Quantitative assessment of human whole blood RNA as a potential biomarker for infectious disease

Analyst

Volumn 132, Issue 12, 2007, Pages 1200-1209

  Smith, Claire L ^a,b   Dickinson, Paul ^a   Forster, Thorsten ^a   Khondoker, Mizanur ^a   Craigon, Marie ^a   Ross, Alan ^a   Storm, Petter ^a   Burgess, Stewart ^a   Lacaze, Paul ^a   Stenson, Benjamin J ^b   Ghazal, Peter ^a  

^a UNIVERSITY OF EDINBURGH   (United Kingdom)

^b UNIVERSITY OF EDINBURGH   (United Kingdom)

Author keywords

[No Author keywords available]

Indexed keywords

BIOLOGICAL MARKER; RNA;

ARTICLE; BIOCHIP; BLOOD ANALYSIS; BLOOD SAMPLING; CLINICAL ASSESSMENT; DISEASE MARKER; HUMAN; MEASUREMENT; METHODOLOGY; NEWBORN; QUANTITATIVE ANALYSIS; RNA EXTRACTION;

EID: 36349035085     PISSN: 00032654     EISSN: None     Source Type: Journal    
DOI: 10.1039/b707122c     Document Type: Article

References (43)

1. B. J. Stoll N. I. Hansen I. Adams-Chapman A. A. Fanaroff S. R. Hintz B. Vohr R. D. Higgins J. Am. Med. Assoc. 2004 292 2357 2365
2. J. Bryce C. Boschi-Pinto K. Shibuya R. E. Black Lancet 2005 365 1147 1152
3. J. S. Gerdes Pediatr. Clin. North Am. 2004 51 4 939 959
4. R. Berner C. M. Niemeyer J. U. Leititis A. Funke C. Schwab U. Rau K. Richter M. S. Tawfeek A. Clad M. Brandis Pediatr. Res. 1998 44 469 477
5. R. G. Jenner R. A. Young Nat. Rev. Microbiol. 2005 3 281 294
6. J. C. Boldrick A. A. Alizadeh M. Diehn S. Dudoit C. L. Liu C. E. Belcher D. Botstein L. M. Staudt P. O. Brown D. A. Relman Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2002 99 972 977
7. C. J. Campbell P. Ghazal J. Appl. Microbiol. 2004 96 18 23
8. C. A. Cummings D. A. Relman Emerg. Infect. Dis. 2000 6 513 525
9. D. Yowe W. J. Cook J. C. Gutierrez-Ramos Microbes Infect. 2001 3 813 821
10. Q. Huang D. Liu P. Majewski L. C. Schulte J. M. Korn R. A. Young E. S. Lander N. Hacohen Science 2001 294 870 875
11. A. R. Whitney M. Diehn S. J. Popper A. A. Alizadeh J. C. Boldrick D. A. Relman P. O. Brown Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2003 100 1896 1901
12. A. A. Alizadeh M. B. Eisen R. E. Davis C. Ma I. S. Lossos A. Rosenwald J. C. Boldrick H. Sabet T. Tran X. Yu J. I. Powell L. Yang G. E. Marti T. Moore J. Hudson, Jr. L. Lu D. B. Lewis R. Tibshirani G. Sherlock W. C. Chan T. C. Greiner D. D. Weisenburger J. O. Armitage R. Warnke R. Levy W. Wilson M. R. Grever J. C. Byrd D. Botstein P. O. Brown L. M. Staudt Nature 2000 403 503 511
13. M. Bittner P. Meltzer Y. Chen Y. Jiang E. Seftor M. Hendrix M. Radmacher R. Simon Z. Yakhini A. Ben-Dor N. Sampas E. Dougherty E. Wang F. Marincola C. Gooden J. Lueders A. Glatfelter P. Pollock J. Carpten E. Gillanders D. Leja K. Dietrich C. Beaudry M. Berens D. Alberts V. Sondak Nature 2000 406 536 540
14. T. R. Golub D. K. Slonim P. Tamayo C. Huard M. Gaasenbeek J. P. Mesirov H. Coller M. L. Loh J. R. Downing M. A. Caligiuri C. D. Bloomfield E. S. Lander Science 1999 286 531 537
15. C. M. Perou T. Sorlie M. B. Eisen M. van de Rijn S. S. Jeffrey C. A. Rees J. R. Pollack D. T. Ross H. Johnsen L. A. Akslen O. Fluge A. Pergamenschikov C. Williams S. X. Zhu P. E. Lonning A. L. Borresen-Dale P. O. Brown D. Botstein Nature 2000 406 747 752
16. F. Borovecki L. Lovrecic J. Zhou H. Jeong F. Then H. D. Rosas S. M. Hersch P. Hogarth B. Bouzou R. V. Jensen D. Krainc Proc. Natl. Acad. Sci. U. S. A. 2005 102 11023 11028
17. R. J. Feezor C. Oberholzer H. V. Baker D. Novick M. Rubinstein L. L. Moldawer J. Pribble S. Souza C. A. Dinarello W. Ertel A. Oberholzer Infect. Immun. 2003 71 5803 5813
18. M. Ghielmetti M. Bellis M. O. Spycher S. Miescher G. Vergeres Mol. Immunol. 2006 43 939 949
19. M. J. Griffiths M. J. Shafi S. J. Popper C. A. Hemingway M. M. Kortok A. Wathen K. A. Rockett R. Mott M. Levin C. R. Newton K. Marsh D. A. Relman D. P. Kwiatkowski J. Infect. Dis. 2005 191 1599 1611
20. A. D. Hershey Y. Tang S. W. Powers M. A. Kabbouche D. L. Gilbert T. A. Glauser F. R. Sharp Headache 2004 44 994 1004
21. P. A. Horwitz E. J. Tsai M. E. Putt J. M. Gilmore J. J. Lepore M. S. Parmacek A. C. Kao S. S. Desai L. R. Goldberg S. C. Brozena M. L. Jessup J. A. Epstein T. P. Cappola Circulation 2004 110 3815 3821
22. C. C. Liew J. Ma H. C. Tang R. Zheng A. A. Dempsey J. Lab. Clin. Med. 2006 147 126 132
23. M. Prucha A. Ruryk H. Boriss E. Moller R. Zazula I. Herold R. A. Claus K. A. Reinhart P. Deigner S. Russwurm Shock 2004 22 29 33
24. Q. Tan K. Christensen L. Christiansen H. Frederiksen L. Bathum J. Dahlgaard T. A. Kruse Hum. Genet. 2005 117 267 274
25. Y. Tang T. A. Glauser D. L. Gilbert A. D. Hershey M. D. Privitera D. M. Ficker J. P. Szaflarski F. R. Sharp Acta Neurol. Scand. 2004 109 159 168
26. Y. Tang M. B. Schapiro D. N. Franz B. J. Patterson F. J. Hickey E. K. Schorry R. J. Hopkin M. Wylie T. Narayan T. A. Glauser D. L. Gilbert A. D. Hershey F. R. Sharp Ann. Neurol. 2004 56 808 814
27. D. C. Thach B. K. Agan C. Olsen J. Diao B. Lin J. Gomez M. Jesse M. Jenkins R. Rowley E. Hanson C. Tibbetts D. A. Stenger E. Walter Genes Immun. 2005 6 588 595
28. Z. Wang D. Neuburg C. Li L. Su J. Y. Kim J. C. Chen D. C. Christiani Environ. Health Perspect. 2005 113 233 241
29. R. J. Feezor H. V. Baker M. Mindrinos D. Hayden C. L. Tannahill B. H. Brownstein A. Fay S. MacMillan J. Laramie W. Xiao L. L. Moldawer J. P. Cobb K. Laudanski C. L. Miller-Graziano R. V. Maier D. Schoenfeld R. W. Davis R. G. Tompkins Physiol. Genomics 2004 19 247 254
30. H. R. Wong T. P. Shanley B. Sakthivel N. Cvijanovich R. Lin G. L. Allen N. J. Thomas A. Doctor M. Kalyanaraman N. M. Tofil S. Penfil M. Monaco M. A. Tagavilla K. Odoms K. Dunsmore M. Barnes B. J. Aronow Physiol. Genomics 2007 30 146 155
31. D. C. Montgomery, Design and Analysis of Experiments, John Wiley & Sons Inc., New York, 6th edn, 2004
32. G. R. Warnes, Technical Report, University of Rochester, 2006 (http://www.urmc.rochester.edu/smd/biostat/people/faculty/manuscripts/ 0606_warnes_liu.pdf)
33. C. E. Bonferroni Pubblicazioni del R Istituto Superiore di Scienze Economiche e Commerciali di Firenze 1936 8 3 62
34. D. N. Cooper Ann. Med. 1992 24 427 437
35. E. Di Pierro M. D. Cappellini R. Mazzucchelli V. Moriondo D. Mologni B. Zanone Poma A. Riva Exp. Hematol. (N. Y.) 2005 33 584 591
36. X. M. Sun C. Neuwirth D. P. Wade B. L. Knight A. K. Soutar Hum. Mol. Genet. 1995 4 2125 2129
37. F. Tassone R. J. Hagerman W. D. Chamberlain P. J. Hagerman Am. J. Med. Genet. 2000 97 195 203
38. P. V. Pant H. Tao E. J. Beilharz D. G. Ballinger D. R. Cox K. A. Frazer Genome Res. 2006 16 331 339
39. H. O. Critchley K. A. Robertson T. Forster T. A. Henderson A. R. Williams P. Ghazal Am. J. Obstet. Gynecol. 2006 195 406 e401 416
40. O. Ramilo W. Allman W. Chung A. Mejias M. Ardura C. Glaser K. M. Wittkowski B. Piqueras J. Banchereau A. K. Palucka D. Chaussabel Blood 2007 109 2066 2077
41. S. E. Calvano W. Xiao D. R. Richards R. M. Felciano H. V. Baker R. J. Cho R. O. Chen B. H. Brownstein J. P. Cobb S. K. Tschoeke C. Miller-Graziano L. L. Moldawer M. N. Mindrinos R. W. Davis R. G. Tompkins S. F. Lowry Nature 2005 437 1032 1037
42. S. W. Yeung T. M. Lee H. Cai I. M. Hsing Nucleic Acids Res. 2006 34 e118
43. X. Duburcq C. Olivier F. Malingue R. Desmet A. Bouzidi F. Zhou C. Auriault H. Gras-Masse O. Melnyk Bioconjugate Chem. 2004 15 307 316