New views of protein structure: Applications to the caseins: Protein structure and functionality

ACS Symposium Series

Volumn 935, Issue , 2006, Pages 52-70

  Farrell Jr , H M ^a   Qi, P X ^a   Uversky, V N ^b,c,d  

^a EASTERN REGIONAL RESEARCH CENTER   (United States)

^b INDIANA UNIVERSITY   (United States)

^c INSTITUTE FOR BIOLOGICAL INSTRUMENTATION   (Russian Federation)

^d Molecular Kinetics   (United States)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

EID: 36749050494     PISSN: 00976156     EISSN: None     Source Type: Book Series    
DOI: None     Document Type: Conference Paper

References (52)

1. Swaisgood, H. E. In Advanced dairy chemistry: proteins; Fox, P. F.; McSweeney, P. L. H., Eds.; Kluwer Academic / Plenum Publishers: New York, NY, 2003; Vol. 1, pp. 139-201.
2. Farrell, H. M., Jr.; Jimenez-Flores, R.; Bleck, G. T.; Brown, E. M.; Butler, J. E.; Creamer, L. K.; Hicks, C. L.; Hollar, C. M.; Ng-Kwai-Hang, K. F.; Swaisgood, H. E. J. Dairy Sci. 2004, 87, 1641-1674.
3. Creamer, L. K.; Richardson, T.; Parry, D. A. Arch. Biochem. Biophys. 1981, 211, 689-696.
4. Holt, C.; Sawyer, L. J. Chem. Soc. Faraday Trans. 1993, 89, 2683-2692.
5. Paulsson, M.; Dejmek, P. J. Dairy Sci. 1990, 73, 590-600.
6. Xie, D.; Bhakuni, V.; Freire, E. Biochemistry 1991, 30, 10673-10678.
7. Byler, D. M.; Farrell, H. M., Jr.; Susi, H. J. Dairy Sci. 1988, 71, 2622-2629.
8. Shi, Z.; Woody, R. W.; Kallenbach, N. R. Adv. Protein Chem. 2002, 62, 163-240.
9. Creamer, T. P.; Campbell, M. N. Adv. Protein Chem. 2002, 62, 263-282.
10. Farrell, H. M., Jr.; Wickham, E. D.; Unruh, J. J.; Qi, P. X.; Hoagland, P. D. Food Hydrocolloids 2001, 15, 341-354.
11. Malin, E. L.; Alaimo, M. H.; Brown, E. M.; Aramini, J. M.; Germann, M. W.; Farrell, H. M., Jr.; McSweeney, P. L.; Fox, P. F. J. Protein Chem. 2001, 20, 391-404.
12. Syme, C. D.; Blanch, E. W.; Holt, C.; Jakes, R.; Goedert, M.; Hecht, L.; Barron, L. D. Eur. J. Biochem. 2002, 269, 148-156.
13. Kumosinski, T. F.; Brown, E. M.; Farrell, H. M., Jr. J. Dairy Sci. 1993, 76, 2507-2520.
14. Farrell, H. M., Jr.; Brown, E. M.; Hoagland, P. D.; Malin, E. L. In Advanced Dairy Cemistry - 1: Proteins, 3rd edition; Fox, P. F.; McSweeney, P. L. H., Eds.; Kluwer Academic/Plenum Publishers: New York, 2003; Vol. 1 Part A, pp. 203-231.
15. Kumosinski, T. F.; King, G.; Farrell, H. M., Jr. J. Protein Chem. 1994, 13, 701-714.
16. Farrell, H. M., Jr.; Qi, P. X.; Uversky, V. N. Proceeding chater. In Advances in Biopolymers: Molecules, clusters, networks and interations; Fishman, M.; Qi, P. X. Eds.; American Chemical Society Publishers: Washington, DC.
17. Tompa, P. Trends Biochem. Sci. 2002, 27, 527-533.
18. Onuchic, J. N.; Nymeyer, H.; Garcia, A. E.; Chahine, J.; Socci, N. D. Adv. Protein Chem. 2000, 53, 87-152.
19. Dunker, A. K.; Lawson, J. D.; Brown, C. J.; Williams, R. M.; Romero, P.; Oh, J. S.; Oldfield, C. J.; Campen, A. M.; Ratliff, C. M.; Hipps, K. W.; Ausio, J.; Nissen, M. S.; Reeves, R.; Kang, C.; Kissinger, C. R.; Bailey, R. W.; Griswold, M. D.; Chiu, W.; Garner, E. C.; Obradovic, Z. J. Mol. Graph. Model. 2001, 19, 26-59.
20. Romero, P.; Obradovic, Z.; Dunker, A. K. Genome Bioinformatics 1997, 8, 110-124.
21. Dunker, A. K.; Garner, E.; Guilliot, S.; Romero, P.; Albrecht, K.; Hart, J.; Obradovic, Z.; Kissinger, C.; Villafranca, J. E. Pac. Symp. Biocomput. 1998, 473-484.
22. Romero, P.; Obradovic, Z.; Li, X.; Garner, E. C.; Brown, C. J.; Dunker, A. K. Proteins 2001, 42, 38-48.
23. Vihinen, M. Protein Eng. 1987, 1, 477-480.
24. Cupo, P.; El-Deiry, W.; Whitney, P. L.; Awad, W. M., Jr. J. Biol. Chem. 1980, 255, 10828-10833.
25. Mrabet, N. T.; Van den Broeck, A.; Van den brande, I.; Stanssens, P.; Laroche, Y.; Lambeir, A. M.; Matthijssens, G.; Jenkins, J.; Chiadmi, M.; van Tilbeurgh, H.; Rey, F.; Janin, J.; Quax, W. J.; Lasters, I.; De Maeyer, M.; Wodak, S. J. Biochemistry 1992, 31, 2239-2253.
26. D'Amico, S.; Gerday, C.; Feller, G. J. Biol. Chem. 2001, 276, 25791-25796.
27. Saunders, N. F.; Thomas, T.; Curmi, P. M.; Mattick, J. S.; Kuczek, E.; Slade, R.; Davis, J.; Franzmann, P. D.; Boone, D.; Rusterholtz, K.; Feldman, R.; Gates, C.; Bench, S.; Sowers, K.; Kadner, K.; Aerts, A.; Dehal, P.; Detter, C.; Glavina, T.; Lucas, S.; Richardson, P.; Larimer, F.; Hauser, L.; Land, M.; Cavicchioli, R. Genome Res. 2003, 13, 1580-1588.
28. Uversky, V. N.; Gillespie, J. R.; Fink, A. L. Proteins 2000, 41, 415-427.
29. Dunker, A. K.; Obradovic, Z.; Romero, P.; Garner, E. C.; Brown, C. J. Genome Inform. Ser. Workshop Genome Inform. 2000, 11, 161-171.
30. Oldfield, C. J.; Cheng, Y.; Cortese, M. S.; Brown, C. J.; Uversky, V. N.; Dunker, A. K. Biochemistry 2005, 44, 1989-2000.
31. Li, X.; Romero, P.; Rani, M.; Dunker, A. K.; Obradovic, Z. Genome Inform. Ser. Workshop Genome Inform. 1999, 10, 30-40.
32. Uversky, V. N. Protein Sci. 2002, 11, 739-756.
33. Pepper, L.; Farrell, H. M., Jr. J. Dairy Sci. 1982, 65, 2259-2266.
34. Kumosinski, T. F.; King, G.; Farrell, H. M., Jr. J. Protein Chem. 1994, 13, 681-700.
35. Hoagland, P. D.; Unruh, J. J.; Wickham, E. D.; Farrell, H. M., Jr. J. Dairy Sci. 2001, 84, 1944-1949.
36. Farrell, H. M., Jr.; Kumosinski, T. F.; Cooke, P. H.; King, G.; Hoagland, P. D.; Wickham, E. D.; Dower, H. J.; Groves, M. L. J. Protein Chem. 1996, 15, 435-445.
37. Farrell, H. M., Jr.; Kumosinski, T. F.; Cooke, P. H.; Hoagland, P. D.; Wickham, E. D.; Unruh, J. J.; Groves, M. L. Int. Dairy J. 1999, 9, 193-199.
38. Farrell, H. M.; Cooke, P. H.; Wickham, E. D.; Piotrowski, E. G.; Hoagland, P. D. J. Protein Chem. 2003, 22, 259-273.
39. Kajiwara, K.; Niki, R.; Urakawa, H.; Hiragi, Y.; Donkai, N.; Nagura, M. Biochim. Biophys. Acta 1988, 955, 128-134.
40. Andrews, A. L.; Atkinson, D.; Evans, M. T. A.; Finer, E. G.; Green, J. P.; Phillips, M. C.; Robertson, N. Biopolymers 1979, 18, 1105-1121.
41. Takase, K.; Niki, R.; Arima, S. Biochim. Biophys. Acta 1980, 622, 1-8.
42. Qi, P. X.; Wickham, E. D.; Farrell, H. M., Jr. Protein J. 2004, 23, 389-402.
43. Farrell, H. M., Jr.; Qi, P. X.; Brown, E. M.; Cooke, P. H.; Tunick, M. H.; Wickham, E. D.; Unruh, J. J. J. Dairy Sci. 2002, 85, 459-471.
44. Farrell, H. M., Jr.; Kumosinski, T. F.; Malin, E. L.; Brown, E. M. In Methods Mol Biol., Vol. 172: Calcium-binding Protein Protocols, Vol. 1: Reviews and Case Studies.; Vogel, H. J., Ed.; Humana Press, Inc.: Totwa, NJ, 2002; Vol. 1, pp. 97-140.
45. Mora-Gutierrez, A.; Kumosinski, T. F.; Farrell, H. M., Jr. J. Agric. Food Chem. 1997, 45, 4545-4553
46. Niewold, T. A.; Murphy, C. L.; Hulskamp-Koch, C. A.; Tooten, P. C.; Gruys, E. Amyloid 1999, 6, 244-249.
47. Goers, J.; Permyakov, S. E.; Permyakov, E. A.; Uversky, V. N.; Fink, A. L. Biochemistry 2002, 41, 12546-12551.
48. Chiti, F.; Calamai, M.; Taddei, N.; Stefani, M.; Ramponi, G.; Dobson, C. M. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 2002, 99, 16419-16426.
49. Groves, M. L.; Dower, H. J.; Farrell, H. M., Jr. J. Protein Chem. 1992, 11, 21-28.
50. Farrell, H. M., Jr.; Thompson, M. P. J. Dairy Sci. 1971, 54, 1219-1228.
51. Farrell, H. M., Jr. In Encyclopedia of Reproduction; Knobil, E.; Neill, J. D., Eds.; Academic Press, Inc.: San Diego, CA, 1999; Vol. 3, pp. 256-263.
52. Sood, S. M.; Lekic, T.; Farrell, H. M., Jr.; Slattery, C. W. FASEB J. 2005, 4, A818.