A classical point charge model study of system size dependence of oxidation and reorganization free energies in aqueous solution

Journal of Physical Chemistry B

Volumn 112, Issue 2, 2008, Pages 257-269

  Ayala, Regla ^a   Sprik, Michiel ^a  

^a UNIVERSITY OF CAMBRIDGE   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

COMPUTER SIMULATION; DENSITY FUNCTIONAL THEORY; ELECTRIC CHARGE; ELECTRON TRANSITIONS; ENERGY GAP; FREE ENERGY;

ELECTRON TRANSFER; LONG-RANGE INTERACTIONS; OXIDATION FREE ENERGY;

OXIDATION;

EID: 38749135480     PISSN: 15206106     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/jp0748516     Document Type: Article

References (73)

1. Hynes, J. T. Annu. Rev. Phys. Chem. 1985, 36, 573.
2. Nitzan, A. Chemical Dynamics in Condensed Phases; Oxford University Press: Oxford, 2006.
3. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1956, 24, 966.
4. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1956, 24, 979.
5. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1957, 26, 867.
6. Marcus, R. A. J. Chem. Phys. 1965, 43, 679.
7. Marcus, R. A.; Sutin, N. Biochim. Biophys. Acta 1985, 811, 265.
8. Marcus, R. A. Rev. Mod. Phys. 1993, 65, 599.
9. Lee, S.; Hynes, J. T. J. Chem. Phys. 1988, 88, 6853.
10. Kim, H. J.; Hynes, J. T. J. Chem. Phys. 1990, 93, 5194.
11. Kim, H. J.; Hynes, J. T. J. Chem. Phys. 1990, 93, 5211.
12. Kim, H. J.; Hynes, J. T. J. Chem. Phys. 1992, 96, 5088.
13. Newton, M. D.; Friedman, H. L. J. Chem. Phys. 1988, 88, 4460.
14. Liu, Y.-P.; Newton, M. D. J. Phys. Chem. 1994, 98, 7162.
15. Tachiya, M. J. Phys. Chem. 1993, 97, 5911.
16. Matyushov, D. V. J. Chem. Phys. 2004, 120, 7532.
17. Warshel, A. J. Phys. Chem. 1982, 86, 2218.
18. Hwang, J. K.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 1987, 109, 715.
19. King, G.; Warshel, A. J. Chem. Phys. 1990, 93, 8682.
20. Olsson, M. H. M.; Hong, G.; Warshel, A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 5025.
21. Kuharski, R. A.; Bader, J. S.; Chandler, D.; Sprik, M.; Klein, M. L.; Impey, R. W. J. Chem. Phys. 1988, 89, 3248.
22. Carter, E. A.; Hynes, J. T. J. Phys. Chem. 1989, 93, 2184.
23. Carter, E. A.; Hynes, J. T. J. Chem. Phys. 1991, 94, 5961.
24. Zhou, H.-X.; Szabo, A. J. Chem. Phys. 1995, 103, 3481.
25. Yelle, R. B.; Ichiye, Y. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 4127.
26. Ando, K. J. Chem. Phys. 1997, 106, 116.
27. Ando, K. J. Chem. Phys. 2001, 114, 9470.
28. Hartnig, C.; Koper, M. T. M. J. Chem. Phys. 2001, 115, 8540.
29. Small, D. W.; Matyushov, D. V.; Voth, G. A. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 7470.
30. Ghorai, P. K.; Matyushov, D. V. J. Phys. Chem. A 2006, 110, 8857.
31. Leontyev, I. V.; Tachiya, M. J. Chem. Phys. 2005, 123, 224502.
32. Halley, J. W.; Hautman, J. Phys. Rev. B 1988, 38, 11704.
33. Benjamin, I. J. Phys. Chem. 1991, 95, 6675.
34. Rose, D. A.; Benjamin, I. J. Chem. Phys. 1994, 100, 3545.
35. Rose, D. A.; Benjamin, I. Chem. Phys. Lett. 1995, 234, 209.
36. Straus, J. B.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. 1993, 97, 7388.
37. Straus, J. B.; Calhoun, A.; Voth, G. A. J. Chem. Phys. 1995, 102, 529.
38. Calhoun, A.; Koper, M. T. M.; Voth, G. A. J. Phys. Chem. B 1999, 103, 3442.
39. Hartnig, C.; Koper, T. M. J. Am. Chem. Soc. 2003, 125, 9840.
40. Car, R.; Parrinello, M. Phys. Rev. Lett. 1985, 55, 2471.
41. Tateyama, Y.; Blumberger, J.: Sprik, M.; Tavernelli, I. J. Chem. Phys. 2005, 122, 234505.
42. Blumberger, J.; Sprik, M. Theor. Chem. Acc. 2006, 115, 113.
43. Blumberger, J.; Tavernelli, I.; Klein, M. L.; Sprik, M. J. Chem. Phys. 2006, 124, 064507.
44. VandeVondele, J.; Lynden-Bell, R.; Meijer. E. J.; Sprik, M. J. Phys. Chem. B 2006, 110, 3614.
45. VandeVondele, J.; Sulpizi, M.; Sprik, M. Angew. Chem., Intl. Ed. 2006, 45, 1936.
46. Ayala, R.; Sprik, M. J. Chem. Theory Comput. 2006, 2, 1403.
47. Sulpizi, M.; Raugei, S.; VandeVondele, J.; Carloni, P.; Sprik, M. J. Phys. Chem. B 2007, 11, 36969.
48. Tateyama, Y.; Blumberger, J.; Ohno, T.; Sprik, M. J. Chem. Phys. 2007, 126, 204506.
49. VandeVondele, J.; Ayala, R.; Sulpizi, M.; Sprik, M. J. Electroanal. Chem. 2007, 607, 113.
50. Blumberger, J.; Bernasconi, L.; Tavernelli, I.; Vuilleumier, R.; Sprik, M. J. Am. Chem. Soc. 2004, 126, 3928.
51. Hummer, G.; Pratt, R. L.; Garcia, A. E. J. Phys. Chem. 1996, 100, 1206.
52. Hummer, G.; Pratt, L. R.; Garcia, A. E. J. Chem. Phys. 1997, 107, 9275.
53. Hummer, G.; Pratt, L. R.; Garcia, A. E. J. Phys. Chem. A 1998, 102, 7885.
54. Hummer, G.; Pratt, L. R.: Garcia, A. E.; Shekhar, G. J. Phys. Chem. B 1998, 102, 3841.
55. Figuerido, F.; Del Buono, G. S.; Levy, R. J. Phys. Chem. B 1997, 101, 5622.
56. Lynden-Bell, R. M.; Rasaiah, J. C. J. Chem. Phys. 1997, 107, 1981.
57. Bogusz, S.; Cheatham, T. E., III; Brooks, B. R. J. Chem. Phys. 1998, 108, 7070.
58. Hünenberger, P. H.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 1999, 110, 1856.
59. Baker, N. A.; Hünenberger, P. H.; McCammon, J. A. J. Chem. Phys. 1999, 110, 10679.
60. Peter, C.; van Gunsteren, W. F.; Hünenberger. J. Chem. Phys. 2003, 119, 12205.
61. Kastenholz, M. A.; Hünenberger, J. J. Chem. Phys. 2006, 124, 224501.
62. Leslie, M.; Gillan, M. J. J. Phys.: Condens. Matter 1985, 18, 973.
63. Makov, G.; Payne, M. C. Phys. Rev. B 1995, 51, 4014.
64. Schultz, P. A. Phys. Rev. Lett. 2000, 84, 1942.
65. Schultz, P. A. Phys. Rev. Lett. 2006, 96, 246401.
66. Lento, J.; Mozos, J.-L.; Nieminen, R. M. J. Phys.: Condens. Matter 2002, 14, 2637.
67. Wright, A. F.; Modine, N. A. Phys. Rev. B 2006, 74, 235209.
68. Tachiya, M. J. Phys. Chem. 1989, 93, 7050.
69. Kirkwood, J. G. J. Chem. Phys. 1935, 3, 300.
70. VandeVondele, J.; Sprik, M. Phys. Chem. Chem. Phys 2005, 7, 1363.
71. Berendsen, H. J. C.; Postma, J. P. M.; van Gunsteren, W. F. V.; Hermans, J. In Intermolecular Forces: Proceedings of the Fourteenth Jerusalem Symposium on Quantum Chemistry and Biochemistry; Pullman, B., Ed.; Reidel: Dordrecht, The Netherlands, 1981; p 331.
72. Allen, M. P.; Tildesley, D. J. Computer Simulation of Liquids; Oxford University Press: Oxford, 1987.
73. Smith, W.; Forester, T. R. DL_POLY 2.14; Council for the Central Laboratory of the Research Councils, Daresbury Laboratory: Warrington WA4 4AD, England, 2003.