Different weak C-H⋯O contacts in N-methylacetamide-water system: Molecular dynamics simulations and NMR experimental study

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 108, Issue 33, 2004, Pages 12596-12601

  Zhang, Rong ^a   Li, Haoran ^a   Lei, Yi ^a   Han, Shijun ^a  

^a ZHEJIANG UNIVERSITY   (China)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ALGORITHMS; BIOCHEMISTRY; COMPUTER SIMULATION; HYDROGEN; HYDROGEN BONDS; MOLECULAR DYNAMICS; NUCLEAR MAGNETIC RESONANCE; NUCLEIC ACIDS; PARAMETER ESTIMATION; STABILIZATION;

CRYSTAL PACKING; HYDROGEN BONDING NETWORKS; N-METHYLACETAMIDES (NMA); RADIAL DISTRIBUTION FUNCTIONS (RDF);

CARBON;

EID: 4344580703     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp049623f     Document Type: Article

References (55)

1. (a) Manas, E. S.; Getahun, Z.; Wright, W. W.; DeGrado, W. F.; Vanderkooi, J. M. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 9883.
2. (b) Langley, C. H.; Allinger, N. L. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 5208.
3. Sitkoff, D.; Case, D. A. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 12262.
4. Kim, K.-Y.; Lee, H.-J.; Karpfen, A.; Park, J.; Yoon, C.-J.; Choi, Y.-S. Phys. Chem. Chem. Phys. 2001, 3, 1973.
5. Akiyama, M. Spectrochim. Acta, Parr A 2002, 58, 1943.
6. Kulhánek, P.; Schlag, E. W.; Koèa, J. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 5789.
7. Ham, S.; Kim, J.; Lee, H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 118, 3491.
8. Green, R. D. Hydrogen Banging by C-H Group; Macmillan: London, 1974.
9. Desiraju, G. R.; Stdiner, T. The Weak Hydrogen Bond in Structural Chemistry and Biology; Oxford University Press: Oxford, 1999.
10. Musah, R. A.; Jensen, G. M.; Rosenfeld, R. J.; McRee, D. E.; Goodin, D. B. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 9083.
11. Gu, Y.; Kar, T.; Scheiner, S. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 9411.
12. Lei, Y.; Li, H.; Pan, H. Han, S. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 1574.
13. Mabry, S. A.; Lee, B.; Zheng, T.; Jonas, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 8887.
14. Marigliano, A. C. G.; Varetti, E. L. J. Phys. Chem. A 2002, 106, 1100.
15. Herrebout, W. A.; Clou, K.; Desseyn, H. O. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 4865.
16. Torii, H.; Tatsumi, T.; Tasumi, M. J. Roman. Spectrosc. 1998, 29, 537.
17. Nandini, G.; Sathyanarayana, D. N. J. Mol. Struct. (THEOCHEM) 2002, 579, 1.
18. Gellman, S. H.; Dado, G. P.; Liang, G.-B.; Adams, B. R. J. Am. Chem. Soc. 1991, 113, 1164.
19. Markham, L. M.; Hudson, B. S. J. Phys. Chem. 1996, 100, 2731.
20. Ludwig, R.; Weinhold, F.; Farrar, T. C. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 8861.
21. Ludwig, R.; Reis, O.; Winter, R.; Weinhold, F. Farrar, T. C. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 9312.
22. Torii, H.; Tatsumi, T.; Kanazawa, T.; Tasumi, M. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 309.
23. Akiyama, M.; Torii, H. Spectrochim. Acta, Part A 1999, 56, 137.
24. Kwac, K.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2247.
25. Ham, S.; Kim, J.-H.; Lee, H.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 118, 3491.
26. Kwac, K.; Cho, M. J. Chem. Phys. 2003, 119, 2256.
27. Buck, M.; Karplus, M. J. Phys. Chem. B 2001, 105, 11000.
28. (a) Zielkiewicz, J.; Mazerski, J. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 861.
29. (b) Zielkiewicz, J. Phys. Chem. Chem. Phys. 2000, 2, 2925.
30. Iuchi, S.; Morita, A.; Kato, S. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 3466.
31. Gregurick, S. K.; Chaban, G. M.; Gerber, R. B. J. Phys. Chem. A 2002, 106. 8696.
32. Maple, J. R.; Ewig, C. S. J. Chem. Phys. 2001, 115, 4981.
33. Han, W.-G.; Suhai, S. J. Phys. Chem. 1996, 100, 3942.
34. (a) Cuevas, G.; Renugopalakrishnan, V.; Madrid, G.; Hagler, A. T. Phys. Chem. Chem. Phys. 2002, 4, 1490.
35. (b) Dixon, D. A.; Dobbs, K. D.; Valentini, J. J. J. Phys. Chem. 1994, 98, 13435.
36. Gao, J.; Freindorf, M. J. Phys. Chem. A 1997, 101, 3182.
37. Vargas, R.; Garza, J.; Dixon, D. A.; Hay, B. P. J. Am. Chem. Soc. 2000, 122, 4750.
38. Vargas, R.; Garza, J.; Friesner, R. A.; Stern, H.; Hay, B. P.; Dixon, D. A. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 4963.
39. Chalaris, M.; Samios, J. J. Mol. Liq. 2002, 98-99, 399.
40. Victor, P. J.; Hazra, D. K. J. Chem. Eng. Data 2002, 47, 79.
41. Berweger, C. D.; Gunsteren, W. F.; Müller-Plathe, F. Chem. Phys. Lett. 1995, 232, 429.
42. Mark, P.; Nilsson, L. J. Phys. Chem. A 2001, 105, 9954.
43. Jorgensen, W. L.; Maxwell, D. S.; Tirado-Rives, J. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 11225.
44. Jorgensen, W. L.; Swenson, C. J. J. Am. Chem. Soc. 1985, 107, 569.
45. Dudek, M. J.; Ramnarayan, K.; Ponder, J. W. J. Comput. Chem. 1998. 19, 548. Available from http://dasher.wustl.edu/tinker.
46. Luzar, A.; Chandler, D. J. Chem. Phys. 1993, 98, 8160.
47. Lei, Y.; Li, H.; Han, S. Chem. Phys. Lett. 2003, 380, 542.
48. CRC Handbook of Chemistry and Physics, 80th ed.; Lide, D. R., Ed.; CRC Press: Boca Raton, FL, 1999-2000.
49. Mizuno, K.; Imafuji, S.; Fujiwara, T.; Ohta, T.; Tamiya, Y. J. Phys. Chem. B 2003, 107, 3972.
50. Mizuno, K.; Kimura, Y.; Morichika, H.; Nishimura, Y.; Shimada, Y.; Maeda, S.; Imafuji, S.; Ochi, T. J. Mol. Liq. 2000, 85, 139.
51. Mizuno, K.; Imafuji, S.; Ochi, T.; Ohta, T.; Maeda, S. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11001.
52. Mizuno, K.; Ochi, T.; Shindo, Y. J. Chem. Phys. 1998, 109, 9502.
53. Dohnal, V.; Tkadlecová, M. J. Phys. Chem. B 2002, 106, 12307.
54. Tkadlecová, M.; Dohnal, V.; Costas, M. Phys. Chem. Chem. Phys. 1999, 1, 1479.
55. Shekaari, H.; Modarress, H.; Hadipour, N. J. Phys. Chem. A 2003, 107, 1891.