-
1
-
-
0036117841
-
-
Hu, X.; Ritz, T.; Damjanović, A.; Autenrieth, F.; Schulten, K. Q Rev Biophys 2002, 35, 1.
-
(2002)
Q Rev Biophys
, vol.35
, pp. 1
-
-
Hu, X.1
Ritz, T.2
Damjanović, A.3
Autenrieth, F.4
Schulten, K.5
-
2
-
-
4444277787
-
-
Berg, J.; Tymoczko, J.; Stryer, L. Biochemistry; W. H. Freeman and Company: New York, 2002
-
Berg, J.; Tymoczko, J.; Stryer, L. Biochemistry; W. H. Freeman and Company: New York, 2002.
-
-
-
-
5
-
-
0000134121
-
-
Axelrod, H. L.; Feher, G.; Allen, J. P.; Chirino, A. J.; Day, M. W.; Hsu, B. T.; Rees, D. C. Acta Crystallogr D 1994, 50, 596.
-
(1994)
Acta Crystallogr D
, vol.50
, pp. 596
-
-
Axelrod, H.L.1
Feher, G.2
Allen, J.P.3
Chirino, A.J.4
Day, M.W.5
Hsu, B.T.6
Rees, D.C.7
-
8
-
-
0036301164
-
-
Axelrod, H. L.; Abresch, E. C.; Okamura, M. Y.; Yeh, A. P.; Rees, D. C.; Feher, G. J Mol Biol 2002, 319, 501.
-
(2002)
J Mol Biol
, vol.319
, pp. 501
-
-
Axelrod, H.L.1
Abresch, E.C.2
Okamura, M.Y.3
Yeh, A.P.4
Rees, D.C.5
Feher, G.6
-
10
-
-
84986512474
-
-
Brooks, B. R.; Bruccoleri, R. E.; Olafson, B. D.; States, D. J.; Swaminathan, S.; Karplus, M. J Comp Chem 1983, 4, 187.
-
(1983)
J Comp Chem
, vol.4
, pp. 187
-
-
Brooks, B.R.1
Bruccoleri, R.E.2
Olafson, B.D.3
States, D.J.4
Swaminathan, S.5
Karplus, M.6
-
11
-
-
0041784950
-
-
MacKerell, A. D.; Bashford, D.; Bellot, M.; Dunbrack, R. L.; Evansec, J. D.; Field, M. J.; Fisher, S.; Gao, J.; Guo, H.; Ha, S.; Joseph, D.; Kuchnir, L.; Kuczera, K. K.; Lau, F. T. K.; Mattos, C.; Michnick, S.; Ngo, T.; Nguyen, D. T.; Prodhom, B.; Reiher, I. W. E.; Roux, B.; Schlenkrich, M.; Smith, J.; Stote, R.; Straub, J.; Watanabe, M.; Wiorkiewicz-Kuczera, J.; Yin, D.; Karplus, M. J Phys Chem B 1998, 102, 3586.
-
(1998)
J Phys Chem B
, vol.102
, pp. 3586
-
-
MacKerell, A.D.1
Bashford, D.2
Bellot, M.3
Dunbrack, R.L.4
Evansec, J.D.5
Field, M.J.6
Fisher, S.7
Gao, J.8
Guo, H.9
Ha, S.10
Joseph, D.11
Kuchnir, L.12
Kuczera, K.K.13
Lau, F.T.K.14
Mattos, C.15
Michnick, S.16
Ngo, T.17
Nguyen, D.T.18
Prodhom, B.19
Reiher, I.W.E.20
Roux, B.21
Schlenkrich, M.22
Smith, J.23
Stote, R.24
Straub, J.25
Watanabe, M.26
Wiorkiewicz-Kuczera, J.27
Yin, D.28
Karplus, M.29
more..
-
12
-
-
0029011701
-
-
Cornell, W. D.; Cieplak, P.; Bayly, C. I.; Gould, I. R., Jr.; Merz, K. M.; Ferguson, D. M.; Spellmeyer, D. C.; Fox, T.; Cladwell, J. W.; Kollmann, P. A. J Am Chem Soc 1995, 117, 5179.
-
(1995)
J Am Chem Soc
, vol.117
, pp. 5179
-
-
Cornell, W.D.1
Cieplak, P.2
Bayly, C.I.3
Gould Jr., I.R.4
Merz, K.M.5
Ferguson, D.M.6
Spellmeyer, D.C.7
Fox, T.8
Cladwell, J.W.9
Kollmann, P.A.10
-
13
-
-
0019888774
-
-
Northrup, S. H.; Pear, M. R.; Morgan, J. D.; McCammon, J. A.; Karplus, M. J Mol Biol 1981, 153, 1087.
-
(1981)
J Mol Biol
, vol.153
, pp. 1087
-
-
Northrup, S.H.1
Pear, M.R.2
Morgan, J.D.3
McCammon, J.A.4
Karplus, M.5
-
14
-
-
84862412673
-
-
http://altal.middlebury.edu/chemistry/software/heme/2003.
-
-
-
-
15
-
-
0342674893
-
-
Rush, T. S.; Kozlowski, P. M.; Piffat, C. A.; Kumble, R.; Zgierski, M. Z.; Spiro, T. G. J Phys Chem B 2000, 104, 5020.
-
(2000)
J Phys Chem B
, vol.104
, pp. 5020
-
-
Rush, T.S.1
Kozlowski, P.M.2
Piffat, C.A.3
Kumble, R.4
Zgierski, M.Z.5
Spiro, T.G.6
-
16
-
-
0038581885
-
-
Rai, B. K.; Durbin, S. M.; Prohofsky, E. W.; Sage, J. T.; Ellison, M. K.; Roth, A.; Scheidt, W. R.; Sturhahn, W.; Alp, E. E. J Am Chem Soc 2003, 125, 6927.
-
(2003)
J Am Chem Soc
, vol.125
, pp. 6927
-
-
Rai, B.K.1
Durbin, S.M.2
Prohofsky, E.W.3
Sage, J.T.4
Ellison, M.K.5
Roth, A.6
Scheidt, W.R.7
Sturhahn, W.8
Alp, E.E.9
-
17
-
-
0037472743
-
-
Ceccarelli, M.; Procacci, P.; Marchi, M. J Comp Chem 2002, 24, 129.
-
(2002)
J Comp Chem
, vol.24
, pp. 129
-
-
Ceccarelli, M.1
Procacci, P.2
Marchi, M.3
-
19
-
-
0037146082
-
-
Mao, J.; Zhang, Y.; Oldfield, E. J Am Chem Soc 2002, 124, 13911.
-
(2002)
J Am Chem Soc
, vol.124
, pp. 13911
-
-
Mao, J.1
Zhang, Y.2
Oldfield, E.3
-
20
-
-
0000261653
-
-
Rovira, C.; Carloni, P.; Parrinello, M. J Phys Chem B 1999, 103, 7031.
-
(1999)
J Phys Chem B
, vol.103
, pp. 7031
-
-
Rovira, C.1
Carloni, P.2
Parrinello, M.3
-
21
-
-
3042524904
-
-
Bayly, C. I.; Cieplak, P.; Cornell, W. D.; Kollman, P. A. J Phys Chem 1993, 97, 10269.
-
(1993)
J Phys Chem
, vol.97
, pp. 10269
-
-
Bayly, C.I.1
Cieplak, P.2
Cornell, W.D.3
Kollman, P.A.4
-
23
-
-
4444234090
-
-
Spartan'02 Irvine, CA 2001
-
Spartan'02 Irvine, CA 2001.
-
-
-
-
24
-
-
4444254368
-
-
Gaussian03 Carnegie, PA 2003
-
Gaussian03 Carnegie, PA 2003.
-
-
-
-
25
-
-
0029878720
-
-
Humphrey, W. F.; Dalke, A.; Schulten, K. J Mol Graph 1996, 14, 33.
-
(1996)
J Mol Graph
, vol.14
, pp. 33
-
-
Humphrey, W.F.1
Dalke, A.2
Schulten, K.3
-
26
-
-
0004016501
-
-
Jorgensen, W. L.; Chandrasekhar, J.; Madura, J. D.; Impey, R. W.; Klein, M. L. J Chem Phys 1983, 79, 926.
-
(1983)
J Chem Phys
, vol.79
, pp. 926
-
-
Jorgensen, W.L.1
Chandrasekhar, J.2
Madura, J.D.3
Impey, R.W.4
Klein, M.L.5
-
29
-
-
0042415783
-
-
Kalé, L.; Skeel, R.; Bhandarkar, M.; Brunner, R.; Gursoy, A.; Krawetz, N.; Phillips, J.; Shinozaki, A.; Varadarajan, K.; Schulten, K. J Comput Phys 1999, 151, 283.
-
(1999)
J Comput Phys
, vol.151
, pp. 283
-
-
Kalé, L.1
Skeel, R.2
Bhandarkar, M.3
Brunner, R.4
Gursoy, A.5
Krawetz, N.6
Phillips, J.7
Shinozaki, A.8
Varadarajan, K.9
Schulten, K.10
-
30
-
-
0035913537
-
-
Rocchia, W.; Alexov, E.; Honig, B. J Phys Chem B 2001, 105, 6507.
-
(2001)
J Phys Chem B
, vol.105
, pp. 6507
-
-
Rocchia, W.1
Alexov, E.2
Honig, B.3
-
31
-
-
0026319199
-
-
Nicholls, A.; Sharp, K. A.; Honig, B. Proteins Struct Funct Genet 1991, 11, 281.
-
(1991)
Proteins Struct Funct Genet
, vol.11
, pp. 281
-
-
Nicholls, A.1
Sharp, K.A.2
Honig, B.3
-
32
-
-
4444384184
-
-
Read, J.; Gill, R.; Dales, S. L.; Cooper, J. B.; Wood, S. P.; Anthony, C. Protein Sci 1999, 8, 1032.
-
(1999)
Protein Sci
, vol.8
, pp. 1032
-
-
Read, J.1
Gill, R.2
Dales, S.L.3
Cooper, J.B.4
Wood, S.P.5
Anthony, C.6
-
33
-
-
0030058302
-
-
McGee, W. A.; Rosell, F. I.; Liggins, J. R.; Rodriguez-Ghidarpour, S.; Luo, Y.; Chen, J.; Brayer, G. D.; Mauk, A. G.; Nall, B. T. Biochemistry 1996, 35, 1995.
-
(1996)
Biochemistry
, vol.35
, pp. 1995
-
-
McGee, W.A.1
Rosell, F.I.2
Liggins, J.R.3
Rodriguez-Ghidarpour, S.4
Luo, Y.5
Chen, J.6
Brayer, G.D.7
Mauk, A.G.8
Nall, B.T.9
-
34
-
-
0036923706
-
-
Nordgren, C. E.; Tobias, D. J.; Klein, M. L.; Blasie, J. K. Biophys J 2002, 83, 2906.
-
(2002)
Biophys J
, vol.83
, pp. 2906
-
-
Nordgren, C.E.1
Tobias, D.J.2
Klein, M.L.3
Blasie, J.K.4
|