Multiple ionization mass spectrometry strategy used to reveal the complexity of metabolomics

Analytical Chemistry

Volumn 80, Issue 2, 2008, Pages 421-429

  Nordström, Anders ^a,b   Want, Elizabeth ^a,c   Northen, Trent ^a   Lehtiö, Janne ^b   Siuzdak, Gary ^d  

^a SCRIPPS RESEARCH INSTITUTE   (United States)

^b KAROLINSKA UNIVERSITY HOSPITAL   (Sweden)

^c IMPERIAL COLLEGE LONDON   (United Kingdom)

^d NONE

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

ELECTROSPRAY IONIZATION; IONIZATION; MASS SPECTROMETRY; METABOLISM;

DESORPTION IONIZATION ON SILICON (DIOS); OFFLINE MASS SPECTROMETRY; UNIQUE ION FEATURES;

COMPLEXATION;

ANALYTIC METHOD; ARTICLE; ELECTROSPRAY MASS SPECTROMETRY; LIQUID CHROMATOGRAPHY; MASS SPECTROMETRY; MATRIX ASSISTED LASER DESORPTION IONIZATION TIME OF FLIGHT MASS SPECTROMETRY; METABOLOMICS;

CHROMATOGRAPHY, LIQUID; DATA INTERPRETATION, STATISTICAL; HUMANS; MALE; METABOLISM; SERUM; SPECTROMETRY, MASS, ELECTROSPRAY IONIZATION; SPECTROMETRY, MASS, MATRIX-ASSISTED LASER DESORPTION-IONIZATION;

EID: 38349103941     PISSN: 00032700     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1021/ac701982e     Document Type: Article

References (40)

1. Fiehn, O.; Kopka, J.; Dormann, P.; Altmann, T.; Trethewey, R. N.; Willmitzer, L. Nat. Biotechnol. 2000, 18, 1157-1161.
2. Clish, C. B.; Davidov, E.; Oresic, M.; Plasterer, T. N.; Lavine, G.; Londo, T.; Meys, M.; Snell, P.; Stochaj, W.; Adourian, A.; Zhang, X.; Morel, N.; Neumann, E.; Verheij, E.; Vogels, J. T.; Havekes, L. M.; Afeyan, N.; Regnier, F.; van der Greef, J.; Naylor, S. Omics 2004, 8, 3-13.
3. Goodacre, R.; Vaidyanathan, S.; Dunn, W. B.; Harrigan, G. G.; Kell, D. B. Trends Biotechnol. 2004, 22, 245-252.
4. Brindle, J. T.; Antti, H.; Holmes, E.; Tranter, G.; Nicholson, J. K.; Bethell, H. W.; Clarke, S.; Schofield, P. M.; McKilligin, E.; Mosedale, D. E.; Grainger, D. J. Nat. Med. 2002, 8, 1439-1444.
5. Sabatine, M. S.; Liu, E.; Morrow, D. A.; Heller, E.; McCarroll, R.; Wiegand, R.; Berriz, G. F.; Roth, F. P.; Gerszten, R. E. Circulation 2005, 112, 3868-3875.
6. Kawashima, H.; Oguchi, M.; Ioi, H.; Amaha, M.; Yamanaka, G.; Kashiwagi, Y.; Takekuma, K.; Yamazaki, Y.; Hoshika, A.; Watanabe, Y. Int J. Neurosci. 2006, 116, 927-936.
7. Ippolito, J. E.; Xu, J.; Jain, S.; Moulder, K.; Mennerick, S.; Crowley, J. R.; Townsend, R. R.; Gordon, J. I. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 2005, 102, 9901-9906.
8. Griffin, J. L. Curr. Opin. Chem. Biol. 2003, 7, 648-654.
9. Want, E. J.; Nordstrom, A.; Morita, H.; Siuzdak, G. J. Proteome Res. 2007, 6, 459-468.
10. Villas-Boas, S. G.; Mas, S.; Akesson, M.; Smedsgaard, J.; Nielsen, J. Mass Spectrom. Rev. 2005, 24, 613-646.
11. Sandvoss, M.; Weltring, A.; Preiss, A.; Levsen, K.; Wuensch, G. J. Chromatogr., A 2001, 917, 75-86.
12. Jellum, E. J. Chromatogr. 1977, 143, 427-462.
13. Jonsson, P.; Gullberg, J.; Nordstrom, A.; Kusano, M.; Kowalczyk, M.; Sjostrom, M.; Moritz, T. Anal. Chem. 2004, 76, 1738-1745.
14. Kopka, J. J. Biotechnol. 2006, 124, 312-322.
15. Want, E. J.; O'Maille, G.; Smith, C. A.; Brandon, T. R.; Uritboonthai, W.; Qin, C.; Trauger, S. A.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2006, 78, 743-752.
16. Waybright, T. J.; Van, Q. N.; Muschik, G. M.; Conrads, T. P.; Veenstra, T. D.; Issaq, H. J. J. Liq. Chromatogr. Relat. Technol. 2006, 29, 2475-2497.
17. Tolstikov, V. V.; Lommen, A.; Nakanishi, K.; Tanaka, N.; Fiehn, O. Anal. Chem. 2003, 75, 6737-6740.
18. Nordstrom, A.; O'Maille, G.; Qin, C.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2006, 78, 3289-3295.
19. Aharoni, A.; Ric de Vos, C. H.; Verhoeven, H. A.; Maliepaard, C. A.; Kruppa, G.; Bino, R.; Goodenowe, D. B. Omics 2002, 6, 217-234.
20. Chen, H.; Pan, Z.; Talaty, N.; Raftery, D.; Cooks, R. G. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2006, 20, 1577-1584.
21. Vaidyanathan, S.; Gaskell, S.; Goodacre, R. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2006, 20, 1192-1198.
22. Vaidyanathan, S.; Jones, D.; Broadhurst, D. I.; Ellis, J.; Jenkins, T.; Dunn, W. B.; Hayes, A.; Burton, N.; Oliver, S. G.; Kell, D. B.; Goodacre, R. Metabolomics 2005, 1, 243-250.
23. Fisher, S. M.; Perkins, P. D. Agilent technical note, 2005.
24. Nordstrom, A.; Apon, J. V.; Uritboonthal, W.; Go, E. P.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2006, 78, 272-278.
25. Smith, C. A.; Want, E. J.; O'Maille, G.; Abagyan, R.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2006, 78, 779-787.
26. Murphy, R. C. Mass Spectrometry of Phospholipids: Tables of Molecular and Product Ions; Illuminati Press: Denver, CO, 2002.
27. Idborg, H.; Zamani, L.; Edlund, P. O.; Schuppe-Koistinen, I.; Jacobsson, S. P. J. Chromatogr., B: Anal. Technol. Biomed. Life Sci. 2005, 828, 9-13.
28. Ullsten, S.; Danielsson, R.; Backstrom, D.; Sjoberg, P.; Bergquist, J. J. Chromatogr., A 2006, 1117, 87-93.
29. Byrdwell, W. C. Rapid Commun. Mass Spectrom. 1998, 12, 256-272.
30. Siegel, M. M.; Tabei, K.; Lambert, F.; Candela, L.; Zoltan, B. J. Am. Soc. Mass Spectrom. 1998, 9, 1196-1203.
31. Gallagher, R. T.; Balogh, M. P.; Davey, P.; Jackson, M. R.; Sinclair, I.; Southern, L. J. Anal. Chem. 2003, 75, 973-977.
32. Niessen, W. M. A.; Manini, P.; Andreoli, R. Mass Spectrom. Rev. 2006, 25, 881-899.
33. Cech, N. B.; Enke, C. G. Mass Spectrom. Rev. 2001, 20, 362-387.
34. Sangster, T.; Spence, M.; Sinclair, P.; Payne, R.; Smith, C. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 1361-1364.
35. Baumgart, S.; Lindner, Y.; Kuhne, R.; Oberemm, A.; Wenschuh, H.; Krause, E. Rapid Commun. Mass Spectrom. 2004, 18, 863-868.
36. Wang, M. Z.; Fitzgerald, M. C. Anal. Chem. 2001, 73, 625-631.
37. Trauger, S. A.; Go, E. P.; Shen, Z. X.; Apon, J. V.; Compton, B. J.; Bouvier, E. S. P.; Finn, M. G.; Siuzdak, G. Anal. Chem. 2004, 76, 4484-4489.
38. Broeckling, C. D.; Huhman, D. V.; Farag, M. A.; Smith, J. T.; May, G. D.; Mendes, P.; Dixon, R. A.; Sumner, L. W. J. Exp. Bot. 2005, 56, 323-336.
39. Nordstrom, A.; Tarkowski, P.; Tarkowska, D.; Dolezal, K.; Astot, C.; Sandberg, G.; Moritz, T. Anal. Chem. 2004, 76, 2869-2877.
40. Halket, J. M.; Waterman, D.; Przyborowska, A. M.; Patel, R. K. P.; Fraser, P. D.; Bramley, P. M. J. Exp. Bot. 2005, 56, 219-243.