Detecting D-amino acid-containing neuropeptides using selective enzymatic digestion

Analytical Chemistry

Volumn 80, Issue 8, 2008, Pages 2874-2880

  Ewing, Michael A ^a   Wang, Jane ^a   Sheeley, Sarah A ^a   Sweedler, Jonathan V ^a  

^a UNIVERSITY OF ILLINOIS AT URBANA CHAMPAIGN   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ENZYME ACTIVITY; MASS SPECTROMETRY; PEPTIDES;

ABDOMINAL GANGLION; MICROSOMAL ALANYL AMINOPEPTIDASE;

AMINO ACIDS;

DEXTRO AMINO ACID; MICROSOMAL AMINOPEPTIDASE; NEUROPEPTIDE;

AMINO TERMINAL SEQUENCE; ARTICLE; CHIRALITY; COMPLEX FORMATION; CONTROLLED STUDY; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; ENZYME ACTIVITY; ENZYME DEGRADATION; ENZYME METABOLISM; LIQUID CHROMATOGRAPHY; NONHUMAN;

AMINO ACIDS; ANIMALS; ANTIGENS, CD13; APLYSIA; NEUROPEPTIDES; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION; STEREOISOMERISM;

EID: 42349100379     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac7025173     Document Type: Article

References (52)

1. Baggerman, G.; Verleyen, P.; Clynen, E.; Huybrechts, J.; De Loof, A.; Schoofs, L. J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2004, 803, 3-16.
2. Fricker, L. D.; Lim, J.; Pan, H.; Che, F. Y. Mass Spectrom. Rev. 2006, 25, 327-344.
3. Hummon, A. B.; Amare, A.; Sweedler, J. V. Mass Spectrom. Rev. 2006, 25, 77-98.
4. Parkin, M. C.; Wei, H.; O'Callaghan, J. P.; Kennedy, R. T. Anal. Chem. 2005, 77, 6331-6338.
5. Svensson, M.; Skold, K.; Nilsson, A.; Faith, M.; Svenningsson, P.; Andren, P. E. Biochem. Soc. Trans. 2007, 35, 588-593.
6. Kreil, G. Science 1994, 266, 996-997.
7. Fujii, N. Origins Life Evol Biosphere 2002, 32, 103-127.
8. Kreil, G. Annu. Rev. Biochem. 1997, 66, 337-345.
9. Soyez, D.; Toullec, J. Y.; Ollivaux, C.; Geraud, G. J. Biol. Chem. 2000, 275, 37870-37875.
10. Auvynet, C.; Seddiki, N.; Dunia, I.; Nicolas, P.; Amiche, M.; Lacombe, C. Eur. J. Cell Biol. 2006, 85, 25-34.
11. Buczek, O.; Yoshikami, D.; Bulaj, G.; Jimenez, E. C.; Olivera, B. M. J. Biol. Chem. 2005, 280, 4247-4253.
12. Buczek, O.; Yoshikami, D.; Watkins, M.; Bulaj, G.; Jimenez, E. C.; Olivera, B. M. FEBS J. 2005, 272, 4178-4188.
13. Kreil, G.; Barra, D.; Simmaco, M.; Erspamer, V.; Erspamer, G. F.; Negri, L.; Severini, C.; Corsi, R.; Melchiorri, P. Eur. J. Pharmacol. 1989, 162, 123-128.
14. Torres, A. M.; Menz, I.; Alewood, P. F.; Bansal, P.; Lahnstein, J.; Gallagher, C. H.; Kuchel, P. W. FEBS Lett. 2002, 524, 172-176.
15. Torres, A. M.; Tsampazi, C.; Geraghty, D. P.; Bansal, P. S.; Alewood, P. F.; Kuchel, P. W. Biochem. J. 2005, 391, 215-220.
16. Heck, S. D.; Siok, C. J.; Krapcho, K. J.; Kelbaugh, P. R.; Thadeio, P. F.; Welch, M. J.; Williams, R. D.; Ganong, A. H.; Kelly, M. E.; Lanzetti, A. J.; et al. Science 1994, 266, 1065-1068.
17. Kamatani, Y.; Minakata, H.; Kenny, P. T. M.; Iwashita, T.; Watanabe, K.; Funase, K.; Sun, X. P.; Yongsiri, A.; Kim, K. H.; Novales-Li, P.; Novales, E. T.; Kanapi, C. G.; Takeuchi, H.; Nomoto, K. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1989, 160, 1015-1020.
18. Montecucchi, P. C. D. C., R.; Piani, S.; Gozzini, L.; Erspamer, V. Int. J. Pept. Protein Res. 1981, 17, 275-283.
19. Morishita, F.; Nakanishi, Y.; Kaku, S.; Furukawa, Y.; Ohta, S.; Hirata, T.; Ohtani, M.; Fujisawa, Y.; Muneoka, Y.; Matsushima, O. Biochem. Biophys. Res. Commun. 1997, 240, 354-358.
20. Morishita, F.; Sasaki, K.; Kanemaru, K.; Nakanishi, Y.; Matsushima, O.; Furukawa, Y. Peptides 2001, 22, 183-189.
21. Yasuda-Kamatani, Y.; Kobayashi, M. Y., A.; Fujita, T.; Minakata, H.; Nomoto, K.; Nakamura, M.; Sakiyama, F. Peptides 1997, 18, 347-354.
22. Yasuda-Kamatani, Y.; Nakamura, M.; Minakata, H.; Nomoto, K.; Sakiyama, F. J. Neurochem. 1995, 64, 2248-2255.
23. Jilek, A.; Mollay, C.; Tippelt, C.; Grassi, J.; Mignogna, G.; Mullegger, J.; Sander, V.; Fehrer, C.; Barra, D.; Kreil, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 4235-4239.
24. Erspamer, V.; Melchiorri, P.; Falconieri-Erspamer, G.; Negri, L.; Corsi, R.; Severini, C.; Barra, D.; Simmaco, M.; Kreil, G. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1989, 86, 5188-5192.
25. Mignogna, G.; Simmaco, M.; Kreil, G.; Barra, D. EMBO J. 1993, 12, 4829-4832.
26. Richter, K.; Egger, R.; Kreil, G. Science 1987, 238, 200-202.
27. Satake, H.; Yasuda-Kamatani, Y.; Takuwa, K.; Nomoto, K.; Minakata, H.; Nagahama, T.; Nakabayashi, K.; Matsushima, O. Eur. J. Biochem. 1999, 261, 130-136.
28. Mor, A.; Delfour, A.; Nicolas, P. J. Biol. Chem. 1991, 266, 6264-6270.
29. Kanemaru, K.; Morishita, F.; Matsushima, O.; Furukawa, Y. Peptides 2002, 23, 1991-1998.
30. Morishita, F.; Minakata, H.; Sasaki, K.; Tada, K.; Furukawa, Y.; Matsushima, O.; Mukai, S. T.; Saleuddin, A. S. Peptides 2003, 24, 1533-1544.
31. Gallois, D.; Brisorgueil, M. J.; Conrath, M.; Mailly, P.; Soyez, D. Eur. J. Cell Biol. 2003, 82, 431-440.
32. Soyez, D.; Van Herp, F.; Rossier, J.; Le Caer, J. P.; Tensen, C. P.; Lafont, R. J. Biol. Chem. 1994, 269, 18295-18298.
33. Torres, A. M.; Tsampazi, M.; Kennett, E. C.; Belov, K.; Geraghty, D. P.; Bansal, P. S.; Alewood, P. F.; Kuchel, P. W. Amino Acids 2007, 32, 63-68.
34. Torres, A. M.; Tsampazi, M.; Tsampazi, C.; Kennett, E. C.; Belov, K.; Geraghty, D. P.; Bansal, P. S.; Alewood, P. F.; Kuchel, P. W. FEBS Lett. 2006, 580, 1587-1591.
35. Heck, S. D.; Faraci, W. S.; Kelbaugh, P. R.; Saccomano, N. A.; Thadeio, P. F.; Volkmann, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A 1996, 93, 4036-4039.
36. Sweedler, J. V.; Li, L.; Rubakhin, S. S.; Alexeeva, V.; Dembrow, N. C.; Dowling, O.; Jing, J.; Weiss, K. R.; Vilim, F. S. J. Neurosci. 2002, 22, 7797-7808.
37. Iida, T.; Santa, T.; Toriba, A.; Imai, K. Biomed. Chromatogr. 2001, 15, 319-327.
38. Liu, J. P.; Hsieh, Y. Z.; Weiesler, D.; Novotny, M. Anal. Chem. 1991, 63, 408-412.
39. Liu, Y. M.; Schneider, M.; Sticha, C. M.; Toyooka, T.; Sweedler, J. V. J. Chromatogr., A 1998, 800, 345-354.
40. Sheeley, S. A.; Miao, H.; Ewing, M. A.; Rubakhin, S. S.; Sweedler, J. V. Analyst 2005, 130, 1198-1203.
41. Czerwenka, C.; Lindner, W. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 2713-2718.
42. Czerwenka, C.; Maier, N. M.; Lindner, W. Anal. Bioanal. Chem. 2004, 379, 1039-1044.
43. Czerwenka, C.; Lindner, W. Anal. Bioanal. Chem. 2005, 382, 599-638.
44. Serafin, S. V.; Maranan, R.; Zhang, K.; Morton, T. H. Anal. Chem. 2005, 77, 5480-5487.
45. Adams, C. M.; Zubarev, R. A. Anal. Chem. 2005, 77, 4571-4580.
46. Grigorean, G.; Gronert, S.; Lebrilla, C. B. Int. J. Mass Spectrom. 2002, 219, 79-87.
47. Wachsmuth, E. D.; Fritze, I.; Pfleiderer, G. Biochemistry 1966, 5, 169-174.
48. Doucette, A.; Li, L. Proteomics 2001, 1, 987-1000.
49. Turner, A. J. In Handbook of Proteolytic Enzymes; Barrett, A. J., Rawlings, N. D., Eds.; Academic Press: San Diego, 1998; pp 996-1000.
50. Garden, R. W.; Shippy, S. A.; Li, L.; Moroz, T. P.; Sweedler, J. V. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1998, 95, 3972-3977.
51. Jakubowski, J. A.; Hatcher, N. G.; Xie, F.; Sweedler, J. V. Neurochem. Int. 2006, 49, 223-229.
52. Krstanovic, M.; Brgles, M.; Halassy, B.; Frkanec, R.; Vrdoljak, A.; Branovic, K.; Tomasic, J.; Benedetti, F. Prep. Biochem. Biotechnol. 2006, 36, 175-195.