke, Proteomics 2002, 2, 747.
31. P. A. Majcherczyk, T. McKenna, P. Moreillon, P. Vaudaux, FEMS Microbiol. Lett. 2006, 255, 233.
32. E. R. Castanja, A. Fox, K. F. Fox, J. Microbiol. Meth. 2006, 67, 230.
33. C. Friedrichs, A. C. Rodloff, G. S. Chhatval, W. Schellenberger, K. Eschrich, J. Clin. Microbiol. 2007, 45, 2392.
34. T. Neuhof, Ph.D. Thesis, Technical University of Berlin, Berlin, 2002.
35. M. Komon-Zelazowska, T. Neuhof, R. Dieckmann, H. von Döhren, R. Herrera-Estrella, C. P. Kubicek, I. S. Druzhinina, Eukaryotic Cell 2007, 6, 2332.
36. T. Degenkolb, R. Dieckmann, K. F. Nielsen, T. Gräfenhan, C. Theis, D. Zafari, P. Chaverri, A. Ismaiel, H. Brückner, H. von Döhren, U. Thrane, G. J. Samuels, Mycol. Prog. 2008, in press.
37. H. Laatsch, 'Antibase 2007 SciDex - The Natural Products identifier', Wiley-VCH, Weinheim, 2007.
38. T. O. Larsen, J. Smedsgaard, K. F. Nielsen, M. E. Hansen, J. C. Frisvad, Nat. Prod. Rep. 2005, 22, 672.
39. A. Viterbo, I. Chet, Mol. Plant Pathol. 2007, in press.
40. S. Askolin, M. Penttilä, H. A. Wösten, T. Nakari-Setälä, FEMS Microbiol. Lett. 2005, 253, 281.
41. C. P. Kubicek, S. E. Baker, C. Gamauf, I. S. Druzhinina, submitted to GenBank, 2007/8.
42. M. B. Linder, G. R. Szilvay, T. Nakari-Setälä, M. Penttilä, FEMS Microbiol. Rev. 2005, 29, 877.
43. T. Nakari-Setälä, N. Aro, M. Ilmen, G. Munoz, N. Kalkkinen, E. Atalo, M. Penttil⊣, Eur. J. Biochem. 1997, 248, 415.
44. E. Rintala, M. Linder, T. Nakari-Setälä, 8th European Conference on Fungal Genetics, Vienna, April 8-11, 2006, Abstract VII p-9.
45. S. Askolin, Ph.D. Thesis, University of Helsinki, Helsinki, 2006.
46. G. F. Kraus, I. Druzhinina, W. Gams, J. Bissett, D. Zafari, G. Szakacs, A. Koptchinski, H. Prillinger, R. Zare, C. P. Kubicek, Mycologia 2004, 96, 1059.
47. S. Rebuffat, C. Goulard, B. Bodo, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1 1995, 1849.
48. G. J. Samuels, R. Pardo-Schultheiss, K. P. Hebbar, R. D. Lumsden, C. N. Bastos, J. C. B. Costa, J. L. Bezerra, Mycol. Res. 2000, 104, 760.
49. J. L. Bezerra, J. C. B. Costa, C. N. Bastos, F. G. Faleiro, Fitopatol. Bras. 2003, 28, 408.
50. M. C. Aime, W. Phillips-Mora, Mycologia 2005, 97, 1012.
51. J. T. de Souza, A.W. V. Pomella, J. H. Bowers, C. P. Pirovani, L. L. Loguercio, K. P. Hebbar, Phytopathology 2006, 96, 61.
52. T. Gräfenhan, Ph.D. Thesis, Humboldt-University, Berlin, 2006.
53. T. Degenkolb, G. J. Samuels, H. Brückner, in preparation.
54. K. F. Nielsen, T. Gräfenhan, D. Zafari, U. Thrane, J. Agric. Food Chem. 2005, 53, 8190.
55. I. Augeven-Bour, S. Rebuffat, C. Auvin, C. Goulard, Y. Prigent, B. Bodo, J. Chem. Soc., Perkin Trans. 1 1997, 1587.
56. D. G. Corley, M. Miller-Wideman, R. C. Durley, J. Nat. Prod. 1994, 57, 422.
57. H.-B. Lee, Y. Kim, H.-Z. Jin, J.-J. Lee, C.-J. Kim, J.-Y. Park, H.-S. Jung, Lett. Appl. Microbiol. 2005, 40, 497.
58. H.-Z. Jin, J.-H., W.-D. Zhang, H.-B. Lee, Y.-S. Hong, Y.-H. Kim, J.-J. Lee, J. Asian Nat. Prod. Res. 2007, 9, 203.
59. K. F. Nielsen, U. Thrane, J. Chromatogr, A 2001, 929, 75.
60. Y. Saikawa, H. Okamoto, T. Inui, M. Makabe, T. Okuno, T. Suda, K. Hashimoto, M. Nakata, Tetrahedron 2001, 57, 8277.
61. S.A. Rehner, G. J. Samuels, Mycol. Res. 1994, 98, 625.
62. L. Poirier, F. Quiniou, N. Ruiz, M. Montagu, J.-C. Amiard, Y. F. Poirier, Aquat. Toxicol. 2007, 83, 254.
63. M. Favilla, L. Macchia, A. Gallo, C. Altomare, Food Chem. Toxicol. 2006, 44, 1922.
64. M. Mohamed-Benkada, M. Montagu, J. F. Biard, F. Mondeguer, P. Vérité, M. Dalgalarrondo, J. Bissett, Y. F. Pouchus, Rapid Commun. Mass Spectrom. 2006, 20, 1176.
65. M. J. Thirumalachar, Hindustan Antibiot. Bull. 1968, 10, 287.
66. A. Jaworski, H. Brückner, J. Pept. Sci. 2000, 6, 149.
67. C. T. Hou, A. Ciegler, C. W. Hesseltine, Appl. Microbiol. 1972, 23, 183.
68. T. Hino, H. Saitoh, T. Miwa, M. Kanda, S. Kumazawa, J. Diary Sci. 1994, 77, 3426.
69. S. Kumazawa, M. Kanda, H. Aoyama, M. Utagawa, J. Kondo, S. Sakamoto, H. Ohtani, T. Mikawa, I. Chiga, T. Haysase, J. Antibiot. 1994, 47, 1136.
70. M. Ritzau, S. Heinze, K. Dornberger, A. Berg, W. F. Fleck, B. Schlegel, A. Härtl, U. Gräfe, J. Antibiot. 1997, 50, 722.
71. A. Berg, P. A. Grigoriev, T. Degenkolb, T. Neuhof, B. Schlegel, U. Gräfe, J. Pept. Sci. 2003, 9, 810.
72. G. Irmscher, G. Jung, Eur. J. Biochem. 1977, 80, 165.
73. R. L. Cross, W. E. Kohlbrenner, J. Biol. Chem. 1978, 253, 4865.
74. S. B. Singh, K. Herath, Z. Guan, D. L. Zink, A.W. Dombrowski, J. D. Polishook, K. C. Silverman, R. B. Lingham, P. J. Felock, D. J. Hazuda, Org. Lett. 2002, 4, 1431.
75. J. Smedsgaard, H. C. Frisvad, J. Microbiol. Meth. 1996 25, 5.
76. T. Degenkolb, W. Gams, H. Brückner, Chem. Biodivers. 2008, 5, 693.