Test and modification of the van der Waals' radii employed in the default PCM model

International Journal of Quantum Chemistry

Volumn 108, Issue 9, 2008, Pages 1422-1434

  Mu, Wei Hua ^a   Chasse, Gregory Adam ^a,b,c   Fang, De Cai ^a,c  

^a BEIJING NORMAL UNIVERSITY   (China)

^b BANGOR UNIVERSITY   (United Kingdom)

^c Global Institute of Computational Molecular and Materials Science   (China)

Author keywords

DFT; MP2; PCM UA0; Van der Waals' radius

Indexed keywords

ALKALI METALS; CHARACTERIZATION; MATHEMATICAL MODELS; REDUNDANCY;

COMPARATIVE ANALYSIS; REDUNDANT IMAGINARY FREQUENCIES (RIFS);

VAN DER WAALS FORCES;

EID: 43949128114     PISSN: 00207608     EISSN: 1097461X     Source Type: Journal    
DOI: 10.1002/qua.21674     Document Type: Article

References (55)

1. 1 Becke, A. D. J Chem Phys 1993, 98, 5648.
2. 2 Lee, C. ; Yang, W. ; Parr, R. G. Phys Rev B 1988, 37, 785.
3. 3 Mobli, M. ; Almond, A. Org Biomol Chem 2007, 5, 2243.
4. 4 Maseras, F. ; Morokuma, K. J Comput Chem 1995, 16, 1170.
5. 5 Humbel, S. ; Sieber, S. ; Morokuma, K. J. Chem Phys 1959, 1996, 105.
6. 6 Vreven, T. ; Morokuma, K. J Comput Chem 2000, 21, 1419.
7. 7 Frisch, M. J. ; Trucks, G. W. ; Schlegel, H. B. ; Scuseria, G. E. ; Robb, M. A. ; Cheeseman, J. R. ; Montgomery, J. A. ; Vreven, T., Jr. ; Kudin, K. N. ; Burant, J. C. ; Millam, J. M. ; Iyengar, S. S. ; Tomasi, J. ; Barone, V. ; Mennucci, B. ; Cossi, M. ; Scalmani, G. ; Rega, N. ; Petersson, G. A. ; Nakatsuji, H. ; Hada, M. ; Ehara, M. ; Toyota, K. ; Fukuda, R. ; Hasegawa, J. ; Ishida, M. ; Nakajima, T. ; Honda, Y. ; Kitao, O. ; Nakai, H. ; Klene, M. ; Li, X. ; Knox, J. E. ; Hratchian, H. P. ; Cross, J. B. ; Adamo, C. ; Jaramillo, J. ; Gomperts, R. ; Stratmann, R. E. ; Yazyev, O. ; Austin, A. J. ; Cammi, R. ; Pomelli, C. ; Ochterski, J. W. ; Ayala, P. Y. ; Morokuma, K. ; Voth, G. A. ; Salvador, P. ; Dannenberg, J. J. ; Zakrzewski, V. G. ; Dapprich, S. ; Daniels, A. D. ; Strain, M. C. ; Farkas, O. ; Malick, D. K. ; Rabuck, A. D. ; Raghavachari, K. ; Foresman, J. B. ; Ortiz, J. V. ; Cui, Q. ; Baboul, A. G. ; Clifford, S. ; Cioslowski, J. ; Stefanov, B. B. ; Liu, G. ; Liashenko, A. ; Piskorz, P. ; Komaromi, I. ; Martin, R. L. ; Fox, D. J. ; Keith, T. ; Al‐Laham, M. A. ; Peng, C. Y. ; Nanayakkara, A. ; Challacombe, M. ; Gill, P. M. W. ; Johnson, B. ; Chen, W. ; Wong, M. W. ; Gonzalez, C. ; Pople, J. Gaussian 03, revision B 02, Gaussian, Pittsburgh, PA, 2003.
8. 8 Onsager, L. J Am Chem Soc 1936, 58, 1486.
9. 9 Miertus, S. ; Scrocco, E. ; Tomasi, J. Chem Phys 1981, 55, 117.
10. 10 Miertus, S. ; Tomasi, J. Chem Phys 1982, 65, 239.
11. 11 Tomasi, J. ; Persico, M. Chem Rev 2027, 1994, 94.
12. 12 Cossi, M. ; Barone, V. ; Cammi, R. ; Tomasi, J. Chem Phys Lett 1996, 255, 327.
13. 13 Frisch, Æ. ; Frisch, M. J. ; Trucks G. W. Gaussian 03 user's Reference 2004.
14. 14 Miller, A. W. ; Nguyen, S. T. Org Lett 2004, 6, 2301.
15. 15 Hancock, M. T. ; Pinhas, A. R. Tetrahedron Lett 2003, 44, 5457.
16. 16 Hancock, M. T. ; Pinhas, A. R. Synthesis 2004, 14, 2347.
17. 17 Weidner‐Wells, M. A. ; Boggs, C. M. ; Foleno, B. D. ; Wira, E. ; Bush, K. ; Goldschmidt, R. M. ; Hlasta, D. J. Bioorg Med Chem Lett 2001, 11, 1829.
18. 18 Ciske, F. L. ; Barbachyn, M. R. ; Genin, M. J. ; Grega, K. C. ; Lee, C. S. ; Dolak, L. A. ; Seest, E. P. ; Watt, W. ; Adams, W. J. ; Friis, J. M. ; Ford, C. W. ; Zurenko, G. E. Bioorg Med Chem Lett 2003, 13, 4235.
19. 19 Cui, Y. ; Dang, Y. ; Yang, Y. ; Zhang, S. ; Ji, R. Eur J Med Chem 2005, 40, 209.
20. 20 Wang, G. ; Ella‐Menye, J.‐R. ; Sharma, V. Bioorg Med Chem Lett 2006, 16, 2177.
21. 21 Nakamura, T. ; Hashimoto, N. ; Ishizuka, T. ; Kunieda, T. Tetrahedron Lett 1997, 38, 559.
22. 22 Gibson, C. L. ; Gillon, K. ; Cook, S. Tetrahedron Lett 1998, 39, 6733.
23. 23 Adam, W. ; Bosio, S. G. ; Turro, N. J. J Am Chem Soc 2002, 124, 8814.
24. 24 Hein, J. E. ; Hultin, P. G. Tetrahedron: Asym 2005, 16, 2341.
25. 25 Li, J.‐F. ; Yang, R. ; Nie, L. ; Yang, L.‐J. ; Huang, R. ; Lin, J. J. Peptide Res 2005, 66, 319.
26. 26 Kotake, T. ; Hayashi, Y. ; Rajesh, S. ; Mukai, Y. ; Takiguchi, Y. ; Kimura, T. ; Kiso, Y. Tetrahedron 2005, 61, 3819.
27. 27 Hodgson, D. M. ; Štefane, B. ; Miles, T. J. ; Witherington, J. J Org Chem 2006, 71, 8510.
28. 28 Gandhi, S. ; Bisai, A. ; Bhanu Prasad, B. A. ; Singh, V. K. J Org Chem 2007, 72, 2133.
29. 29 Hodgson, D. M. ; Humphreys, P. G. ; Miles, S. M. ; Brierley, C. A. J. ; Ward, J. G. J Org Chem 2007, 72, 10009.
30. 30 Trost, B. M. ; Fandrick, D. R. Org Lett 2005, 7, 823.
31. 31 Hodgson, D. M. ; Humphreys, P. G. ; Ward, J. G. Org Lett 2006, 8, 995.
32. 32 Zheng, J.‐C. ; Liao, W.‐W. ; Sun, X.‐X. ; Sun, X.‐L. ; Tang, Y. ; Dai, L.‐X. ; Deng, J.‐G. Org Lett 2007, 9, 5789.
33. 33 Bisseret, P. ; Bouix‐Peter, C. ; Jacques, O. ; Henriot, S. ; Eustache, J. Org Lett 1999, 1, 1181.
34. 34 Ooi, T. ; Kagoshima, N. ; Ichikawa, H. ; Maruoka, K. J Am Chem Soc 1999, 121, 3328.
35. 35 Ochterski, J. W. Vibrational analysis in Gaussian, Gaussian, 1999. Available at http://www.gaussian.com/g_whitepap/vib.htm.
36. 36 Richardson, N. A. ; Xie, Y. ; King, R. B. ; Schaefer, H. F., III. J Phys Chem A 2001, 105, 11134.
37. 37 Möller, C. ; Plesset, M. S. Phys Rev 1934, 46, 618.
38. 38 Krishnan, R. ; Binkley, J. S. ; Seeger, R. ; Pople, J. A. J Chem Phys 1980, 72, 650.
39. 39 Clark, T. ; Chandrasekhar, J. ; Spitznagel, G. W. ; Schleyer, P. v. R. J Comput Chem 1983, 4, 294.
40. 40 Pascual‐Ahuir, J. L. ; Silla, E. ; Tuñon, I. J Comput Chem 1994, 15, 1127.
41. 41 Cossi, M. ; Mennucci, B. ; Cammi, R. J Comput Chem 1996, 17, 57.
42. 42 Bondi, A. J. Phys Chem 1964, 68, 441.
43. 43 Bader, R. F. W. Atoms in Molecules: A Quantum Theory ; Clarendon: Oxford, 1994 ; p 432.
44. 44 Barone, V. ; Cossi, M. ; Tomasi, J. J Chem Phys 1997, 107, 3210.
45. 45 Young, D. C. Computational Chemistry: A Practical Guide for Applying Techniques to Real World Problems ; Wiley: New York, 2001.
46. 46 Foresman, J. B. ; Frisch, Æ. Exploring Chemistry with Electronic Structure Methods, 2nd ed. ; Gaussian: Pittsburgh, PA, 1996.
47. 47 Klein, R. A. Chem Phys Lett 2006, 425, 128.
48. 48 Keith, T. A. SCVS Program, McMaster University, 1992.
49. 49 Boudier, A. ; Bromm, L. O. ; Lotz, M. ; Knochel, P. Angew Chem Int Ed 2000, 39, 4414.
50. 50 Yus, M. ; Gomis, J. Eur J Org Chem 2002, 1989.
51. 51 El‐Hiti, G. A. Monatshefte für Chemie 2004, 135, 323.
52. 52 Rappoport, Z. ; Marek, I. The Chemistry of Organolithium Compounds, Vols. 1 and 2; Wiley: Chichester, UK, 2004.
53. 53 Davie, C. P. ; Danheiser, R. L. Angew Chem Int Ed 2005, 44, 5867.
54. 54 Austin, W. F. ; Zhang, Y. ; Danheiser, R. L. Org Lett 2005, 7, 3905.
55. 55 Pozharskii, A. F. ; Ryabtsova, O. V. Russ Chem Rev 2006, 75, 709.