Optimal surface chemistry for peptide immobilization in on-chip phosphorylation analysis

Analytical Chemistry

Volumn 80, Issue 3, 2008, Pages 643-650

  Inamori, Kazuki ^a   Kyo, Motoki ^a   Matsukawa, Kazuki ^a   Inoue, Yusuke ^b   Sonoda, Tatsuhiko ^b   Tatematsu, Kenji ^c   Tanizawa, Katsuyuki ^c   Mori, Takeshi ^b   Katayama, Yoshiki ^b  

^a TOYOBO CO LTD   (Japan)

^b KYUSHU UNIVERSITY   (Japan)

^c OSAKA UNIVERSITY   (Japan)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOCHIPS; CHEMICAL MODIFICATION; CROSSLINKING; HYDROPHOBICITY; PHOSPHORYLATION; SURFACE CHEMISTRY;

CYSTEINE-TERMINATED PEPTIDES; GOLD SURFACE; HYDROPHILIC POLYMERS; PEPTIDE IMMOBILIZATION;

PEPTIDES;

MACROGOL; PEPTIDE DERIVATIVE;

ARTICLE; ENZYME SUBSTRATE; FLUORESCENCE; PEPTIDE ANALYSIS; PROTEIN IMMOBILIZATION; PROTEIN PHOSPHORYLATION; SURFACE PROPERTY;

BIOSENSING TECHNIQUES; CROSS-LINKING REAGENTS; ENZYMES, IMMOBILIZED; PEPTIDES; PHOSPHORYLATION; PHOSPHOTRANSFERASES; POLYETHYLENE GLYCOLS; SURFACE PROPERTIES; TIME FACTORS;

EID: 38849117080     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac701667g     Document Type: Article

References (53)

1. Emili, A. Q.; Cagney, G. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 393-397.
2. Panicker, R. C.; Xuan, H.; Yao, S. Q. Comb. Chem. High Throughput Screening 2004, 7, 547-556.
3. Beattie, J.; Shand, J. H.; Flint, D. J. Eur. J. Biochem. 1996, 239, 479-486.
4. Stone, J. D.; Demkowicz, Jr., W. E.; Stern, L. J. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A., 2005, 102, 3744-3749.
5. Eichler, J. Comb. Chem. High Throughput Screening 2005, 8, 135-143.
6. Usui, K.; Tomizaki, K.; Ohyama, T.; Nokihara, K.; Mihara, H. Mol. Biosyst. 2006, 2, 113-121.
7. Gannot, G.; Tangrea, M. A.; Gillespie, J. W.; Erickson, H. S.; Wallis, B. S.; Leakan, R. A.; Knezevic, V.; Hartmann, D. P.; Chuaqui, R. F.; Emmert-Buck, M. R. J. Mol. Diagn. 2005, 7, 427-436.
8. Kato, R.; Kaga, C.; Kunimatsu, M.; Kobayashi, T.; Honda, H. J. Biosci. Bioeng. 2006, 101, 485-495.
9. Omer, B. P.; Derda, R.; Lewis, R. L.; Thomson, J. A.; Kiessling, L. L. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 10808-10809.
10. Schutkowski, M.; Reimer, U.; Panse, S.; Dong, L.; Lizcano, J. M.; Alessi, D. R.; Schneider-Mergener, J. Angew. Chem., Int. Ed. 2004, 43, 2671-2674.
11. Williams, D. M.; Cole, P. A. Trends Biochem. Sci 2001, 26, 271-273.
12. Falsey, J. R.; Renil, M.; Park, S.; Li, S.; Lam, K. S. Bioconjugate Chem. 2001, 12, 346-353.
13. Lizcano, J. M.; Deak, M.; Motrice, N.; Kieloch, A.; Hastie, C. J.; Dong, L.; Schutkowski, M.; Reimer, U.; Alessi, D. R. J. Biol. Chem. 2002, 277, 27839-27849.
14. Reimer, U.; Reineke, U.; Schneider-Mergener, J. Curr. Opin. Biotechnol. 2002, 13, 315-320.
15. Pal, M.; Moffa, A.; Sreekumar, A.; Ethier, S. P.; Barder, T. J.; Chinnaiyan, A.; Lubman, D. M. Anal. Chem. 2006, 78, 702-710.
16. Wenschuh, H.; Volkmer-Engert, R.; Schmidt, M.; Schulz, M.; Schneider-Mergener, J.; Reineke, U. Biopolymers 2000, 55, 188-206.
17. Reineke, U.; Volkmer-Engert, R.; Schneider-Mergener, J. Curr. Opin. Biotechnol. 2001, 12, 59-64.
18. Panse, S.; Dong, L.; Burian, A.; Carus, R.; Schutkowski, M.; Reimer, U.; Schneider-Mergener, J. Mol. Diversity 2004, 8, 291-299.
19. Su, J.; Bringer, M. B.; Ismagilov, R. F.; Mrksich, M. J. Am. Chem. Soc. 2005, 127, 7280-7281.
20. Uttamchandani, M.; Chan, E. W. S.; Chen, G. Y. J.; Yao, S. Q. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2003, 13, 2997-3000.
21. Lesaicherre, M. L.; Uttamchandani, M.; Chen, G. Y. J.; Yao, S. Q. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2002, 12, 2079-2083.
22. Lesaicherre, M. L.; Uttamchandani, M.; Chen, G. Y. J.; Yao, S. Q. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2002, 12, 2085-2088.
23. Chen, G. Y. J.; Uttamchandani, M.; Lue, R. Y. P.; Lesaicherre, M. L.; Yao, S. Q. Curr. Top. Med. Chem. 2003, 3, 705-724.
24. Shigaki, S.; Yamaji, T.; Han, X.; Yamanouchi, G.; Sonoda, T.; Okitsu, O.; Mori, T.; Niidome, T.; Katayama, Y. Anal. Sci. 2007, 23, 271-275.
25. Duburcq, X.; Olivier, C.; Malingue, F.; Desmet, R.; Bouzidi, A.; Zhou, F.; Auriautt, C.; Gras-Masse, H.; Melnyk, O. Bioconjugate Chem. 2004, 15, 307-316.
26. Yousaf, M. N.; Mrksich, M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 4286-4287.
27. Kwon, Y.; Mrksich, M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 806-812.
28. Houseman, B. T.; Huh, J. H.; Kron, S. J.; Mrksich, M. Nat. Biotechnol. 2002, 20, 270-274.
29. Wegner, G. J.; Lee, H. J.; Corn, R. M. Anal. Chem. 2002, 74, 5161-5168.
30. Andresen, H.; Grotzinger, C.; Zarse, K.; Kreuzer, O. J.; Ehrentreich-Forster, E.; Bier, F. F. Proteomics 2006, 6, 1376-1384.
31. Rothenhäusler, B.; Knoll, W. Nature 1988, 332, 615-617.
32. Nelson, B. P.; Frutos, A. G.; Brockman, J. M.; Corn, R. M. Anal. Chem. 1999, 71, 3928-3934.
33. Brockman, J. M.; Nelson, B. P.; Corn, R. M. Annu. Rev. Phys. Chem. 2000, 51, 41-63.
34. Inamori, K.; Kyo, M.; Nishiya, Y.; Inoue, Y., Sonoda, T.; Kinoshita, E.; Koike, T.; Katayama, Y. Anal. Chem. 2005, 77, 3979-3985.
35. Koike, T.; Inoue, M.; Kimura, E.; Shiro, M. J. Am. Chem. Soc. 1996, 118, 3091-3099.
36. Kimura, E.; Aoki, S.; Koike, T.; Shiro, M. J. Am. Chem. Soc. 1997, 119, 3068-3076.
37. Fujioka, H.; Koike, T.; Yamada, N.; Kimura, E. Heterocycles 1996, 42, 775-787.
38. Kinoshita, E.; Takahashi, M.; Takeda, H.; Shiro, M.; Koike, T. Dalton Trans. 2004, 8, 1189-1193.
39. Takeda, H.; Kawasaki, A.; Takahashi, M.; Yamada, A.; Koike, T. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2003, 17, 2075-2081.
40. Tanaka, T.; Tsutsui, H.; Hirano, K.; Koike, T.; Tokumura, A.; Satouchi, K. J. Lipid Res. 2004, 45, 2145-2150.
41. Kinoshita, E.; Yamada, A.; Takeda, H.; Kinoshita-Kikuta, E.; Koike, T. J. Sep. Sci. 2005, 28, 155-162.
42. Kinoshita, E.; Kinoshita-Kikuta, E.; Takiyama, K.; Koike, T. Mol. Cell. Proteomics 2006, 5, 749-757.
43. Nelson, B. P.; Grimsrud, T. E.; Liles, M. R.; Goodman, R. M.; Corn, R. M. Anal. Chem. 2001, 73, 1-7.
44. Brockman, J. M.; Frutos, A. G.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8044-8051.
45. Sonoda, T.; Shigaki, S.; Nagashima, T.; Okitsu, O.; Kita, Y.; Murata, M.; Katayama, Y. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 847-850.
46. Kyo, M.; Yamamoto, T.; Motohashi, H.; Kamiya, T.; Kuroita, T.; Tanaka, T.; Engel, J. D.; Kawakami, B.; Yamamoto, M. Genes Cells 2004, 9, 153-164.
47. Song, A.; Wang, X.; Zhang, J.; Marik, J.; Lebrilla, C. B.; Lam, K. S. Bioorg. Med. Chem. Lett. 2004, 14, 161-165.
48. Kemp, B. E.; Graves, D. J.; Benjamini, E.; Krebs, E. G. J. Biol. Chem. 1977, 252, 4888-4894.
49. Okumura, A.; Sato, Y.; Kyo, M.; Kawaguchi, H. Anal. Biochem. 2005, 339, 328-337.
50. Peterson, A. W.; Wolf, L. K.; Georgiadis, R. M. J. Am. Chem. Soc. 2002, 124, 14601-14607.
51. Smith, E. A.; Wanat, M. J.; Cheng, Y.; Barreira, S. V. P.; Frutos, A. G.; Corn, R. M. Langmuir 2001, 17, 2502-2507.
52. Uchida, K.; Otsuka, H.; Kaneko, M.; Kataoka, K.; Nagasaki, Y. Anal. Chem. 2005, 77, 1075-1080.
53. Otsuka, H.; Nagasaki, Y.; Kataoka, K. Biomacromolecules 2000, 1, 39-48.