Monitoring molecular beacon/DNA interactions using atomic force microscopy

Analytical Chemistry

Volumn 76, Issue 19, 2004, Pages 5721-5725

  Jin, Yan ^a   Wang, Kemin ^a   Tan, Weihong ^a   Wu, Ping ^a   Wang, Qing ^a   Huang, Hongmei ^a   Huang, Shasheng ^a   Tang, Zhiwen ^a   Guo, Qiuping ^a  

^a HUNAN UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ATOMIC FORCE MICROSCOPY; FLUORESCENCE; MOLECULAR DYNAMICS; RNA; SIGNAL PROCESSING; SIGNAL TO NOISE RATIO;

DNA INTERACTIONS; MOLECULAR BEACON (MB); SIGNAL TRANSDUCTION;

DNA;

DNA; OLIGONUCLEOTIDE; PROTEIN; RNA;

ARTICLE; ATOMIC FORCE MICROSCOPY; BIOLOGICAL MONITORING; BIOTINYLATION; DNA HYBRIDIZATION; DNA PROBE; FLUOROSCOPY; GENE TARGETING; MOLECULAR BEACON; MOLECULAR INTERACTION; NUCLEIC ACID IMMOBILIZATION; NUCLEOTIDE SEQUENCE; OLIGONUCLEOTIDE PROBE; SENSITIVITY AND SPECIFICITY; SIGNAL TRANSDUCTION;

DNA; DNA PROBES; FLUORESCENT DYES; MICROSCOPY, ATOMIC FORCE;

EID: 4744369354     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac049933u     Document Type: Article

References (33)

1. Tyagi, S.; Kramer, F. R. Nat. Biotechnol. 1996, 14, 303-308.
2. Fang, X.; Li, J.; Perlette, J., Tan, W.; Wang, K. Anal. Chem. 2000, 72, 747A-753A.
3. Fang, X.; Liu, X.; Schuster, S.; Tan, W. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 2921-2922.
4. Tang, Z. W.; Wang, K. M.; Tan, W. H.; Li, J.; Liu, L. F.; Guo, Q. P.; Meng, X. X.; Ma, C. B.; Huang, S. S. Nucleic Acid Res. 2003, 31, e148.
5. Matsuo, T. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1379 (2), 178-184.
6. Sokol, D. L.; Zhang, X. L.; Lu, P. Z.; Gewitz, A. M. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 11538-11543.
7. Li, J.; Fang, X.; Schuster, S.; Tan, W. Angew. Chem., Int. Ed. 2000, 39, 1049-1052. Fang, X.; Li, J.; Tan, W. Anal. Chem. 2000, 72, 3250-3280.
8. Li, J.; Fang, X.; Schuster, S.; Tan, W. Angew. Chem., Int. Ed. 2000, 39, 1049-1052. Fang, X.; Li, J.; Tan, W. Anal. Chem. 2000, 72, 3250-3280.
9. Li, J.; Ron, G.; Tan, W. Nucleic Acids Res. 2000, 28, e52, 1-5.
10. Takano, H, Kenseth, J. R.; Wong, S.-S.; O'Brien, J. C.; Porter, M. D. Chem. Rev. 1999, 99, 2845-2890.
11. Lillehei, P. T.; Bottomley, L. A. Anal. Chem. 2000, 72, 189R-196R
12. Hansma, H. G.; Chen, C. H. J. Struct. Biol. 2000, 131, 44-55.
13. Krautbauer, R.; Rief M.; Gaub, H. E. Nano Lett. 2003, 3, 493-496.
14. Boland, T.; Ratner, B. D. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1995, 92, 5297-5301.
15. Wang, J.; Bard, A. J. Anal. Chem. 2001, 73, 2207.
16. Wong, J.; Chilkoti, A.; Moy, V. T. Biomol. Eng. 1999, 16, 45-55.
17. Lo, Y.; Zhu, Y.; Beebe, T. P., Jr. Langmuir 2001, 17, 3741-3748.
18. Dammer, U.; Hegner, M.; Anselmetti, D.; Wagner, P.; Dreier, M.; Huber, W.; Guntherodt, H. J. Biophys. J. 1996, 70, 2437-2441.
19. Schwesinger, F.; Ros, R.; Strunz, T.; Anselmetti, D.; Güntherodt, H. J.; Honegger, A.; Jermutus, L.; Tiefenauer, L.; Plückthun, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 9972-9977. Ros, R.; Schwesinger, F.; Anselmetti, D.; Kubon, M.; Schäfer, R.; Plückthun, A.; Tiefenauer, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 7402-7405.
20. Schwesinger, F.; Ros, R.; Strunz, T.; Anselmetti, D.; Güntherodt, H. J.; Honegger, A.; Jermutus, L.; Tiefenauer, L.; Plückthun, A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2000, 97, 9972-9977. Ros, R.; Schwesinger, F.; Anselmetti, D.; Kubon, M.; Schäfer, R.; Plückthun, A.; Tiefenauer, L. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 7402-7405.
21. Jiang, Y. X.; Zhu, C. F.; Ling, L. S.; Wan, L. J.; Fang, X. H.; Bai, C. Anal. Chem. 2003, 75, 2112-2116.
22. Lee, G. U.; Chrisey, L. A.; Colton, R. J. Science 1994, 266, 771-773.
23. Mazzola, L. T.; Frank C. W.; Fodor S. P. A.; Mosher, C.; Lartius, R.; Henderson, E. Biophys. J. 1999, 76, 2922-2933.
24. Lioubashevski, O.; Patolsky, F.; Willner, I. Langmuir 2001, 17, 5134-5136.
25. Moy, V. T.; Florin, E.-L.; Gaub, H. E. Colloids Surf. 1994, 93, 343-348.
26. Peterson, A. W.; Heaton, R. J.; Georgiadis, R. M. Nucleic Acids Res. 2001, 29, 5163-5168.
27. Chen, Z. Z.; Wang, K. M.; Yang, X. H.; Huang, S. S.; Huang, H. M.; Li, D.; Wang, Q. Acta Chem. Sin. 2003, 61, 137-140.
28. Osborne, M. A.; Furey W. S.; Klenerman, D.; Balasubramanian, S. Anal. Chem. 2000, 72, 3678-3681.
29. Yuan, C. B.; Chen, A.; Kolb, P.; Moy, V. T. Biochemistry 2000, 39, 10219-10223.
30. Lo, Y. S.; Huefner, N. D.; Chan, W. S.; Stevens, F.; Harris, J. M.; Beebe, T. P., Jr. Langumir 1999, 15, 1373-1382.
31. Strunz, T.; Oroszlan, K.; Schaferä, R.; Güntherodt, H. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1999, 96, 11277-11282.
32. Wenzler, L. A.; Moyes, G. L.; Raiker, G. N.; Hansen, R. L.; Harris, J. M.; Beebe, T. P., Jr. Langmuir 1997, 13, 3761-3768.
33. Wenzler, L. A.; Moyes, G. L.; Harris, J. M.; Beebe, T. P., Jr. Anal. Chem. 1997, 69, 2855-2861.