Characterization and optimization of peptide arrays for the study of epitope-antibody interactions using surface plasmon resonance imaging

Analytical Chemistry

Volumn 74, Issue 20, 2002, Pages 5161-5168

  Wegner, Greta J ^a   Lee, Hye Jin ^a   Corn, Robert M ^a  

^a UNIVERSITY OF WISCONSIN MADISON   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

PEPTIDES;

ALCOHOLS; AMINO ACIDS; MONOLAYERS; OPTIMIZATION; SURFACE PLASMON RESONANCE;

ANTIBODIES;

ALANINE; ALKANE DERIVATIVE; CYSTEINE; DISULFIDE; EPITOPE; GOLD; HYBRID PROTEIN; MONOCLONAL ANTIBODY; PEPTIDE; THIOL;

AMINO ACID SUBSTITUTION; ANALYTIC METHOD; ANTIGEN ANTIBODY REACTION; ARTICLE; BINDING SITE; COVALENT BOND; PROTEIN INTERACTION; PROTEIN PURIFICATION; QUANTITATIVE ANALYSIS; SURFACE PLASMON RESONANCE; SURFACE PROPERTY;

ANTIBODIES; EPITOPES; FLUORESCENT DYES; INDICATORS AND REAGENTS; PEPTIDES; SURFACE PLASMON RESONANCE; THERMODYNAMICS;

EID: 0037109027     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac025922u     Document Type: Article

References (39)

1. Reineke, U.; Kramer, A.; Schneider-Mergener, J. Curr. Top. Microbiol. Immunol. 1999, 243, 23-36.
2. Portefaix, J.-M.; Thebault, S.; Bourgain-Guglielmetti, F.; Del Rio, M.; Grainer, C.; Mani, J.-C.; Navarro-Teulon, I.; Nicolas, M.; Soussi, T.; Pau, B. J. Immunol. Methods 2000, 244, 17-28.
3. Reuter, M.; Scheider-Mergener, J.; Kupper, D.; Meisel, A.; Mackeldanz, P.; Kruger, D. H.; Scroeder, C. J. Biol. Chem. 1999, 274, 5213-5221.
4. Hilpert, K.; Hansen, G.; Wessner, H.; Schneider-Mergener, J.; Hohne, W. J. Biochem. 2000, 128, 1051-1057.
5. Wenschuh, H.; Volkmer-Engert, R.; Schmidt, M.; Schulz, M.; Schneider-Mergener, J.; Reineke, U. Biopolymers 2000, 55, 188-206.
6. Zhang, S.; Yan, L.; Altman, M.; Lassle, M.; Nugent, H.; Frankel, F.; Lauffenburger, D. A.; Whitesides, G. M.; Rich, A. Biomaterials 1999, 20, 1213-1220.
7. Houseman, B. T.; Mrksich, M. Biomaterials 2001, 22, 943-955.
8. Reineke, U.; Volkmer-Engert, R.; Schneider-Mergener, J. Curr. Opin. Biotechnol. 2001, 12, 59-64.
9. Frutos, A. G.; Brockman, J. M.; Corn, R. M. Langmuir 2000, 16, 2192-2197.
10. Brockman, J. M.; Frutos, A. G.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8044-8051.
11. Smith, E. A.; Erickson, M. G.; Ulijasz, A. T.; Weisblum, B.; Corn, R. M. Langmuir, in press.
12. Maeji, N. J.; Bray, A. M.; Valerie, R. M.; Seldon, M. A.; Wang, J. X.; Geysen, H. M. Pept. Res. 1991, 4, 142-146.
13. Brockman, J. M.; Frutos, A. G.; Corn, R. M. J. Am. Chem. Soc. 1999, 121, 8044-8051.
14. Smith, E.; Wanat, M. J.; Cheng, Y.; Barreira, S. V. P.; Frutos, A. G.; Corn, R. M. Langmuir 2001, 17, 2502-2507.
15. Lee, H. J.; Goodrich, T. T.; Corn, R. M. Anal. Chem. 2001, 73, 5525-5531.
16. Duffy, D. C.; McDonald, J. C.; Schueller, O. J. A.; Whitesides, G. M. Anal. Chem. 1998, 70, 4974-4984.
17. Effenhauser, C. S.; Bruin, G. J. M.; Paulus, A.; Ehrat, M. Anal. Chem. 1997, 69, 3451-3457.
18. Nelson, B. P.; Frutos, A. G.; Brockman, J. M.; Corn, R. M. Anal. Chem. 1999, 71, 3928-3934.
19. Berrymen, D. E.; Mulero, J. J.; Hughes, L. B.; Brasaemle, D. L; Bensadoun, A. Biochim. Biophys. Acta 1998, 1382, 217-229.
20. Lewis, S. E.; Listenberger, L. L.; Ory, D. S.; Schaffer, J. E. J. Biol. Chem. 2001, 276, 37042-37050.
21. Eckhardt, M.; Gotza, B.; Gerhardy-Schahn, R. J. Biol. Chem. 1999, 274, 8779-8787.
22. Zhang, F. F.; Pajor, A. M. Biochim. Biophys. Acta 2001, 1511, 80-89.
23. Bouchard, B. A.; Furie, B.; Furie, B. C. Biochemistry 1999, 38, 9517-9523.
24. Pearson, D. L; Reimonenq, R. D.; Pollard, K. M. Protein Expression Purif. 1999, 17, 49-56.
25. Slootstra, J. W.; Kuperus, D.; Pluckthun, A.; Meloen, R. H. Mol. Diversity 1996, 2, 156-164.
26. Zhang, L.; Hernan, R.; Brizzard, B. Mol. Biotechnol. 2001, 19, 313-321.
27. Kaltenboeck, B.; Heard, D.; DeGraves, F. J.; Schmeer, N. J. Clin. Microbiol. 1997, 35, 2293-2298.
28. Luo, D.; Geng, M.; Schultes, B.; Ma, J.; Xu, D. Z.; Hamza, N.; Qi, W.; Noujaim, A. A.; Madiyalakan, R. J. Biotechnol. 1998, 65, 225-228.
29. Kjeldsen, T.; Pettersson, A. F.; Hach, M. Biotechnol. Appl. Biochem. 1999, 29, 79-86.
30. Nuzzo, R. G.; Zegarski, B. R.; Dubois, L H. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 733-740.
31. Jung, L. S.; Campbell, C. T. J. Phys. Chem. B 2000, 104, 11168-11178.
32. Niman, H. L; Houghten, R. A.; Walker, L. E.; Reisfeld, R. A.; Wilson, I. A.; Hogle, J. M.; Lerner, R. A. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1983, 80, 4949-4953.
33. Wilson, I. A.; Niman, H. L; Houghten, R. A.; Cherenson, A. R.; Connoly, M. L.; Lerner, R. A. Cell 1984, 37, 767-778.
34. Nelson, B. P.; Grimsrud, T. E.; Liles, M. R.; Goodman, R. M.; Corn, R. M. Anal. Chem. 2001, 73, 1-7.
35. Firsov, D.; Schild, L.; Gautschi, I.; Merillat, A. M.; Schneeberger, E.; Rossier, B. C. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 1996, 93, 15370-15375.
36. Boldicke, T.; Struck, F.; Schaper, F.; Tegge, W.; Sobek, H.; Villbrandt, B.; Lankenau, P.; Bocher, M. J. Immunol. Methods 2000, 240, 165-183.
37. Bracci, L.; Lozzi, L.; Lelli, B.; Pini, A.; Neri, P. Biochemistry 2001, 40, 6611-6619.
38. Monnet, C.; Laune, D.; Laroche-Traineau, J.; Biard-Piechaczyk, M.; Briant, L.; Bes, C.; Pugniere, M.; Mani, J.-C.; Pau, B.; Cerutti, M.; Devauchelle, G.; Devaux, C.; Granier, C.; Chardes, T. J. Biol. Chem. 1999, 274, 3789-3496.
39. Houseman, B. T.; Huh, J. H.; Kron, S., J.; Mrksich, M. Nat. Biotechnol. 2001, 20, 270-274.